| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | NC_000913 | 3,992,524 | (CGGGC)2→1 | coding (1372‑1376/2547 nt) | cyaA → | adenylate cyclase |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | NC_000913 | 3992517 | 3992521 | 5 | 38 [0] | [0] 39 | cyaA | adenylate cyclase |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 3992522 = | 0 (0.000) | 38 (0.920) | 37/270 | 0.1 | 100% | coding (1370/2547 nt) | cyaA | adenylate cyclase |
| ? | NC_000913 | = 3992516 | 0 (0.000) | coding (1364/2547 nt) | cyaA | adenylate cyclase | |||||
TATCGGCGTGCTGACGCGTAAGCTGTATGCCGCGTTTGAAGCATTACCAGGTAAAGTGACGCTGGTAAACCCGCAGATTTCACCCGATCTCTCGGAACCGAATCTGACCTTTATTTATGTGCCGCCGGGCCGGGCTAACCGTTCAGGTTGGTATCTGTATAACCGCGCGCCAAATATTGAGTCGATCATCAGCCATCAGCCGCTGGAATATAACCGTTACCTGAATAAACTGGTGGCGTGGGCATGGTTTAACGGCCTGCTGACCTCGCGC > NC_000913/3992394‑3992664 | caggagatcgccgtgctgacgcgtaagcggtacgccgcgtctgaagcattcccaggtaaagtgacgctggtaaccccgcagatttcacccgatctctcggaaccgcatctgacctttatttatgtgccGCCGGGCTAACCGtt > 2:78777‑M1/129‑143 (MQ=255) aggatatcggcgtgctgacgcgtaagctgtatgccgcgtttgaagcattaccaggtaaagtgacgctggtaaacccgcagatttcacccgatctctcggaaccgaatctgacctttatttatgtgccGCCGGGCTAaccgctc < 2:363094‑M1/16‑4 (MQ=255) ttatcggcgtgctgccgcgtaagctgtatgccgcgtttgaagcattaccaggtaaagtgacgctggtaaacccgcagatttcacccgatctctcggaaccgaatctgacctttatttatgtgccGCCGGGCTAACCGTTCAgg > 2:542800‑M1/125‑143 (MQ=255) gatcggcgtgctgacgcgtaagctgtatgccgcgtttgaagcattaccaggtaaagtgacgctggtaaacccgcagatttcacccgatctctcggaaccgaatctgacctttatttatgtgccGCCGGGCTAACCGTTCAGGt > 1:707732‑M1/124‑143 (MQ=255) cgtgctgacgcgtaagctgtatgccgcgtttgaagcattaccaggtaaagtgacgctggtaaacccgcagatttcacccgatctctcggaaccgaatctgacctttatttatgtgccGCCGGGCTAACCGTTCAGGTTGGTAt > 1:398917‑M1/118‑143 (MQ=255) tgacgcgtaagctgtatgccgcgtttgaagcattaccaggtaaagtgacgctggtaaacccgcagatttcacccgacatctcggctcccactctgacctttatttatgtgccGCCGGGCTAACCGTTCAGGTTGGTATCTGta < 1:178213‑M1/31‑1 (MQ=255) cgcgtgagctgtctgccgcgtttgaagcattaccaggtaaagtgacgctggtaaacccgcagatttcacccgatctctcggaaccgaatctgacctttatttatgtgccGCCGGGCTAACCGTTCAGGTTGGTATCTGTATaa > 2:673538‑M1/110‑143 (MQ=255) gtaagctgtatgccgcgtttgaagcattaccaggtaaagtgacgctggtaaacccgcagatttcacccgatctctcggaaccgaatctgacctttatttatgtgccGCCGGGCTAACCGTTCAGGTTGGTATCTGTCTAACcg < 1:460821‑M1/37‑1 (MQ=255) aagcggtatgccgcgtttgaagcattaccaggtaaagcgccgctggtaaacccgcagatttcacccgatctctcggaaccgaatctgacctttatttatgtgccGCCGGGCTAACCGTTCAGGTTGGTATCTGTATAACcgcg > 2:109839‑M1/105‑143 (MQ=255) gctgtatgccgcgtttgaagcattaccaggtaaagtgacgctggtaaacccgcagatttcacccgatctctcggaaccgaatctgacctttatttatgtgccGCCGGGCTAACCGTTCAGGTTGGTCTCTGTATCACcgcgcg < 2:155577‑M1/41‑1 (MQ=255) ctgtacgcggcgtttgaagcattaccaggtaaagtgacgctggtaaacccgcagatttcacccgatctctcggaaccgaatctgacctttatttatgtgccGCCGGGCTAACCGTTCAGGTTGGTATCTGTATAACCgcgcgc > 1:483984‑M1/102‑143 (MQ=255) ccgcacgccgcgtgtgaagcattaccagctaacgcgacgctggtaaacccgcacatttcacccgctctctcggtaccgcatctgtcctttatttatgtgccGCCGGGCTAACCGTTCAGGTTGGTATCTGTATAACCgcgcgc > 1:93569‑M1/102‑143 (MQ=255) tgccgggtttgaagcgttaccaggtacagtgatgcggccaatcccgcagatttcacccgatctctcggaaccgaatctgacctttatttatgtgccGCCGGGCTAACCGTTCAGGTTGGTATCTGTATAACCGCGCGCCAAat > 1:739861‑M1/97‑143 (MQ=255) cgcgtttgaagcattaccaggtaaagtgacgctggtaaacccgcagatttcacccgatctctcggaaccgaatctgacctttatttatgtgccGCCGGGCTAACCGTTCAGGTTGGTATCTGTATAACCGCGCGCCAAAGAtt < 1:467814‑M1/50‑1 (MQ=255) cgtttgaagcattaccgggtaaagtgacgctgttaaacccgcagatttctcccgagctctcggaaccgaatctgacctttatttatgtgccGCCGGGCTAACCGTTCAGGTTGGTATCTGTATAACCGCGCGCCAAATATTGa > 2:418713‑M1/92‑143 (MQ=255) gcattaccaggtaaagtgacgctggtaaacccgcagatttcacccgatctctcggaaccgaatctgacctttatttatgtgccGCCGCGCTAACCGCACAGGTTAGTACTTTGATTACCGAGCGCCAAATACTGAGtcgaaca < 2:343963‑M1/60‑4 (MQ=255) ggtaaagtgacgctggtaaacccgcagatttcacccgatctctcggaaccgaatctgtcttttatttatgtgccGCTGGGCTAACCGTTCAGGTTGGTATCTGTATAACCGCGCGCCAAATATTGAGTCGATcatcagccatc > 1:306211‑M1/75‑143 (MQ=255) aagtgacgctggtaaacccgcagatttcacccgatctctcggaaccgaatctgacctttatttatgtgccGCCGGGCTAACCGTTCAGGTTGGTATCTGTATAACCGCGCGCCAAATATTGAGTCGATCatcagccatcagcc < 2:77639‑M1/73‑1 (MQ=255) acccgcagatttcccccgatctctcggaaccgaatctgacctttatttatgtgccGCCGGGCTAACCGTTCAGGTTGGTATCTGTATAACCGCGCGCCAAATATTGAGTCGATCATCAGCCATCAGCCGCTGGAATATAACCg > 2:510693‑M1/56‑143 (MQ=255) gatttcgcccgatctctcggaaccgaatctgccctttatttatgggccGCCGGGCTAACCGTTCTGGTTGGTATCTGTATAACCGCGCGCCAAATATTGAGTCGATCATCAGCCATCAGCCGCTGGAATATAACCGTTACCTg > 2:633471‑M1/49‑143 (MQ=255) gatttcacccgatctctcggaaccgaatctgaccgttatttatgtgccGCCGGGCTAACCGTTCAGGTTGGTATCTGTATAACCGCGCGCCAAATATTGAGTCGATCACCAGCCATCAGCCGCTGGAACATAACCGTTACcta < 2:90848‑M1/95‑2 (MQ=255) ccccgacctctcggatcggaatcggacctttatttatgtgccGCCGGGCTAACCGTTCAGGTTGGTATCTGTATACCCGCGCGTCAAATATTGAGTCGATCATCAGCCATCAGCCGCTGGAATATAACCGTTACCTGAATaaa > 2:729998‑M1/43‑143 (MQ=255) acccgatctctcggaaccgaatctgacctttatttatgtgccGCCGGGCTAACCGTTCAGGTTGGTATCTGTATAACCGCGCGCCAAATATTGAGTCGATCATCAGCCATCAGCCGCTGGAATATAACCGTTACCTGAATaaa < 1:713159‑M1/101‑1 (MQ=255) cccgatctctcggaaccgaatctgacctttatttatgtgccGCCGGGCTAACCGTTCAGGTTGGTATCTGTATAACCGCGCGCCAAATATTGAg < 1:646402‑M1/53‑1 (MQ=255) cccgatctctcggaaccgaatctgacctttatttatgtgccGCCGGGCTAACCGTTCAGGTTGGTATCTGTATAACCGCGCGCCAAATATTGAg > 2:646402‑M1/42‑94 (MQ=255) ccgatctctcggaaccgcatctgacctttatttatgtgccGCCGGGCTCACCGTTCAGGTTGGTATCTGTATAACCGCGCGCCAAATATTGAGTCGATCATCAGCCATCAGCCGCTGGAATATAACCGTTACCTGAATAAACt > 2:173612‑M1/41‑143 (MQ=255) cgatctctcggaaccgaatctgacctttatttatgtgccGCCGGGCTAACCGTTCAGGTTGGTATCTGTATAACCGCGCGCCAAATATTGAGTCGATCATCAGCCATCAGCCGCTGGAATATAACCGTTACCTGAATAAACtg > 1:3607‑M1/40‑143 (MQ=255) gatctctcggaaccgaatctgacctttatttatgtgccGCCGGGCTAACCGTTCAGGTTGGTATCTGTATAACCGCGCGCCAACTATTGAGTCCATCATCAGCCCTCAGCCGCTGGAATATCACCGGTACCCGAATCAActgc < 2:487156‑M1/105‑2 (MQ=255) tcggaaccgaatctgacctttatttatgtgccGCCGGGCTAACCGTTCAGGTTGGTATCTGTATAACCGCGCGCCAAATATTGAGTCGATCATCAGCCATCAGCCGCTGGAATATAACCGTTACCTGAATAAACTGGTGGCGt < 1:522320‑M1/111‑1 (MQ=255) ggcaccgaatctgacctttatttatgtgccGCCGGGCTAACCGTTCCGGTGGGTATCTGTATAACCGCGCGCCAAATATTGAGTCGATCATCAGCCATCAGCCGCTGGAATATAACCGTTACCTGAATAAACTGGTGGCGTgg > 2:555001‑M1/31‑143 (MQ=255) ccgaatctgacctttatttatgtgccGCCGGGCTAACCGTTCAGGTTGGTATCTGTATAACCGCGCGCCAAATCTTGAGTCGATCATCAGCCATCAGCCGATGGAATATAAACGTTAACTGAATCAACTGGTGGCGCGggcca < 2:44065‑M1/117‑3 (MQ=255) ctgacctttatttatgtgccGCCGGGCTAACCGTTCAGGTTGGTATCTGTATAACCGCGCGCCAAATATTGAGTCGATCATCAGCCATCAGCCGCTGGAATATAACCGTTACCTGAATAAACTGGTGGCGTGGGCATGGTTTa > 1:131505‑M1/21‑143 (MQ=255) ttctttttttgtgtgccGCCGGGCTAACCGTTCAGGTTGGTATGTGTATAACCGCGCGCCAAATAGTGAGTCGATCATCAGCCATCAGCCGCTGGAATATAGCCGTTACCTGAATAAACTGGTGGCGTGGGCATGGTTTAACg > 2:51709‑M1/18‑143 (MQ=255) ctttatttatgtgccGCCGGGCTAACCGTTCAGGTTGGTATCTGTATAACCGCGCGCCAAATATTGAGTCGATCATCAGCCATCAGCCGCTGGAATATAACCGTTACCTGAATAAACTGGTGGCGTGGGCATAGTTTAACGGc < 1:393541‑M1/128‑1 (MQ=255) ttatttatgtgccGCCGGGCTAACCGTTCAGGTTGGTATCTTTATAACCGCGCGCCAAATATTGAGTCGATCATCAGCCATCATCCGCTGTAATATAACCGTTACCTGAATAAACTGGTGGCGTGGGCATGGTTTAACGGCct > 1:363094‑M1/14‑143 (MQ=255) catttacgtgccGCCGGGCTAACCGTTCAGGTTGGTATCTGTATAACCGCGCGCCAAATATTGAGTCGATCATCAGCCATCAGCCGCTGGAATATAACCGTTACCTGAATAAACTGGTGGCGTGGGCATGGTTTAACGGCctg > 1:304696‑M1/13‑143 (MQ=255) tgccGCCGGGCTAACCGTTCAGGTTGGTATCTGTATAACCGCGCGCCAAATATTGAGTCGATCATCAGCCATCAGCCGCTGGAATATAACCGTTACCTGAATAAACTGGTGGCGTGGGCATGGTTTAACGGCCTGCTGACCTc > 1:77639‑M1/5‑143 (MQ=255) gccGCCGGGCTAACCGTTCAGGTTGGTATCTGTATAACCGCGCGCCAAATATTGAGTCGATCATCAGCCATCAGCCGCTGGAATATAACCGTTACCTGAATAAACTGGTGGCGTGGGCATGGTTTAACGGCCTGCTGACCTcg > 1:510090‑M1/4‑143 (MQ=255) GCCGGGCTAACCGTTCAGGTTGGTATCTGTATAACCGCGCGCCAAATATTGAGTCGATAATCAGCCAACAGCAGATGGAATATGACAGTTACCTGAATAAACTGGTAGAGTGGGCGAGGTTTAACCGCATGCTGAACACgcgc < 2:388578‑M1/143‑1 (MQ=255) | TATCGGCGTGCTGACGCGTAAGCTGTATGCCGCGTTTGAAGCATTACCAGGTAAAGTGACGCTGGTAAACCCGCAGATTTCACCCGATCTCTCGGAACCGAATCTGACCTTTATTTATGTGCCGCCGGGCCGGGCTAACCGTTCAGGTTGGTATCTGTATAACCGCGCGCCAAATATTGAGTCGATCATCAGCCATCAGCCGCTGGAATATAACCGTTACCTGAATAAACTGGTGGCGTGGGCATGGTTTAACGGCCTGCTGACCTCGCGC > NC_000913/3992394‑3992664 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |