| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | NC_000913 | 3,992,524 | (CGGGC)2→1 | coding (1372‑1376/2547 nt) | cyaA → | adenylate cyclase |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | NC_000913 | 3992517 | 3992521 | 5 | 38 [0] | [0] 39 | cyaA | adenylate cyclase |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 3992522 = | 0 (0.000) | 38 (0.920) | 37/270 | 0.1 | 100% | coding (1370/2547 nt) | cyaA | adenylate cyclase |
| ? | NC_000913 | = 3992516 | 0 (0.000) | coding (1364/2547 nt) | cyaA | adenylate cyclase | |||||
CAGGATATCGGCGTGCTGACGCGTAAGCTGTATGCCGCGTTTGAAGCATTACCAGGTAAAGTGACGCTGGTAAACCCGCAGATTTCACCCGATCTCTCGGAACCGAATCTGACCTTTATTTATGTGCCGCCGGGCCGGGCTAACCGTTCAGGTTGGTATCTGTATAACCGCGCGCCAAATATTGAGTCGATCATCAGCCATCAGCCGCTGGAATATAACCGTTACCTGAATAAACTGGTGGCGTGGGCATGGTTTAACGGCCTGCTGA > NC_000913/3992389‑3992656 | cAGGAGATCGCCGTGCTGACGCGTAAGCGGTACGCCGCGTCTGAAGCATTCCCAGGTAAAGTGACGCTGGTAACCCCGCAGATTTCACCCGATCTCTCGGAACCGCATCTGACCTTTATTTATGTGCCgccgggctaaccgtt > 2:78777‑M2/1‑128 (MQ=255) aGGATATCGGCGTGCTGACGCGTAAGCTGTATGCCGCGTTTGAAGCATTACCAGGTAAAGTGACGCTGGTAAACCCGCAGATTTCACCCGATCTCTCGGAACCGAATCTGACCTTTATTTATGTGCCgccgggctaaccgctc < 2:363094‑M2/143‑17 (MQ=255) ttatcGGCGTGCTGCCGCGTAAGCTGTATGCCGCGTTTGAAGCATTACCAGGTAAAGTGACGCTGGTAAACCCGCAGATTTCACCCGATCTCTCGGAACCGAATCTGACCTTTATTTATGTGCCgccgggctaaccgttcagg > 2:542800‑M2/2‑124 (MQ=255) gatcGGCGTGCTGACGCGTAAGCTGTATGCCGCGTTTGAAGCATTACCAGGTAAAGTGACGCTGGTAAACCCGCAGATTTCACCCGATCTCTCGGAACCGAATCTGACCTTTATTTATGTGCCgccgggctaaccgttcaggt > 1:707732‑M2/2‑123 (MQ=255) cGTGCTGACGCGTAAGCTGTATGCCGCGTTTGAAGCATTACCAGGTAAAGTGACGCTGGTAAACCCGCAGATTTCACCCGATCTCTCGGAACCGAATCTGACCTTTATTTATGTGCCgccgggctaaccgttcaggttggtat > 1:398917‑M2/1‑117 (MQ=255) tGACGCGTAAGCTGTATGCCGCGTTTGAAGCATTACCAGGTAAAGTGACGCTGGTAAACCCGCAGATTTCACCCGACATCTCGGCTCCCACTCTGACCTTTATTTATGTGCCgccgggctaaccgttcaggttggtatctgta < 1:178213‑M2/143‑32 (MQ=255) cgcgTGAGCTGTCTGCCGCGTTTGAAGCATTACCAGGTAAAGTGACGCTGGTAAACCCGCAGATTTCACCCGATCTCTCGGAACCGAATCTGACCTTTATTTATGTGCCgccgggctaaccgttcaggttggtatctgtataa > 2:673538‑M2/1‑109 (MQ=255) gTAAGCTGTATGCCGCGTTTGAAGCATTACCAGGTAAAGTGACGCTGGTAAACCCGCAGATTTCACCCGATCTCTCGGAACCGAATCTGACCTTTATTTATGTGCCgccgggctaaccgttcaggttggtatctgtctaaccg < 1:460821‑M2/143‑38 (MQ=255) aaGCGGTATGCCGCGTTTGAAGCATTACCAGGTAAAGCGCCGCTGGTAAACCCGCAGATTTCACCCGATCTCTCGGAACCGAATCTGACCTTTATTTATGTGCCgccgggctaaccgttcaggttggtatctgtataaccgcg > 2:109839‑M2/1‑104 (MQ=255) gCTGTATGCCGCGTTTGAAGCATTACCAGGTAAAGTGACGCTGGTAAACCCGCAGATTTCACCCGATCTCTCGGAACCGAATCTGACCTTTATTTATGTGCCgccgggctaaccgttcaggttggtctctgtatcaccgcgcg < 2:155577‑M2/143‑42 (MQ=255) ccgcacgccgcgtGTGAAGCATTACCAGCTAACGCGACGCTGGTAAACCCGCACATTTCACCCGCTCTCTCGGTACCGCATCTGTCCTTTATTTATGTGCCgccgggctaaccgttcaggttggtatctgtataaccgcgcgc > 1:93569‑M2/7‑101 (MQ=255) cTGTACGCGGCGTTTGAAGCATTACCAGGTAAAGTGACGCTGGTAAACCCGCAGATTTCACCCGATCTCTCGGAACCGAATCTGACCTTTATTTATGTGCCgccgggctaaccgttcaggttggtatctgtataaccgcgcgc > 1:483984‑M2/1‑101 (MQ=255) tGCCGGGTTTGAAGCGTTACCAGGTACAGTGATGCGGCCAATCCCGCAGATTTCACCCGATCTCTCGGAACCGAATCTGACCTTTATTTATGTGCCgccgggctaaccgttcaggttggtatctgtataaccgcgcgccaaat > 1:739861‑M2/1‑96 (MQ=255) cgcgTTTGAAGCATTACCAGGTAAAGTGACGCTGGTAAACCCGCAGATTTCACCCGATCTCTCGGAACCGAATCTGACCTTTATTTATGTGCCgccgggctaaccgttcaggttggtatctgtataaccgcgcgccaaagatt < 1:467814‑M2/143‑51 (MQ=255) cgTTTGAAGCATTACCGGGTAAAGTGACGCTGTTAAACCCGCAGATTTCTCCCGAGCTCTCGGAACCGAATCTGACCTTTATTTATGTGCCgccgggctaaccgttcaggttggtatctgtataaccgcgcgccaaatattga > 2:418713‑M2/1‑91 (MQ=255) gCATTACCAGGTAAAGTGACGCTGGTAAACCCGCAGATTTCACCCGATCTCTCGGAACCGAATCTGACCTTTATTTATGTGCCgccgcgctaaccgcacaggttagtactttgattaccgagcgccaaatactgagtcgaaca < 2:343963‑M2/143‑61 (MQ=255) ggTAAAGTGACGCTGGTAAACCCGCAGATTTCACCCGATCTCTCGGAACCGAATCTGTCTTTTATTTATGTGCCgctgggctaaccgttcaggttggtatctgtataaccgcgcgccaaatattgagtcgatcatcagccatc > 1:306211‑M2/1‑74 (MQ=255) aaGTGACGCTGGTAAACCCGCAGATTTCACCCGATCTCTCGGAACCGAATCTGACCTTTATTTATGTGCCgccgggctaaccgttcaggttggtatctgtataaccgcgcgccaaatattgagtcgatcatcagccatcagcc < 2:77639‑M2/143‑74 (MQ=255) aCCCGCAGATTTCCCCCGATCTCTCGGAACCGAATCTGACCTTTATTTATGTGCCgccgggctaaccgttcaggttggtatctgtataaccgcgcgccaaatattgagtcgatcatcagccatcagccgctggaatataaccg > 2:510693‑M2/1‑55 (MQ=255) gATTTCGCCCGATCTCTCGGAACCGAATCTGCCCTTTATTTATGGGCCgccgggctaaccgttctggttggtatctgtataaccgcgcgccaaatattgagtcgatcatcagccatcagccgctggaatataaccgttacctg > 2:633471‑M2/1‑48 (MQ=255) gATTTCACCCGATCTCTCGGAACCGAATCTGACCGTTATTTATGTGCCgccgggctaaccgttcaggttggtatctgtataaccgcgcgccaaatattgagtcgatcaccagccatcagccgctggaacataaccgttaccta < 2:90848‑M2/143‑96 (MQ=255) ccccgACCTCTCGGATCGGAATCGGACCTTTATTTATGTGCCgccgggctaaccgttcaggttggtatctgtatacccgcgcgtcaaatattgagtcgatcatcagccatcagccgctggaatataaccgttacctgaataaa > 2:729998‑M2/2‑42 (MQ=255) aCCCGATCTCTCGGAACCGAATCTGACCTTTATTTATGTGCCgccgggctaaccgttcaggttggtatctgtataaccgcgcgccaaatattgagtcgatcatcagccatcagccgctggaatataaccgttacctgaataaa < 1:713159‑M2/143‑102 (MQ=255) cccGATCTCTCGGAACCGAATCTGACCTTTATTTATGTGCCgccgggctaaccgttcaggttggtatctgtataaccgcgcgccaaatattgag < 1:646402‑M2/94‑54 (MQ=255) cccGATCTCTCGGAACCGAATCTGACCTTTATTTATGTGCCgccgggctaaccgttcaggttggtatctgtataaccgcgcgccaaatattgag > 2:646402‑M2/1‑41 (MQ=255) ccGATCTCTCGGAACCGCATCTGACCTTTATTTATGTGCCgccgggctcaccgttcaggttggtatctgtataaccgcgcgccaaatattgagtcgatcatcagccatcagccgctggaatataaccgttacctgaataaact > 2:173612‑M2/1‑40 (MQ=255) cGATCTCTCGGAACCGAATCTGACCTTTATTTATGTGCCgccgggctaaccgttcaggttggtatctgtataaccgcgcgccaaatattgagtcgatcatcagccatcagccgctggaatataaccgttacctgaataaactg > 1:3607‑M2/1‑39 (MQ=255) gATCTCTCGGAACCGAATCTGACCTTTATTTATGTGCCgccgggctaaccgttcaggttggtatctgtataaccgcgcgccaactattgagtccatcatcagccctcagccgctggaatatcaccggtacccgaatcaactgc < 2:487156‑M2/143‑106 (MQ=255) tcGGAACCGAATCTGACCTTTATTTATGTGCCgccgggctaaccgttcaggttggtatctgtataaccgcgcgccaaatattgagtcgatcatcagccatcagccgctggaatataaccgttacctgaataaactggtggcgt < 1:522320‑M2/143‑112 (MQ=255) ggCACCGAATCTGACCTTTATTTATGTGCCgccgggctaaccgttccggtgggtatctgtataaccgcgcgccaaatattgagtcgatcatcagccatcagccgctggaatataaccgttacctgaataaactggtggcgtgg > 2:555001‑M2/1‑30 (MQ=255) ccGAATCTGACCTTTATTTATGTGCCgccgggctaaccgttcaggttggtatctgtataaccgcgcgccaaatcttgagtcgatcatcagccatcagccgatggaatataaacgttaactgaatcaactggtggcgcgggcca < 2:44065‑M2/143‑118 (MQ=255) cTGACCTTTATTTATGTGCCgccgggctaaccgttcaggttggtatctgtataaccgcgcgccaaatattgagtcgatcatcagccatcagccgctggaatataaccgttacctgaataaactggtggcgtgggcatggttta > 1:131505‑M2/1‑20 (MQ=255) ttcttTTTTTGTGTGCCgccgggctaaccgttcaggttggtatgtgtataaccgcgcgccaaatagtgagtcgatcatcagccatcagccgctggaatatagccgttacctgaataaactggtggcgtgggcatggtttaacg > 2:51709‑M2/3‑17 (MQ=255) cTTTATTTATGTGCCgccgggctaaccgttcaggttggtatctgtataaccgcgcgccaaatattgagtcgatcatcagccatcagccgctggaatataaccgttacctgaataaactggtggcgtgggcatagtttaacggc < 1:393541‑M2/143‑129 (MQ=255) ttatttatGTGCCgccgggctaaccgttcaggttggtatctttataaccgcgcgccaaatattgagtcgatcatcagccatcatccgctgtaatataaccgttacctgaataaactggtggcgtgggcatggtttaacggcct > 1:363094‑M2/1‑13 (MQ=255) catttacgTGCCgccgggctaaccgttcaggttggtatctgtataaccgcgcgccaaatattgagtcgatcatcagccatcagccgctggaatataaccgttacctgaataaactggtggcgtgggcatggtttaacggcctg > 1:304696‑M2/2‑12 (MQ=255) tgCCgccgggctaaccgttcaggttggtatctgtataaccgcgcgccaaatattgagtcgatcatcagccatcagccgctggaatataaccgttacctgaataaactggtggcgtgggcatggtttaacggcctgctgacctc > 1:77639‑M2/1‑4 (MQ=255) gccgccgggctaaccgttcaggttggtatctgtataaccgcgcgccaaatattgagtcgatcatcagccatcagccgctggaatataaccgttacctgaataaactggtggcgtgggcatggtttaacggcctgctgacctcg > 1:510090‑M2/1‑3 (MQ=255) | CAGGATATCGGCGTGCTGACGCGTAAGCTGTATGCCGCGTTTGAAGCATTACCAGGTAAAGTGACGCTGGTAAACCCGCAGATTTCACCCGATCTCTCGGAACCGAATCTGACCTTTATTTATGTGCCGCCGGGCCGGGCTAACCGTTCAGGTTGGTATCTGTATAACCGCGCGCCAAATATTGAGTCGATCATCAGCCATCAGCCGCTGGAATATAACCGTTACCTGAATAAACTGGTGGCGTGGGCATGGTTTAACGGCCTGCTGA > NC_000913/3992389‑3992656 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |