New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | 2070250 = | 110 (0.560) | 3 (0.020) | 3/460 | NT | 2.6% | intergenic (‑70/‑27) | insC1/yoeA | IS2 repressor TnpA/CP4‑44 prophage, putative disrupted hemin or colicin receptor,Phage or Prophage Related, interrupted by IS2 and C‑terminal deletion |
? | NC_000913 | 2070480 = | 118 (0.630) | intergenic (+6/‑180) | yoeA/yeeP | CP4‑44 prophage, putative disrupted hemin or colicin receptor,Phage or Prophage Related, interrupted by IS2 and C‑terminal deletion/pseudogene, CP4‑44 prophage, 50S ribosome‑binding GTPase family,Phage or Prophage Related, putative histone |
Only 100 of 119 total aligned reads displayed.
AACAACCTGTTCTCCGGCGGCGACAGCAGTAAGACTTCCTTCCTGGTATTGCTT‑ACGCCAGAGAAATAACTGGCTGGCTGCTACACCATGTTGCCGGGCAACGAGGGAGACCGTCATCCCCGGTTCAAAGCTCTGCTGAACAATTGCGATCTTTTCCTGTGTGGTACGCCGTCTGCGTTTCTCCGGCCCTAAGACATCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAGTGGCGAAGCATCCTCCCGTGTTTTAATTCTCATTGATGGTCAGGAGGTAACTTATCAGCGCGCCGGAGATAATTATGGTGTGGGACTGTTGATAGATGAGTCTGCGCTGGAGCGTGTTGAGGTAGTGAAAGGTCCATATTCCGTACTGTACGGTTCACAGGCAATTGGCGGTATTGTTAACTTCATCACCAAAAAGGGTGAATCTCCGGACTCCCTATATCACTTAAATTGATACAACTTTTTAGAGTAGTCAT > NC_000913/2069977‑2070526 | tgtgtcgccagaaatactcatccacagacagggcacggtcatcggctttaatcagccacagtaccaggtcaagttcaggcagaatgtcacggtacccgcttacgcgagagcaataagtggctggccaccattctcgatacaaaactctgctgaatagcagcgattttcccagcgtggtgcgtcttttgcattttactggttctgagttatcaattatctgttcactaatgactactctaaaaagttgtatcaatttaagtgatatagggagtccGGAGATTc < 1:457880‑M1/8‑1 (MQ=255) tgggtcgccagaaatgcgcgaccacggacaggcgacggtcatctgatttaaacagccacagtaccaggtcaagtgcgggaagaatgtcccgggacccgcttactcgagagcaataaggtgctggccaacattctcgatacaaaactctgctggatagcagcgattttcccatcgtggtgcgtcttttgcattttacttgttctgagttatcaattatctgttcactaatgactactctaaaaagttgtatcaatttaagtgatatagggagtccGGAGATTc > 1:1917565‑M1/275‑282 (MQ=255) gtgtcgccagaaatactcatccacagacagggcacggtcatcggctttaatcagccacagtaccaggtcaagttcaggcagaatgtcacggtacccgcttacgcgagagcaataagtggctggccaccattctcgatacaaaactctgctgaatagcagcgattttcccagcgtggtgcgtcttttgcattttactggttctgagttatcaattatctgttcactaatgactactctaaaaagttgtatcaatttaagtgatatagggagtccGGAGATTCa < 2:1540610‑M1/9‑1 (MQ=255) gtcgccagaaatactcatccacagacagggcacggtcatcggctttaatcagccacagtaccaggtcaagttcaggcagaatgtcacggtacccgcttacgcgagagcaataagtggctggccaccattctcgatacaaaactctgctgaatagcagcgattttcccagcgtggtgcgtctcttgcattttactggttctgtgttatcaattatctgttcactaatgactactttaaaacgttgtatcaatttaagtgatatagggagtccggatgttcacc < 1:644969‑M1/11‑9 (MQ=255) gcgACAGCAGTAAGACTTCCTTCCTGGTATTGCTT‑ACGCCAGAGAAATAACTGGCTGGCTGCTACACCATGTTGCCGGGCAACGAGGGAGACCGTCATCCCCGGTTCAAAGCTCTGCTGAACAATTGCGATCTTTTCCTGTGTGGTACGCCGTCTGCGTTTCTCCGGCCCTAAGACATCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAGTGGc > 2:1081950/1‑281 (MQ=31) gtagccttcctgcCTGTGATTGCTTAACGCAAG‑GAAATAACTTGCTTGCTGCTACACCCTGTTGCCGGGCAACGAGGTGGACCGTCATCCCCGGTTCAAAGCTCTGCTGAACAATTGCGATCTTTTCCTGTGTGGTACGCCGTCTGCGTTTCTCCGGCCCTAAGACATCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAGTGGCGAAGCAtcctc < 1:1081950/277‑1 (MQ=11) ggTATTGCTT‑ACGCCAGAGAAATAACTGGCTGGCTGCTACACCATGTTGCCGGGCAACGAGGGAGACCGTCATCCCCGGTTCAAAGCTCTGCTGAACAATTGCGATCTTTTCCTGTGTGGTACGCCGTCTGCGTTTCTCCGGCCCTAAGACATCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAGTGGCGAAGCATCCTCCCGTGTTTTAATtct > 1:278555/1‑282 (MQ=255) 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agaAATAACTGGCTGGCTGCTACACCATGTTGCCGGGCAACGAGGGAGACCGTCATCCCCGGTTCAAAGCTCTGCTGAACAATTGCGATCTTTTCCTGTGTGGTACGCCGTCTGCGTTTCTCCGGCCCTAAGACATCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAGTGGCGAAGCATCCTCCCGTGTTTTAATTCTCATTGATGGTCaggagg > 1:1061912/1‑282 (MQ=255) tAACTGGCTGGCTGCTACACCATGTTGCCGGGCAACGAGGGAGACCGTCATCCCCGGTTCAAAGCTCTGCTGAACAATTGCGATCTTTTCCTGTGTGGTACGCCGTCTGCGTTTCTCCGGCCCTAAGACATCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAGTGGCGAAGCATCCTCCAGTGGTTTAATTCTCATTGATGGTAAGGAGGTAACt > 2:510999/1‑282 (MQ=255) ggctggctGCTACACCATGTTGCCGGGCAACGAGGGAGACCGTCATCCCCGGTTCAAAGCTCTGCTGAACAATTGCGATCTTTTCCTGTGTGGTACGCCGTCTGCGTTTCTCCGGCCCTAAGACATCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAGTGGCGAAGCATCCTCCCGTGTTTTAATTCTCATTGATGGTCAGGAGGTAACTTATCa > 1:553991/1‑282 (MQ=255) ggctggctGCTACACCATGTTGCCGGGCAACGAGGGAGACCGTCATCCCCGGTTCAAAGCTCTGCTGAACAATTGCGATCTTTTCCTGTGTGGTACGCCGTCTGCGTTTCTCCGGCCCTAAGACATCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGGCTAGTGGCGAAGCATCCTCCCGTGTTTTAATTCTCATTGATGGTCAGGAGGTAACTTATCa > 2:1318495/1‑282 (MQ=255) ctggctgCTACACCATGTTGCCGGGCAACGAGGGAGACCGTCATCCCCGGTTCAAAGCTCTGCTGAACAATTGCGATCTTTTCCTGTGTGGTACGCCGTCTGCGTTTCTCCGGCCCTAAGACATCAATTATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGCATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAGTGGCGAAGCATCGTCCCGTGTTTTAATTCTCATTGATGGTCAGGAGGTAACTTATCAgc > 2:1354779/1‑282 (MQ=255) gctgctACACCATGTTGCCGGGCAACGAGGGAGACCGTCATCCCCGGTTCAAAGCTCTGCTGAACAATTGCGATCTTTTCCTGTGTGGTACGCCGTCTGCGTTTCTCCGGCCCTAAGACATCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAGTGGCGAAGCATCCTCCCGTGTTTTAATTCTCATTGATGGTCAGGAGGTAACTTATCAgcgcg > 1:653691/1‑282 (MQ=255) ctACACCATGTTGCCGGGCAACGAGGGAGACCGTCATCCCCGGTTCAAAGCTCTGCTGAACAATTGCGATCTTTTCCTGTGTGGTACGCCGTCTGCGTTTCTCCGGCCCTAAGACATCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAGTGGCGAAGCATCCTCCCGTGTTTTAATTCTCATTGATGGTCAGGAGGTAACTTATCAGCGCGCCg < 2:1621911/281‑1 (MQ=255) cgaaacCATGTTGCCGGGCAACGAGGTGGACCGGCATCCCCGGTTCAAAGCTCTGTTGAACAATTGCGATCTTTTCCTGTGTGTTACGCCGTCTGCGTTTCTCCGGCCCTAAGACATCAATCATCTGTTCTCCAATGCCTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAGTGGCGAAGCATCCTCCCGTGTTTTAATTCTCATTGATGGTCAGGAGGTAACTTATCAGCGCGCCg < 1:1318495/277‑1 (MQ=255) tACACCATGTTGCCGGGCAACGAGGGAGACCGTCATCCCCGGTTCAAAGCTCTGCTGAACAATTGCGATCTTTTCCTGTGTGGTACGCCGTCTGCGTTTCTCCGGCCCTAAGACATCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAGTGGCGAAGCATCCTCCCGTGTTTTAATTCTCATTGATGGTCAGGAGGTAACTTATCAGCGCGCCGga < 2:1073761/282‑1 (MQ=255) tACACCATGGTGCCGGGCAACGAGGGAGACCGGCAACCCCGGTTCAAAGCTCTGCTGAACAATTGCGATCTTGTCCTGTGTGGGACGCCGTCTGCGTTTCTCCGGCCCTAAGACATCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAGTGGCGAAGCATCCTCCCGTGTTTTAATTCTGATTGATGGTCAGGAGGTAACTTATCAGCGCGCCGga < 2:1813217/282‑1 (MQ=255) aaacCATGTTGCCGGGCAAAGAGGGAGAACGTCATCCCCGGTTTAAATCTCTGCTGAACAATTGCGATCTGTTGCTGTGTGGTACGCCGTCGGCGTTTCTCCGGCCCTAAGACATCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAGTGGCGAAGCATCCTCCCGTGTTTTAATTCTCATGGATGGTCAGGAGGTAACTTATCAGCGCGCCGga < 1:1752073/279‑1 (MQ=255) ccATGTTGCCGGGCAACGCGGGAGACCGTCATCCCCGGGTAAAAGCTCTGTTGAACAATTTCGATCTTTTCCTGTGTGGTACGCCGTCTGCGTTTCTCCGGCCCTAAGACATCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTTTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAGTGGCGAAGCATCCTCCCGTGTTTTAATTCTCATTGATGGTCAGGAGGTAACTTATCAGCGCGCCGGAGAt < 1:975998/281‑1 (MQ=255) 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aaGCTCTGCTGAACAATTGCGATCTTTTCCTGTGTGGTACGCCGTCTGCGTTTCTCCGGCCCTAAGACATCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAGTGGCGAAGCATCCTCCCGTGTTTTAATTCTCATTGATGGTCAGGAGGTAACTTATCAGCGCGCCGGAGATAATTATGGTGTGGGACTGTTGATAGAt > 2:925724/1‑266 (MQ=255) aaGCTCTGCTGAACAATTGCGATCTTTTCCTGTGTGGTACGCCGTCTGCGTTTCTCCGGCCCTAAGACATCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAGTGGCGAAGCATCCTCCCGTGTTTTAATTCTCATTGATGGTCAGGAGGTAACTTATCAGCGCGCCGGAGATAATTATGGTGTGGGACTGTTGATAGAt < 1:925724/266‑1 (MQ=255) tgctgAACAATTGCGATCTTTTCCTGTGTGGTACGCCGTCTGCGTTTCTCCGGCCCTAAGACATCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAGTGGCGAAGCATCCTCCCGTGTTTTAATTCTCATTGATGGTCAGGAGGTAACTTATCAGCGCGCCGGAGATAATTATGGTGTGGGACTGTTGATAGATGAGTCTGCGCTGGAGCGTGTTg > 1:343328/1‑282 (MQ=255) 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 17 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |