| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 2070250 = | 110 (0.560) | 3 (0.020) | 3/460 | NT | 2.6% | intergenic (‑70/‑27) | insC1/yoeA | IS2 repressor TnpA/CP4‑44 prophage, putative disrupted hemin or colicin receptor,Phage or Prophage Related, interrupted by IS2 and C‑terminal deletion |
| ? | NC_000913 | 2070480 = | 118 (0.630) | intergenic (+6/‑180) | yoeA/yeeP | CP4‑44 prophage, putative disrupted hemin or colicin receptor,Phage or Prophage Related, interrupted by IS2 and C‑terminal deletion/pseudogene, CP4‑44 prophage, 50S ribosome‑binding GTPase family,Phage or Prophage Related, putative histone | |||||
Only 100 of 132 total aligned reads displayed.
TAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAGTGGCGAAGCATCCTCCCGTGTTTTAATTCTCATTGATGGTCAGGAGGTAACTTATCAGCGCGCCGGAGATAATTATGGTGTGGGACTGTTGATAGATGAGTCTGCGCTGGAGCGTGTTGAGGTAGTGAAAGGTCCATATTCCGTACTGTACGGTTCACAGGCAATTGGCGGTATTGTTAACTTCATCACCAAAAAGGGTGAATCTCCGGACTCCCTATATCACTTAAAT‑‑‑TG‑‑‑‑‑‑‑‑‑ATACAACTTTTTAGAGTAGTCATTAGTGAACAGATAATTGATAACTCAGAACCAGTAAAATGCAAAAGACGCACCACGCTGGGAAAATCGCTGCTATTCAGCAGAGTTTTGTATCG‑AGAATGGTGGCCAGCCACTTATTGCTCTCGCGTAAGCGGGTACCGTGACATTCTGCCTGAACTTGACCTGGTACTGTGGCTGATTAAAGCCGATGACCGTGCCCTGTCTGTGGATGAGTATTTCTGGCGACACA > NC_000913/2070201‑2070753 | tAAAAACTAGTATTAAGACTTTCCATTATTTAAGTGTAATTGGTTGTCTGTGGATTCAGGGGGCCAGTCTAGTGGCGAAGCATCCTCCCGTGTTTTAATTCTCATTGATGGTCAGGAGGTAACTTATCAGCGCGCCGGAGATAATTATGGTGTGGGACTGTTGATAGATGAGTCTGCGCTGGAGCGTGTTGAGGTAGTGAAAGGTCCATATTCCGTACTGTACGGTTCACAGGCAATTGGCGGTATTGTTAACTTCATCACCAAAAAGGGTGAATCTCCGGa < 1:218526/282‑1 (MQ=255) aaaaaCTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAGTGGCGAAGCATCCTCCCGTGTTTTAATTCTCATTGATGGTCAGGAGGTAACTTATCAGCGCGCCGGAGATAATTATGGTGTGGGACTGTTGATAGATGAGTCTGCGCTGGAGCGTGTTGAGGTAGTGAAAGGTCCATATTCCGTACTGTACGGTTCACAGGCAATTGGCGGTATTGTTAACTTCATCACCAAAAAGGGTGAATCTCCGGa < 2:419006/281‑1 (MQ=255) aGTATTATGATGATTACTAATTTTATGGTTATTGGTTGGTTGGAGAATCAGGGGGCCAGTCTATGGGCGAAGCATTCTCCCGTATTTTGATTCTCATTGATGGTCAGGAGGTAACTTATCAGCGCGCCGGAGATAATTATGGTGGGGGACTGTTGATAGATGGGTCTGCTGTGGAGCGTGTTGAGGTAGTGAGATGACCATATTCCGTACTGTACGGTTCACAGGAAATTGGCGGTATTGTTAACTTTATCACCAAAAAGGGAGAATCTCCGGACTCCCtat < 1:1354779/282‑1 (MQ=255) aGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTTGAGATTCAGGGTGCCAGTCTAGTGGCGAAGCATCCTCCCGTTTTTTAATTCTCATTGATGGTCAGGAGGTAACTTATCATCGCGCCGGAGATAATTATGGTGTGGGACTGTTGATAGATGAGTCTGCGCTGGAGCGTGTTGAGGTAGTGAAAGGTCCATATTCCGTACTGTACGGTTCACAGGCAATTGGCGGTATTGTTAACTTCATCACCAAAAAGGGTGAATCTCCGGACTCCCtat < 2:1380204/282‑1 (MQ=255) 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gATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAGTGGCGAAGCATCCTCCCGTGTTTTAATTCTCATTGATGGTCAGGAGGTAACTTATCAGCGCGCCGGAGATAATTATGGTGTGGGACTGTTGATAGATGAGTCTGCGCTGGAGCGTGTTGAGGTAGTGAAAGGTCCATATTCCGTACTGTACGGTTCACAGGCAATTGGCGGTATTGTTAACTTCATCACCAAAAAGGGTGAATCTCCGGACTCCCTATATCACTTAAAT‑‑‑TG‑‑‑‑‑‑‑‑‑a > 2:549863/1‑269 (MQ=255) atatTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAGTGGCGAAGCATCCTCCCGTGTTTTAATTCTCATTGATGGTCAGGAGGTAACTTATCAGCGCGCCGGAGATAATTATGGTGTGGGACTGTTGATAGATGAGTCTGCGCTGGAGCGTGTTGAGGTAGTGAAAGGTCCATATTCCGTACTGTACGGTTCACAGGCAATTGGCGGTATTGTTAACTTCATCACCAAAAAGGGTGAATCTCCGGACTCCCTATATCACTTAAAT‑‑‑TG‑‑‑‑‑‑‑‑‑ATACAACTTTTTaga < 2:1878905/282‑1 (MQ=255) ttGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAGTGGCGAAGCATCCTCCCGTGTTTTAATTCTCATTGATGGTCAGGAGGTAACTTATCAGCGCGCCGGAGATAATTATGGTGTGGGACTGTTGATAGATGAGTCTGCGCTGGAGCGTGTAGAGGTAGTGAAAGGTCCATATTCCGTACTGTACGGTTCACAGGCAATTGGCGGTATTGTTAACTTCATCACCAAAAAGGGTGAATCTCCGGACTCCCTATATCACTTAAAT‑‑‑TG‑‑‑‑‑‑‑‑‑ATACAACTTTTTAGagtagt < 2:126086/280‑1 (MQ=255) 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ggTGAATCTCCGGACTCCCTATATCACTTAAAT‑‑‑TG‑‑‑‑‑‑‑‑‑ATACAACTTTTTAGAGTAGTCATTAGTGAACAGATAATTGATAACTCAGAACCAGTAAAATGCAAAAGACGCACCACGCTGGGAAAATCGCTGCTATTCAGCAGAGTTTTGTATCG‑AGAATGGTGGCCAGCCACTTATTGCTCTCGCGTAAGCGGGTACCGTGACATTCTGCCTGAACTTGACCTGGTACTGTGGCTGATTAAAGCCGATGACCGTGCCCTGTCTGTGGATGAGTATTTCTGGCGac < 1:1267943/282‑1 (MQ=255) tgaatctccGGACTCCCTATATCACTTAAAT‑‑‑TG‑‑‑‑‑‑‑‑‑ATACAACTTTTTAGAGTAGTCATTAGTGAACAGATAATTGATAACTCAGAACCAGTAAAATGCAAAAGACGCACCACGCTGGGAAAATCGCTGCTATTCAGCAGAGTTTTGTATCG‑AGAATGGTGGCCAGCCACTTATTGCTCTCGCGTAAGCGGGTACCGTGACATTCTGCCTGAACTTGACCTGGTACTGTGGCTGATTAAAGCCGATGACCGTGCCCTGTCTGTGGATGAGTATTTCTGGCGacac < 2:1540610‑M2/273‑1 (MQ=255) gaatctccGGACTCCCTATATCACTTAAAT‑‑‑TG‑‑‑‑‑‑‑‑‑ATACAACTTTTTAGAGTAGTCATTAGTGAACAGATAATTGATAACTCAGAACCAGTAAAATGCAAAAGACGCACCACGCTGGGAAAATCGCTGCTATTCAGCAGAGTTTTGTATCG‑AGAATGGTGGCCAGCCACTTATTGCTCTCGCGTAAGCGGGTACCGTGACATTCTGCCTGAACTTGACCTGGTACTGTGGCTGATTAAAGCCGATGACCGTGCCCTGTCTGTGGATGAGTATTTCTGGCGAcaca < 1:457880‑M2/274‑1 (MQ=255) gaatctccGGACTCCCTATATCACTTAAAT‑‑‑TG‑‑‑‑‑‑‑‑‑ATACAACTTTTTAGAGTAGTCATTAGTGAACAGATAATTGATAACTCAGAACAAGTAAAATGCAAAAGACGCACCACGATGGGAAAATCGCTGCTATCCAGCAGAGTTTTGTATCG‑AGAATGTTGGCCAGCACCTTATTGCTCTCGAGTAAGCGGGTCCCGGGACATTCTTCCCGCACTTGACCTGGTACTGTGGCTGTTTAAATCAGATGACCGTCGCCTGTCCGTGGTCGCGCATTTCTGGCGAccca > 1:1917565‑M2/9‑282 (MQ=255) | TAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAGTGGCGAAGCATCCTCCCGTGTTTTAATTCTCATTGATGGTCAGGAGGTAACTTATCAGCGCGCCGGAGATAATTATGGTGTGGGACTGTTGATAGATGAGTCTGCGCTGGAGCGTGTTGAGGTAGTGAAAGGTCCATATTCCGTACTGTACGGTTCACAGGCAATTGGCGGTATTGTTAACTTCATCACCAAAAAGGGTGAATCTCCGGACTCCCTATATCACTTAAAT‑‑‑TG‑‑‑‑‑‑‑‑‑ATACAACTTTTTAGAGTAGTCATTAGTGAACAGATAATTGATAACTCAGAACCAGTAAAATGCAAAAGACGCACCACGCTGGGAAAATCGCTGCTATTCAGCAGAGTTTTGTATCG‑AGAATGGTGGCCAGCCACTTATTGCTCTCGCGTAAGCGGGTACCGTGACATTCTGCCTGAACTTGACCTGGTACTGTGGCTGATTAAAGCCGATGACCGTGCCCTGTCTGTGGATGAGTATTTCTGGCGACACA > NC_000913/2070201‑2070753 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 10 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |