| New junction evidence | |||||||||||
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| ? | NC_000913 | = 3154364 | 154 (0.820) | coding (853/957 nt) | yqhC | transcriptional activator of yqhD | |||||
Only 100 of 191 total aligned reads displayed.
TATGCCTTAAGTATGATTCCGTTCGTTAAACGCCATGAAGATCAGGTAATGACGTTCCTGATGATCCTGCCAATTGCCTTGTTAA‑CCGCTGGCTTGTTAGGCACGCTGTTTGTGGTGATTAAAAAAAAATACTGTAACGCCTGACGATTTTCCCCGTTCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTCCCCTGCATCGCCCGCATTCTTGCCGCATCTTCCCCCGGCGTCACACCGAAGTAACGTTTAAACTCACGGCTAAATTGCGATGCGCTTTCATAGCCGACGCGCATCGCTGCTGCGCTGGCCTTCATGCCGTCATGGATGATCATCATCCGCGCCTTATGCAGACGGTAATTCTTCAAATACTGCAACGGCGAGGTACTGGTGACAGACTTAAAATTATGGTGGAACGCCGATACGCTCATGTTGGCTTCTGCCGCCAGTTGCTCGACGCTCAGGTTTTCGGTGTATTTATTCTCAATCCGTTTCAGCACGCGGCTAATCAGACTGAAGTGAGTCTGGCGACTGACCAGCGCCAGTAACGCGC > NC_000913/3154077‑3154627 | gCCTTAAGTATGATTCCGTTCGTTAAACGCCATGAAGATTAGGTAATGACGTTCCTGATGATCCTGCCAATTGCCTTGTTGA‑CCGCTGTTTTGTTAGGCACGCTGTTTGTGGTGATTAAAAAAAAATACTGTAACGCCTGACGATTTTCCCCGTTCCCGGTTGCTATACCGGGAATGTATTTCATTCCCCTGCATCGCCCGCATTATTGCCGCCATAACCCCCGGCGTCAACCCGACGTAACGTTGAAACTCCCGGCCAAATTGCAATCCTCTTTCATAGc > 1:453377/1‑281 (MQ=255) 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tggatTCCGGTCGTTAAACGCCATGAAGATCAGGTAATGACGTTCCGGATGATCCTGCCAAGTGGCTTGTTAA‑CCGCTGGCTTGTTAGGCACGCTGTTTGTGGTGATTAAAAAAAAATACTGTAACGCCTGACGATTTTCCCCGTTCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTCCCCTGCATCGCCCGCATTCTTGCCGCATCTTCCCCCGGCGTCACACCGAAGTAACGTTTAAACTCACGGCTAAATTGCGATGCGCTTTCATAGCCGACgcgcat > 1:1259307‑M2/3‑276 (MQ=255) aTGATTCCGTTCGTCAAACTCCAGGAAAATCAGGTAATTACGTTCCTGATGATCCTGCCAATTTCCTTGTTAA‑CCGCTGGCTTGTTAGGCACGCTGTTTGTGGTCATTTAAAAAAAATACTGTAACGCCTGACGATTTTCCCCGTTCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTCCCCTGCATCGCCCGCATTCTTGCCGCATCTTCCCCCGGCGTCACACCGAAGTAACGTTTAAACTCACGGCTAAATTGCGATGCGCTTTCATAGCCGACgcgcat > 2:962781‑M2/1‑276 (MQ=255) aTGATTCAGTTTGTTAAACGCCATGAATATAAGGTAATTACGTTCCGGGTTGTCCTGACAATTGCCTTATTAA‑CCGCTGTCTTGTTAGGCACGCTGTTTGTGGTAATTAAAAAAAAATACTGTAACGCCTGACGATTTTCCCCGTTCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTCCCCTGCATCGCCCGCATTCTTGCCGCATTTTCCCCCGGCGTCACACCGAAGTAACGTTTAAACTCACGGCTAAATTGCGATGCGCTTTCATAGCCGACgcgcat > 2:647570‑M2/1‑276 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |