| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_000913 | = 3154351 | 160 (0.820) | 6 (0.030) | 5/460 | NT | 3.8% | coding (866/957 nt) | yqhC | transcriptional activator of yqhD |
| ? | NC_000913 | = 3154364 | 154 (0.820) | coding (853/957 nt) | yqhC | transcriptional activator of yqhD | |||||
Only 100 of 181 total aligned reads displayed.
AAGTATGATTCCGTTCGTTAAACGCCATGAAGATCAGGTAATGACGTTCCTGATGATCCTGCCAATTGCCTTGTTAA‑CCGCTGGCTTGTTAGGCACGCTGTTTGTGGTGATTAAAAAAAAATACTGTAACGCCTGACGATTTTCCCCGTTCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTCCCCTGCATCGCCCGCATTCTTGCCGCATCTTCCCCCGGCGTCACACCGAAGTAACGTTTAAACTCACGGCTAAATTGCGATGCGCTTTCATAGCCGACGCGCATCGCTGCTGCGCTGGCCTTCATGCCGTCATGGATGATCATCATCCGCGCCTTATGCAGACGGTAATTCTTCAAATACTGCAACGGCGAGGTACTGGTGACAGACTTAAAATTATGGTGGAACGCCGATACGCTCATGTTGGCTTCTGCCGCCAGTTGCTCGACGCTCAGGTTTTCGGTGTATTTATTCTCAATCCGTTTCAGCACGCGGCTAATCAGACTGAAGTGAGTCTGGCGACTGACCAGCGCCAGTAACGCGCCGCCGCAAGGTCCGGTCA > NC_000913/3154085‑3154645 | aaGTATGATTCCGTTCGTTAAACGCCATGAAGATCAGGTAATGACGTTCCTGATGATCCTGCCAATTGCCTTGTTAA‑CCGCTGGCTTGTTAGGCACGCTGTTTGTGGTGATTAAAAAAAAATACTGTAACGCCTGCCGATTTTCCCCGTTCCCGGTTGCTGTACGGGGAACGAATTTAATTCCCCTGACTCGCCCGCTTTCTGCCCGCATTTTCCCCCGGCGTCCCACCGAAGTAACGTTAAAACCCACGGATAAATTGCTATGCCCTTTAATACCCGACg < 1:1952998‑M2/281‑2 (MQ=255) 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tatTCCGTTCGTTAAACGCCATGAATATCATGGAATGGCGTTCCTGACTTTCCTGCCAATTGCCTTGTTAA‑CCGCTGGCTTGTTACGCACGCTGTTTGTGGTGATTAAAAAAAAAGACTTTACCGCCTGACGATTTTCCCCGTTCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTCCCCTGCATCGCCCGCATTCTTGCCGCATCTTCCCCCGGCGTCACACCGAAGTAACGTTTAAACTCACGGCTAAATTGCGATGCGCTTTCATAGCCGACgcgcatcg > 1:646853‑M2/2‑274 (MQ=255) gATTCCGTTCGTTAAACGCCATGAAGATCAGGTAATGACGTTCCTGATGATCCTGCCAATTGCCTTGTTAA‑CCGCTGGCTTGTTAGGCACGCTGTTTGTGGTGATTAAAAAAAAATACTGTAACGCCTGACGATTTTCCCCGTTCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTCCCCTGCATCGCCCGCATTCTTGCCGCATCTTCCCCCGGCGTCACACCGAAGTAACGTTTAAACTCACGGCTAAATTGCGATGCGCTTTCATAGCCGACgcgcatcg < 2:160731‑M2/282‑9 (MQ=255) ttcgttAAACGCCATGAAGATCAGGTAATGACGTTCCTGATGATCCTGCCAATTGCCTTGTTAA‑CCGCTGGCTTGTTAGGCACGCTGTTTGTGGTGATTAAAAAAAAATACTGTAACGCCTGACGATTTTCCCCGTTCCCGGTTGCTGTCCCGGGAACGTATTTAATTCCCCTGCATCGCCCGCATTCTTGCCGCATCTTCCCCCGGCGTCAAACCGAAGTAACGGTTAAACTCACGGCTAAATTGCGATGCGCTTTCATACCCGACGCGCATCgctgct > 2:1878678/1‑280 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |