| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | NC_000913 | 1251175 = | 42 (0.830) | 4 (0.080) | 4/472 | NT | 8.0% | coding (110/1920 nt) | dhaR | dhaKLM operon transcription activator |
| ? | NC_000913 | 1251499 = | 51 (1.050) | coding (434/1920 nt) | dhaR | dhaKLM operon transcription activator | |||||
AGCGATGCTGACGCTCGGGCAGGCTGCGCTGGAAGATGCCTGGGAATATATGGCACCGCGAGAGTGTGCGCTGTTTATCCTCGATGAAACCGCCTGCATTCTCAGCCGTAATGGCGATCCGCAAACCTTGCAGCAGCTAAGTGCACTGGGATTCAATGACGGCACGTATTGCGCCGAGGGAATTATTGGTACTTGTGCGCTATCGTTAGCGGCTATCTCTGGTCAGGCCGTGAAAACGATGGCCGATCAACATTTCAAACAGGTACTCTGGAACTGGGCCTTTTGTGCAACGCCGTTGTTTGACAGCAAGGGCCGATTGACGGGAACAATAGCGCTGGCGTGTCCGGTTGAGCAAACTACCGCAGCTGATTTGCCGTTGACGTTGGCAATCGCCCGCGAGGTCGGAAATTTACTGCTGACGGACAGTTTGCTCGCTGAAACTAACCGTCATTTAAATCAACTTAATGCCCTGTTAGAAAGTATGGATGATGGCGTGATTAGCTGGGACGAGCAGGGTAATTTGCAATTTATTAATGCCCAGGCGGCGCGGGTCTTGCGCCTTGAC > NC_000913/1251218‑1251782 | aGCGATGCTGACGCTCGGGCAGGCTGCGCTGGAAGATGCCTGGGAATATATGGCACCGCGAGAGTGTGCGCTGTTTATCCTCGATGAAACCGCCTGCATTCTCAGCCGTAATGGCGATCCGCAAACCTTGCAGCAGCTAAGTGCACTGGGATTCAATGACGGCACGTATTGCGCCGAGGGAATTATTGGTACTTGTGCGCTATCGTTAGCGGCTATCTCTGGTCAGGCCGTGAAAACGATGGCCGATCAACATTTCAAACAGGTACTCTGGAACTGGGCCTTTTGTGCa < 2:269539/289‑1 (MQ=255) cTGGAAGATGCCTGGGAATATATGGCACCGCGAGAGTGTGCGCTGTTTATCCTCGATGAAACCGCCTGCATTCTCAGCCGTAATGGCGATCCGCAAACCTTGCAGCAGCTAAGTGCACTGGGATTCAATGACGGCACGTATTGCGCCGAGGGAATTATTGGTACTTGTGCGCTATCGTTAGCGGCTATCTCTGGTCAGGCCGTGAAAACGATGGCCGATCAACATTTCAAACAGGTACTCTGGAACTGGGCCTTTTGTGCAACGCCGTTGTTTGACAGCAAGGGCCGAt > 1:319194/1‑289 (MQ=255) aGATGCCTGGGAATATATGGAACCGCGAGAGTGTGCGCTGTTTATCCTCGATGAAACCGCCTGCATTCTCAGCCGTAATGGCGATCCGCAAACCTTGCAGCAGCTAAGTGCACTGGGATTCAATGACGGCACGTATTGCGCCGAGGGAATTATTGGTACTTGTGCGCTATCGTTAGCGGCTATCTCTGGTCAGGCCGTGAAAACGATGGCCGATCAACATTTCAAACAGGTACTCTGGAACTGGGCCTTTTGTGCAACGCCGTTGTTTGACAGCAAGGGCCGATTGAc < 2:204163/288‑1 (MQ=255) ccatatattcccaggCACCGCGAGAGTGTGCGCTGTTTATCCTCGATGAAACCGCCTGCATTCTCAGCCGTAATGGCGATCCGCAAACCTTGCAGCAGCTAAGTGCACTGGGATTCAATGACGGCACGTATTGCGCCGAGGGAATTATTGGTACTTGTGCGCTATCGTTAGCGGCTATCTCTGGTCAGGCCGTGAAAACGATGGCCGATCAACATTTCAAACAGGTACTCTGGAACTGGGCCTTTTGTGCAACGCCg > 1:457083/14‑257 (MQ=255) ccatatattcccaggCACCGCGAGAGTGTGCGCTGTTTATCCTCGATGAAACCGCCTGCATTCTCAGCCGTAATGGCGATCCGCAAACCTTGCAGCAGCTAAGTGCACTGGGATTCAATGACGGCACGTATTGCGCCGAGGGAATTATTGGTACTTGTGCGCTATCGTTAGCGGCTATCTCTGGTCAGGCCGTGAAAACGATGGCCGATCAACATTTCAAACAGGTACTCTGGAACTGGGCCTTTTGTGCAACGCCg < 2:457083/244‑1 (MQ=255) ccatatattcccaggCACCGCGAGAGTGTGCGCTGTTTATCCTCGATGAAACCGCCTGCATTCTCAGCCGTAATGGCGATCCGCAAACCTTGCAGCAGCTAAGTGCACTGGGATTCAATGACGGCACGTATTGCGCCGAGGGAATTATTGGTACTTGTGCGCTATCGTTAGCGGCTATCTCTGGTCAGGCCGTGAAAACGATGGCCGATCAACATTTCAAACAGGTACTCTGGAACTGGGCCTTTTGTGCAACGCCg > 1:290482/14‑257 (MQ=255) ccatatattcccaggCACCGCGAGAGTGTGCGCTGTTTATCCTCGATGAAACCGCCTGCATTCTCAGCCGTAATGGCGATCCGCAAACCTTGCAGCAGCTAAGTGCACTGGGATTCAATGACGGCACGTATTGCGCCGAGGGAATTATTGGTACTTGTGCGCTATCGTTAGCGGCTATCTCTGGTCAGGCCGTGAAAACGATGGCCGATCAACATTTCAAACAGGTACTCTGGAACTGGGCCTTTTGTGCAACGCCg < 2:290482/244‑1 (MQ=255) attgatGGAACCGCGGCAGTGTGCGCTGTTTATCCTCCATGAAACCGCCTGCATTCTCAGCCTTAATGGCGATCCGCAAACCTTGCAGCAGCTAAGTGCACTGGGATTCAATGACGGCACGTATTGCGCCGAGGGAATTATTGGTACTTGTGCGCTATCGTTAGCGGCTATCTCTGGTCAGGCCGTGAAAACGATGGCCGATCAACATTTCAAACAGGTACTCTGGAACTGGGCCTTTTGTGCAACGCCGTTGTTTGACAGCAAGGGCCGATTGACGGGAACAATAgcg < 1:303364/285‑1 (MQ=255) atGGCACCGCGAGAGTGTGCGCTGTTTATCCTCGATGAAACCGCCTGCATTCTCAGCCGTAATGGCGATCCGCAAACCTTGCAGCAGCTAAGTGCACTGGGATTCAATGACGGCACGTATTGCGCCGAGGGAATTATTGGTACTTGTGCGCTATCGTTAGCGGCTATCTCTGGTCAGGCCGTGAAAACGATGGCCGATCAACATTTCAAACAGGTACTCTGGAACTGGGCCTTTTGTGCAACGCCGTTGTTTGACAGCAAGGGCCGATTGACGGGAACAATAGCGCTg > 2:430873/1‑288 (MQ=255) tGGCACCGCGAGAGTGTGCGCTGTTTATCCTCGATGAAACCGCCTGCATTCTCAGCCGTAATGGCGATCCGCAAACCTTGCAGCAGCTAAGTGCACTGGGATTCAATGACGGCACGTATTGCGCCGAGGGAATTATTGGTACTTGTGCGCTATCGTTAGCGGCTATCTCTGGTCAGGCCGTGAAAACGATGGCCGATCAACATTTCAAACAGGTACTCTGGAACTGGGCCTTTTGTGCAACGCCGTTGTTTGACAGCAAGGGCCGATTGACGGGAACAATAGCGCTGGc < 2:223776/289‑1 (MQ=255) 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ggTACTCTGGAACTGGGCCTTTTGTGCAACGCCGTTGTTTGACAGCAAGGGCCGATTGACGGGAACAATAGCGCTGGCGTGTCCGGTTGAGCAAACTACCGCAGCTGATTTGCCGTTGACGTTGGCAATCGCCCGCGAGGTCGGAAATTTACTGCTGACGGACAGTTTGCTCGCTGAAACTAACCGTCATTTAAATCAACTTAATGCCCTGTTAGACAGTATGGATGATGGCGTGATTAGCTGGGACGAGCAGGGTAATTTGCAATTTATTAATGCCCAGGCGGCGCgg > 2:191712/1‑289 (MQ=255) aCTCTGGAACTGGGCCTTTTGTGCAACGCCGTTGTTTGACAGCAAGGGCCGATTGACGGGAACAATAGCGCTGGCGTGTCCGGTTGAGCAAACTACCGCAGCTGATTTGCCGTTGACGTTGGCAATCGCCCGCGAGGTCGGAAATTTACTGCTGACGGACAGTTTGCTCGCTGAAACTAACCGTCATTTAAATCAACTTAATGCCCTGTT‑GAAAGTATTGATTATGGCGTGATTAAGTGGGACGGGGCAGGTAATTTGCAATTTATTTATTCCCAggccgccgcggt > 2:99414/1‑281 (MQ=255) tctGGAACTGGGCCTTTTGTGCAACGCCGTTGTTTGACAGCAAGGGCCGATTGACGGGAACAATAGCGCTGGCGTGTCCGGTTGAGCAAACTACCGCAGCTGATTTGCCGTTGACGTTGGCAATCGCCCGCGAGGTCGGAAATTTACTGCTGACGGACAGTTTGCTCGCTGAAACTAACCGTCATTTAAATCAACTTAATGCCCTGTTAGAAAGTATGGATGATGGCGTGATTAGCTGGGACGAGCAGGGTAATTTGCAATTTATTAATGCCCAGGCGGCGCGGGTCtt < 1:148236/289‑1 (MQ=255) ggcctTTTGTGCAACGCCGTTGTTTGACAGCAAGGGCCGATTGACGGGAACACTCGCGCTGGCGTGTCCGGTTGAGCACACTACCGCCGCTGATTTGCCGTTGACGTTGGCAATCGCCCGCGAGGTCGGACATTTACTGCTGACGGACAGTTTGCTCGCTGAAACTAACCGTCATTTAAATCAACTTAATGCCCTGTTAGAAAGTATGGATGATGGCGTGATTAGCTGGGACGAGCAGGGTAatttgcaatttattaatgccaaggcatcttccagcgcagcctgcccg > 2:62363‑M2/6‑267 (MQ=255) ggcctTTTGTGCAACGCCGTTGTTTGACAGCAAGGGCCGATTGACGGGAACAATAGCGCTGGCGTGTCCGGTTGAGCAAACTACCGCAGCTGATTTGCCGTTGACGTTGGCAATCGCCCGCGAGGTCGGAAATTTACTGCTGACGGACAGTTTGCTCGCTGAAACTAACCGTCATTTAAATCAACTTAATGCCCTGTTAGAAAGTATGGATGATGGCGTg < 2:311890‑M2/215‑1 (MQ=255) ggcctTTTGTGCAACGCCGTTGTTTGACAGCAAGGGCCGATTGACGGGAACAATAGCGCTGGCGTGTCCGGTTGAGCAAACTACCGCAGCTGATTTGCCGTTGACGTTGGCAATCGCCCGCGAGGTCGGAAATTTACTGCTGACGGACAGTTTGCTCGCTGAAACTAACCGTCATTTAAATCAACTTAATGCCCTGTTAGAAAGTATGGATGATGGCGTg > 1:311890‑M2/6‑220 (MQ=255) ggcctTTTGTGCAACGCCGTTGTTTGACAGCAAGGGCCGATTGACGGGAACAATAGCGCTGGCGTGTCCGGTTGAGCAAACTACCGCAGCTGATTTGCCGTTGACGTTGGCAATCGCCCGCGAGGTCGGAAATTTACTGCTGACGGACAGTTTGCTCGCTGAAACTAACCGTCATTTAAATCAACTTAATGCCCTGTTAGAAAGTATGGATGATGGCGTGATTAGCTGGGACGAGCAGGGTAATTTGCAAt < 2:343268‑M2/246‑1 (MQ=255) ggcctTTTGTGCAACGCCGTTGTTTGACAGCAAGGGCCGATTGACGGGAACAATAGCGCTGGCGTGTCCGGTTGAGCAAACTACCGCAGCTGATTTGCCGTTGACGTTGGCAATCGCCCGCGAGGTCGGAAATTTACTGCTGACGGACAGTTTGCTCGCTGAAACTAACCGTCATTTAAATCAACTTAATGCCCTGTTAGAAAGTATGGATGATGGCGTGATTAGCTGGGACGAGCAGGGTAATTTGCAAt > 1:343268‑M2/6‑251 (MQ=255) ggcctTTTGTGCAACGCCGTTGTTTGACAGCAAGGGCCGATTGACGGGAACAATAGCGCTGGCGTGTCCGGTTGAGCAAACTACCGCAGCTGATTTGCCGTTGACGTTGGCAATCGCCCGCGAGGTCGGAAATTTACTGCTGACGGACAGTTTGCTCGCTGAAACTAACCGTCATTTAAATCAACTTAATGCCCTGTTAGAAAGTATGGATGATGGCGTGATTAGCTGGGACGAGCAGGGTAATTTGCAATTTATTAATGCCCAGGCGGCGCGGGTCTTGCGCCTTGAc > 2:340254‑M2/6‑289 (MQ=255) ggcctTTTGTGCAACGCCGTTGTTTGACAGCAAGGGCCGATTGACGGGAACAATAGCGCTGGCGTGTCCGGTTGAGCAAACTACCGCAGCTGATTTGCCGTTGACGTTGGCAATCGCCCGCGAGGTCGGAAATTTACTGCTGACGGACAGTTTGCTCGCTGAAACTAACCGTCATTTAAATCAACTTAATGCCCTGTTAGAAAGTATGGATGATGGCGTGATTAGCTGGGACGAGCAGGGTAATTTGCAATTTATTAATGCCCAGGCGGCGCGGGTCTTGCGCCTTGAc > 2:55423‑M2/6‑289 (MQ=255) cctTTTGTGCAACGCCGTTGTTTGACAGCAAGGGCCGATTGACGGGAACAATAGCGCTGGCGTGTCCGGTTGAGCAAACTACCGCAg > 2:413319‑M2/4‑87 (MQ=255) cctTTTGTGCAACGCCGTTGTTTGACAGCAAGGGCCGATTGACGGGAACAATAGCGCTGGCGTGTCCGGTTGAGCAAACTACCGCAg < 1:413319‑M2/84‑1 (MQ=255) | AGCGATGCTGACGCTCGGGCAGGCTGCGCTGGAAGATGCCTGGGAATATATGGCACCGCGAGAGTGTGCGCTGTTTATCCTCGATGAAACCGCCTGCATTCTCAGCCGTAATGGCGATCCGCAAACCTTGCAGCAGCTAAGTGCACTGGGATTCAATGACGGCACGTATTGCGCCGAGGGAATTATTGGTACTTGTGCGCTATCGTTAGCGGCTATCTCTGGTCAGGCCGTGAAAACGATGGCCGATCAACATTTCAAACAGGTACTCTGGAACTGGGCCTTTTGTGCAACGCCGTTGTTTGACAGCAAGGGCCGATTGACGGGAACAATAGCGCTGGCGTGTCCGGTTGAGCAAACTACCGCAGCTGATTTGCCGTTGACGTTGGCAATCGCCCGCGAGGTCGGAAATTTACTGCTGACGGACAGTTTGCTCGCTGAAACTAACCGTCATTTAAATCAACTTAATGCCCTGTTAGAAAGTATGGATGATGGCGTGATTAGCTGGGACGAGCAGGGTAATTTGCAATTTATTAATGCCCAGGCGGCGCGGGTCTTGCGCCTTGAC > NC_000913/1251218‑1251782 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 10 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |