| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | NC_000913 | 755,709 | Δ75 bp | coding (150‑224/348 nt) | sdhD → | succinate dehydrogenase, membrane subunit, binds cytochrome b556 |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | NC_000913 | 755709 | 755783 | 75 | 40 [0] | [0] 40 | sdhD | succinate dehydrogenase, membrane subunit, binds cytochrome b556 |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 755708 | 0 (0.000) | 38 (1.050) | 33/238 | 0.2 | 100% | coding (149/348 nt) | sdhD | succinate dehydrogenase, membrane subunit, binds cytochrome b556 |
| ? | NC_000913 | 755784 = | 0 (0.000) | coding (225/348 nt) | sdhD | succinate dehydrogenase, membrane subunit, binds cytochrome b556 | |||||
TCCTCGTATGGTAAGCAACGCCTCCGCATTAGGACGCAATGGCGTACATGATTTCATCCTCGTTCGCGCTACCGCTATCGTCCTGACGCTCTACATCATTTATATGGTCGGTTTTTTCGCTACCAGTGGCGAGCTGACATATGAAGTCTGGATCGG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/755553‑755708‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ctggatcggCATGTGGCAGGTGTTGACCGACTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCTGATGCTGCAACTGGTGATTGTCGTTGCACTGGTGGTTTACGTGATTTATGGATTCGTTGTGGTGTGGGGTGTGTGATGAAATTGCCAGTCAGAGAATTT > NC_000913/755784‑755930 TCCTCGTATGGTAAGCAACGCCTCCGCATTAGGACGCAATGGCGTACATGATTTCATCCTCGTTCGCGCTACCGCTATCGTCCTGACGCTCTACATCATTTATATGGTCGGTTTTTTCGCTACCAGTGGCGAGCTGACATATGAAGTCT < 6:160453/149‑1 GTATGGTAAGCAACGCCTCCGCATTAGGACGCAATGGCGTACATGATTTCATCCTCGTTCGCGCTACCGCTATCGTCCTGACGCTCTACATCATTTATATGGTCGGTTTTTTCGCTACCAGTGGCGAGCTGACATATGAAGTCTGGA < 8:46171/147‑1 TGGTAAGCAACGCCTCCGCATTAGGACGCAATGGCGTACATGATTTCATCCTCGTTCGCGCTACCGCTATCGTCCTGACGCTCTACATCATTTATATGGTTGGTTTTTTCGCTACCAGTGGCGAGCTGACATATGAAGTC < 7:114878/140‑1 TGGTAAGCAACGCCTCAGCATTAGGACGCAATGGCGTACATGATTTCATCCTCGTTCGCGCTACCGCTATCGTCCTGACGCTCTACATCATTTATATGGTTGGTTTTTTCGCTACCAGTGGCGAGCTGACATATGAAGTC > 8:114878/1‑140 TAAGCAACGCCTCCGCATTAGGACGCAATGGCGTACATGATTTCATCCTCGTTCGCGCTACCGCTATCGTCCTGACGCTCTACATCATTTATATGGTCGGTTTTTTCGCTACCAGTGGCGAGCTGACATATGAAGTCTGGATCGGCATG > 4:136828/1‑149 GCAACGCCTCCGCATTAGGACGCAATGGCGTACATGATTTCATCCTCGTTCGCGCTACCGCTATCGTCCTGACGCTCTACATCATTTATATGGTCGGTTTTTTCGCTACCAGTGGCGAGCTGACATATGAAGTC < 1:84649/134‑1 GCAACGCCTCCGCATTAGGACGCAATGGCGTACATGATTTCATCCTCGTTCGCGCTACCGCTATCGTCCTGACGCTCTACATCATTTATATGGTCGGTTTTTTCGCTACCAGTGGCGAGCTGACATATGAAGTC > 2:84649/1‑134 ACGCCTCCGCATTAGGACGCAATGGCGTACATGATTTCATCCTCGTTCGCGCTACCGCTATCGTCCTGACGCTCTACATCATTTATATGGTCGGTTTTTTCGCTACCAGTGGCGAGCTGACATATGAAGTCTGGATCGGCATGTGGCAG < 3:136828/149‑1 CGCATTAGGACGCAATGGCGTACATGATTTCATCCTCGTTCGCGCTACCGCTATCGTCCTGACGCTCTACATCATTTATATGGTCGGTTTTTTCGCTACCAGTGGCGAGCTGACATATGAAGTCTGGATCGGCATGTGGCAGGTGTTGA < 5:1945/149‑1 TAGGACGCAATGGCGTACATGATTTCATCCTCGTTCGCGCTACCGCTATCGTCCTGACGCTCTACATCATTTATATGGTCGGTTTTTTCGCTACCAGTGGCGAGCTGACATATGAAGTCTGGATCGGCATGTGGCAGGTGTTGACCGAC > 7:87447/1‑149 AATGGCGTACATGATTTCATCCTCGTTCGCGCTACCGCTATCGTCCTGACGCTCTACATCATTTATATGGTCGGTTTTTTCGCTACCAGTGGCGAGCTGACATATGAAGTCTGGATCGGCATGTGGCAGGTGTTGACCGACTACGTTA > 4:84379/1‑148 AATGGCGTACATGATTTCATCCTCGTTCGCGCTACCGCTATCGTCCTGACGCTCTACATCATTTATATGGTCGGTTTTTTCGCTACCAGTGGCGAGCTGACATATGAAGTCTGGATCGGCATGTGGCAGGTGTTGACCGACTACGTTA > 3:143644/1‑148 ATGATTTCATCCTCGTTCGCGCTACCGCTATCGTCCTGACGCTCTACATCATTTATATGGTCGGTTTTTTCGCTACCAGTGGCGAGCTGACATATGAAGTCTGGATC < 7:138342/107‑1 ATGATTTCATCCTCGTTCGCGCTACCGCTATCGTCCTGACGCTCTACATCATTTATATGGTCGGTTTTTTCGCTACCAGTGGCGAGCTGACATATGAAGTCTGGATC > 8:138342/1‑107 TTCATCCTCGTTCGCGCTACCGCTATCGTCCTGACGCTCTACATCATTTATATGGTCGGTTTTTTCGCTACCAGTGGCGAGCTGACATATGAAGTCTGGATCGGCATGTGGCAGGTGTTGACCGACTACGTTAAACCGCTGGCTTTGC < 4:143644/148‑1 CATCCTCGTTCGCGCTACCGCTATCGTCCTGACGCTCTACATCATTTATATGGTCGGTTTTTTCGCTACCAGTGGCGAGCTGACATATGAAGTCTGGATCGGCATGTGGCAGGTGTTGACCGACTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGC < 8:147614/148‑1 CCTCGTTCGCGCTACCGCTATCGTCCTGACGCTCTACATCATTTATATGGTCGGTTTTTTCGCTACCAGTGGCGAGCTGACATATGAAGTCTGGATCGGCATGTGGCAGGTGTTGACCGACTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCTGA > 5:73194/1‑149 CCTCGTTCGCGCTACCGCTATCGTCCTGACGCTCTACATCATTTATATGGTCGGTTTTTTCGCTACCAGTGGCGAGCTGACATATGAAGTCTGGATCGGCATGTGGCAGGTGTTGACCGACTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCTGA > 5:156952/1‑149 TTCGCGCTACCGCTATCGTCCTGACGCTCTACATCATTTATATGGTCGGTTTTTTCGCTACCAGTGGCGAGCTGACATATGAAGTCTGGATCGGCATGTGGCAGGTGTTGACCGACTACGTTAAAC > 7:68971/1‑126 TTCGCGCTACCGCTATCGTCCTGACGCTCTACATCATTTATATGGTCGGTTTTTTCGCTACCAGTGGCGAGCTGACATATGAAGTCTGGATCGGCATGTGGCAGGTGTTGACCGACTACGTTAAAC < 8:68971/126‑1 CGCTACCGCTATCGTCCTGACGCTCTACATCATTTATATGGTCGGTTTTTTCGCTACCAGTGGCGAGCTGACATATGAAGTCTGGATCGGCATGTGGCAGGTGTTGACCGACTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCTGATGCTGCAAC < 3:84379/149‑1 CCGCTATCGTCCTGACGCTCTACATCATTTATATGGTCGGTTTTTTCGCTACCAGTGGCGAGCTGACATATGAAGTCTGGATCGGCATGTGGCAGGTGTTGACCGACTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCTGATGCTGCAACTGG < 8:87447/147‑1 ACGCTCTACATCATTTATATGGTCGGTTTTTTCGCTACCAGTGGCGAGCTGACATATGAAGTCTGGATCGGCATGTGGCAGGTGTTGACCGACTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCTGATGCTGCAACTGGTGATTGTCGTTGCAC < 6:73194/148‑1 ACGCTCTACATCATTTATATGGTCGGTTTTTTCGCTACCAGTGGCGAGCTGACATATGAAGTCTGGATCGGCATGTGGCAGGTGTTGACCGACTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCTGATGCTGCAACTGGTGATTGTCGTTGCAC < 6:156952/148‑1 TCTACATCATTTATATGGTCGGTTTTTTCGCTACCAGTGGCGAGCTGACATATGAAGTCTGGATCGGCATGTGGCAGGTGTTGACCGACTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCTGATGCTGCAACTGGTGATTGTCGTT > 8:120488/1‑140 TCTACATCATTTATATGGTCGGTTTTTTCGCTACCAGTGGCGAGCTGACATATGAAGTCTGGATCGGCATGTGGCAGGTGTTGACCGACTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCTGATGCTGCAACTGGTGATTGTCGTT < 7:120488/140‑1 TACATCATTTATATGGTCGGTTTTTTCGCTACCAGTGGCGAGCTGACATATGAAGTCTGGATCGGCATGTGGCAGGTGTTGACCGACTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCTGATGCTGCAACTGGTGATTGTCGTTGCACTGGTGGT > 1:122275/1‑149 CATCATTTATATGGTCGGTTTTTTCGCTACCAGTGGCGAGCTGACATATGAAGTCTGGATCGGCATGTGGCAGGTGTTGACCGACTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGC > 5:17132/1‑109 CATCATTTATATGGTCGGTTTTTTCGCTACCAGTGGCGAGCTGACATATGAAGTCTGGATCGGCATGTGGCAGGTGTTGACCGACTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGC < 6:17132/109‑1 GGTCGGTTTTTTCGCTACCAGTGGCGAGCTGACATATGAAGTCTGGATCGGCATGTGGCAGGTGTTGACCGACTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCTGATGCTGCAACTGGTGATTGTCGTTGCACTGGTGGTTTACGTGATTTATG > 6:168554/1‑149 GTCGGTTTTTTCGCTACCAGTGGCGAGCTGACATATGAAGTCTGGATCGGCATGTGGCAGGTGTTGACCGACTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCTGATGCTGCAACTGGTGATTGTCGTTGCACTGGTGGTTTACGTGATTTATGG < 4:155484/149‑1 GTCGGTTTTTTCGCTACCAGTGGCGAGCTGACATATGAAGTCTGGATCGGCATGTGGCAGGTGTTGACCGACTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCTGATGCTGCAACTGGTGATTGTCGTTGCACTGGTGGTTTACGTGATTTATG > 3:155484/1‑148 TCGGTTTTTTCGCTACCAGTGGCGAGCTGACATATGAAGTCTGGATCGGCATGTGGCAGGTGTTGACCGACTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCTGATGCTGCAACTGGTGATTGTCGTTGCACTGGTGGTTTACGTGATTTATGGA > 1:195091/1‑149 TCGGTTTTTTCGCTACCAGTGGCGAGCTGACATATGAAGTCTGGATCGGCATGTGGCAGGTGTTGACCGACTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCTGATGCTGCAACTGGTGATTGTCGTTGCACTGGTGGTTTACGTGATTTATGGA > 1:46702/1‑149 GGTTTTTTCGCTACCAGTGGCGAGCTGACATATGAAGTCTGGATCGGCATGTGGCAGGTGTTGACCGACTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCTGATGCTGCAACTGGTGATTGTCGTTGCACTGGTGGTTTACGTGATTTATGGATT > 6:120979/1‑149 TTTTCGCTACCAGTGGCGAGCTGACATATGAAGTCTGGATCGGCATGTGGCAGGTGTTGACCGACTACGTTAAACCGCTGGCTT > 6:79468/1‑84 TTCGCTACCAGTGGCGAGCTGACATATGAAGTCTGGATCGGCATGTGGCAGGTGTTGACCGACTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCTGATGCTGCAACTGGTGATTGTCGTTGCACTGGTGGTTTACGTGATTTAT > 2:154407/1‑138 TTCGCTACCAGTGGCGAGCTGACATATGAAGTCTGGATCGGCATGTGGCAGGTGTTGACCGACTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCTGATGCTGCAACTGGTGATTGTCGTTGCACTGGTGGTTTACGTGATTTAT < 1:154407/138‑1 TCGCTACCAGTGGCGAGCTGACATATGAAGTCTGGATCGGCATGTGGCAGGTGTTGACCGACTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCTGATGCTGCAACTGGTGATTGTCGTTGCACTGGTGGTTTACGTGATTTATGGATTCGTTGT < 2:122275/148‑1 TACCAGTGGCGAGCTGACATATGAAGTCTGGATCGGCATGTGGCAGGTGTTGACCGACTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCTGATGCTGCAACTGGTGATTGTCGTTGCACTGGTGGTTTACGTGATTTATGGATTCGTTGTGGTGT > 2:51495/1‑149 CAGTGGCGAGCTGACATATGAAGTCTGGATCGGCATGTGGCAGGTGTTGACCGACTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCTGATGCTGCAACTGGTGATTGTCGTTGCACTGGTGGTTTACGTGATTTATGGATTCGTTGTGGTGTGGG < 5:120979/149‑1 GCGAGCTGACATATGAAGTCTGGATCGGCATGTGGCAGGTGTTGACCGACTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCTGATGCTGCAACTGGTGATTGTCGTTGCACTGGTGGTTTACGTGATTTATGGATTCGTTGTGGTGTGGGGTGTG > 1:69979/1‑149 ACATATGAAGTCTGGATCGGCATGTGGCAGGTGTTGACCGACTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCTGATGCTGCAACTGGTGATTGTCGTTGCACTGGTGGTTTACGTGATTTATGGATTCGTTGTGGTGTGGGGTGTGTGATGA < 1:51495/147‑1 TGAAGTCTGGATCGGCATGTGGCAGGTGTTGACCGACTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCTGATGCTGCAACTGGTGATTGTCGTTGCACTGGTGGTTTACGTGATTTATGGATTCGTTGTGGTGTGGGGTGTGTGATGAAATTGCC < 2:69979/149‑1 AAGTCTGGATCGGCATGTGGCAGGTGTTGCCCGCCTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCTGATGCTGCAACTGGTGATTGTCGTTGCACTGGTGGTTTACGTGATTTATGGATTCGTTGTGGTGTGGGGTGTGTGATGAAATTGCCAG > 4:32609/1‑149 AGTCTGGATCGGCATGTGGCAGGTGTTGACCGACTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCTGATGCTGCAACTGGTGATTGTCGTTGCACTGGTGGTTTACGTGATTTATGGATTCGTTGTGGTGTGGGGTGTGTGATGAAATTGCCAGT > 1:154095/1‑149 TGGATCGGCATGTGGCAGGTGTTGACCGACTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCTGATGCTGCAACTGGTGATTGTCGTTGCACTGGTGGTTTACGTGATTTATGGATTCGTTGTGGTGTGGGGTGTGTGATGAAATTGCCAGTCA > 1:186362/1‑147 GGCATGTGGCAGGTGTTGACCGACTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCTGATGCTGCAACTGGTGATTGTCGTTGCACTGGTGGTTTACGTGATTTATGGATTCGTTGTGGTGTGGGGTGTGTGATGAAATTGCCAGTCAGAGAATTT < 2:195091/149‑1 TCCTCGTATGGTAAGCAACGCCTCCGCATTAGGACGCAATGGCGTACATGATTTCATCCTCGTTCGCGCTACCGCTATCGTCCTGACGCTCTACATCATTTATATGGTCGGTTTTTTCGCTACCAGTGGCGAGCTGACATATGAAGTCTGGATCGG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/755553‑755708‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ctggatcggCATGTGGCAGGTGTTGACCGACTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCTGATGCTGCAACTGGTGATTGTCGTTGCACTGGTGGTTTACGTGATTTATGGATTCGTTGTGGTGTGGGGTGTGTGATGAAATTGCCAGTCAGAGAATTT > NC_000913/755784‑755930 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |