| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 2070250 = | 108 (0.570) | 3 (0.020) | 3/460 | NT | 2.7% | noncoding (22/1331 nt) | IS2 | repeat region |
| ? | NC_000913 | 2070480 = | 116 (0.630) | intergenic (+6/‑180) | yoeA/yeeP | CP4‑44 prophage; putative disrupted hemin or colicin receptor;Phage or Prophage Related; interrupted by IS2 and C‑terminal deletion/pseudogene, CP4‑44 prophage; 50S ribosome‑binding GTPase family;Phage or Prophage Related; putative histone | |||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 130 total aligned reads displayed.
TAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAGTGGCGAAGCATCCTCCCGTGTTTTAATTCTCATTGATGGTCAGGAGGTAACTTATCAGCGCGCCGGAGATAATTATGGTGTGGGACTGTTGATAGATGAGTCTGCGCTGGAGCGTGTTGAGGTAGTGAAAGGTCCATATTCCGTACTGTACGGTTCACAGGCAATTGGCGGTATTGTTAACTTCATCACCAAAAAGGGTGAATCTCCGGACTCCCTATATCACTTAAAT‑‑‑TG‑‑‑‑‑‑‑‑‑ATACAACTTTTTAGAGTAGTCATTAGTGAACAGATAATTGATAACTCAGAACCAGTAAAATGCAAAAGACGCACCACGCTGGGAAAATCGCTGCTATTCAGCAGAGTTTTGTATCG‑AGAATGGTGGCCAGCCACTTATTGCTCTCGCGTAAGCGGGTACCGTGACATTCTGCCTGAACTTGACCTGGTACTGTGGCTGATTAAAGCCGATGACCGTGCCCTGTCTGTGGATGAGTATTTCTGGCGACACA > NC_000913/2070201‑2070753 | aaaaaCTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAGTGGCGAAGCATCCTCCCGTGTTTTAATTCTCATTGATGGTCAGGAGGTAACTTATCAGCGCGCCGGAGATAATTATGGTGTGGGACTGTTGATAGATGAGTCTGCGCTGGAGCGTGTTGAGGTAGTGAAAGGTCCATATTCCGTACTGTACGGTTCACAGGCAATTGGCGGTATTGTTAACTTCATCACCAAAAAGGGTGAATCTCCGGa < 1:419006/281‑1 (MQ=255) 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ggtgaacatccGGACTCCCTATATCACTTAAAT‑‑‑TG‑‑‑‑‑‑‑‑‑ATACAACGTTTTAAAGTAGTCATTAGTGAACAGATAATTGATAACACAGAACCAGTAAAATGCAAGAGACGCACCACGCTGGGAAAATCGCTGCTATTCAGCAGAGTTTTGTATCG‑AGAATGGTGGCCAGCCACTTATTGCTCTCGCGTAAGCGGGTACCGTGACATTCTGCCTGAACTTGACCTGGTACTGTGGCTGATTAAAGCCGATGACCGTGCCCTGTCTGTGGATGAGTATTTCTGGCGac < 2:644969‑M2/271‑1 (MQ=255) ggTGAATCTCCGGACTCCCTATATCACTTAAAT‑‑‑TG‑‑‑‑‑‑‑‑‑ATACAACTTTTTAGAGTAGTCATTAGTGAACAGATAATTGATAACTCAGAACCAGTAAAATGCAAAAGACGCACCACGCTGGGAAAATCGCTGCTATTCAGCAGAGTTTTGTATCG‑AGAGTGGTGGCCAGCCACTTATTGCTCTCGCGTAAGCGGGTACCGTGACATTCTGCCTGAACTTGACCTGGTACTGTGGCTGATTAAAGCCGATGACCGTGCCCTGTCTGTGGATGAGTATTTCTGGc > 1:679925/1‑279 (MQ=255) tgaatctccGGACTCCCTATATCACTTAAAT‑‑‑TG‑‑‑‑‑‑‑‑‑ATACAACTTTTTAGAGTAGTCATTAGTGAACAGATAATTGATAACTCAGAACCAGTAAAATGCAAAAGACGCACCACGCTGGGAAAATCGCTGCTATTCAGCAGAGTTTTGTATCG‑AGAATGGTGGCCAGCCACTTATTGCTCTCGCGTAAGCGGGTACCGTGACATTCTGCCTGAACTTGACCTGGTACTGTGGCTGATTAAAGCCGATGACCGTGCCCTGTCTGTGGATGAGTATTTCTGGCGacac < 1:1540610‑M2/273‑1 (MQ=255) gaatctccGGACTCCCTATATCACTTAAAT‑‑‑TG‑‑‑‑‑‑‑‑‑ATACAACTTTTTAGAGTAGTCATTAGTGAACAGATAATTGATAACTCAGAACCAGTAAAATGCAAAAGACGCACCACGCTGGGAAAATCGCTGCTATTCAGCAGAGTTTTGTATCG‑AGAATGGTGGCCAGCCACTTATTGCTCTCGCGTAAGCGGGTACCGTGACATTCTGCCTGAACTTGACCTGGTACTGTGGCTGATTAAAGCCGATGACCGTGCCCTGTCTGTGGATGAGTATTTCTGGCGAcaca < 2:457880‑M2/274‑1 (MQ=255) | TAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAGTGGCGAAGCATCCTCCCGTGTTTTAATTCTCATTGATGGTCAGGAGGTAACTTATCAGCGCGCCGGAGATAATTATGGTGTGGGACTGTTGATAGATGAGTCTGCGCTGGAGCGTGTTGAGGTAGTGAAAGGTCCATATTCCGTACTGTACGGTTCACAGGCAATTGGCGGTATTGTTAACTTCATCACCAAAAAGGGTGAATCTCCGGACTCCCTATATCACTTAAAT‑‑‑TG‑‑‑‑‑‑‑‑‑ATACAACTTTTTAGAGTAGTCATTAGTGAACAGATAATTGATAACTCAGAACCAGTAAAATGCAAAAGACGCACCACGCTGGGAAAATCGCTGCTATTCAGCAGAGTTTTGTATCG‑AGAATGGTGGCCAGCCACTTATTGCTCTCGCGTAAGCGGGTACCGTGACATTCTGCCTGAACTTGACCTGGTACTGTGGCTGATTAAAGCCGATGACCGTGCCCTGTCTGTGGATGAGTATTTCTGGCGACACA > NC_000913/2070201‑2070753 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 10 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |