| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | NC_000913 | 1,978,503 | Δ776 bp | insB1–insA | insB1, insA | |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | NC_000913 | 1978503–1979270 | 1979278 | 9–776 | 108 [0] | [0] 108 | insB1–insA | insB1,insA |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 1978502 | 0 (0.000) | 102 (1.440) | 78/264 | 0.0 | 100% | intergenic (‑305/+16) | flhD/insB1 | flagellar class II regulon transcriptional activator, with FlhC/IS1 transposase B |
| ? | NC_000913 | 1979279 = | 0 (0.000) | intergenic (‑64/‑474) | insA/uspC | IS1 repressor TnpA/universal stress protein | |||||
Only 100 of 108 total aligned reads displayed.
GTCTTTACACTTATCTAAGATTTTTCCTAAATCGACGCAACTGTACTCGTCACTACACGCACATACAACGGAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATGCGTGATGCAGATCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGATTCAGGTTATGCCG > NC_000913/1978363‑1978643 | ttcTTTATACTTATCTAAGATTTTTCATAAATAGATGCAACTGTACTCGTCACTACACGCACATATAACAAAGGGGAGATGCGATTTTCAATAATGCGTGATGCAGATCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGtat < 2:621579‑M1/142‑4 (MQ=255) cTTTACACTTATCTAAGATTTTTCCTAAATCGACGCAACTGTACTCGTCACTACACGCACATACAACGGAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATGCGTGATGCAGATCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGtataa > 1:756610‑M1/1‑138 (MQ=255) tttACACTTATCTAAGATTTTTCCTAAATCGACGCAACTGTACTCGTCACTACACGCACATACAACGGAGGGGGGCTGCGATTCTCAATAATCCGCGATGCAGACCACACAACACACTCAATTACTTAACATAAATGtataag > 2:597403‑M1/1‑137 (MQ=255) ttcacacttaTCTAAGACTTTTCCTAAATCGACGCAACTGTACTCGTCACTACACGCACATACAACGGAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATGCGTGATGCAGATCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGtataag < 1:397201‑M1/140‑7 (MQ=255) ttACACTTATCTAAGATTGTTCCTAAATCGACGCAACTGTACTCGTCACTACACGCACATACAACGGAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATGCGTGATGCAGATCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGtataagt < 1:329567‑M1/143‑8 (MQ=255) tACACTTATCTAAGATTTTTCCTAAATCGACGCAACTGTACTCGTCACTACACGCACATACAACGGAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATGCGTGATGCAGATCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGtataagtc > 1:369190‑M1/1‑135 (MQ=255) tACACTTATCTAAGATTTTTCCTAAATCGACGCAACTGTACTCGTCACTACACGCACATACAACGGAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATGCGTGATGCAGATCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGtataagta > 1:847338‑M1/1‑135 (MQ=255) acTTATCTAAGATTTTTCCTAAATCGACGCAACTGTACTCGTCACTACACGCACATACAACGGAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATGCGTGATGCAGATCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGtataagtgata > 1:126959‑M1/1‑132 (MQ=255) cTTATCTAAGATTTTTCCTAAATCGACGCAACTGTACTCGTCACTACACGCACATACAACGGAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATGCGTGATGCAGATCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGtataagtcatac < 2:194333‑M1/143‑13 (MQ=255) cTTATCTAAGATTTTTCCTAAATCGACGCAACTGTACTCGTCACTACACGCACATACAACGGAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATGCGTGATGCAGATCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGtataagtcatac < 2:298602‑M1/143‑13 (MQ=255) ttATCTAAGATTTTTCCTAAATCGACGCAACTGTACTCGTCACTACACGCACATACAACGGAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATGCGTGATGCAGATCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGtataagtcatact < 1:493323‑M1/143‑14 (MQ=255) ttATCTAAGATTTTTCCTAAATCGACGCAACTGTACTCGTCACTACACGCACATACAACGGAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATGCGTGATGCAGATCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGtataagtcatact > 1:403583‑M1/1‑130 (MQ=255) ttATCTAAGATTTTTCCTAAATCGACGCAACTGTACTCGTCACTACACACACTGACAACGGAGGGGGGCTGCGATTTCCAATAATGCGTGATGCCGATGACTCAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGtataagtcatgct > 1:845352‑M1/1‑130 (MQ=255) tAAGATTTTTCCTAAATCGACGCAACTGTACTCGTCACTACACGCACATACAACGGAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATGCGTGATGCAGATCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGtataagtcatacttttgt > 1:430083‑M1/1‑125 (MQ=255) aaGATTTTTCCTAAATCGACGCAACTGTACTCGTCACTACACGCACATACAACGGAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATGCGTGATGCAGATCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGtataagtcatacttttgtt > 2:103612‑M1/1‑124 (MQ=255) aaGATTTTTCCTAAATCGACGCAACTGTACTCGTCACTACACGCACATACAACGGAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATGCGTGATGACGACCACACAAAACACTAAACTACATTACATAAATGtataagtcatactatttat > 2:883806‑M1/1‑124 (MQ=255) aGATTTTTCCTAAATCGACGCAACTGTACTCGTCACTACACGCACATACAACGGAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATGCGTGATGCAGATCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGtataagtcatacttttgttt > 2:3636‑M1/1‑123 (MQ=255) aGATTTTTCCTAAATCGACGCAACTGTACTCGTCACTACACGCACATACAACGGAGGGGGGCGGCGATTTTCAATAATGCGTGATGCAGATCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGtataagtcatacttttgttt > 1:1015235‑M1/1‑123 (MQ=255) aTTTTTCCTAAATCGACGCAACTGTACTCGTCACTACACGCACATACAACGGAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATGCGTGATGCAGATCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGtataagtcatacttttgttttg < 2:234073‑M1/143‑23 (MQ=255) aTTTTTCCTAAATCGACGCAACTGTACTCGTCACTACACGCACACACAACGCAGGGGGGCTGCGATATTCAATAATGCGTGATACAGATCACACAAAACACTCAATTACTTAACATTAATGtatacatcatacaattgatttg > 2:1082984‑M1/1‑121 (MQ=255) tttttGCTAAATCGACGCAACTGTACTCGTCAATACACGCACATACAACGGAGGGGGGCTGAGCGTTTCAGTAATGCGTGATGCAGATCACATAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGtataagtcatacttttgttttgg < 2:474702‑M1/143‑24 (MQ=255) tttttCCTAAATCGACGCAACTGTACTCGTCACTACACGCACATACAACGGAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATGCGTGATGCAGATCACACAAACCACTCAATTACTTAACATAAATGtataagtcatacttttggtttgg < 2:1124712‑M1/143‑24 (MQ=255) tttttCCTAAATCGACGCAACTGTACTCGTCACTACACGCACATACAACGGAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATGCGTGATGCAGATCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGtataagtcatacttttgttttgg < 2:1112046‑M1/143‑24 (MQ=255) ttCCTAAATCGACGCAACTGTACTCGTCACTACACGCACATACAACGGAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATGCGTGATGCAGATCACACAAAAAAATCAATTACCTAACATAAATGtataagtcatacttttgctttcggtg > 2:955020‑M1/1‑117 (MQ=255) cTAAATCGACGCAACTGTACTCGTCACTACACGCACATACAACGGAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATGCGTGATGCAGATCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGtataagtcatacttttgttttgggtgtat > 1:158913‑M1/1‑114 (MQ=255) tAAATCGACGCAACTGTACTCGTAACAACACGCACATACAACGGAGGGGGGCTGCGACTTTCAATAATGCGTGATGCAGATCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGtataagtcatacttttgttttgggtgtatt > 1:576313‑M1/1‑113 (MQ=255) tCGACGCAACTGTACTCGTCACTACACGCACATACAACGGAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATGCGTGATGCAGATCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGtataagtcatacttttgttttgggtgtatttcaa < 2:498938‑M1/143‑35 (MQ=255) cgacgaCACGGTCCTCGTCACTACACGAAAATAGCAGTGGGGGGGGCTGCAATTTCCAATAATGCGTGATGCAGATCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGtataagtcatacttttgttttgggtgtatttcaac < 2:831407‑M1/143‑36 (MQ=255) cGACGCAACTGTACTCGTCACTACACGCACATACAACGGAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATGCGTGATGCAGATCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGtataagtcatacttttgttttgggtgtatttcaat < 2:157555‑M1/143‑36 (MQ=255) aCGCAACTGTACTCGTCACTACACGCACATACAACGGAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATGCGTGATGCAGATCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGtataagtcatacttttgttttgggtgtatttcaatct < 1:938999‑M1/143‑38 (MQ=255) ctcaaCCGTACTCGTCACTACACGCACATACAACGGAGGGGGGTTCCGATTTTCAATAATGCGTGATGCATATCACACAAAACACTCCATTACTTAACATAAATGtataactcatacttttgttttgggtgtatttcaatctg < 1:939960‑M1/141‑39 (MQ=255) cgactGCACTCGGCACTACACGCACATCCAACGGCGGGGGACCACAATCTTCAATAATGCGTGATGCAGATCACACAAAACACTCAATTACGTAACATAAATGtataagtcatacttttgttttgggtgtatttcaatctgtt < 2:954066‑M1/141‑41 (MQ=255) cAACTGTACTCGTCACTACACGCACATACAACGGAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATGCGTGATGCAGATCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGtataagtcatacttttgttttgggtgtatttcaatctgtt < 2:703227‑M1/143‑41 (MQ=255) cAACTGTACTCGTCACTACACGCACATACAACGGAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATGCGTGATGCAGATCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGtataagtcatacttttgttttgggtgtatttcaatctgtt < 2:1164846‑M1/143‑41 (MQ=255) aaCTGTACTCGTCACTACACGCACATACAACGGAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATGCGTGATGCAGATCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGtataagtcatacttttgttttgggtgtatttcaatctgtta > 2:621092‑M1/1‑102 (MQ=255) tGTACTCGTCACTACACGCACATACAACGGAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATGCGTGATGCAGATCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGtataagtcatacttttgttttgggtgtatttcaatctgttaaaa > 1:87499‑M1/1‑99 (MQ=255) tACTCGTCACTACACGCACATACAACGGAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATGCGTGATGCAGATCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGtataagtcatacttttgttttgggtgtatttcaatctgttaaaaag > 2:1010947‑M1/1‑97 (MQ=255) cTCGTCACTACACGCGCATACAACGGAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATGCGTGATGCAGATCACACAAAACACTCGATTACTTAACATAAATGtataagtcatacttttgttttgggtgtatttcaatctgttaaaaagtt < 2:578486‑M1/143‑49 (MQ=255) tCGTCACTACACGCACATACAACGGAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATGCGTGATGCAGATCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGtataagtcatacttttgttttgggtgtatttcactccgttaaacagttt > 1:28922‑M1/1‑94 (MQ=255) tCGTCACTACACGCACATACAACGGAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATGCGTGATGCAGATCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGtataagtcatacttttgttttgggtgtatttcaatctgttaaaaagttt > 1:1021891‑M1/1‑94 (MQ=255) tCGTCACTACACGCACATACAACGGAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATGCGTGATGCAGATCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGtataagtcatacttttgttttgggtgtatttcaatctgttaaaaagttt < 1:408428‑M1/143‑50 (MQ=255) gTCACTACACGCACATACAACGGAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATGCGTGATGCAGATCACACAAAACACTCGATTACTTAACATAAATGtataagtcatacttttgttttgggtgtatttcaatctgttaaaaagttttt > 2:539766‑M1/1‑92 (MQ=255) gTCACTACACGCACATACAACGGAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATGCGTGATGCAGATCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGtataagtcatacttttgttttgggtgtatttcaatctgttaaaaagttttt > 1:372446‑M1/1‑92 (MQ=255) gTCACTACACGCACATACAACGGAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATGCGTGATGCAGATCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGtataagtcatacttttgttttgggtgtatttcaatctgttaaaaagttttt < 2:369190‑M1/143‑52 (MQ=255) cACGACACGCACATACTACGCAGGGCGGCTGCGATTTTCAATAATGCGTGATGCAGATCACATAAAACACTTAATTACTTAACATAAATGtataagtcatacttttgttttgggtgtatttcaatctgttaaaaagtttttcg < 2:377070‑M1/143‑54 (MQ=255) cTACACGCACATACAACGGAGGGGGGCTGCGATTTTCAATACTGCAAGATGCAGATCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGtataagtcatacttttgttttgggtgtatgtcaatctgttaaaaagtttttcggt > 2:739445‑M1/1‑88 (MQ=255) tcaacgaaCATACAATGGAGGGGGGCTGAGATTTTCAATAATGCGTGATACAGAACACACAAAACACTCAATTACGAAACATAAATGtataagtcatacttttgttttgggtgtatttcaatctgttaaaaagtttttcgcta < 2:907775‑M1/140‑57 (MQ=255) gCACATACAACGGAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATGCGTGATGCAGATCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGtataagtcatacttttgttttgggtgtatttcaatctgttaaaaagtttttcgctacgtta > 2:632028‑M1/1‑82 (MQ=255) gCACATACAACGGAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATGCGTGATGCAGATCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGtataagtcatacttttgttttgggtgtatttcaatctgttaaaaagtttttcgctacgcta > 2:67826‑M1/1‑82 (MQ=255) aTACAACGGAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATGCGTGATGCAGATCACACAAAACACTCAATTACTTAACCTAAATGtatacgtcatacttttgttttgggtgtatttcaatctgttaaaaagtttttcgctacgctagcaa > 1:85730‑M1/1‑78 (MQ=255) aTACAACGGAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATGCGAGATGCAGATCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAACGcacaagccatactcttgccttaggtgtatttcaatctgataaaaagtttttcgctaccctagcaa > 2:1179990‑M1/1‑78 (MQ=255) tACAACGGAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATGCGTGATGCAGATCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGtataagtcatacttttgttttgggtgtatttcaatctgttaaaaagttttttgctacgctagcaag > 2:1040030‑M1/1‑77 (MQ=255) aaCGGAGGGGGGCTGCGATTTTCACTAATGCGTGATGCAGATCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGtataagtcatacttttgttttgggtgtatttcaatctgttaaaaagtttttcgctacgctagcaagcaa > 2:746391‑M1/1‑74 (MQ=255) aaCGGAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATGCGTGATGCAGATCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGtataagtcatacttttgttttgggtgtatttcaatctgttaaaaagtttttcgctacgctagcaagcaa < 1:171584‑M1/143‑70 (MQ=255) ccgagGGGGGCTGCGATTTTCAATAATGCGTGATGCAGATCACACAAAACACTTAATTACTTAACATAAATGtataagtcatacttttgttttgggtgtatttcaatctgttaaaaagtttttcgctacgctagcaagcaaaa < 2:751214‑M1/141‑72 (MQ=255) cGGAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATCCGTGATGCAGATCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGtataagtcatacttttgtttttggtgtatttaaatctattaaaaagcttttcgctacgctatcacgcaata > 2:942326‑M1/1‑72 (MQ=255) gAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATGCGTGATGCAGATCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGtataagtcatacttttgttttgggtgtatttcaatctgttaaaaagtttttcgctacgctagcaagcaaaaat > 1:474485‑M1/1‑70 (MQ=255) cgggggtcTGCGATTTTCAATAATGCGTGATGCAGATCACACAAAACTCTCAATTACTTAACATAAATGtataagtcatacttttgttttgggtgtatttcaatctgttaaaaagtttttcgctacgctagcaagcaaaaatg < 1:1296694‑M1/142‑75 (MQ=255) aGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATGCGTGATGCAGATCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGtataagtcatacttttgatttgggtgtatttcaatctgttaaaaagtaaatagccaccctttcaaccaaaaatg > 1:909350‑M1/1‑69 (MQ=255) gggggCTGCGATTTTCAATAATGCGTGATGCAGATCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGtataagtcatacttttgttttgggtgtatttcaatctgttaaaaagtttttcgctacgctagcaagcaaaaatgaa < 2:183174‑M1/143‑77 (MQ=255) gggggCTGCGATTTTCAATAATGCGTGATGCAGATCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGtataagtcatacttttgttttgggtgtatttcaatctgttaaaaagtttttcgctacgctagcaagcaaaaatgaa < 1:103612‑M1/143‑77 (MQ=255) gCTGCGATTTTCAATAATGCGTGATGCAGATCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGtataagtcatacttttgttttgggtgtatttcaatctgttaaaaagtttttcgctacgctagcaagcaaaaatgaaacag < 1:359326‑M1/143‑81 (MQ=255) cTGCGACTTGCAATAATGCGTGATGCAGATCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGtataagtcatacttttgttttgggtgtatttcaatctgttaaaaagtttttcgctacgctagcaagcaaaaatgaaacagg < 1:976934‑M1/143‑82 (MQ=255) gATTTTCAATAATGCGTGATGCAGATCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGtataagtcatacttttgttttgggtgtatttcaatctgttaaaaagtttttcgctacgctagcaagcaaaaatgaaacaggaata > 1:581946‑M1/1‑58 (MQ=255) cAATAATGCGTGATGCAGATCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGtataagtcatactcttgttttgggtgtatttcaatctgttaaaaagtttttcgctacgctagcaagcaaaactgaaacaggcataatcgaa > 2:894915‑M1/1‑52 (MQ=255) aataatGCGTGATGCAGATCACAAAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGtataagtcatacttttgttttgggtgtatttcaatctgttaaaaagtttttcgctacgctagcaagcaaaaatgaaacaggaataatcgaaa > 2:166066‑M1/1‑51 (MQ=255) ataatGCGTGATGCAGATCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGtataagtcatacttttgttttgggtgtatttcaatctgttaaaaagtttttcgctacgctagcaagcaaaaatgaaacaggaataatcgaaat > 1:355292‑M1/1‑50 (MQ=255) taatGCGTGATGCAGATCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGtataagtcatacttttgttttgggtgtatttcaatctgttaaaaagtttttcgctacgctagcaagcaaaaatgaaacaggaataatcgaaatg > 1:332189‑M1/1‑49 (MQ=255) aatGCGTGATGCAGATCAGACAAAACATTCAAGTACTTAACGTAAATGtataaggcatacttttgttttgcgtgtatttaaatctgttaaaaagtttttcgctacgctagcaagcaaaaatgaaacaggaataatcgaaatgg < 2:867836‑M1/143‑96 (MQ=255) atGTGTGATGCAGATCACACAAAACACTCAATTACTCACCATAAATGtataattcatacttttgttttgggtgtatttcaatctgttaaaaagtttttcgctacgctagcaagcaaaaatgaaacagcaataatcgacatggg > 1:1285716‑M1/1‑47 (MQ=255) atGCGTGATGCAGATCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGtataagtcatacttttgttttgggtgtatttcaatctgttaaaaagtttttcgctacgctagcaagcaaaaatgaaacaggaataatcgaaatggg > 2:793045‑M1/1‑47 (MQ=255) cGTGATGCAGATCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGtataagtcatacttttgttttgggtgtatttcaatctgttaaaaagtttttcgctacgctagcaagcaaaaatgaaacaggaataatcgaaatgggatg < 2:87499‑M1/143‑100 (MQ=255) tGATGCAGTTCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAACGtataagtcatacttttgttttgggtgtatttcaatctgttaaaaagtttttcgctacgctagcaagcaaaaatgaaacaggaataatcgaaatgggatgtt < 2:1042756‑M1/143‑102 (MQ=255) aGATCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGtataagtcatacttttgttttgggtgtatttcaatctgttaaaaagttattggctacgctaacaagaaaaaatgaaacagaaatgatggaaatggaatgttgcgaaa > 2:337872‑M1/1‑36 (MQ=255) gATCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGtataagtcatacttttgttttgggtgtatttcaatctgttaaaaagtttttcgctacgctagcaagcaaaaatgaaacaggaataatcgaaatgggatgttgcgcaca < 1:3636‑M1/143‑109 (MQ=255) aTCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGtatacgtcatccttttgttttgggtgtatttcaatctgttaaaaagtttttcgctacgataccaatcaaaaaagaaacagtaagactcacactaggatgttgctcacag > 2:881424‑M1/1‑34 (MQ=255) tCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGtataagtcatacttttgttttgggtgtatttcaatctgttaaaaagtttttcgctacgctagcaagcaaaactgaaacaggaataatcgaaatgggatgttgcgcacagt > 1:67273‑M1/1‑33 (MQ=255) acaAAACACTCAATTACTTAACATAAATGtataagtcatacttttgttttgggtgtatttcaatctgttaaaaagtttttcgctacgctagcaagcaaaaatgaaacaggaataatcgaaatgggatgttgcgcacagtcaaa > 2:79761‑M1/1‑29 (MQ=255) acaAAACACTCAATTACTTAACATAAATGtataagtcatacttttgttttgggtgtatttcaatctgttaaaaagtttttcgctacgctagcaagcaaaaatgaaacaggaataatcgaaatgggatgttgcgcacagtcaaa > 1:936768‑M1/1‑29 (MQ=255) acaAAACACTCAATTACTTAACATAAATGtataagtcatacttttgttttgggtgtatttcaatctgttaaaaagtttttcgctacgctagcaagcaaaaatgaaacaggaataatcgaaatgggat > 1:1177539‑M1/1‑29 (MQ=255) acaAAACACTCAATTACTTAACATAAATGtataagtcatacttttgttttgggtgtatttcaatctgttaaaaagtttttcgctacgctagcaagcaaaaatgaaacaggaataatcgaaatgggat < 2:1177539‑M1/127‑99 (MQ=255) aaaaCACTCAATTACTTAACATAAATGtataagtcatacttttgttttgggtgtatttcaatctgttaaaaagtttttcgctacgctagcaagcaaaaatgaaacaggaataatcgaaatgggatgttgcgcacagtcaaaat > 1:737175‑M1/1‑27 (MQ=255) aaCACTCAATTACTTAACATAAATGtataagtcatacttttgttttgggtgtatttcaatctgttgtcgcagttctcgctacgaccgcatgcaaaaatgaaacaggaataatcgaaatgggatgttgcgcacagtcaaaataa < 1:991591‑M1/143‑119 (MQ=255) aaCACTCAATTACTTAACATAAATGtataagtcatacttttgttttgggtgtattacaatctgttaaaaagtttttcgctacgctagcaagcaaaaatgaaacaggaataatcgaaatgggatgttgcgcacagtcaaaataa > 2:369165‑M1/1‑25 (MQ=255) aaCACTCAATTACTTAACATAAATGtataagtcatacttttggtttgggtgtatttcaatctgttaaaaagtttttcgctacgctagcaagcaaaaatgaaacaggaataatcgaaatgggatgttgcgcacagtcaaaataa < 1:613458‑M1/143‑119 (MQ=255) aaCACTCAATCACTCAACACAAATGtataagtcatacttttgttttgggtgtatttcaatctgttaaaaagtttttcgctacgctagcaagcaaaaatgaaacaggaataatcgaaatgggatgttgcgcacagtcaaaataa < 1:708270‑M1/143‑119 (MQ=255) cacTCAATTTCTTAGCAGAAATGtataagtcatacttttgttttgggtgtatttcaatctgttaaaaagtttttcgctacgctagcaagcaaaaatgaaacaggaataatcgaaatgggatgttgcgcacagtcaaaataact < 1:837331‑M1/143‑121 (MQ=255) acTCAATTACTTAACATAAATGtataagtcatacttttgttttgggtgtatttcaatctgttaaaaagtttttcgctacgctagcaagcaaaaatgaaacaggaataatcgaaatgggatgttgcccacagtcaaaataactc > 2:1204933‑M1/1‑22 (MQ=255) cTCAAGTACTTAACATAAATGtataagtcatacttttgttttgggtgtatttcaatctgttaaaaagtttttcgctacgctagcaagcaaaaatgaaacaggaataatcgaaatgggatgttgcgcacagtcaaaataactca < 1:1256056‑M1/143‑123 (MQ=255) tCAATTACTTAACATAAATGtataagtcatacttttgttttgggtgtatttcaatctgttaaaaagtttttcgctacgctagcaagcaaaaatggataagggataatcgaaatgggatgttgcgcacagtcacaataactcat > 1:1041693‑M1/1‑20 (MQ=255) tCAATTACTTAACATAAATGtataagtcatacttttgttttgggtgtatttcaatctgttaaaaagtttttcgctacgctagcaagcaaaaatgaaacaggaataatcgagatgggatgttgcgcgcagtcaaaataagtcac > 1:334446‑M1/1‑20 (MQ=255) tCAATTACTTAACATAAATGtataagtcatacttttgttttgggtgtatttcaatctgttaaaaagtttttcgctacgctagcaagcaaaaatgaaacaggaataatcgaaatgggatgttgcgcactttcaaaatcactcac > 1:38481‑M1/1‑20 (MQ=255) tACTTAACATAAATGtataagtcatacttttgttgtgggtgtatttcaatctgttaaaaagtttttcgctacgctagcaagcaaaaatgaaacaggaataatcgaaatgggatgttgcgcacagtcaaaataactcaccgtaa < 1:477658‑M1/143‑129 (MQ=255) cTTAACATAAATGtataagtcatacttttgttttgggtgtatttcaatctgttaaaaagtttttcgctacgctagcaagcaaacatgaaacaggaataatcgaaatgggatgttgcgcacagtcaaaataactcaccgtaaat > 1:283495‑M1/1‑13 (MQ=255) aCATAAATGtataagtcaaactgttctttcgggagaatttcaaactgtaaaaaagtttttcgctacgctagcaagcaaaaatgaaacaggaataatcgaaatgggatgttgcgcacagtcaaaataactcaccgtaaataatc < 2:428471‑M1/143‑135 (MQ=255) aTAAATGtataagtcatacttttgttttgggtgtatttcaatctgttaaaaagtttttcgctacgctagcaagcaaaaatgaaacaggaataatcgaaatgggatgttgcgcacagtcaaaataactcaccgtaaataatcat > 1:1316092‑M1/1‑7 (MQ=255) aTAAATGtataagtcatacttttgttttgggtgtatttcaatctgttaaaaagtttttcgctacgctagcaagcaaaaatgaaacaggaataatcgaaatgagatgttgcgcacagtcaaaataactcaccgtaaagaatcat > 2:1231329‑M1/1‑7 (MQ=255) tAAATGtataagtcatacttttgttttgggtgtatttcaatctgttaaaaagtttttcgctacgctagcaagcaaaaatgaaacaggaacaatcgaaatgggatgttgcgcgcagtccaaataactcaccgtaactaatcatc > 1:516730‑M1/1‑6 (MQ=255) aaaTGtataagtcatacttttgttttgggtgtatttcaatctgttaaaaagtttttcgctacgctagcaagcaaaaatgaaacaggaataatcgaaatgggatgttgcgcacagtcaaaataactcaccgtaaataatcatct > 1:1307331‑M1/1‑5 (MQ=255) tGtataagtcatacttttgttttgggtgtatttcaatctgttaaaaagtttttcgctacgctagcaagcaaaaatgaaacaggaataatcgaaatgggatgttgcgcacagtcaaaataactcaccgtaaataatcatctgct < 1:539766‑M1/143‑142 (MQ=255) | GTCTTTACACTTATCTAAGATTTTTCCTAAATCGACGCAACTGTACTCGTCACTACACGCACATACAACGGAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATGCGTGATGCAGATCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGATTCAGGTTATGCCG > NC_000913/1978363‑1978643 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |