| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 213083 = | 60 (0.920) | 3 (0.050) | 3/276 | 9.9 | 4.9% | coding (753/1299 nt) | tilS | tRNA(Ile)‑lysidine synthetase |
| ? | NC_000913 | 213120 = | 58 (0.920) | coding (790/1299 nt) | tilS | tRNA(Ile)‑lysidine synthetase | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
ATTTTGCCGAAGCAACGGCCCGCAGCGCCGCACTTTGTGCTGAACAAGAGAGCCTGCTGGATGAACTGCTGGCAGATGATTTAGCACACTGTCAATCGCCGCAGGGGACGCTGCAGATTGTGCCAATGCTGGCGATGAGTGATGCCCGCCGCGCGGCGATTATCCGCCGCTGGCTGGCAGGGCAGAATGCACCGATGCCTTCCCGCGACGCGTTGGTGAGGATCTGGCAGGAAGTGGCGCTGGCGCGGGAAGATGCCTCACCCTGTTTACGTTTGGGCGCGTTT > NC_000913/212941‑213224 | aTTTTGCCGAAGCAACGGCCCGCAGCGCCGCACTTTGTGCTGAACAAGAGAGCCTGCTGGATGAACTGCTGGCAGGTGATTTAGCACACTAGAAATCATCGCAGGGGACGCTGCAGATTATGCCAATGCTGGCGCTGGGTGAt > 2:1000000/1‑143 (MQ=255) ttttCCCGAAGCCGCGGCCCGCAGCGCGGCACTGTGTGCTGAACAAGGGGGCCTGCTGGATGACAAGCTGGCAGTTGATTTAGCACGCGGTCAATCGCCGCAGGGGACGCTGCAGATTGTGCCAATGCTGGCGATGAGTGATg < 2:351332/143‑1 (MQ=255) gtttGCCGAAGCAACGGCCCGCAGCGCCGCACTTGGTGCTGAACAAGAGAGCCTGCTGGATGAACTGCTGGCAGATGATTTAGCACACTGTCAATCGCCGCAGGGGACGCTGCAGATTGTGCCAATGCTGGCGATGAGTGATg < 1:877491/142‑1 (MQ=255) cGAAGCAACGGCCCGCAGCGCCGCACTTTGTGCTGAACAAGAGAGCCTGCTGGATGAACTGCTGGCAGATGATTTAGCACACTGTCAATCGCCGCAGGGGACGCTGCAGATTGTGCCAATGCTGGCGATGAGTGATGCccgcc > 1:442262/1‑143 (MQ=255) gAAGCAACGGCCCGCAGCGCCGCACTTTGTGCTGAACAAGAGAGCCTGCTGGATGAACTGCTGGCAGATGATTTAGCACACTGTCAATCGCCGCAGGGGACGCTGCAGATTGTGCCAATGCTGGCGATGTGTGATGCccgccg > 1:272611/1‑143 (MQ=255) aaCGGCCCGCAGCGCCGCACTTTGTGCTGAACAAGAAAGCCTGCTGGATGAACTGCTGGCAGATGATTTAGCACACTGTCAATCGCCGCAGGGGACGCCGCAGGTTGTGCCAATGCTGGCGATGAGAGAGGCCCGCCGCgagg > 2:187607/1‑143 (MQ=255) ggCCCGCAGCGCCGCACTTTGTGCTGAACAAGAGAGCCTGCTGGATGAACTGCTGGCAGATGATTTAGCACACTGTCAATCGCCGCAGGGGACGCTGCAGATTGTGCCAATGCTGGCGATGAGTGATGCCCGCCGCGCGGCGa < 2:909101/143‑1 (MQ=255) ggCCCGCAGCGCCGCACTTTGTGCTGAACAAGAGAGCCTGCTGGATGAACTGCTGGCAGATCATTTAGCACACTGTCAATCGCCGCAGGGGACGCTGCAGATTGTGCCAATGCTGGCGATGAGTGATGCCCGCCGCGCGGCGa < 1:183863/143‑1 (MQ=255) ccGCAGCGCCGCACTTTGTGCTGAACAAGAGAGCCTGCTGGATGAACTGCTGGCAGATGATTTAGCACACTGTCAATCGCCGCAGGGGACGCTGCAGATTGTGCCAATGCTGGCGATGAGTGATGCCCGCCGCGCGGCGATTa > 1:1085875/1‑143 (MQ=255) ccGCAGCGCCGCACTTTGTGCTGAACAAGAGAGCCTGCTGGATGAACTGCTGGCAGATGATTTAGCACACTGTCAATCGCCGCAGGGGACGCTGCAGATTGTGCCAATGCTGGCGATGAGTGATGCCCGCCGCGCGGCGATTa > 1:244341/1‑143 (MQ=255) gCAGCGCCGCACTTTGTGCTGAACAAGAGAGCCTGCTGGATGAACTGCTGGCAGATGATTTAGCACACTGTCAATCGCCGCAGGGGACGCTGCAGATTGTGCCAATGCTGGCGATGAGCGATGCCCGCCGCGCGGCGATTATc > 2:938496/1‑143 (MQ=255) gcgcCGCACTTTGTGCTGAACAAGAGAGCCTGCTGGATGAACTGCTGGCAGATGATTTAGCACACTGTCAATCGCCGCAGGGGACGCTGCAGATTGTGCCAATGCTGGCGATGAGTGATGCCCGCCGCGCGGCGATTATccgc < 2:350571/143‑1 (MQ=255) tgCTGAACAAGAGAGCCTGCTGGATGAACTGCTGGCAGATGATTTAGCACACTGTCAATCGCCGCAGGGGACGCTGCAGCTTGTGCCAATGCTGGCGATGAGTGATGCCCGCCGCGCGGCGATTATCCGCCGCTGGCTggcag > 1:562522/1‑143 (MQ=255) tgCTGAACAAGAGAGCCTGCTGGATGAACTGCTGGCAGATGATTTAGCACACTGTCAATCGCCGCAGGGGACGCTGCAGATTGTGCCAATGCTGGCGATGAGTGATGCCCGCCGCGCGGCGATTATCCGCCGCTGGCTggcag > 2:1073338/1‑143 (MQ=255) cTGAACAAGAGAGCCTGCTGGATGAACTGCTGGCAGATGATTTAGCACACTGTCAATCGCCGCAGGGGACGCTGCAGATTGTGCCAATGCTGGCGATGAGTGATGCCCGCCGCGCGGCGATTATGCGCCGCTGGCGggcaggg > 1:290634/1‑143 (MQ=255) cTGAACAAGAGAGCCTGCTGGATGAACTGCTGGCAGATGATTTAGCACACTGTCAATCGCCGCAGGGGACGCTGCAGATTGTGCCAATGCTGGCGATGAGTGATGCCCGCCGCGCGGCGATTATCCGCCGCTGGCTggcaggg < 1:563365/143‑1 (MQ=255) tGAACAAGAGAGCCTGCTGGATGAACTGCTAGCAGATGATTTAGCACACTGTCAATCGCCGCAGGGAACTCTGCAGATTGTACAAATACTCACGCTGAGTTATGCCCACCACGCGAAGAATAACAGCCGCGCGCTagcaaggc > 2:383921/1‑143 (MQ=255) gAACGAGAGAGCGTGCTGGATGAGCTGCGGGCAGATGAGTGAGCACACTGTCAATCGCCGCAGGGGACGCTGCAGAGTGTGCCAATGCTGGCGATGAGTGATGGCCGCCGCGCGGCGATTATCCGCCGCGGGCTggcagggca < 1:951157/143‑1 (MQ=255) aCAAGAGGGCGTGCTGGATGGACTGCGGGCAGATGATTTAGCACACGGTCAATCGCCGCAGGGGACGCTGCAGATGGTGCCAATGCTGGCGATGAGTGATGCCCGCCGCGCGGCGATTATCCGCCGCTGGCTGGCAGGGCAGa < 2:3637/143‑1 (MQ=255) cAAGAGAGCCTGCTGGATGAACTGCTGGCAGATGATTTAGCACACTGTCAATCGCCGCAGGGGACGCTGCAGATTGTGCCAATGCTGGCGATGAGTGATGCCCGCCGCGCGGCGATTATCCGCCGCTGGCTGGCAGGGCAGaa > 2:496869/1‑143 (MQ=255) agagagCCTGCTGGATGAACTGCTGGCAGATGATTTAGCACACTGTCAATCGCCGCAGGGGACGCTGCAGATTGTGCCAATGCTGGCGATGAGTGATGCCCGCCGCGCGGCGATTATCCGCCGCTGGCTGGCAGGGCAGACTg > 2:661816/1‑143 (MQ=255) gagagCCTGCTGGATGACCTGCTGGCAGATGATGTAGCACACTGTCAATCGCCGCAGGGGACGCTGCAGATTGTGCCAATGCTGGCGATGAGTGATGCCCGCCGCGCGGCGATTATCCGCCGCTGGCTGGCAGGGCAGAATGc < 2:992222/143‑1 (MQ=255) ctgctgGATGAACTGCTGGCGGATGATTTAGCACACTGTCAAGCGCCGCAGGGGACGCTGCAGATTGTGCCAATGCTGGCGATGAGTGATGCCCGCCGCGCGGCGATTATCCGCCGCTGGCTGGCAGGGCAGAATGCACCGAt < 2:457619/143‑1 (MQ=255) ggATGAACTGCTGGCAGATGATTTAGCACACTGTCAATCGCCGCAGGGGACGCTGCAGATTGTGCCAATGCTGGCGATGAGTGATGCCCGCCGCGCGGCGATTATCCGCCGCTGGCTGGCAGGGCAGAATGCACCGATGCCtt < 2:243270/143‑1 (MQ=255) gATGAACTGCTGGCAGATGATTTCGCACACTGTCAATCGCAGCAGGGGAAGCTGCAGATTGTGCCGATGCTGGCGATGAGTGGTGCCCGCCGCGCGGCGATTATCAGCCGCTGGCTGGCAGGGCAGAAGGCACCGAAGcggtc > 2:995232/1‑139 (MQ=255) tgctgGCAGATGATTTAGCACCATGTCAATCGCCGCAGGGGACGCTGCAGATTGTGCCAATGCTGGCGATGAGTGATGCCCGCCGCGCGGCGATTATCCGCCGCTGGCTGGCAGGGCAGAATGCACCGATGCCTTCCCGCGAc < 2:979643/143‑1 (MQ=255) tgctgGCAGATGATTTAGCACACTGTCAATCGCCGCCACGCACGCTGCAGATTGTGCCAATGCTGGCGATGCCCCATTCCCGCCACCCTACCATGAGCCGCCGCCGGCCTGCAGGGCCGAATGCCCCGATGCCTTCCCGCGAc > 2:297711/1‑143 (MQ=255) tgctgGCAGATGATTTAGCACACTGTCAATCGCCGCAGGGGACGCTGCAGATTGTGCCAATGCTGGCGCTGAGTGATGCCCGCCGCGCGGCGATTATCCGCCGCTGGCTGGCAGGGCAGAATGCACCGATGCCTTCCCGCGAc > 1:252628/1‑143 (MQ=255) tgctgGCAGATGATTTAGCACACTGTCAATCGCCGCAGGGGACGCTGCAGATTGTGCCAATGCTGGCGATGAGTGATGCCCGCCGCGCGGCGATTATCCGCCGCTGGCTGGCAGGGCAGAATGCACCGATGCCTTCCCGCGAc > 1:338982/1‑143 (MQ=255) tgctgGCAGATGATTTAGCACACTGTCAATCGCCGCAGGGGACGCTGCAGATTGTGCCAATGCTGGCGATGAGGGATGCCCGCCGCGCGGCGATTATCCGCCGCTGGCTGGCAGGGCAGAATGCACCGATGCCTTCCCGCGAc > 1:410380/1‑143 (MQ=255) gCAGATGATTTAGCACACTGTCAATCGCCGCAGGGGACGCTGCAGATTGTGCCAATGCTGGCGATGAGTGATGCCCGCCGCGCGGCGATTATCCGCCGCTGGCTGGCAGGGCAGAATGCACCGATGCCTTCCCGCGACGCGtt > 1:886922/1‑143 (MQ=255) cAGATGATTTAGCACACTGTCAATCGCCGCAGGGGACGCTGCAGATTGTGCCAATGCTGGCGATGAGTGATGCCCGCCGCGCGGCGATTATCCGCCGCTGGCTGGCAGGGCAGAATGCACCGATGCCTTCCCGCGACGCGTTg < 2:96324/143‑1 (MQ=255) gatgatTTAGCACACTGTCAATCGCCGCAGGGGACGCTGCAGATTGTGCCAATGCTGGCGATGAGTGATGCCCGCCGCGCGGCGATTATCCGCCGCTGGCTGGCAGGGCAGAATGCACCGATGCCTTCCCGCGACGCGTTGGt > 2:539250/1‑143 (MQ=255) gatgatTTAGCACACTGTCAATCGCCGCAGGGGACGCTGCAGATTGTGCCAATGCTGGCGATGAGTGATGCCCGCCGCGCGGCGATTATCCGCCGCTGGCTGGCAGGGCAGAATGCACCGATGCCTTCCCGCGACGCGTTGGt > 2:1065773/1‑143 (MQ=255) gatgatTTAGCACACTGTCAATCGCCGCAGGGGACGCTGCAGATTGTGCCAATGCTGGCGATGAGTGATGCCCGCCGCGCGGCGATTATCCGCCGCTGGCTGGCAGGGCAGAATGCACCGATGCCTTCCCGCGACGCGTTGGt > 1:139965/1‑143 (MQ=255) cacaCTGTCAATCGCCGCAGGGGACGCTGCAGATTGTGCCAATGCGGGCGATGAGTGATGCCCGCCGCGCGGCGATTATCCGCTGCTGGCTGGCAGGGCAGAATGCACCGATGCCTTCCCGCGACGCGTTGGTGAGGATCTgg < 1:638878/143‑1 (MQ=255) cacTGTCAATCGCCGCAGGGGACGCTGCAGATTGTGCCAATGCTGGCGATGAGTGATGCCCGCCGCGCGGCGATTATCCGCCGCTGGCTGGCAGGGCAGCATGCCCCGATGCCTTCCCGCGACGCGTTGGTGAGGGTCTGGCa > 2:818088/1‑143 (MQ=255) acTGTCAATCGCCGCAGGGGACGCTGCAGATTGTGCCAATGCTGGCGATGAGTGATGCCCGCCGCGCGGCGATTATCCGCCGCTGGCTGGCAGGGCAGAATGCACCGATGGCTTCCCGCGACGCGTTGGTGAGGGTCTGGCAg > 1:965231/1‑143 (MQ=255) cTGTCAATCGCCGCAGGGGACGCTGCAGATTGTGCCAATGCTGGCGATGAGTGATGCCCGCCGCGCGGCGACTATCCGCCGCTGGCTGGCAGGGCAGAATGCACCGATGCCTTCCCGCGACGCGTTGGTGAGGATCTGGCAgg < 2:660305/143‑1 (MQ=255) tGTCAATCGCCGCAGGGGACGCTGCAGATTGTGCCAATGCTGGCGATGAGTGATGCCCGCCGCGCGGCGATTATCCGCCGCTGGCTGGCAGGGCAGAATGCACCGATGCCTTCCCGCGACGCGTTGGTCAGGATCTGGCAggc > 1:1007076/1‑142 (MQ=255) gTCAATCGCCGCAGGGGACGCTGCAGATTGTGCCAATGCTGGCGATGAGTGATGCCCGCCGCGCGGCGATTATCCGCCGCTGGCTGGCAGGGCAGAATGCACCGATGCCTTCCCGCGACGCGTTGGTGAGGATCTGGCAGGaa < 1:777615/143‑1 (MQ=255) aaTCGCCGCAGGGGACGCTGCGGATTGTGCCAATGCTGGCGATGAGTGATGCCCGCCGCGCGGCGCTTATCCGCCGCTGGCGGGCAGGGCAGGATGCACGGAGGCCTTCCCGCGACGCGTTGGTGAGGATCTGGCAGGAAGtg < 2:155369/143‑1 (MQ=255) aaTCGCCGCACGGGACGCTGCAGATTGTGCCAATGCTGGCGATGAGTGATGCCCGCCGCGCGGCGATTATCCGCCGCTGGCTGGCAGGGCGGAATGCACCGATGCCTTCCCGCGACGCGTTGGTGAGGATCTGGCAGGAAGtg < 1:678561/143‑1 (MQ=255) ttgggcgcgGGCGACGCTGGAGATTGGGCCAGTGCTGGCGATGGGTGAGGCCCGCCGCGCGGCGATTATCCGCCGCTGGCTGGCAGGGCAGAATGCACCGATGCCTTCCCGCGACGCGTTGGTGAGGATCTGGCAGGAAGtgg < 2:178785/138‑1 (MQ=255) aTCGCCGCAGGGGACGCTGCAGATTGTGCCAATGCTGGCGATGAGTGATGCCCGCCGCGCGGCGATTATCCGCCGCTGGCTGGCAGGGCAGAATGCACCGATGCCTTCCCGCGACGCGTTGGTGAGGATCTGGCAGGAAGtgg > 1:508485/1‑143 (MQ=255) ccgcAGGGGACGCTGCAGATTGTGCCAATGCTGGCGATGAGTGATGCCCGCCGCGCGGCGATTATCCGCCGCTGGCTGGCAGGGCAGAATGCACCGGTGCCTTCCCGCGACGCGTTGGCGAGGATCTAGCAGGAAGtggcgct > 2:406443/1‑143 (MQ=255) ggggGCGCGGCAGATTGTGGCAATGCTGGCGATGAGTGATGCCCGCCGCGCGGCGATTATCCGCCGCTGGCTGGCAGGGCAGAATGCACCGATGCCTTCCCGCGACGCGTTGGTGAGGATCTGGCAGGAAGtggcgctggcgc < 2:598000/143‑1 (MQ=255) gACGCTGCAGATTGTGCCAATGCTGGCGATGAGTGATGCCCGCCGCGCGGCGATTATCCGCCGCTGGCTGGCAGGGCAGAATGCACCGATGCCTTCCCGCGACGCGTTGGTGAGGATCTGGCAGGAAGTGGCGCTGGCGCggg > 1:1069254/1‑143 (MQ=255) gACGCTGCAGAGTGTGCCAATGCTGGCGATGAGTGATGCCCGCCGCGCGGCGATTATCCGCCGCTGGCTGGCAGGGCAGAATGCACCGATGCCTTCCCGCGACGCGTTGGTGAGGATCTGGCAGGAAGTGGCGCTGGCGCggg < 1:882442/143‑1 (MQ=255) gCTGCAGAGTGTGCGAATGCTGGCGATGAGTGATGCCGGCCGCGCGGGGATTATGCTCCGCTGGCTGGCAGGGCAGAATGCACCGATGCCTTCCCGCGACGCGTGGGTGAGGATCTGGCAGGAAGTGGCGCTGGCGCGGGAAg < 2:1007627/143‑1 (MQ=255) tGCAGGTTGGGCCAATGCTGGCGATGAGTGAGGCCCGCCGCGCGGCGATTATCCGCCGCTGGCTGGCAGGGCCGAATGCACCGATGCCTTCCCGCGACGCGTTGGTGAGGATCTGGCAGGAAGTGGCGCTGGCGCGGGAAGAt < 2:350455/143‑1 (MQ=255) agagTGTGCCAATGCTGGCGATGAGTGATGCCCGCCGCGCGGCGATTATCCGCCGCTGGCTGGCAGGGCAGAATGCACCGATGCCTTCCCGCGACGCGTTGGTGAGGATCTGGCAGGAAGTGGCGCTGGCGCGGGAAGATGcc < 2:729909/143‑1 (MQ=255) aGATTGTGCCAATGCTGGCGATGAGTGATGCCCGCCGCGCGGCGATTATCCGCCGCTGGCTGGCAGGGCAGAATGCACCGATGCCTTCCCGCGACGCGTTGGTGAGGATCTGGCAGGAAGTGGCGCTGGCGCGGGAAGATGcc < 1:1098952/143‑1 (MQ=255) gATTGTGCCAATGCTGGCGATGAGTGATGCCCGCCGCGCGGCGATTATCCGCCGCTGGCTGGCAGGGCAGAATGCACCGATGCCTTCCCGCGACGCGTTGGTGAGGATCTGGCAGGAAGTGGCGCTGGCGCGGGAAGATGCCt > 1:192984/1‑143 (MQ=255) gggcgcggAGTGATGCCCGCCGCGCGGCGATTATCCGCCGCTGGCTGGCAGGGCAGAATGCACCGATGCCTTCCCCCGCCGCGTTTGTGAGGATCTGGCAGGAAGTGGCGCTGGCGCGGGAAGATGCCTCACCCTGTTTACGt < 1:438542/136‑1 (MQ=255) ggCCATGAGTGCTGCCGGCCGCGCGGCGATGATCCGCCGCTGGCTGGTAGGGCAGAATGCACCGATGCCGTCCCGCGACGCGTTGGTGAGGATCTGGCAGGAAGTGGCGCTGGCGCGGGAAGATGCCTCACCCTGTTTACGtt < 2:864695/143‑1 (MQ=255) gCGATGAGTGATGCCCGCCGCGCGGCGATTATCCGCCGCTGGCTGGCAGGGCAGAATGCACCGATGCCTTCCCGCGACGCGTTGGTGAGGATCTGGCAGGAAGTGGCGCTGGCGCGGGAAGATGCCTCACCCTGTTTACGttt < 2:272611/143‑1 (MQ=255) gCGATGAGTGATGCCCGCCGCGCGGCGATTATCCGCCGCTGGCTGGCAGGGCAGAATGCACCGATGCCTTCCCGCGACGCGTTGGTGAGGATCTGGCAGGAAGTGGCGCTGGCGCGGGAAGATGCCTCACCCTGTTTACGttt < 1:938496/143‑1 (MQ=255) gCGATGAGTGATGCCCGCCGCGCGGCGATTATCCGCCGCTGGCTGGCAGGGCAGAATGCACCGATGCCTTCCCGCGACGCGTTGGTGAGGATCTGGCAGGAAGTGGCGCTGGCGCGGGAAGATGCCTCACCCTGTTTACGttt > 1:357595/1‑143 (MQ=255) aTGCCCGCCGCGCGGCGATTATCCGCCGCTGGCTGGCAGGGCAGAATGCACCGATGCCTTCCCGCGACGCGTTGGTGAGGATCTGGCAGGAAGTGGCGCTGGCGCGGGAAGATGCCTCACCCTGTTTACGTTTGGGCGCGttt < 1:517203/143‑1 (MQ=255) | ATTTTGCCGAAGCAACGGCCCGCAGCGCCGCACTTTGTGCTGAACAAGAGAGCCTGCTGGATGAACTGCTGGCAGATGATTTAGCACACTGTCAATCGCCGCAGGGGACGCTGCAGATTGTGCCAATGCTGGCGATGAGTGATGCCCGCCGCGCGGCGATTATCCGCCGCTGGCTGGCAGGGCAGAATGCACCGATGCCTTCCCGCGACGCGTTGGTGAGGATCTGGCAGGAAGTGGCGCTGGCGCGGGAAGATGCCTCACCCTGTTTACGTTTGGGCGCGTTT > NC_000913/212941‑213224 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |