| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 213083 = | 60 (0.920) | 3 (0.050) | 3/276 | 9.9 | 4.9% | coding (753/1299 nt) | tilS | tRNA(Ile)‑lysidine synthetase |
| ? | NC_000913 | 213120 = | 58 (0.920) | coding (790/1299 nt) | tilS | tRNA(Ile)‑lysidine synthetase | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
TGCTGAACAAGAGAGCCTGCTGGATGAACTGCTGGCAGATGATTTAGCACACTGTCAATCGCCGCAGGGGACGCTGCAGATTGTGCCAATGCTGGCGATGAGTGATGCCCGCCGCGCGGCGATTATCCGCCGCTGGCTGGCAGGGCAGAATGCACCGATGCCTTCCCGCGACGCGTTGGTGAGGATCTGGCAGGAAGTGGCGCTGGCGCGGGAAGATGCCTCACCCTGTTTACGTTTGGGCGCGTTTGAAATCCGACGCTATCAGTCGCAACTGTGGTG > NC_000913/212978‑213256 | tgCTGAACAAGAGAGCCTGCTGGATGAACTGCTGGCAGATGATTTAGCACACTGTCAATCGCCGCAGGGGACGCTGCAGCTTGTGCCAATGCTGGCGATGAGTGATGCCCGCCGCGCGGCGATTATCCGCCGCTGGCTggcag > 1:562522/1‑143 (MQ=255)tgCTGAACAAGAGAGCCTGCTGGATGAACTGCTGGCAGATGATTTAGCACACTGTCAATCGCCGCAGGGGACGCTGCAGATTGTGCCAATGCTGGCGATGAGTGATGCCCGCCGCGCGGCGATTATCCGCCGCTGGCTggcag > 2:1073338/1‑143 (MQ=255) cTGAACAAGAGAGCCTGCTGGATGAACTGCTGGCAGATGATTTAGCACACTGTCAATCGCCGCAGGGGACGCTGCAGATTGTGCCAATGCTGGCGATGAGTGATGCCCGCCGCGCGGCGATTATGCGCCGCTGGCGggcaggg > 1:290634/1‑143 (MQ=255) cTGAACAAGAGAGCCTGCTGGATGAACTGCTGGCAGATGATTTAGCACACTGTCAATCGCCGCAGGGGACGCTGCAGATTGTGCCAATGCTGGCGATGAGTGATGCCCGCCGCGCGGCGATTATCCGCCGCTGGCTggcaggg < 1:563365/143‑1 (MQ=255) tGAACAAGAGAGCCTGCTGGATGAACTGCTAGCAGATGATTTAGCACACTGTCAATCGCCGCAGGGAACTCTGCAGATTGTACAAATACTCACGCTGAGTTATGCCCACCACGCGAAGAATAACAGCCGCGCGCTagcaaggc > 2:383921/1‑143 (MQ=255) gAACGAGAGAGCGTGCTGGATGAGCTGCGGGCAGATGAGTGAGCACACTGTCAATCGCCGCAGGGGACGCTGCAGAGTGTGCCAATGCTGGCGATGAGTGATGGCCGCCGCGCGGCGATTATCCGCCGCGGGCTggcagggca < 1:951157/143‑1 (MQ=255) aCAAGAGGGCGTGCTGGATGGACTGCGGGCAGATGATTTAGCACACGGTCAATCGCCGCAGGGGACGCTGCAGATGGTGCCAATGCTGGCGATGAGTGATGCCCGCCGCGCGGCGATTATCCGCCGCTGGCTGGCAGGGCAGa < 2:3637/143‑1 (MQ=255) cAAGAGAGCCTGCTGGATGAACTGCTGGCAGATGATTTAGCACACTGTCAATCGCCGCAGGGGACGCTGCAGATTGTGCCAATGCTGGCGATGAGTGATGCCCGCCGCGCGGCGATTATCCGCCGCTGGCTGGCAGGGCAGaa > 2:496869/1‑143 (MQ=255) agagagCCTGCTGGATGAACTGCTGGCAGATGATTTAGCACACTGTCAATCGCCGCAGGGGACGCTGCAGATTGTGCCAATGCTGGCGATGAGTGATGCCCGCCGCGCGGCGATTATCCGCCGCTGGCTGGCAGGGCAGACTg > 2:661816/1‑143 (MQ=255) gagagCCTGCTGGATGACCTGCTGGCAGATGATGTAGCACACTGTCAATCGCCGCAGGGGACGCTGCAGATTGTGCCAATGCTGGCGATGAGTGATGCCCGCCGCGCGGCGATTATCCGCCGCTGGCTGGCAGGGCAGAATGc < 2:992222/143‑1 (MQ=255) ctgctgGATGAACTGCTGGCGGATGATTTAGCACACTGTCAAGCGCCGCAGGGGACGCTGCAGATTGTGCCAATGCTGGCGATGAGTGATGCCCGCCGCGCGGCGATTATCCGCCGCTGGCTGGCAGGGCAGAATGCACCGAt < 2:457619/143‑1 (MQ=255) ggATGAACTGCTGGCAGATGATTTAGCACACTGTCAATCGCCGCAGGGGACGCTGCAGATTGTGCCAATGCTGGCGATGAGTGATGCCCGCCGCGCGGCGATTATCCGCCGCTGGCTGGCAGGGCAGAATGCACCGATGCCtt < 2:243270/143‑1 (MQ=255) gATGAACTGCTGGCAGATGATTTCGCACACTGTCAATCGCAGCAGGGGAAGCTGCAGATTGTGCCGATGCTGGCGATGAGTGGTGCCCGCCGCGCGGCGATTATCAGCCGCTGGCTGGCAGGGCAGAAGGCACCGAAGcggtc > 2:995232/1‑139 (MQ=255) tgctgGCAGATGATTTAGCACCATGTCAATCGCCGCAGGGGACGCTGCAGATTGTGCCAATGCTGGCGATGAGTGATGCCCGCCGCGCGGCGATTATCCGCCGCTGGCTGGCAGGGCAGAATGCACCGATGCCTTCCCGCGAc < 2:979643/143‑1 (MQ=255) tgctgGCAGATGATTTAGCACACTGTCAATCGCCGCCACGCACGCTGCAGATTGTGCCAATGCTGGCGATGCCCCATTCCCGCCACCCTACCATGAGCCGCCGCCGGCCTGCAGGGCCGAATGCCCCGATGCCTTCCCGCGAc > 2:297711/1‑143 (MQ=255) tgctgGCAGATGATTTAGCACACTGTCAATCGCCGCAGGGGACGCTGCAGATTGTGCCAATGCTGGCGCTGAGTGATGCCCGCCGCGCGGCGATTATCCGCCGCTGGCTGGCAGGGCAGAATGCACCGATGCCTTCCCGCGAc > 1:252628/1‑143 (MQ=255) tgctgGCAGATGATTTAGCACACTGTCAATCGCCGCAGGGGACGCTGCAGATTGTGCCAATGCTGGCGATGAGTGATGCCCGCCGCGCGGCGATTATCCGCCGCTGGCTGGCAGGGCAGAATGCACCGATGCCTTCCCGCGAc > 1:338982/1‑143 (MQ=255) tgctgGCAGATGATTTAGCACACTGTCAATCGCCGCAGGGGACGCTGCAGATTGTGCCAATGCTGGCGATGAGGGATGCCCGCCGCGCGGCGATTATCCGCCGCTGGCTGGCAGGGCAGAATGCACCGATGCCTTCCCGCGAc > 1:410380/1‑143 (MQ=255) gCAGATGATTTAGCACACTGTCAATCGCCGCAGGGGACGCTGCAGATTGTGCCAATGCTGGCGATGAGTGATGCCCGCCGCGCGGCGATTATCCGCCGCTGGCTGGCAGGGCAGAATGCACCGATGCCTTCCCGCGACGCGtt > 1:886922/1‑143 (MQ=255) cAGATGATTTAGCACACTGTCAATCGCCGCAGGGGACGCTGCAGATTGTGCCAATGCTGGCGATGAGTGATGCCCGCCGCGCGGCGATTATCCGCCGCTGGCTGGCAGGGCAGAATGCACCGATGCCTTCCCGCGACGCGTTg < 2:96324/143‑1 (MQ=255) gatgatTTAGCACACTGTCAATCGCCGCAGGGGACGCTGCAGATTGTGCCAATGCTGGCGATGAGTGATGCCCGCCGCGCGGCGATTATCCGCCGCTGGCTGGCAGGGCAGAATGCACCGATGCCTTCCCGCGACGCGTTGGt > 1:139965/1‑143 (MQ=255) gatgatTTAGCACACTGTCAATCGCCGCAGGGGACGCTGCAGATTGTGCCAATGCTGGCGATGAGTGATGCCCGCCGCGCGGCGATTATCCGCCGCTGGCTGGCAGGGCAGAATGCACCGATGCCTTCCCGCGACGCGTTGGt > 2:1065773/1‑143 (MQ=255) gatgatTTAGCACACTGTCAATCGCCGCAGGGGACGCTGCAGATTGTGCCAATGCTGGCGATGAGTGATGCCCGCCGCGCGGCGATTATCCGCCGCTGGCTGGCAGGGCAGAATGCACCGATGCCTTCCCGCGACGCGTTGGt > 2:539250/1‑143 (MQ=255) cacaCTGTCAATCGCCGCAGGGGACGCTGCAGATTGTGCCAATGCGGGCGATGAGTGATGCCCGCCGCGCGGCGATTATCCGCTGCTGGCTGGCAGGGCAGAATGCACCGATGCCTTCCCGCGACGCGTTGGTGAGGATCTgg < 1:638878/143‑1 (MQ=255) cacTGTCAATCGCCGCAGGGGACGCTGCAGATTGTGCCAATGCTGGCGATGAGTGATGCCCGCCGCGCGGCGATTATCCGCCGCTGGCTGGCAGGGCAGCATGCCCCGATGCCTTCCCGCGACGCGTTGGTGAGGGTCTGGCa > 2:818088/1‑143 (MQ=255) acTGTCAATCGCCGCAGGGGACGCTGCAGATTGTGCCAATGCTGGCGATGAGTGATGCCCGCCGCGCGGCGATTATCCGCCGCTGGCTGGCAGGGCAGAATGCACCGATGGCTTCCCGCGACGCGTTGGTGAGGGTCTGGCAg > 1:965231/1‑143 (MQ=255) cTGTCAATCGCCGCAGGGGACGCTGCAGATTGTGCCAATGCTGGCGATGAGTGATGCCCGCCGCGCGGCGACTATCCGCCGCTGGCTGGCAGGGCAGAATGCACCGATGCCTTCCCGCGACGCGTTGGTGAGGATCTGGCAgg < 2:660305/143‑1 (MQ=255) tGTCAATCGCCGCAGGGGACGCTGCAGATTGTGCCAATGCTGGCGATGAGTGATGCCCGCCGCGCGGCGATTATCCGCCGCTGGCTGGCAGGGCAGAATGCACCGATGCCTTCCCGCGACGCGTTGGTCAGGATCTGGCAggc > 1:1007076/1‑142 (MQ=255) gTCAATCGCCGCAGGGGACGCTGCAGATTGTGCCAATGCTGGCGATGAGTGATGCCCGCCGCGCGGCGATTATCCGCCGCTGGCTGGCAGGGCAGAATGCACCGATGCCTTCCCGCGACGCGTTGGTGAGGATCTGGCAGGaa < 1:777615/143‑1 (MQ=255) aaTCGCCGCAGGGGACGCTGCGGATTGTGCCAATGCTGGCGATGAGTGATGCCCGCCGCGCGGCGCTTATCCGCCGCTGGCGGGCAGGGCAGGATGCACGGAGGCCTTCCCGCGACGCGTTGGTGAGGATCTGGCAGGAAGtg < 2:155369/143‑1 (MQ=255) aaTCGCCGCACGGGACGCTGCAGATTGTGCCAATGCTGGCGATGAGTGATGCCCGCCGCGCGGCGATTATCCGCCGCTGGCTGGCAGGGCGGAATGCACCGATGCCTTCCCGCGACGCGTTGGTGAGGATCTGGCAGGAAGtg < 1:678561/143‑1 (MQ=255) ttgggcgcgGGCGACGCTGGAGATTGGGCCAGTGCTGGCGATGGGTGAGGCCCGCCGCGCGGCGATTATCCGCCGCTGGCTGGCAGGGCAGAATGCACCGATGCCTTCCCGCGACGCGTTGGTGAGGATCTGGCAGGAAGtgg < 2:178785/138‑1 (MQ=255) aTCGCCGCAGGGGACGCTGCAGATTGTGCCAATGCTGGCGATGAGTGATGCCCGCCGCGCGGCGATTATCCGCCGCTGGCTGGCAGGGCAGAATGCACCGATGCCTTCCCGCGACGCGTTGGTGAGGATCTGGCAGGAAGtgg > 1:508485/1‑143 (MQ=255) ccgcAGGGGACGCTGCAGATTGTGCCAATGCTGGCGATGAGTGATGCCCGCCGCGCGGCGATTATCCGCCGCTGGCTGGCAGGGCAGAATGCACCGGTGCCTTCCCGCGACGCGTTGGCGAGGATCTAGCAGGAAGtggcgct > 2:406443/1‑143 (MQ=255) ggggGCGCGGCAGATTGTGGCAATGCTGGCGATGAGTGATGCCCGCCGCGCGGCGATTATCCGCCGCTGGCTGGCAGGGCAGAATGCACCGATGCCTTCCCGCGACGCGTTGGTGAGGATCTGGCAGGAAGtggcgctggcgc < 2:598000/143‑1 (MQ=255) gACGCTGCAGATTGTGCCAATGCTGGCGATGAGTGATGCCCGCCGCGCGGCGATTATCCGCCGCTGGCTGGCAGGGCAGAATGCACCGATGCCTTCCCGCGACGCGTTGGTGAGGATCTGGCAGGAAGTGGCGCTGGCGCggg > 1:1069254/1‑143 (MQ=255) gACGCTGCAGAGTGTGCCAATGCTGGCGATGAGTGATGCCCGCCGCGCGGCGATTATCCGCCGCTGGCTGGCAGGGCAGAATGCACCGATGCCTTCCCGCGACGCGTTGGTGAGGATCTGGCAGGAAGTGGCGCTGGCGCggg < 1:882442/143‑1 (MQ=255) gCTGCAGAGTGTGCGAATGCTGGCGATGAGTGATGCCGGCCGCGCGGGGATTATGCTCCGCTGGCTGGCAGGGCAGAATGCACCGATGCCTTCCCGCGACGCGTGGGTGAGGATCTGGCAGGAAGTGGCGCTGGCGCGGGAAg < 2:1007627/143‑1 (MQ=255) tGCAGGTTGGGCCAATGCTGGCGATGAGTGAGGCCCGCCGCGCGGCGATTATCCGCCGCTGGCTGGCAGGGCCGAATGCACCGATGCCTTCCCGCGACGCGTTGGTGAGGATCTGGCAGGAAGTGGCGCTGGCGCGGGAAGAt < 2:350455/143‑1 (MQ=255) agagTGTGCCAATGCTGGCGATGAGTGATGCCCGCCGCGCGGCGATTATCCGCCGCTGGCTGGCAGGGCAGAATGCACCGATGCCTTCCCGCGACGCGTTGGTGAGGATCTGGCAGGAAGTGGCGCTGGCGCGGGAAGATGcc < 2:729909/143‑1 (MQ=255) aGATTGTGCCAATGCTGGCGATGAGTGATGCCCGCCGCGCGGCGATTATCCGCCGCTGGCTGGCAGGGCAGAATGCACCGATGCCTTCCCGCGACGCGTTGGTGAGGATCTGGCAGGAAGTGGCGCTGGCGCGGGAAGATGcc < 1:1098952/143‑1 (MQ=255) gATTGTGCCAATGCTGGCGATGAGTGATGCCCGCCGCGCGGCGATTATCCGCCGCTGGCTGGCAGGGCAGAATGCACCGATGCCTTCCCGCGACGCGTTGGTGAGGATCTGGCAGGAAGTGGCGCTGGCGCGGGAAGATGCCt > 1:192984/1‑143 (MQ=255) gggcgcggAGTGATGCCCGCCGCGCGGCGATTATCCGCCGCTGGCTGGCAGGGCAGAATGCACCGATGCCTTCCCCCGCCGCGTTTGTGAGGATCTGGCAGGAAGTGGCGCTGGCGCGGGAAGATGCCTCACCCTGTTTACGt < 1:438542/136‑1 (MQ=255) ggCCATGAGTGCTGCCGGCCGCGCGGCGATGATCCGCCGCTGGCTGGTAGGGCAGAATGCACCGATGCCGTCCCGCGACGCGTTGGTGAGGATCTGGCAGGAAGTGGCGCTGGCGCGGGAAGATGCCTCACCCTGTTTACGtt < 2:864695/143‑1 (MQ=255) gCGATGAGTGATGCCCGCCGCGCGGCGATTATCCGCCGCTGGCTGGCAGGGCAGAATGCACCGATGCCTTCCCGCGACGCGTTGGTGAGGATCTGGCAGGAAGTGGCGCTGGCGCGGGAAGATGCCTCACCCTGTTTACGttt < 2:272611/143‑1 (MQ=255) gCGATGAGTGATGCCCGCCGCGCGGCGATTATCCGCCGCTGGCTGGCAGGGCAGAATGCACCGATGCCTTCCCGCGACGCGTTGGTGAGGATCTGGCAGGAAGTGGCGCTGGCGCGGGAAGATGCCTCACCCTGTTTACGttt > 1:357595/1‑143 (MQ=255) gCGATGAGTGATGCCCGCCGCGCGGCGATTATCCGCCGCTGGCTGGCAGGGCAGAATGCACCGATGCCTTCCCGCGACGCGTTGGTGAGGATCTGGCAGGAAGTGGCGCTGGCGCGGGAAGATGCCTCACCCTGTTTACGttt < 1:938496/143‑1 (MQ=255) aTGCCCGCCGCGCGGCGATTATCCGCCGCTGGCTGGCAGGGCAGAATGCACCGATGCCTTCCCGCGACGCGTTGGTGAGGATCTGGCAGGAAGTGGCGCTGGCGCGGGAAGATGCCTCACCCTGTTTACGTTTGGGCGCGttt < 1:517203/143‑1 (MQ=255) ccgccgCGCGGCGATTATCCGCCGCTGGCTGGCAGGGCAGAATGCACCGATGCCTTCCCGCGACGCGTTGGTGAGGATCTGGCAGGAAGTGGCGCTGGCGCGGGAAGATGCCTCACCCTGTTTACGTTTGGGCGCGTTTGaaa > 2:360767/1‑143 (MQ=255) gcgcgcgGTGGTTTTCCGCCGCTGGTTTTCAGGGCAGAATGCGTCGATGCCTTCCCGCGTCGCGTTGGTGAGGATCTGGCAGGCAGTGGCGCTTGCGCGGTAAGATGCCTCACCCTGTTTACGTTTGGGCGCGTTTGAAATcc < 2:962661/142‑1 (MQ=255) gcgcgGCGATTATCCGCCGCTGGCTGGCAGGGCAGAATGCACCGATGCCTTCCCGCGACGCGTTGGTGAGGGTCTGGCAGGAAGTGGCGCTGGCGCGGGAAGATGCCTCACCCTGTTTACGTTTGGGCGCGTTTGAAATCCGa > 1:296456/1‑143 (MQ=255) cgcgGCGATTATCCGCCGCTGGCTGGCAGGGCAGAATGCACCGATGCCTTCCCGCGACGCGTTGGTGAGGATCTGGCAGGAAGTGGCGCTGGCGCGGGACGTTGCCTCGCCCTGTTTACGTTTGGGCGCGTTTGAAATCCGAc < 2:139965/143‑1 (MQ=255) ggcgATTATCCGCTGCTGGCTGCCAGGGCAGAATGCACCGATGCCTTCCCGCGACGCGTTGGTGAGGATCTGGCAGGAAGTGGCGCTGGCGCGGGAAGAGGCCTCACCCTGTTTACGTTTGGGCGCGTTTGAAATCCGACGCt < 2:1072960/143‑1 (MQ=255) cgATTATCCGCCGCTGGCTGGCAGGGCAGAATGCACCGATGCCTTCCCGCGACGCGTTGGTGAGGATCTGGCAGGAAGTGGCGCTGGCGCGGGAAGATGCCTCACCCTGTTTACGTTTGGGCGCGTTTGAAATCCGACGCTAt < 1:609731/143‑1 (MQ=255) aTTATCCGCCGCTGGCTGGCAGGGCAGAATGCGCCGATGCCTTCCCGCGACGCGTTGGTGAGGATCCGGCAGGAAGTGGCGCTGGCGCGGGAAGATGCCTCACCCCGTTTACGTGTGGGCGCGTTCGAACTCCCACGccctca > 2:690822/1‑138 (MQ=255) tCCGCCGCTGGCTGGCAAGGAAGAATGAACCGTTGCCTTCCCGCGACGCGTTGGTGAGGATCTGGCAGGACGTGGCGCTGGCGCGGGAAGATGCCCCACCCTGTTTACGGTTGGGCGCGGTTGAAATCCGACGCTATCAGTCg > 2:144036/1‑143 (MQ=255) ctggcAGGGCAGAATGCACCGATGCCTTCCCGCGACGCGTTGGTGAGGATCTGGCAGGAAGTGGCGCTGGCGCGGGAAGATGCCTCACCCTGTTTACGTTTGGGCGCGTTTGAAATCCGACGCTATCAGTCGCAACTgtggtg < 1:918360/143‑1 (MQ=255) ctggcAGGGCAGAATGCACCGATGCCTTCCCGCGACGCGTTGGTGAGGATCTGGCAGGAAGTGGCGCTGGCGCGGGAAGATGCCTCACCCTGTTTACGTTTGGGCGCGTTTGAAATCCGACGCTATCAGTCGCAACTgtggtg < 1:1073338/143‑1 (MQ=255) | TGCTGAACAAGAGAGCCTGCTGGATGAACTGCTGGCAGATGATTTAGCACACTGTCAATCGCCGCAGGGGACGCTGCAGATTGTGCCAATGCTGGCGATGAGTGATGCCCGCCGCGCGGCGATTATCCGCCGCTGGCTGGCAGGGCAGAATGCACCGATGCCTTCCCGCGACGCGTTGGTGAGGATCTGGCAGGAAGTGGCGCTGGCGCGGGAAGATGCCTCACCCTGTTTACGTTTGGGCGCGTTTGAAATCCGACGCTATCAGTCGCAACTGTGGTG > NC_000913/212978‑213256 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |