| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| JC JC | NC_000913 | 458,790 | IS186 (–) +6 bp :: Δ1 bp | intergenic (+90/‑93) | clpX → / → lon | ATPase and specificity subunit of ClpX‑ClpP ATP‑dependent serine protease/DNA‑binding ATP‑dependent protease La |
| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_000913 | 458790 = | 0 (0.000) | 63 (1.040) | 52/278 | 0.1 | 100% | intergenic (+90/‑98) | clpX/lon | ATPase and specificity subunit of ClpX‑ClpP ATP‑dependent serine protease/DNA‑binding ATP‑dependent protease La |
| ? | NC_000913 | 608008 = | NA (NA) | noncoding (2/1345 nt) | IS186 | repeat region | |||||
| * | ? | NC_000913 | = 458795 | 0 (0.000) | 57 (0.950) | 45/276 | 0.3 | 100% | intergenic (+95/‑93) | clpX/lon | ATPase and specificity subunit of ClpX‑ClpP ATP‑dependent serine protease/DNA‑binding ATP‑dependent protease La |
| ? | NC_000913 | = 609351 | NA (NA) | noncoding (1345/1345 nt) | IS186 | repeat region | |||||
Only 100 of 127 total aligned reads displayed.
TGCTGATTTATGGCAAGCCGGAAGCGCAACAGGCATCTGGTGAATAATTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTAATAGATGGCGTGAAGCACAGTCGTGTCATCTGATTACCTGGCGGAAATTAAACTAAGAGAGAGCTCTATGAATCCTGAGCGTTCTGAACGCATTGAAATCCCCGTATTGCCGCTGCG > NC_000913/458654‑458937 | tGCTGATTTATGGCAAGCCGGAAGCCCGACGGGCATCTTGTGAATAATTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACAt < 1:755685‑M1/143‑2 (MQ=255) gCTGATTTATGGCAAGCCGGAAGCGCAACAGGCATCTGGTGAATAATTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAACGTGGGGGAAACAtc > 2:1086874‑M1/1‑141 (MQ=255) ccggccggagtatcgagtgctgcgggcttaccaatatgggccagacttgctgaccagttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaagcatatcaggcgtaataccacaacgcttaagttagcgcttatgggGAAACATcc > 2:809332‑M1/135‑143 (MQ=255) cTGATTTATGGCAAGCCGGAAGCGCAACAGGCATCTGGTGAATAATTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACAtcc < 1:1093819‑M1/143‑4 (MQ=255) gATTTATGGCAAGCCGGAAGCGCAACAGGCATCTGGTGAATAATTAACCATTCCCATACAATTAGTTCACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACAtccga > 1:393028‑M1/1‑138 (MQ=255) caaagtatccagttcttcgggcttaccaatatgggccagaattgctgaccagttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatgggGAAACATCCCCata > 1:804167‑M1/130‑143 (MQ=255) aagtatccagttcttcgggcttaccaatatgggccagaattgatgcctagaagtcgtgagagtaattcctcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagtcagcgcttctgggGCAACATCcccatcta < 2:1094289‑M1/16‑4 (MQ=255) cAAGCCGGAAGCGCAACAGGCATCTGGTGAATAATTAACCGTTCGCGGCCAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAAGGTGGGGGAGACAtcccgtaagcgcta > 2:611936‑M1/1‑129 (MQ=255) tccaggtcttcgggcttactaatatgggccaggattgctgaccagttatcgtgagagtaatgcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatgggGAAACATCCCCATATACTGAc > 2:310133‑M1/123‑143 (MQ=255) 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tctcGGCGTTGAATGTGGGGGAAACAtcccataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgttaagacgatgcctcgcgttcttcaattgcgttgtgtaggccgccagggatactgtc > 2:486794‑M1/1‑26 (MQ=255) cttagggtagcgcttatgggGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTAATAGATGGCGTGAAGCACAGTCGTGTCATCTGATTACCTGGCGGAAATTAAACTAAGAGAGAGCTCTATGAATCCTGAGCGTTCTGAACGCa > 2:671987‑M1/21‑143 (MQ=255) ttaagttagcgcttatgggGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTAATAGATGGCGTGAAGCACAGTCGTGTCATCTGATTACCTGGCGGAAATTAAACTAAGAGAGAGCTCTATGAATCCTGAGCGTTCTGAACGCAt < 1:105141‑M1/124‑1 (MQ=255) cGGCGTTGAATGTGGGGGAAACAtcccataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgttaagacgatgcctcgcgttcttcaattgcgttttgtaggctgtcagggatactgtccca < 2:1113890‑M1/143‑121 (MQ=255) cgcttatgggGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTAATAGATGGCGTGAAGCACAGTCGTGTCATCTGATTACCTGGCGGAAATTAAACTAAGAGAGAGCTCTATGAATCCTGAGCGTTCTGAACGCATTGAAATccc > 2:126225‑M1/11‑143 (MQ=255) aaggtgggtTAAACAtcccataagcgctaacttaagggttgaaccatcggaataatgcgacgcctcggtgcctcgttaagacgatgcctcgcgttcttcaattgcgttttgtaggctgtcagggatactgtcccacgaatggc < 2:1028483‑M1/140‑129 (MQ=255) gtgGGGGAAACAtcccataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgttaagacgatgcctcgcgttcttcaattgcgttttgtaggctgtcagggatactgtcccacgaatgggcac > 1:706126‑M1/1‑12 (MQ=255) gggggAAACAtcccataagcgctaacttaagggttgaagcatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgttaagacgatgcctcgcgttcttcaattgcgtcttgtaggctgtcagggataccttcacacgaacggccaccg > 2:110366‑M1/1‑10 (MQ=255) ggGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTAATAGATGGCGTGAAGCACAGTCGTGTCATCTGCTAACGTTGCGGAAATTAAACTAAGAGAGAGCTCTATGAATCCTGAGCGTTCTGAACGCATTGAAATCCCCGTATTGc < 1:418391‑M1/141‑1 (MQ=255) ggGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTAATAGATGGCGTGAAGCACAGTCGTGTCATCTGATTACCTGGCGGAAGTTAAACTAAGAGAGAACTCTATGAATCCTGAGCGTTCTGAACGCATTGAAATCCCCGTATTGc < 1:873099‑M1/141‑1 (MQ=255) 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> 1:813066/1‑143 (MQ=255) | TGCTGATTTATGGCAAGCCGGAAGCGCAACAGGCATCTGGTGAATAATTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTAATAGATGGCGTGAAGCACAGTCGTGTCATCTGATTACCTGGCGGAAATTAAACTAAGAGAGAGCTCTATGAATCCTGAGCGTTCTGAACGCATTGAAATCCCCGTATTGCCGCTGCG > NC_000913/458654‑458937 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |