| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC JC | NC_000913 | 458,790 | IS186 (–) +6 bp :: Δ1 bp | intergenic (+90/‑93) | clpX → / → lon | ATPase and specificity subunit of ClpX‑ClpP ATP‑dependent serine protease/DNA‑binding ATP‑dependent protease La |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 458790 = | 0 (0.000) | 63 (1.040) | 52/278 | 0.1 | 100% | intergenic (+90/‑98) | clpX/lon | ATPase and specificity subunit of ClpX‑ClpP ATP‑dependent serine protease/DNA‑binding ATP‑dependent protease La |
| ? | NC_000913 | 608008 = | NA (NA) | noncoding (2/1345 nt) | IS186 | repeat region | |||||
| * | ? | NC_000913 | = 458795 | 0 (0.000) | 57 (0.950) | 45/276 | 0.3 | 100% | intergenic (+95/‑93) | clpX/lon | ATPase and specificity subunit of ClpX‑ClpP ATP‑dependent serine protease/DNA‑binding ATP‑dependent protease La |
| ? | NC_000913 | = 609351 | NA (NA) | noncoding (1345/1345 nt) | IS186 | repeat region | |||||
AGCTTACAGGTGGCCATTCGTGGGACAGTATCCCTGACAGCCTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCTTTACACTTTCGCCCGTGGTCAGTGATGGCTGCGGGCGAATCGTACCAGATGTTGTCAATTAATCGTGTTGGCACAGCGTTATGA > NC_000913/609212‑609484 | aGCTTACAGGTGGCCATTCGTGGGACAGTATCCCTGACAACCTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATAATCTTAACGAGACGCCGAGGCGTCGCATTCGTCAGATGGTTCAACACTTAAGTTAGCGCTTATGGGAgga > 1:77844/1‑141 (MQ=11) aGGTGGCCAGTCGTGGGACAGTATCCCTGACAGCCTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCg < 2:93311/143‑1 (MQ=38) gCCATTCGTGGGACAGTATCCCTGACAGCCTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGAGCATATGGGAGTAATCCCCGCatat > 2:953908/1‑143 (MQ=255) cATTCGTGGGACAGTATCCCTGACAGCCTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGGAATCCCCGCCTATcc > 2:1005426/1‑143 (MQ=25) aTTCGTGGGACAGTATCCCTGACAGCCTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCg < 1:10972/143‑1 (MQ=255) aTTCGTGGGACAGTATCCCTGACAGCCTACAAAACGCAATGGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGACGCACCGAGGCGTCGCATTCTACAGACGGTTCGACCCGTAAGTTAGCGCGTCTGGGAGTACTCCCCCCATACCCg > 2:290552/1‑143 (MQ=11) ttCGTGGGACAGTATCCCTGACAGCCTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTTACGAGGCACCGAGGAGTCGCATCCATCAGATGGTTCACCCCTTAAGTTAGCGCATCTGGGAGTAATCCCCGCATATCCgg > 2:184489/1‑143 (MQ=14) gcgggggACAGGATCACTACCAGAGTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGt < 2:1024463/139‑1 (MQ=14) cGTGGGACAGTATCCCTGCCAGCCTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGtt < 1:282709/143‑1 (MQ=255) tGGGACAGTATCCCTGACAGCCCACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTgt < 1:218475/143‑1 (MQ=255) gACAGTGTCCCTGACAGCCTACAAAACGCAATTCAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGATGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTGATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTgtcag < 1:185675/143‑1 (MQ=255) aCAGTATCCCTGACAGCCTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGCGGCGTCGCATTCTTCCGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCACTTATGGGAGTACTCCCCGCATATCCGGTTgtcagg > 1:67869/1‑143 (MQ=255) cAGTATCCCTGACAGCCTACAAATCGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTgtcaggt < 1:220624/143‑1 (MQ=255) cccTGACAGCCTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGAt < 1:716928/143‑1 (MQ=255) ccTGACAGCCTACAAAGCGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATCCTTCCGATGGTTCGACCCTTAAGGTAGCGCTTATGGGGGTAATCGCCGCATATCCGGTTGtcaggtcaggcag > 2:1062862/1‑140 (MQ=17) ccTGACAGCCTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATg < 1:525354/143‑1 (MQ=255) ccAGCCTCCAAACCGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTaa < 2:305229/142‑1 (MQ=255) aCAGCCGAGAGACCGCAATTGAAGGACGCGAGGCATCGTTTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTGCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTaa < 2:654783/143‑1 (MQ=18) aGCCTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGACGGATCAACCCTGAAGTTAGCGCTTATGGGAGGAATCCCCGCCTATCCGGTTGTCGGGTCAGGATGGTAAgg > 2:909115/1‑143 (MQ=17) cTACCAAACGCAATGGAAGGGCGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTGAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCAc < 2:1014798/143‑1 (MQ=21) cAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTg < 2:43956/143‑1 (MQ=255) aaaCGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCt > 1:383102/1‑143 (MQ=255) aCGAAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGATGTGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCttt < 1:287866/143‑1 (MQ=255) gaaCGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCCGCTCTGCACTTTCGca > 2:781378/1‑142 (MQ=255) aaCGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTACGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGCTGGTAAGGCACCTGCTTTACACTTTCGccc > 1:96243/1‑143 (MQ=255) gCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCGCCTGCTTTCCACTTTCGCCCGTGGCCAg > 1:1033127/1‑143 (MQ=255) cATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCTTTACACTTTCGCCCGTGGTCAGt < 1:968926/143‑1 (MQ=255) tCGTCTTAGCGAGGCACCGAGGCGTTGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGTGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGTATGGTAAGGCACCTGCTTTACACTTTCGCCCGTGCTTAGtca < 2:454426/143‑3 (MQ=25) tCGTCTTAGCGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCATATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCTTTACACTTTCGCCCGTGGTCAGTGa < 2:57983/143‑1 (MQ=255) tCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCTTTACACTTTCGCCCGTGGTCAGTGa < 1:359742/143‑1 (MQ=255) tCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCTTTACACTTTCGCCCGCGGTCAGTGa > 2:518967/1‑143 (MQ=255) gTCTTGCCGCGGCACCGAGGCGTCGCATGCGTCAGATGGGTCGACCCTGACGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCTTTACACTTTCGCCCGTGGTCAGTGATg < 2:818709/143‑1 (MQ=255) tCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCACGTCAGGATGGTAAGGCAACTGCTTTACACTTTCGCCCGTGGTCAGTGATgg > 1:810827/1‑143 (MQ=255) cTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCTTTCCACTTTCGCCCGTGGTCAGTGATGGc > 1:619204/1‑143 (MQ=255) aaCGATGCAGCGAGGCGGCGCAGTCTTCAGATGGTTCTACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTATTCCCCGCATATCCGGGTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCTTTACACTTTCGCCCGTGGTCAGTGATGGCTGc < 2:891533/143‑1 (MQ=37) aaCGAGGCATCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCTTTACACTTTCGCCCGTGGTCAGTGATGGCTGc < 2:322590/143‑1 (MQ=255) aaCGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCTTTACACTTTCGCCCGTGGTCAGTGATGGCTGc > 1:681332/1‑143 (MQ=255) gCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCTTTACACTTTCGCCCGTGGTCAGTGATGGCTGCGGGCGa < 1:295640/143‑1 (MQ=255) gCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCTTTACACTTTCGCCCGTGGTCAGTGATGGCTGCGCGCGa > 2:134246/1‑143 (MQ=255) aCCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCACATCAAGAGGTCAGGTCAGGCTGGTAAGGCACCTGCTTTACACTTTCGCCCGTGGTCAGTGATGGCTGCGGGCGAAt > 1:702177/1‑143 (MQ=37) ggCGTCGCATTCTGCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCTTTACACTTTCGCCCGTGGTCAGTGATGGCTGCGGGCGAATCGTAc < 1:227700/143‑1 (MQ=255) cggcGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCTTTACACTTTCGCCCGTGGTCAGTGATGGCTGCGGGCGAATCGTACCa < 2:87143/140‑1 (MQ=255) tCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCTTTACACTTTCGCCCGTGGTCAGTGATGGCTGCGGGCGAATCGTACCAGa < 2:408174/143‑1 (MQ=255) gCATGCGTCAGATGGTTCAACCCTTGAGTTAGCGCGTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCTTTACACTTTCGCCCGTGGTCAGTGATGGCTGTGGGCGAATCGTACCAGAtg < 2:982265/143‑1 (MQ=255) cATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATGATCGGGTGTCAGGTGGGGACGGTAAGGCACCTGCTTTACACTTTCGCCCGTGGTCAGTGATGGCTGCGGGCGAATCGTACCAGAtgt > 1:258101/1‑143 (MQ=38) aTTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCTTTACACTTTCGCCCGTGGTCAGCGATGGCTGCGGGCGAATCGTCCCTGAtgtt > 2:325066/1‑143 (MQ=255) aTTCTGCAGATGTCTCAACCCTTGTGGTAGCGCTTATGGCAGTAATCCCCGCATTTCCGGTTGTCAGGCCAGGATGGTAAGGCACCCGCTTTACACTTTCGCCCGTGTTCAGTGATGGCTGCGGTCGAATCGTACCAGAtgtt < 2:1022862/143‑1 (MQ=255) aTTCGTCATGTGGTGCCACCCTTAAGGTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCTCTACACTTTCGCCCGTGGTCAGTGATGGCTGCGGGCGAATCGTACCAGAtgtt < 2:953294/143‑1 (MQ=255) cttcAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCTTTACACTTTCGCCCGTGGTCAGTGATGGCTGCGGGCGAATCGTACCAGATGTTGTc > 2:62605/1‑143 (MQ=255) cttcAGAGGGTTCAACCCTTAAGTGAGCGCGTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCTTTACACTTTCGCCCGTGGTCAGTGATGGCTGCGGGCGAATCGTACCAGATGTTGTc < 2:288544/143‑1 (MQ=255) tcAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGCTGGTAAGGCACCTGCTTTACACTTTGGCCCGTGGTCCGTGATGGCTGCGGGTGAGGTGTCCCAGATGGGGTCac > 2:279407/1‑142 (MQ=37) aTGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCTTTACACTTTCGCCCGTGGTCAGTGATCGCTGCGAGCGAATCGTACCAGATGCTGGCAAttca > 2:56120/1‑141 (MQ=255) ggTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACATGCTTTACACTTTCGCCCGTGGTCAGTGATGGCTGCGGGCGAATCGTACCAGATGTTGTCAATTAATc > 2:12574/1‑143 (MQ=255) ttCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCTTTACACTTTCGCCCGTGGTCAGTGATGGCTGCGGGCGAATCGTACCAGATGTTGTCAATTAATCgt > 2:751697/1‑143 (MQ=255) cAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCTTTACACTTTCGCCCGTGGGCGGTGATGGCTGCGGGCGAATCGTACCAGATGGTGTCAGTTAATCgtgt > 1:772602/1‑143 (MQ=255) agcccTTTTGTTAGCGCTTATGGGAGTAATGCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCCTACGGTTTACGGTTTCGTTAGTCTTCAGTGATGGCTGCGGGCGAATCGTACCAGATGTTGTCAATTAATCGTGtt < 2:495820/141‑1 (MQ=255) aaCCCTTAGGTTGGGGCTTATGGGAGTAATCCCCGCGTATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTGGGGTCCCTCCATCACACTTTCGGCCCTGGTCAGTCATGGCGGCGGGCGAATCGTACCAGATGTTGTCAATTAATCGTGtt < 1:517663/143‑1 (MQ=255) aaCCCTTAAGTTCGCGCTTATGGTAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCTTTACACTTTCGCCCGTGGTCAGTGATGGCTGCGGGCGAATCGTACCAGATGTTGTCAATTAATCGTGtt < 1:147807/143‑1 (MQ=255) aaCCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCTTTACACTTTCGCCCGTGGTCAGTGATGGCTGCGGGCGAATCGTACCAGATGTTGTCAATTAATCGTGtt > 1:572719/1‑143 (MQ=255) aaCCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCTTTACACTTTCGCCCGTGGTCAGTGATGGCTGCGGGCGAATCGTACCAGATGTTGTCAATTAATCGTGtt < 1:168684/143‑1 (MQ=255) aaCCCTGAAGTTAGCGCTTAGGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTGAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCTTTACACTTTCGCCCATGGTCAGTGATGGCTGCGGGCGAATCGTACCAGATGTTGTCAATTAATCGTGtt < 2:967056/143‑1 (MQ=255) ccTTAGGGTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCTGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCTTTACACTTTCGCCCGTGGTCAGTGATGGCTGCGGGCGAATCGTACCAGATGTTGTCAATTAATCGTGTTGGc < 2:921819/143‑1 (MQ=255) tAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAAGCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCTTTACACTTTCGCCCGTGGTCAGTGATGGCTGCGGGCGAATCGTACCAGATGTTGTCAATTAATCGTGTTGGcaca < 1:1091653/143‑1 (MQ=255) gcgcTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCTTTACACTTTCGCCCGTGGTCAGTGATGGCTGCGGGCGAATCGTACCAGATGTTGTCAATTAATCGTGTTGGCACAGCGTTAt < 1:396977/143‑1 (MQ=255) ggttATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCTTTACACTTTCGCCCGTGGTCAGTGATGGCTGCGGGCGAATCGTACCAGATGTTGTCAATTAATCGTGTTGGCACAGCGTTATGa < 2:699294/141‑1 (MQ=255) gcTGATGGGGGGAATCCCCGCATATCCGTGTGTGAGGTCAGGATGGGAAGGCACCTGCTGTACCCTGTCGCCCGTGGTCAGTGATGTCTGCGGGCGAATCGTACCAGATGTTGTCAATTAATCGTGTTGGCACAGCGTTATGa < 2:152446/143‑1 (MQ=255) | AGCTTACAGGTGGCCATTCGTGGGACAGTATCCCTGACAGCCTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCTTTACACTTTCGCCCGTGGTCAGTGATGGCTGCGGGCGAATCGTACCAGATGTTGTCAATTAATCGTGTTGGCACAGCGTTATGA > NC_000913/609212‑609484 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |