| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC JC | NC_000913 | 458,790 | IS186 (–) +6 bp :: Δ1 bp | intergenic (+90/‑93) | clpX → / → lon | ATPase and specificity subunit of ClpX‑ClpP ATP‑dependent serine protease/DNA‑binding ATP‑dependent protease La |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 458790 = | 1 (0.020) | 54 (1.080) | 46/278 | 0.1 | 98.1% | intergenic (+90/‑98) | clpX/lon | ATPase and specificity subunit of ClpX‑ClpP ATP‑dependent serine protease/DNA‑binding ATP‑dependent protease La |
| ? | NC_000913 | 608008 = | NA (NA) | noncoding (2/1345 nt) | IS186 | repeat region | |||||
| * | ? | NC_000913 | = 458795 | 0 (0.000) | 35 (0.710) | 32/276 | 0.6 | 100% | intergenic (+95/‑93) | clpX/lon | ATPase and specificity subunit of ClpX‑ClpP ATP‑dependent serine protease/DNA‑binding ATP‑dependent protease La |
| ? | NC_000913 | = 609351 | NA (NA) | noncoding (1345/1345 nt) | IS186 | repeat region | |||||
GGAGCTTACAGGTGGCCATTCGTGGGACAGTATCCCTGACAGCCTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCTTTAC‑ACTTTCGCCCGTGGTCAGTGATGGCTGCGGGCGAATCGTACCAGATGTTGTCAATTAATCGTGTTGGCACAGCGTTATGACTATCTTT > NC_000913/609210‑609492 | ggAGCTTACAGGTGGCCATTCGTGGGACCGTACCCCTGACAGCCTACAAAACGCACTTGAAGAACGCGACGCATCGTCGTAAAGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGATCAACCCTTAAGTTAGCGCTCATGGGAg > 2:283877/1‑143 (MQ=11)ggAGCTTACAGGTGGCCATTCGTGGGACAGTATCCCTGACAGCCTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAg < 1:491012/143‑1 (MQ=11)ggAGCTTACAGGTGGCCATTCGTGGGACAGTATCCCTGACAGCCTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAg > 1:727528/1‑143 (MQ=11) ttACAGGTGGCCATTCGTGGGACAGTATCCCTGACAGCCTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTGTGGGAGTACTc > 1:232070/1‑143 (MQ=17) aGGTGGCCATTCGTGGGACAGTATCCCTGACAGCCTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCg < 1:139822/143‑1 (MQ=38) ggTGGCCATGGGGGGGGGCGTATCCGTGACAGCCTACAAAACGCAAGTGAAGGACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGc < 2:31714/143‑1 (MQ=14) cGTGAGACAGTATGCCTTACAGCCTACAACACGCAATTGAAGCACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGTGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGtt < 2:99345/143‑1 (MQ=14) tGGGACAGTATCCCTGACAGCCTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTgg > 2:257759/1‑142 (MQ=255) cAGTATCCCTGACAGCCTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTACGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTgtcaggt > 1:262377/1‑143 (MQ=255) cAGTATCCCTGACAGCCTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACACTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCGGGTTgtcaggt > 1:79107/1‑143 (MQ=255) gTATCCCTGACAGCCTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATCCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTgtcaggtca < 1:819726/143‑1 (MQ=255) gTAGCCCCGACAGCCTGCAAAGCGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTgtcaggtca < 2:498677/143‑1 (MQ=255) tATCCCTGACAGCCTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAAGCGTCGCATTGTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATGCCCGCATATCCGGTTgtcaggtaag > 2:345884/1‑143 (MQ=255) tGACAGCCTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATAATTCAGTCGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAGTCCCCGCACATCCGGTCGTCAGGTCACGATGGt > 2:795441/1‑143 (MQ=17) cAGCCTGCAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAg > 2:160511/1‑143 (MQ=255) aGCCTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAgg > 1:270450/1‑143 (MQ=255) cAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGCTAAGGCACCTg > 1:695209/1‑143 (MQ=255) aaaCGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCt > 1:402111/1‑143 (MQ=255) tcGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCttt < 2:386202/142‑1 (MQ=255) cGCTATTGCAGCTCGCGTCGCATCGTCTTAACGAGGCCCCGCCGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTCAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCTTTa < 2:8411/143‑1 (MQ=21) gCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTCGTTTac > 2:298950/1‑143 (MQ=255) cAACTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTGAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCTTTac‑a < 2:640501/143‑1 (MQ=255) tGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCGGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCTTTAC‑ACttt < 2:125654/143‑1 (MQ=255) gaagaaCGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCTTTAC‑ACTTTc > 2:168938/1‑143 (MQ=255) gaagaaCGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCTTTAC‑ACTTTc > 1:615579/1‑143 (MQ=255) gaaCGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCTTTAC‑ACTTTCGcc > 2:507091/1‑143 (MQ=255) gggAGGCTTCGTCTTTACGCGGCACCGAGGCTTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCTTTAC‑ACTTTCGCCCGTg < 2:593753/141‑1 (MQ=255) cgAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCTGGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCTTTAC‑ACTTTCGCCCGTgg < 2:69687/143‑1 (MQ=255) ggttttAGCGAGGCACCGAGGCGCCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGGTTATGGGAGTAATCCCCGCAGATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCTTTAC‑ACTTTCGCCCGTGGTCAGTGAt < 2:161920/139‑1 (MQ=37) cGTGTTACCGATGGACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTCAGGCACCTGCTTTAC‑ACTTTCGCCCGTGGTCAGTGAt < 2:797549/143‑1 (MQ=37) tAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCTTTAC‑ACTTTCGCCCGTGGTCAGTGATGGCTg > 1:639822/1‑143 (MQ=255) aGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCTTTCC‑ACTTTCGCCCGTGGTCCGTGATGGCTGCGGGc > 2:585080/1‑143 (MQ=255) gAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGGTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCTTTAC‑ACTTTCGCCCGTGGTCAGTGATGGCTGCGGGCGAATCGt < 2:317641/143‑1 (MQ=255) gggCGTCGCTTTCTTGAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGTTGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCTTTAC‑ACTTTCGCCCGTGGTCAGTGATGGCTGCGGGCGAATCGTa < 2:585004/142‑1 (MQ=255) aGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCTTTAC‑ACTTTCGCACGTGGTGAGTGATGGCTGCGGGCGAATCGTa > 2:223772/1‑143 (MQ=255) cGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTACTCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGGTGGTAAGGCACCTGCTTTAC‑ACTTTCGCCCGAGGCCAGGGATGGCGGGGGGCGAACCCTACCa > 2:273002/1‑143 (MQ=25) cGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCCGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCTTTAC‑ACTTTCGCCCGTGGTCAGTGATGGCTGCGGGCGAATCGTACCa < 2:727528/143‑1 (MQ=255) tCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCTTTAC‑ACTTTCGCGCGTGGTCAGTGATGGCTGCGGGCGGATCGTACCAgc > 2:283839/1‑142 (MQ=255) tCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCTTTAC‑ACTTTCGCCCGTGGTCAGTGATGGCTGCGGGCGAATCGTACCAGa > 2:747504/1‑143 (MQ=255) tCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCTTTAC‑ACTTTCGCCCGTGGTCAGTGATGGCTGCGGGCGAATCGTACCAGa < 2:337082/143‑1 (MQ=255) tCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCTTTAC‑ACTTTCGCCCGTGGTCAGTGATGGCTGCGGGCGAATCGTACCAGa < 1:433057/143‑1 (MQ=255) tCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTACCTTTACGAGGGTAAGCCA‑CTACTGCGCAACGTTCCCCCGTGGTCCGTGGCGGCTGGGGGCGAATCGTACCAgc > 2:405205/1‑142 (MQ=12) ttcAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCTTTAC‑ACTTTCGCCCGTGGTCAGTGATGGCTGCGGGCGAATCGTACCAGATGTTGTCa > 1:878005/1‑143 (MQ=255) cAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCTTTAC‑ACTTTCGCCCGTGGTCAGTGATGGCTGCGGGCGAATCGTACCAGATGTTGTCAAt > 1:654997/1‑143 (MQ=255) ttCAACCCTTAAGGTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCTTTAC‑ACTTTCGCCCGTGGTCAGTGATGGCTGCGGGCGAATCGTACCAGATGTTGTCAATTAATCgt < 1:731225/143‑1 (MQ=255) actccTTAAGTTAGCGCTTAGTGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCTTTAC‑ACTTTCGCCCGTGGTCAGTGATGGCTGCGGGCGAATCGTACCAGATGTTGTCAATTAATCGTGtt < 2:79107/140‑1 (MQ=255) aaCCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCTTTAC‑ACTTTCGCCCGTGGTCAGTGATGGCTGCGGGCGAATCGTACCAGATGTTGTCAATTAATCGTGtt < 1:160511/143‑1 (MQ=255) ctgaaGTTAGCGCGGATTGGAGTAACCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCTTTAC‑ACTTTCGCCCGTGGTCAGTGAGGGCTGCGGGCGAATCGTACCAGATGTTGTCAATTAATCGTGTTGGca < 2:500209/140‑1 (MQ=255) ttAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCTTTAC‑ACTTTCGCCCGTGGTCAGTGATGGCTGCGGGCGAATCGTACCAGATGTTGTCAATTAATCGTGTTGGcac > 2:196094/1‑143 (MQ=255) gcTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCTTTAC‑ACTTTCGCCCGTGGTCAGTGATGGCTGCGGGCGAATCGTACCAGATGTTGTCAATTAATCGTGTTGGCACAGCGTTATGa > 2:108487/1‑143 (MQ=255) gcTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGAGGGTAAGGCACCTGCTTTAC‑ACTTTCGCCCGTGGTCAGTGATGGCTGCGGGCGAATCGTACCAGATGTTGTCAATTAATCGTGTTGGCACAGCGTTATGa < 1:62296/143‑1 (MQ=255) tATGGGAGTAATCCCCGCATCCCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCTTTAC‑ACTTTCGCCCGTGGTCAGTGATGGCTGCGGGCGAATCGTACCAGATGTTGTCAATTAATCGTGTTGGCACAGCGTTATGACTa < 2:232070/143‑1 (MQ=255) gAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCTTTAC‑ACTTTCGCCCGTGGTCAGTGATGGCTGCGGGCGAATCGTACCAGATGTTGTCAATTAATCGTGTTGGCACAGCGTTATGACTAtcttt > 1:225253/1‑143 (MQ=255) | GGAGCTTACAGGTGGCCATTCGTGGGACAGTATCCCTGACAGCCTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCTTTAC‑ACTTTCGCCCGTGGTCAGTGATGGCTGCGGGCGAATCGTACCAGATGTTGTCAATTAATCGTGTTGGCACAGCGTTATGACTATCTTT > NC_000913/609210‑609492 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |