Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
JC JC | NC_000913 | 458,790 | IS186 (–) +6 bp :: Δ1 bp | intergenic (+90/‑93) | clpX → / → lon | ATPase and specificity subunit of ClpX‑ClpP ATP‑dependent serine protease/DNA‑binding ATP‑dependent protease La |
New junction evidence | |||||||||||
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* | ? | NC_000913 | 458790 = | 0 (0.000) | 32 (0.810) | 29/278 | 0.4 | 100% | intergenic (+90/‑98) | clpX/lon | ATPase and specificity subunit of ClpX‑ClpP ATP‑dependent serine protease/DNA‑binding ATP‑dependent protease La |
? | NC_000913 | 608008 = | NA (NA) | noncoding (2/1345 nt) | IS186 | repeat region | |||||
* | ? | NC_000913 | = 458795 | 0 (0.000) | 47 (1.190) | 40/276 | 0.1 | 100% | intergenic (+95/‑93) | clpX/lon | ATPase and specificity subunit of ClpX‑ClpP ATP‑dependent serine protease/DNA‑binding ATP‑dependent protease La |
? | NC_000913 | = 609351 | NA (NA) | noncoding (1345/1345 nt) | IS186 | repeat region |
GCTGATTTATGGCAAGCCGGAAGCGCAACAGGCATCTGGTGAATAATTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTAATAGATGGCGTGAAGCACAGTCGTGTCATCTGATTACCTGGCGGAAATTAAACTAAGAGAGAGCTCTATGAATCCTGAGCGTTCTGAACGCATTGAAATCCCCGTATTGCCGC > NC_000913/458655‑458933 | gCTGATTTATGGCAAGCCGGAAGCGCAACAGGCATCTGGTGAATAATTAACCATTCCCATACAATTAGTGAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTGGGCGTTGACTGAGGGGGAAACAtg > 2:64107‑M1/1‑141 (MQ=255) cgtgccgaagtatccagtgcttcgggcttaccaataggggccagaattgctgaccagttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatgggGAAACATcc > 2:643970‑M1/135‑143 (MQ=255) cctggCAAGGCGGAGGCGCAACAGGCGTCTGGTGCATAATTAATCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACAtcccataag < 1:322951‑M1/141‑10 (MQ=255) aaGCCGGAAGCGCAACAGGCATCTGGTGAATAATTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCGTTAATGTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACAtcccataagcgctaa < 1:168696‑M1/143‑16 (MQ=255) ccagttcttcgggcttaccaatatgggccagaattgctgaccagttatcgtgagagtgattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttctgggGCAAcatccccatatccacacc < 2:702360‑M1/22‑8 (MQ=255) agttcttcgggcttaccaatatgggccagaattgctgaccagttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatgggGAAACATCCCCATATACTGACGTa > 2:405749‑M1/120‑143 (MQ=255) ggAAGCGCAACAGGCATCTGGTGAATAATTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACAtcccataagcgctaacttaa > 1:681113‑M1/1‑123 (MQ=255) ggAAGCGCAACAGGCATCTGGTGAATAATTAACCATGCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACAtcccataagcgctaacttaa < 1:179543‑M1/143‑21 (MQ=255) gAAGCGCAACAGGCATCTAGGGAATAAGTAACCATTCCCAGACAATGAGTTAACCAAAAGGGGGGGATTTTATCGGCCATTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACAtcccataagcgctaacttaag < 2:23052‑M1/143‑22 (MQ=255) 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GCTGATTTATGGCAAGCCGGAAGCGCAACAGGCATCTGGTGAATAATTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTAATAGATGGCGTGAAGCACAGTCGTGTCATCTGATTACCTGGCGGAAATTAAACTAAGAGAGAGCTCTATGAATCCTGAGCGTTCTGAACGCATTGAAATCCCCGTATTGCCGC > NC_000913/458655‑458933 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |