| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC JC | NC_000913 | 458,790 | IS186 (–) +6 bp :: Δ1 bp | intergenic (+90/‑93) | clpX → / → lon | ATPase and specificity subunit of ClpX‑ClpP ATP‑dependent serine protease/DNA‑binding ATP‑dependent protease La |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 458790 = | 0 (0.000) | 30 (1.140) | 28/278 | 0.1 | 100% | intergenic (+90/‑98) | clpX/lon | ATPase and specificity subunit of ClpX‑ClpP ATP‑dependent serine protease/DNA‑binding ATP‑dependent protease La |
| ? | NC_000913 | 608008 = | NA (NA) | noncoding (2/1345 nt) | IS186 | repeat region | |||||
| * | ? | NC_000913 | = 458795 | 0 (0.000) | 26 (1.000) | 25/276 | 0.1 | 100% | intergenic (+95/‑93) | clpX/lon | ATPase and specificity subunit of ClpX‑ClpP ATP‑dependent serine protease/DNA‑binding ATP‑dependent protease La |
| ? | NC_000913 | = 609351 | NA (NA) | noncoding (1345/1345 nt) | IS186 | repeat region | |||||
ATACGGGGATTTCAATGCGTTCAGAACGCTCAGGATTCATAGAGCTCTCTCTTAGTTTAATTTCCGCCAGGTAATCAGATGACACGACTGTGCTTCACGCCATCTATTAACATGTACGTCAGTATATGGGGATGTTTCccc‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/458927‑458790‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGAAGAACTGGATACTTCGGCACGTAATGCCGGG > NC_000913/608008‑608151 ATACGGGGATTTCAACGCGTTCAGAACGCTCAGGATTCATAGAGCTCTCTCTTAGTTTAATTTCCGCCAGGTAATCAGACGACACGACTGTGCTTCACGCCATCTATTAACATGTACGTCAGTATATGGGGATGTTTCCCCAT < 2:399260/143‑1 CGGGGATTTCAATGCGTTCAGAACGCTCAGGATTCATAGAGCTCTCTCTTAGTTTAATTTCCGCCAGGTAATCAGATGACACGACTGTGCTTCACGCCATCTATTAACATGTACGTCAGTATATGGGGATGTTTCCCCATAAG > 1:400728/1‑143 GGGGATTTCAATGCGTTCAGAACGCTCAGGATTCATAGAGCTCTCTCTTAGTTTAATTTCCGCCAGGTAATCAGATGACACGACTGTGCTTCACGCCATCTATTAACATGTACGTCAGTATATGGGGATGTTTACCCATAAGC > 2:399213/1‑143 GATTTCAATGCGTTCAGAACGCTCAGGATTCATAGAGCTCTCTCTTAGCTTCCTTCCCGTCATATCACCAGATCACACGACTGTGCTTCACGCCATCTATTAACATGTACGTCAGTATATGGGGATGGTTCCCCATAAGCGCT > 2:344440/1‑143 TTCAATGCGTTCAGAACGCTCAGGATTCATAGAGCTCTCTCTTAGTTTAATTTCCGCCAGGTAATCAGATGACACGACTGTGCTTCACGCCATCTATTAACATGTACGTCAGTATATGGGGATGTTTCCCCATAAGAGCTAAC > 1:474962/1‑143 TTCAGAACGCTCAGGATTCATAGAGCTCTCTCTTAGTTTAATTTCCGCCAGGTAATCAGATGACACGACTGTGCTTCACGCCATCTATTAACATGTACGTCAGTATATGGGGATGTTTCCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTT > 1:452366/1‑143 AGAACGCTCAGGATTCATAGAGCTCTCTCTTAGTTTAATTTCCGCCAGGTAATCAGATGACACGACTGTGCTTCACGCCATCTATTAACATGTACGTCAGTATATGGGGATGTTTCCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTG < 2:172786/143‑1 GCTCAGGATTCATAGAGCTCTCTCTTAGTTTAATTTCCGCCAGGTAATCAGATGACACGACTGTGCTTCACGCCAACTATTAACATGTACGTCAGTATATGGGGATGTTTCCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATT > 1:471366/1‑143 CTCAGGATTCATAGAGCTCTCTCTTAGTTTAATTTCCGCCAGGTAATCAGATGACACGACTGTGCTTCACGCCATCTATTAACATGTACGTCAGTATATGGGGATGTTTCCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTA < 1:343381/143‑1 AGAGCTCTCTCTTAGTTTAATTTCCGCCAGGTAATCAGATGACACGACTGTGCTTCACGCCATCTATTAACATGTACGTCAGTATATGGGGATGTTTCCTCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGA > 1:129138/1‑143 ccCTCTTAGTTTAATTTCCGCCAGGTAATCAGATGACACGACTGTGCTTCACGCCATCTATTAACATGTACGTCAGTATATGGGGATGTTTCCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAAC < 1:82760/141‑1 TCTCTTAGTTTAATTTCCGCCAGGTAATCAGATGACACGACTGTGCTTCACGCCATCTATTAACATGTACGTCAGTATATGGGGATGTTTCCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTGGTGGTATTACGCCTGGTATGATTTAACG > 1:366266/1‑143 TCTTAGTTTAATTTCCGCCAGGTAATCAGATGACACGACTGTGCTTCACGCCATCTATTAACATGTACGTCAGCATATGGGCATGTTTCCCCATAAGCGCTAACTTAAGTCTTGTGGTATTACGACTGATAGCACTTAACGTG > 2:64043/1‑143 TTTAATTTCCGCCAGGTAATCAGATGACACGACTGTGCTTCACGCCATCTATTAACATGTACGTCAGTATATGGGGATGTTTCCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATG > 1:170034/1‑143 AATTTCCGCCAGGTAATCAGATGACACGACTGTGCTTCACGCCATCTATTAACATGTACGGCAGTATATGGGGATGTTTCCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAAT < 1:147681/143‑1 TTTCCGCCAGGTAATCAGATGACACGACTGTGCTTCACGCCATCTATTAACATGTACGTCAGTATATGGGGATGTTTCCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTA > 1:392289/1‑143 TGAGACGGCTGTGCTTCACGCCATCGATTAACATGTACGTCAGTATATGGGGATGTTTCCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCA < 1:277044/143‑1 ACGACTGTGCTTCACGCCATCTATTAACATGTACGTCAGTATGTGGGGATGTTTCCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAA > 1:277456/1‑143 CTTCACGCCATCTATTAACATGTACGTCAGTATATGGGGATGTTTCCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCC < 2:474962/143‑1 GCCATCTATTAACATGTACGTCAGTATATGGGGATGTTCCCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTG < 1:42285/143‑1 GCCAGCTATTAACATGTACGTCAGTATATGGGGATGTTTCCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTG < 2:303363/143‑1 TATTAACATGTACGTCAGTATATGGGGATGTTTCCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGAAATGATTTAACGGGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGGCAGCAATTCTGGACGACATTCGTAAGC > 2:93215/1‑143 ATTAACATGTACGTCAGTATATGGGGATGTTTCCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCC > 1:283734/1‑143 ATGTACGTCAGTATATGGGGATGTTTCCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCCATTCTGGCCCGTATTGGTAAGCCCGAAGA > 1:414190/1‑143 ATGTACGTCAGTATATGGGGATGTTTCCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGAAGA > 1:345200/1‑143 gaTACGTCAGTATATGGTGATGTTTCGCCATAATCGCTCACTTAACAGACGTCGATGTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCTCATATTGGTAAGCCCGAAGAA < 2:78562/141‑1 GTCAGTATATGGGGATGTTTCCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGAAGAACTGGA < 2:345200/143‑1 GTCAGTATATGGGGATGTTTCCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGAAGAACTGGA > 1:416193/1‑143 AGTATATGGGGATGTTTCCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTTGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGAAGAACTGGATAC < 2:392289/143‑1 TTTCCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGAAGAACTGGATACTTCGGCACGTAATG > 2:376111/1‑143 CCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGAAGAACTGGATACTTCGGCACGTAATGCCGG > 1:283457/1‑143 CCATAGGCGCTAACTTAGGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGAAGAACTGGATACTTCGGCACGTAATGCCGGG < 2:194761/143‑1 CCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGAAGAACTGGATACTTAGGCACGGAATGCCGGG > 1:50913/1‑143 CCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACGGGTCAGCAATTCTGGCCGATATTGGTAAGCCCGACGAACTTGATACTTTGGCACGGAATGCTGGG > 1:89561/1‑143 ATACGGGGATTTCAATGCGTTCAGAACGCTCAGGATTCATAGAGCTCTCTCTTAGTTTAATTTCCGCCAGGTAATCAGATGACACGACTGTGCTTCACGCCATCTATTAACATGTACGTCAGTATATGGGGATGTTTCccc‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/458927‑458790‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGAAGAACTGGATACTTCGGCACGTAATGCCGGG > NC_000913/608008‑608151 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |