| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC JC | NC_000913 | 458,790 | IS186 (–) +6 bp :: Δ1 bp | intergenic (+90/‑93) | clpX → / → lon | ATPase and specificity subunit of ClpX‑ClpP ATP‑dependent serine protease/DNA‑binding ATP‑dependent protease La |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 458790 = | 0 (0.000) | 33 (0.880) | 30/278 | 0.2 | 100% | intergenic (+90/‑98) | clpX/lon | ATPase and specificity subunit of ClpX‑ClpP ATP‑dependent serine protease/DNA‑binding ATP‑dependent protease La |
| ? | NC_000913 | 608008 = | NA (NA) | noncoding (2/1345 nt) | IS186 | repeat region | |||||
| * | ? | NC_000913 | = 458795 | 1 (0.030) | 31 (0.830) | 28/276 | 0.3 | 96.7% | intergenic (+95/‑93) | clpX/lon | ATPase and specificity subunit of ClpX‑ClpP ATP‑dependent serine protease/DNA‑binding ATP‑dependent protease La |
| ? | NC_000913 | = 609351 | NA (NA) | noncoding (1345/1345 nt) | IS186 | repeat region | |||||
GTGGCCATTCGTGGGACAGTATCCCTGACAGCCTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCTTTACACTTTCGCCCGTGGTCAGTGATGGCTGCGGGCGAATCGTACCAGATGTTGTCAATTAATCGTGTTGGCACAGCGTTATGACTATCTTT > NC_000913/609221‑609492 | gTGGCCATTCGTGGGACAGTATCCCTGACAGCCTACAAAAAGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAATTAACGATCATAGGCGTAGTCCCCGcc > 2:568678/1‑142 (MQ=11) caatCGTTGGACAGTATCTCTGATAGCCTTCAAAACGTATTTAAAGAACGCGAAGCAACGTCTAAACGAGGCACCGAGGCGGCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATcc < 1:235761/140‑1 (MQ=14) cGTGGGACAGTAGCCCTGGCAGCCTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGtt < 1:277877/143‑1 (MQ=255) aCAGTATCCCTGACAGCCTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTCAGTTACCGCTTATGGGAGTAATCACCACATATCCGGTTttcagg > 1:476059/1‑143 (MQ=14) aCAGTATCCCTGACAGCCTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGTGAGTAATCCCCGCATATCCGGTAgtcaga > 1:256108/1‑142 (MQ=255) aCAGTATCCCTGACAGCCTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAATAATTCCCGCATATCCAGTTgtcagg > 1:710921/1‑143 (MQ=255) cAGTATCCCTGACAGCCTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTCTGGGCGTAATCCCCGCATATCCGGTTgtcaggt > 1:663474/1‑143 (MQ=255) tATCCCTGACAGCCTACAAAACGCAATTAAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAAGCGTCGCAGTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATACCCGCATATCCGGTTgtcaggtcag > 2:371134/1‑143 (MQ=255) tGACAGCCTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGCGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGATCAGGATGGt > 1:481534/1‑143 (MQ=255) gtaCATCCTACATATCGCCATTTAATCCCTCGAGGTATCGTCTTAACGAGGCCCCGAGGCTTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCGTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATTTCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGt < 2:378307/141‑1 (MQ=17) gACAGCCTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCACATACTTAAGATGATTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGCTGTCAGGTTAGGATGGTa > 1:339069/1‑143 (MQ=17) acggCCGACAAAACGCGATTGGAGACCGCTAGGCGTCGTCTTAACGTGGCACCGAGGCGGCGCATTCTGCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGTTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTaa < 2:671510/140‑1 (MQ=18) aGCCTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTCTGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTTTCAGGGCGGGGTGGTCAgg > 1:275391/1‑143 (MQ=17) cGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGATTTa > 1:490575/1‑143 (MQ=255) cGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATCGGAGTCATCCCCGCATCTCCGGTTGTCAGGTCAGGCTCGCAAGGCACCTGcctca > 2:22655/1‑139 (MQ=18) 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2:623991/136‑1 (MQ=255) aCCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTCATCCCCGCATATCCGGTGGTCAGGTCCGGATGGTAAGGCACCTGCTTTACACTTTCGACCGTGGTAAGCGATCGCTGCGGCCGGAt > 2:691031/1‑143 (MQ=25) ccGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCTTTACACATTCGACAGTGGTCAGTGATGGATGCGGGCGAATc > 1:572195/1‑143 (MQ=255) gTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGCCCAGGCTGGTAAGGCACCTGCTTTACACTTTCGCCCGTGCTCCGTTATGGCTGCGCGCGCATTGTACCAg > 2:46882/1‑143 (MQ=37) tCGCACTCATCAAATCGTGCAACCCCTAAGGTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCTTTACACTTTCGCCCGTGGTCAGTGATGGCTGCGGGCGAATCGTACCAGa < 1:225265/143‑1 (MQ=255) gCATTCTTCAGTTGTTTCATTCTTTAATTTAGTGCTTATGGTAGTAATACCAGCATAGCCGGTTGGCAGGACAGGACGGTAAGGCACCTGCTTTACACTTTCGCCCGTGGTCAGTGATGGCTGCGGGCGAATCGTACCAGAtg < 1:16943/143‑1 (MQ=255) 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2:564973/1‑142 (MQ=255) tcacgtAAGTTAGCGCTTAGCGGAGTCCTCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTCAGGCACCTGATGTACACTGTCGCCCGTGGTCAGTGATGGCTGCGGGCGAATCGTACCAGATGTTGTCAATTAATCGTGTTg < 2:339760/138‑1 (MQ=255) cccTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCTTTACACTTTCGCCCGTGGTCAGTGATGGCTGCGGGCGAATCGTACCAGATACTGTCAATTAATCGTGtttg > 1:402779/1‑141 (MQ=255) ttAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCTTTACACTTTCGCACGTGGTCAGTGATGGCAGCGAGCGAATCGTACCAGATGTGGTCAATTAATCGTGTTGGcac > 1:190547/1‑143 (MQ=255) gcgcTGAAGGGAGTAAGCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACGGTAGACACACTTTCGCCCGTGGTCAGTGATGGCTGCGGGCGAATCGTACCAGATGTTGTCAATTAATCGTGTTGGCACAGCGTTAt < 1:331404/143‑1 (MQ=255) ttATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCTTTACACTTTCGCCCGTGGTCAGTGACGGCTGCGGGCGAATCGTACCAGATGTTGTCAATTAATAGTGTTGGCACAGCGTTATGACt > 1:194317/1‑143 (MQ=255) gAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCTTTACACTTTCGCCCGTGGTCAGTGATGGCTGCGGGCGAATCATACCAAATGTTGTCAATTAATCGTATGAGCAAAGCGTTATGACTAtcttt > 1:387217/1‑143 (MQ=255) | GTGGCCATTCGTGGGACAGTATCCCTGACAGCCTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCTTTACACTTTCGCCCGTGGTCAGTGATGGCTGCGGGCGAATCGTACCAGATGTTGTCAATTAATCGTGTTGGCACAGCGTTATGACTATCTTT > NC_000913/609221‑609492 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |