| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| JC JC | NC_000913 | 458,790 | IS186 (–) +6 bp :: Δ1 bp | intergenic (+90/‑93) | clpX → / → lon | ATPase and specificity subunit of ClpX‑ClpP ATP‑dependent serine protease/DNA‑binding ATP‑dependent protease La |
| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_000913 | 458790 = | 0 (0.000) | 70 (1.030) | 62/278 | 0.1 | 100% | intergenic (+90/‑98) | clpX/lon | ATPase and specificity subunit of ClpX‑ClpP ATP‑dependent serine protease/DNA‑binding ATP‑dependent protease La |
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| * | ? | NC_000913 | = 458795 | 0 (0.000) | 92 (1.370) | 74/276 | 0.0 | 100% | intergenic (+95/‑93) | clpX/lon | ATPase and specificity subunit of ClpX‑ClpP ATP‑dependent serine protease/DNA‑binding ATP‑dependent protease La |
| ? | NC_000913 | = 609351 | NA (NA) | noncoding (1345/1345 nt) | IS186 | repeat region | |||||
Only 100 of 167 total aligned reads displayed.
TTGCTGATTTATGGCAAGCCGGAAGCGCAACAGGCATCTGGTGAATAATTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGT‑GGGGGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTAATAGATGGCGTGAAGCACAGTCGTGTCATCTGATTACCTGGCGGAAATTAAACTAAGAGAGAGCTCTATGAATCCTGAGCGTTCTGAACGCATTGAAATCCCCGTATTGCCGCTGC > NC_000913/458653‑458936 | ttGCTGATTTATGGCAAGCCGGAAGCGCAACAGGCATCTGGTGAATAATTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGT‑GGGGGAAACa > 2:764564/1‑143 (MQ=255) cTGATTTATGGCAAGCCGGAAGCGCAACAGGCATCTGGTGAATAATTAACCATTCCCATACAATTGGTTAACCAAAAAGGGGGGAGTTTGTGTCCCCTTTAGTTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGT‑GGGGGAGACAtcc > 1:782453‑M1/1‑140 (MQ=255) tGATTTATGGCAAGCCGGAAGCGCAACAGGCATCTGGTGAATAATTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGT‑GGGGGAAACAtccc > 1:511686‑M1/1‑139 (MQ=255) tGATTTATGGCAAGCCGGAAGCGCAACAGGCATCTGGTGAATAATTAACCATTCCCAAACTGTTAGGTTACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGT‑GGGGGAAACAtccc > 1:471174‑M1/1‑139 (MQ=255) tgacgcagtatccagttcctcgggctacccaatatgggccagaactgctgaccagttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatgggGAAACATcccc > 1:621037‑M1/133‑143 (MQ=255) aTTTATGGCAAGCCGGAAGCGCAACAGGCATCTGGTGAATAATTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGT‑GGGGGAAACAtcccat > 1:189540‑M1/1‑137 (MQ=255) cgaagtatccagttcttcgggcttaccaatatgggccagaattgctgaccagttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatgggGAAACAGCGCCata < 2:851986‑M1/14‑1 (MQ=255) tGGCAAGCCGGAAGCGCAACAGGCATCTGGTGAATAATTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGT‑GGGGGAAACAtcccataagcg > 2:290613‑M1/1‑132 (MQ=255) cAAGCCGGAAGCGCAACAGGCATCTGGTGAATAATTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGCGTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGT‑GGGGGAAACAtcccataagcgcta > 1:615608‑M1/1‑129 (MQ=255) 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caatatgggccagaattgctgaccagttatcgtgagagaaatgcaccggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatgggGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTAATAGATGGc < 2:268209‑M1/40‑1 (MQ=255) tGAATAATTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGT‑GGGGGAAACAtcccataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaat > 1:128976‑M1/1‑102 (MQ=255) gggccagaattgctgaccagttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatgggGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTAATAGATGGCGTGAAg < 1:957393‑M1/46‑1 (MQ=255) gAATAATTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGT‑GGGGGAAACAtcccataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatg > 1:335212‑M1/1‑101 (MQ=255) gAATAATTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGT‑GGGGGAAACAtcccataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatg < 1:388315‑M1/143‑43 (MQ=255) 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cATCCCCATATACTGACGTACATGTTAATAGATGGCGTGAAGCACAGTCGTGTCATCTGATTACCTGGCGGAAATTAAACTAAGAGAGAGCTCTATGAATCCTGAGCGTTCTGAACGCATTGAAATCCCCGTATTGCCGCTgc < 1:511963/143‑1 (MQ=255) | TTGCTGATTTATGGCAAGCCGGAAGCGCAACAGGCATCTGGTGAATAATTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGT‑GGGGGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTAATAGATGGCGTGAAGCACAGTCGTGTCATCTGATTACCTGGCGGAAATTAAACTAAGAGAGAGCTCTATGAATCCTGAGCGTTCTGAACGCATTGAAATCCCCGTATTGCCGCTGC > NC_000913/458653‑458936 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |