| Predicted mutation | ||||||
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| JC JC | NC_000913 | 458,790 | IS186 (–) +6 bp :: Δ1 bp | intergenic (+90/‑93) | clpX → / → lon | ATPase and specificity subunit of ClpX‑ClpP ATP‑dependent serine protease/DNA‑binding ATP‑dependent protease La |
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| * | ? | NC_000913 | = 458795 | 0 (0.000) | 92 (1.370) | 74/276 | 0.0 | 100% | intergenic (+95/‑93) | clpX/lon | ATPase and specificity subunit of ClpX‑ClpP ATP‑dependent serine protease/DNA‑binding ATP‑dependent protease La |
| ? | NC_000913 | = 609351 | NA (NA) | noncoding (1345/1345 nt) | IS186 | repeat region | |||||
ATAGTGCTGTGTTTAACGGTGCTGGGATTTACGCTTCTGGTCGGAGACTCGCTGTGTGAGTTTACGGTGAAGGAACGTAATATTGAGTTT‑AAGGCTGTTCTCGCTTACGAACCGAAG‑‑AAGTAGCCGTTGTGCGGGGAGTAATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGAAGAACTGGATACTTCGGCACGTAATGCC > NC_000913/607866‑608148 | aTAGTGCTGTGTTTAACGGTGCTGGGATTTACGCTTCTGGTCGGAGACTCGCTGTGTGAGTTTACGGTGAAGGAACGTAATATTGAGTTT‑AAGGCTGTTCTCGCTTACGAACCTAAG‑‑AAGAAGCCGTTGTGCGGGGAGTAATc > 2:75042/1‑143 (MQ=255)aTAGCGCTGTGTTTAACGGTGCGGGGATTTACGCTTCTGGTCGGAGACTCGCTGTGTGAGTTTACGGTGAAGGAACGTAATATTGAGTTT‑AAGGCTGTTCTCGCTTACGAACCGAAG‑‑AAGTAGCCGTTGTGCGGGGAGTAATc < 1:703294/143‑1 (MQ=255)aTAGCGCTGTGTTGAACGGTGCTGGGATTTACGCTTCGGGTCGGAGACTCGCTGTGTGAGTTTACGGTGAAGGAACGTAATATTGAGTCT‑AAGGCTGTTCTCGCTTACGAACCGAAG‑‑AAGTAGCCGTTGTGCGGGGAGTAATc < 2:696834/143‑1 (MQ=255) cTGTGTTTAACGGTGCTGGGATTTACGCTTCTGGTCGGAGACTCGCTGTGTGAGTTTACGGTGAAGGAACGTAATATTGAGTTT‑AAGGCTGTTCTCGCTTACGAACCGAAG‑‑AAGTAGCCGTTGTGCGGGGAGTAATCCCATaa > 1:97391/1‑143 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gaCTCGCTGTGTGAGTTTACGGTGAAGGAACGTAATATTGAGTTT‑AAGGCTGTTCTCGCTTACGAACCGAAG‑‑AAGTAGCCGTTGTGCGGGGAGTAATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGAt < 2:97391/143‑1 (MQ=255) gaCTCGCTGTGTGAGTGTACGGTGAAGGAACGGAATATTGAGTTT‑AAGGCTGTTCTCGCTTACGAACCGAAG‑‑AAGTAGCCGTTGTGCGGGGAGTAATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGAt < 1:490377/143‑1 (MQ=255) ccTCGCTGTGTGAGTTTACGGTGAAGGAACGTAATATTGAGTTT‑AAGGCTGTTCTCGCTTACGAACCGAAG‑‑AAGTAGCCGTTGTGCGGGGAGTAATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGAtt < 1:596131/142‑1 (MQ=255) cTCGCTGTGTGAGTTTACGGTGAAGGAACGTAATATTGAGTTT‑AAGGCTGTTCTCGCTTACGAACCGAAG‑‑AAGTAGCAGAAGAGAAGGGATTTATCTTATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGAttt > 1:1240172/1‑143 (MQ=37) tCGCTGTGTGAGTTTACGGTGAAGGAACGTAATATTGAGTTT‑AAGGCTGTTCTCGCTTACGAACCGAAG‑‑AAGTAGCCGTTGTGCGGGGAGTAATCCCTTAAGCGCTAACTTAAGGGATGTGGTATTATGCCGGATATgctgaa > 1:163724/1‑138 (MQ=255) gCTGTGTGAGTTTACGGTGAAGGAACGTAATATTGAGTTT‑AAGGCTGTTCTCGCTTACGAACCGAAG‑‑AAGTAGCCGTTGTGCGGGGAGTAATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATGTGATTTAAc > 1:714724/1‑143 (MQ=255) gCTGTGTGAGTTTACGGTGAAGGAACGTAATATTGAGTTT‑AAGGCTGTTCTCGCTTACGAACCGAAG‑‑AAGTAGCCGTTGTGCGGGGAGTAATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCGGATATGATTTCAc > 1:453781/1‑143 (MQ=255) tgtgAGTTTACGGTGAAGGAACGTAATATTGAGTTT‑AAGGCTGGTCTCGCTTACGAACCGAAG‑‑AAGTAGCCGTTGTGCGGGGAGTAATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGc < 1:1204848/143‑1 (MQ=255) tgAGTTTACGGTGAAGGAACGTAATATTGAGTTT‑AAGGCTGTTCTCGCTTACGAACCGAAG‑‑AAGTAGCCGTTGTGCGGGGAGTAATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGGGGTATTACGCCTGATATGCTTTAACGTGCCg > 1:1207972/1‑143 (MQ=255) tgTTTGCGGTGAAGGAACGTAATATTGAGTTT‑AAGGCGGTTCGCGCTTACGAACCGAAG‑‑AAGGAGCCGTTGTGCGGGGAGTAATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGAt < 2:1114348/142‑1 (MQ=255) aGTTTACGGTGAAGGAACGTAATATTGAGTTT‑AAGGCTGTTCTCGCTTACGAACCGAAG‑‑AAGTAGCCGTTGTGCGGGGAGTAATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGAt > 1:750476/1‑143 (MQ=255) gTTTACGGTGAAGGAACGTAATATTGAGTTT‑AAGGCTGTTCTCGCTTACGAACCGAAG‑‑AAGTAGCCGTTGTGCGGGGAGTAATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGGATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATg > 2:701661/1‑143 (MQ=255) ttACGGTGAAGGAACTTAATATTGTGTTTGAAGGACG‑ACACGCTTACGAACCGAAG‑‑AAGTAGCAGTCGTGCGGGGAGTAATCCCATAAGCGCTAACTAAACGGATGTGGTAGTCCGCGTGTTATATTTTAACGTACGgaagaa > 2:92942/1‑143 (MQ=255) tACGGTGAAGGAACGTAATATTGAGTTT‑AAGGCTGTTCTCGCTTACGAACCGAAG‑‑AAGTAGCCGTTGTGCGGGGAGTAATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAAt > 2:676160/1‑143 (MQ=255) cGGTGAAGGAACGTAATATTGAGTTT‑AAGGCTGTTCTCGCTTACGAACCGAAG‑‑AAGTAGCCGTTGTGCGGGGAGTAATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTa < 1:809924/143‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |