Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
JC JC | NC_000913 | 458,790 | IS186 (–) +6 bp :: Δ1 bp | intergenic (+90/‑93) | clpX → / → lon | ATPase and specificity subunit of ClpX‑ClpP ATP‑dependent serine protease/DNA‑binding ATP‑dependent protease La |
New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | 458790 = | 1 (0.010) | 83 (1.040) | 60/278 | 0.2 | 98.8% | intergenic (+90/‑98) | clpX/lon | ATPase and specificity subunit of ClpX‑ClpP ATP‑dependent serine protease/DNA‑binding ATP‑dependent protease La |
? | NC_000913 | 608008 = | NA (NA) | noncoding (2/1345 nt) | IS186 | repeat region | |||||
* | ? | NC_000913 | = 458795 | 0 (0.000) | 64 (0.810) | 53/276 | 0.4 | 100% | intergenic (+95/‑93) | clpX/lon | ATPase and specificity subunit of ClpX‑ClpP ATP‑dependent serine protease/DNA‑binding ATP‑dependent protease La |
? | NC_000913 | = 609351 | NA (NA) | noncoding (1345/1345 nt) | IS186 | repeat region |
GAGCTTACAGGTGGCCATTCGTGGGACAGTATCCCTGACAGCCTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCT‑TAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCTTTACACTTTCGCCCGTGGTCAGTGATGGCTGCGGGCGAATCGTACCAGATGTTGTCAATTAATCGTGTTGGCACAGCGTTATGACTATCTTTT > NC_000913/609211‑609493 | gAGCTTACAGGTGGCCATTCGTGGGACAGTATCCCTGACAGCCTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTGCAGATGGTTCAACCCT‑TAAGTTAGCGCTTATGGGAga > 1:680554/1‑142 (MQ=11) aGCTTACAGGTGGCCATTCGTGGGACAGTATCCCTGACAGCCTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGTCATCGTCTTACCGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCT‑TAAGTTAGCGCTTATGgtagta < 1:55060/143‑1 (MQ=9) cTTACAGGTGGCAATTCGTGGGACAGTATCCCTGACAGCCTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCT‑TAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAAt < 1:1419780/143‑1 (MQ=18) ggTGGCCATTGGTGGGCAAGTAGTCCTGACAGCCTACAAAACGCGATTGAAGAACGCGATGCATCGTCTTAACGAGGCACCGCGGCGTCGCATTCTTCAGCTGG‑TCTTCCCTGTATCTGAGCGCTTACGGGAGTAATCCCCGc < 2:314050/143‑1 (MQ=2) ttCGTGGGAGAGTATCCCTCACAGCCTACAGAGCGCAATGGAAGATCGCGAGGCATCGTCTTACCGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCT‑TAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCgg < 2:1058653/143‑1 (MQ=14) ttCGTGGGACAGTATCCCTGACAGCCTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCT‑TAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCgg < 2:460902/143‑1 (MQ=255) ttCGTGGGACAGTATCCCTGACAGCCTAAAAAACGCAATTGACGAACGCGATGCATCGTCTTAACGAGGCACAGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCT‑GAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCTCCGCATATCCgg > 1:308835/1‑143 (MQ=14) cGTGGGACAGTATCCCTGACAGCCTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCT‑TAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGtt < 1:9284/143‑1 (MQ=255) tGGGACAGTATCCCTGACAGCCTACAAAACGAAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCAGTCTTCAGATGGTTCAACCCT‑TAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTgt > 2:513425/1‑143 (MQ=255) ggtaCAGTTTCCCTGACAGCCTACAACACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACCAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCT‑TAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTgtc < 1:1173169/140‑1 (MQ=255) ggACAGTATCCCTGACAGCCTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGCCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCT‑TAAGTTAGCGCTTATGGGAATAATCCCCGCATATCCGGttcgca > 2:196161/1‑139 (MQ=255) aCAGTATCCCTGACAGCCTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACACT‑TAAGTTAGCGCTTATGGGAGGAATCCCCGCATAGCCGGTGgacagg > 1:223902/1‑143 (MQ=14) aGTATCCCTGACAGCCTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCT‑TAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTgtcaggtc > 1:1258713/1‑143 (MQ=255) gTATCCCTGACAGCCTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCT‑TAAGTTAGCGCTTATGGGAGACATCCCCGCATATCCGGTTgtcagcaca > 2:988881/1‑139 (MQ=255) aTCCCTGACAGCCTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCACTCTTCAGATGGTTCAACCCT‑TAAGTTAGCGCCTATGGGCGTAATCCCCGCATATCCGGTTGtcaggtcagg > 1:373070/1‑143 (MQ=255) tCCCTGACAGCCTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCT‑TAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGa < 1:315909/143‑1 (MQ=255) cTGACAGCCTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCT‑TAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATgg > 2:835795/1‑143 (MQ=255) cTGAAAGCCTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCT‑TAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGCCAGGTCAGGATga > 1:1223669/1‑142 (MQ=255) aCAGCCTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCT‑TAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTaa < 2:1090860/143‑1 (MQ=255) tACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCT‑TAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTa > 2:1171692/1‑136 (MQ=255) tACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCT‑TAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTa < 1:1171692/136‑1 (MQ=255) tACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCT‑TAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCAcc > 1:881633/1‑143 (MQ=255) aaaaCGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCT‑TAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGc > 1:44065/1‑143 (MQ=255) aaaCGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATACTTCAGATGGTTCAACCCT‑TAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGACAGGACGGTAAGGCACCTGCt > 2:33847/1‑143 (MQ=255) gCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCT‑TAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTCGGCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCTTTac > 2:119358/1‑143 (MQ=255) ttGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCT‑TAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGCTTGTCCGGCCCGCATTGTACGGCACCTGCTTTgcacgc > 1:1073291/1‑141 (MQ=17) aaCGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCT‑TAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCTTTACACTTTCGccc > 2:808776/1‑143 (MQ=255) cgAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCT‑TAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCTTTACACTTTCGCCCGTgg < 1:148431/143‑1 (MQ=255) gAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCT‑TAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCACCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGGTGGTAAGGCACCTGCTTTACACTTTCGCACGTTGt > 2:329478/1‑143 (MQ=255) aTCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCT‑TAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAGGGCACCTGCTTTACACTTTCGCCCGTGGTCAGTg > 1:445982/1‑143 (MQ=255) aTCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCT‑TAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCTCTACACTTTCGCCCGTGCTCAggg > 2:1256616/1‑141 (MQ=255) cGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCT‑TAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGAATATCCGGGTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCTTTACACTTTCGCCCGTGGTGAGTGAt > 2:1029617/1‑143 (MQ=255) ttAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCT‑TAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCTTTACACTTTCGCCCGTGGTCAGTGATGGCt > 1:358719/1‑143 (MQ=255) tAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCT‑TAAGTTAGCGCTTATTGAAGTGATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGCGGCGGATGGTAAGGCCCACGCTGTACACTGTGACCCGGGGGCAGTgtaggcag > 2:130274/1‑136 (MQ=12) tAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCT‑TAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCTTTACACTTTCGCACGTGGTCAGTGATGGCTg > 1:63777/1‑143 (MQ=255) aaCGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCT‑TAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCTTTACACTTTCGCCCGTGGTCAGTGATGGCTGc > 1:719452/1‑143 (MQ=255) aaCGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCAT‑TAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATCTGCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACGTGCTTTACACTTTCGCCCGTGGTCAGTGATGGCTGc > 1:711209/1‑143 (MQ=255) aaCGAGGCACCGAGGCGTCGCATGCTTCAGATGGTTCAACCCT‑TAAGTTAGCGCTTATGTGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCTTTACACTTTCGCCCGTGGTCAGTGATGGCTGc < 1:649521/143‑1 (MQ=255) cGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCT‑TAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCCTATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCTTTACACTTTCGCCCGTGGTCAGTGCTGGCTGCgg > 2:1048222/1‑143 (MQ=255) gTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCT‑TAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCACCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCTTTACACTTTCGCCCGAGGTCAGTGATGGCTGCGGGCGAATGGTACCAg > 2:926285/1‑143 (MQ=255) tCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCT‑TAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCTTTACACTTTCGCCCGTGGTCAGTGATGGCTGCGGCCGGATCGTACCCGa > 1:522481/1‑143 (MQ=255) gCATTCTTCAGATGGTTCAACCCT‑TACGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCTTTACACTTTCGCCCGTGGTCAGTGATGGCTGCGGGCGAATCGTACCAGCtg > 1:276742/1‑143 (MQ=255) agtcttcAGATGGTTCAACCCT‑TAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCTTTACACTTTCGCCCGTGGTCAGTGATGGCTGCGGGCGAATCGTACCAGAtgtt < 2:84048/141‑1 (MQ=255) tcAGATGGTTCAACCCT‑TAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCTTTACACTTTCGCCCGTGGTCAGTGATGGCTGCGGGCGAATCGTACCAGATGTTGTCaa < 1:261082/143‑1 (MQ=255) tcAGATGGTTCAACCCT‑TAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCTTTACACTTTCGCCCGTGGTCAGTGATGGCTGCGGGCGAATCGTACCAGATGTTGTCaa < 1:835795/143‑1 (MQ=255) aGATGGTTCAACCCT‑TAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCTTTACACTTTCGCCCGTGGTCAGTGATGGCTGCGGGCGAATCGTACCAGATGTTGTCAAtt > 1:1223871/1‑143 (MQ=255) aTGGTTCAACCCT‑TAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGCTGGTAAGGCACCTGATTTACACTTTCGCCCGTGGTAAGTGATGGCTGCCGGCGAAACGTAACAGCTGTTGTCAAATaa > 2:1093743/1‑143 (MQ=38) aTGGTTCAACCCT‑TAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCTTTACACTTTCGCCCGTGGTCAGGGATGGCTGCGGGCGAATCGTATCAGATGTTGTGAAGTag > 2:47497/1‑142 (MQ=255) ggTTCAACCCT‑TAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTACGCCACATGCTTTACACTTTCGCCCGTGGTCAGTGATGGCTGCGGGCGAATCGTACCAGATGTTGTCAATTAATc < 1:1297149/143‑1 (MQ=255) ttCAACCCT‑TTATTTGGCGCTTAGTGGAGTAATCCCCGCATATCCGTTTTTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCTTTACACTTTCGCCCGTGGTCAGTGATGGCTGTGGGCGAATCGTACCAGATGTTGTCAATTAATCgt < 2:500145/143‑1 (MQ=255) cAACCCT‑TAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCTTTACACTTTCGCCCGTGGTCAGTGATGGCTGCGGGCGAATCGTACCAGATGTGGTCAATTCATCgtgt > 1:256118/1‑143 (MQ=255) aCCCT‑TAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCTTTACACTTTCGCCCGTGGTCAGTGATGGCTGCGGGCGAATCGTACCAGATGTTGTCAATTAATCGTGTTg < 2:1143407/143‑1 (MQ=255) aCCCT‑TAAGTTAGCGCTTATAGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGATCAGGATGGTAAGGCACCTGCTTTACACTTTCGCCCGAGGTCAGTGATGGCTGCGGGCAAATCGTACCAGATGTTGTCAATTAAtagaggtg > 2:377639/1‑136 (MQ=255) cccT‑GAAGTTAGGGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCTTTACACTTTCGCCCGTGGTCAGTGATGGCTGCGGGCGAATCGTACCAGATGTTGTCAATTAATCGTGTTgg < 2:739789/143‑1 (MQ=255) t‑tAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCTTTACACTTTCGCCCGTGGTCAGTGATGGCTGCGGGCGAATCGTACCAGATGTTGTCACTTAATCGTGTTGGcac > 1:1236167/1‑143 (MQ=255) aaGTTAGGGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCTTTACACTTTCGCCCGTGGTCAGTGATGGCTGCGGGCGAATCGTACCAGATGTTGTCAATTAATCGTGTTGGCACAg < 2:551077/143‑1 (MQ=255) ttAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCAGCGTTACACTTTCGCCCGTGGTCAGTGGTGGCTGCGGGCGAAGCGTACGAGATGTTGTCAGTGAATCGTGTTGGGACAGCGt > 1:756643/1‑143 (MQ=255) gcgcTTATGGTAGTGACTCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCTTTACACTTGCGCCCGTGGTCAGTGATGGCTGCGGGCGAATCGTACCAGATGTTGTCAATTAATCGTGTTGGCACAGCGTTAt < 2:769377/143‑1 (MQ=255) ggtgaggggAGTAATCCCCGCATAGCCGATGGGCAGGTCAGGAGGGGAAGGCACCTGCGTGACACTCTCGCCCGTGGTCAGTGATGACTGTGGGGTCAGCCTACCAGATGTTGTCAATTAATCGTGTTGGAACAGCGTTATGa < 2:310147/137‑1 (MQ=255) gcTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCTTTACACTTTCGCCTGTGGTCAGTGATGGCTGCGGGCGAATCGTACCAGATGTTGTCAATTAATCGTGTTGGCACAGCGTTATGa < 1:1314401/143‑1 (MQ=255) gcTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCTTTACACTTTCGCCCGTGGTCAGTGACGGCTGCGGGCGAATCCTACCAGCTGTTGTCAATTAATCGGGTCGGCACGACGTTATGa > 2:308181/1‑143 (MQ=255) gcTTATGGGAGTAAGCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCTTTACACTTTCGCCCGTGGTCAGTGATGGCTGCGGGCGAATCGTACCAGATGTTGTCAATTAATCGTGTTGGCACAGCGTTATGa < 2:1156588/143‑1 (MQ=255) aTGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCTTTACACTTTCGCCCGTGGTCAGTGATGGCTGCGGGCGAATCGTACCAGATGTTGTCAATTAATCGTGTTGGCACAGCGTTATGACTAt > 2:41428/1‑143 (MQ=255) aTGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCTTTACACTTTCGCCCGTGGTCAGTGATGGCTGCGGGCGAATCGTACCAGATGTTGTCAATTAATCGTGTTGGCACAGCGTTATGACTAt < 1:513425/143‑1 (MQ=255) gggAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCTTTACACTTTCGCCCGTGGTCAGTGATGGCTGCGGGCGAATCGTACCAGATGTTGTCACTTAATCGTGTTGGCACAGCGTTATGACTAtct > 2:84918/1‑143 (MQ=255) aGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCTTTACACTTTCGCCCGTGGTCAGTGATGGCTGCGGGCGAATCGTACCAGATGTTGTCAATTAATCGTGTTGGCACAGCGTTATGACTAtctttt > 2:335371/1‑143 (MQ=255) | GAGCTTACAGGTGGCCATTCGTGGGACAGTATCCCTGACAGCCTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCT‑TAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCTTTACACTTTCGCCCGTGGTCAGTGATGGCTGCGGGCGAATCGTACCAGATGTTGTCAATTAATCGTGTTGGCACAGCGTTATGACTATCTTTT > NC_000913/609211‑609493 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |