| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| JC JC | NC_000913 | 458,790 | IS186 (–) +6 bp :: Δ1 bp | intergenic (+90/‑93) | clpX → / → lon | ATPase and specificity subunit of ClpX‑ClpP ATP‑dependent serine protease/DNA‑binding ATP‑dependent protease La |
| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_000913 | 458790 = | 1 (0.020) | 55 (0.880) | 47/278 | 0.3 | 98.1% | intergenic (+90/‑98) | clpX/lon | ATPase and specificity subunit of ClpX‑ClpP ATP‑dependent serine protease/DNA‑binding ATP‑dependent protease La |
| ? | NC_000913 | 608008 = | NA (NA) | noncoding (2/1345 nt) | IS186 | repeat region | |||||
| * | ? | NC_000913 | = 458795 | 0 (0.000) | 65 (1.040) | 51/276 | 0.2 | 100% | intergenic (+95/‑93) | clpX/lon | ATPase and specificity subunit of ClpX‑ClpP ATP‑dependent serine protease/DNA‑binding ATP‑dependent protease La |
| ? | NC_000913 | = 609351 | NA (NA) | noncoding (1345/1345 nt) | IS186 | repeat region | |||||
Only 100 of 123 total aligned reads displayed.
AACCGTTGCTGATTTATGGCAAGCCGGAAGCGCAACAGGCATCTGGTGAATAATTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTAATAGATGGCGTGAAGCACAGTCGTGTCATCTGATTACCTGGCGGAAATTAAACTAAGAGAGAGCTCTATGAATCCTGAGCGTTCTGAACGCATTGAAATCCCCGTATT > NC_000913/458648‑458928 | cggcattacgtgccgaagtatccagttcttcgggcttaccaatatgggccagaattgctgaccagttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcatgcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatgggg < 1:801161‑M1/1‑1 (MQ=255) ggcattacgtgccgaagtatccagttcttcgggcttaccaatatgggccagaattgctgaccagttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatgggGa > 2:270727‑M1/142‑143 (MQ=255) cactacgggccgaagtatcccgttctgcgggcttaccaatatgggccagaattgctgaccagtgatcgtgagagtaattaatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatgggGaaa > 1:194260‑M1/140‑143 (MQ=255) cgtgccgaactatcgagttcttggggcttaccaatatgggctagaattgctgaccagttatcgtgagagcaactcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatgggGAAACATcc > 2:454724‑M1/135‑143 (MQ=255) tgattgatGGTAAGCCGGAAGCGCAACAGGCATCGGGGGAATAATTAGCCAGTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACAtccc < 2:782740‑M1/143‑5 (MQ=255) tGATTTATTGCAATCCGGAAGCGCAACGGGAATCTTGTGAATTGTTGACCATTCCCCTACCATTACTTATCCCAGAAGGGGAGATCTTATCTCCCCGTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATccc < 2:1102265/143‑1 (MQ=255) tGATTTATGGCAAGCCGGAAGCGCAACAGGCATCTGGTGAATAATTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACAtccc > 1:780461‑M1/1‑139 (MQ=255) gcgaggtatccagttctgcgggcttaacaatatgggtcagaattgctgagcagttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatgggGAAACATCCCCat > 1:1098568‑M1/131‑143 (MQ=255) ccgaagtatccagttcttcgggcttaccaatatgggccagaattgctgaccagttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatgggGAAACATCCCCat > 1:181524‑M1/131‑143 (MQ=255) 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cGGCGTTGAATGTGGGGGAAACAtcccataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgttaagacgatgcctcgcgttcttcaattgcgttttgtaggctgtcagggatactgtccca < 1:1139639‑M1/143‑121 (MQ=255) ggCGTTGAATGTGGGGGAAACAtcccataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgttaagacgatgcctcgcgttcttcaattgcgttttgtaggctgtcagggatactgtcccac < 1:742792‑M1/143‑122 (MQ=255) ttagcgcttatgggGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTAATAGATGGCGTGAAGCACAGTCGTGTCATCTGATTACCTGGCGGAAATTAAACTAAGAGAGAGCTCTATGAATCCTGAGCGTTCTGAACGCATTGaaa < 2:646416‑M1/129‑1 (MQ=255) ggtgaATGTGGGGGAAACAgtccattagcgctaagttatgggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcgtcgttaagacgatgcctcgcgttcttcaattgcgttttgtaggctgtcagggatactgtcccacgaa < 2:44963‑M1/141‑125 (MQ=255) tGAATGTGGGGGAAACAtcccataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgttaagacgatgcctcgcgttcttcaattgcgttttgtaggctgtcagggatactgtcccacgaatg < 2:59503‑M1/143‑127 (MQ=255) 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NC_000913/458648‑458928 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |