| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC JC | NC_000913 | 458,790 | IS186 (–) +6 bp :: Δ1 bp | intergenic (+90/‑93) | clpX → / → lon | ATPase and specificity subunit of ClpX‑ClpP ATP‑dependent serine protease/DNA‑binding ATP‑dependent protease La |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 458790 = | 1 (0.020) | 55 (0.880) | 47/278 | 0.3 | 98.1% | intergenic (+90/‑98) | clpX/lon | ATPase and specificity subunit of ClpX‑ClpP ATP‑dependent serine protease/DNA‑binding ATP‑dependent protease La |
| ? | NC_000913 | 608008 = | NA (NA) | noncoding (2/1345 nt) | IS186 | repeat region | |||||
| * | ? | NC_000913 | = 458795 | 0 (0.000) | 65 (1.040) | 51/276 | 0.2 | 100% | intergenic (+95/‑93) | clpX/lon | ATPase and specificity subunit of ClpX‑ClpP ATP‑dependent serine protease/DNA‑binding ATP‑dependent protease La |
| ? | NC_000913 | = 609351 | NA (NA) | noncoding (1345/1345 nt) | IS186 | repeat region | |||||
GCTTACAGGTGGCCATTCGTGGGACAGTATCCCTGACAGCCTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCTTTACACTTTCGCCCGTGGTCAGTGATGGCTGCGGGCGAATCGTACCAGATGTTGTCAATTAATCGTGTTGGCACAGCGTTATGACTATCTTT > NC_000913/609213‑609492 | gCTTACAGGTGGCCATTCGTGCGACAGTATCCCTGACAGCCTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTaa < 1:938828/143‑1 (MQ=17) ctgaCAGGTGGCCAGTCGTGGGACAGGATCCCTGACAGCCTACAACACGCAATTGAAGAACGCGAGGCAGCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAAt < 2:1084510/140‑1 (MQ=11) aCAGTTGGCCCTTCGTGGGACTGTATCCCTGACAGCCTACAAGTCGCAATGGAAGACCGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATccc < 2:663593/143‑1 (MQ=11) aCAGGTGGCCATTCGTGGGACAGTATCCCTGACAGCCTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTGAGCGCGTATGGGAGTAATccc > 2:1040348/1‑143 (MQ=25) aGGTGGCCATTCGTGGGACAGTATCCCTGACAGCCTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGCGTATTCCCCg > 1:421808/1‑143 (MQ=17) gCCATTCGTGGGACAGTATCCCTGACAGCCTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGCAATCCCCGCatat > 2:903223/1‑143 (MQ=25) cATTCGTGGGACAGTATCCCTGACAGCCTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCACGCatatac > 1:266785/1‑141 (MQ=255) atgcGTGGGACAGTATCCCTGACAGCCTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCg < 1:1040224/140‑1 (MQ=255) aTTCGTGGGACAGTATCCCTGACAGCCTACAAAACGTAATGGTACAACGCGAAGCATCGTCTTCACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTGAGATGGTTCAACCCTTACGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCGCCACATATCCg > 2:1131845/1‑143 (MQ=14) aTTCGTGGGACAGTATCCCTGACAGCCTACAAAACGCAATTGAAGAAGGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAAACCTTAAGTTAGCGCTTATTGGAGTAATCGCAGGATATCCg > 2:801357/1‑143 (MQ=11) aTTCGTGGGACAGTATCCCTGACAGCCTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATCTCCg > 2:1135707/1‑143 (MQ=255) cGTGGGACAGTATCCCTGACAGCCTACAAAGCGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGCTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGtt < 2:641288/143‑1 (MQ=255) gACAGTATCCCTCACAGCCTACCAAACGCAATTGAAGAACCCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGTTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTgtcag < 1:604206/143‑1 (MQ=255) aCAGTATCCCTGACAGCCTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACAGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGCTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATGCCAGCATAGCCGGTTgccagg > 1:931156/1‑143 (MQ=14) agcgtCCCTCACAGCCTACAAAACGCAATGGAAGGACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCCTTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTgtcaggtc < 2:162599/139‑1 (MQ=17) aTCCCTGACAGCCTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGtcaggtcagg > 1:530579/1‑143 (MQ=255) tCCCTGACAGCCTACAAAACGCAATTGAATATCTCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGa < 1:588271/143‑1 (MQ=255) cccTGACCGCCTACAAAACGCAATGGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGAt < 1:357573/143‑1 (MQ=255) ccTGACAGCCTACGAGACGCAATTGAAGCACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATg < 2:657280/143‑1 (MQ=255) ccTGACAGCCTACAAAACGCATTTGAAGAACGCTAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATg < 2:49016/143‑1 (MQ=255) cTGACAGCCTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATgg > 1:1078059/1‑143 (MQ=255) gcccgCCTACAACACGCAATTGAAGCCCGCTAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTa < 1:841221/139‑1 (MQ=18) gACGGCCTACAAAACGCAGTTGAAGAACGCGAGGCGTCGGCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTGCAGCTGGTTCAAGCTTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTa < 2:763226/143‑1 (MQ=18) acggtcTACCAAACGCAATTGATGAACGCGTGGCATCGTCGTAACGTGGCAGCGAGGCGTCGCATGCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATTCTCGCATTTCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTaa < 2:703505/138‑1 (MQ=17) aCAGCCTACAAAACGCAATTGCAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTaa < 2:1133058/143‑1 (MQ=255) cgCCTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAgg < 1:297011/142‑1 (MQ=255) aggcgaCAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAgg < 1:440139/138‑1 (MQ=255) ccTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATCTCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCa > 2:33993/1‑143 (MQ=255) cTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCAc > 1:860330/1‑143 (MQ=255) cTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTGAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCAc < 1:574853/143‑1 (MQ=255) aaaCGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCt > 1:711238/1‑143 (MQ=255) aaCGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCtt > 1:1016483/1‑143 (MQ=255) cGCTATTGGCGAACGCGAGGCATCGTGTGAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTGAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCTTTa < 2:53850/143‑1 (MQ=21) cAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCACCCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCTTTaca > 2:463636/1‑143 (MQ=255) aaTTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGCGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGCTGGTAAGGCACCTGCTTTacac > 2:602812/1‑143 (MQ=255) tGAAGAGCGCGAGGCACGGTCGTAACGAGGCACCGGGGCGTCGCATTCTTCCGATGGTGTTACTCTTAAGTTAGTGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCTTTACACttt < 2:1002609/143‑1 (MQ=255) gaagagCGCGAGGCATCGTCGGAACGAGGAACCGGGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGTGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCTTTACACTTTc < 2:36245/143‑1 (MQ=25) gaagaaCGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCTTTACACTTTc > 1:754540/1‑143 (MQ=255) aagaaCGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCTCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCCTTACACTTTcc > 2:673493/1‑142 (MQ=255) aagaaCGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGCGCGCGCAGAACATAGCCGCTTGTCAGCTCAGGATGGTAAGGCACCTGCTTTACACTTTCg > 1:263084/1‑143 (MQ=17) aaCGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCTTTACACTTTCGccc > 1:588899/1‑143 (MQ=255) aCGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTCAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCGCCGCCTATCCGGTTGTCCGGTCAGGATGGTAAGGCGCCTGCTTTACACTTTCGCACg > 2:18273/1‑143 (MQ=21) gcgAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCTGGTCGGGCTGGTACGGCACCTGCTTTACAATTTCGCCCGTg > 1:177706/1‑143 (MQ=21) ggCATTGACGTAACGACGCACCGTGGTGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCTTTACACTTTCGCCCGTGGTCa < 2:1028573/143‑1 (MQ=37) ttAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGCTGGTTCAACCCTTCACTTAGCGCTTATAGGAGTCCTCCCCGCATATCCGGTTGTCAGCTCAGGCTTGTAAGGCACCTGCTCTACACTTTCCCCCGTGGCCCGTggcggcc > 1:514992/1‑137 (MQ=21) ttAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCTTTACACTTTCGCCCGGGGGCAGTGATGGCt > 2:1054426/1‑143 (MQ=255) tAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCACATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCTTTACACTTTCGCCCGTGGTAAGTGAGGGCtt > 2:42691/1‑142 (MQ=255) cACCGGGGCGTCGCATGCGTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCTTTACACTTTCGCCCGTGGTCAGTGATGGCTGCGGGCGaa < 2:641742/143‑1 (MQ=255) cGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTACTTTACACTTTCACCCGTGGTCAGTGATGGCTGCGGGCGAATCg > 1:1108756/1‑143 (MQ=255) gAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCTTTACACTTTCGCCCGTGGTCAGTGATGGCTGCGGGCGAATCGt < 1:463636/143‑1 (MQ=255) ggCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCCCTTATGTGAGTAATCCCCGCATATCTGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCTTTACACTTACGCCGGTGGTCAGTGATGGCTGCGGGCGAATCGTAc > 2:189427/1‑143 (MQ=38) gTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCTTTACACTTTCGCCCGTGGTCAGTGATGGCTGCGGGCGAATCGTACCAg < 1:394498/143‑1 (MQ=255) cATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGCTGGTAAGGCACCTGCTTTACACTTTCGCCCGTGGTCAGCGATGGCTGCGGGCGAATCGTACCAGAtgt > 2:845857/1‑143 (MQ=255) cttcAGATGGTGCAACCCTTGAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCTTTACACTTTCGCCCGTGGTCAGTGATGGCTGCGGGCGAATCGTACCAGATGTTGTc < 2:1096002/143‑1 (MQ=255) cAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCTTTACACTTTCGCCCGTGGTCAGTGATGGCTGCGGGCGAATCGTACCAGATGTTGTCAAt > 1:1002930/1‑143 (MQ=255) ggTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCTTTACACTTTCGCCCGTGGTCAGTGATGGCTGCGGGCGAATCGTACCAGATGTTGTCAATTAATc < 2:643553/143‑1 (MQ=255) ccTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCTTTACACTTTCGCCCGTGGTCAGTGATGGCTGCGGGCGAATCGTACCAGCTGTTGTCAATTAATCGTGTTGGc > 1:1117229/1‑143 (MQ=255) ccTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCTTTACACTTTCGCCCGTGGTCAGTGATGGCTGCGGGCGAATCGTACCAGATGTTGTCAATTACTCGTGTTGGc > 1:847105/1‑143 (MQ=255) ttAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCTTTACACTTTCGCCCGTGGTCAGTGATGGCTGCGGGCGAATCGTACCAGATGTTGTCAATTAATCGTGTTGGcac > 1:792493/1‑143 (MQ=255) ttAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCTTTACACTTTCGCCCGTGGTCAGTGATGGCTGCGGGCGAATCGTACCAGATGTTGTCAATTAATCGTGTTGGcac > 2:909399/1‑143 (MQ=255) cggcgcTTATCGGAGTAGTCCCCGTAGCTCCGGTTGTCAGGGCAGGGTGGTAAGGCACCTGCTTTACACTGTCGCCCGTGGTCAGTGATGGCTGCGGGCGAATCGTACCAGATGTTGTCAATTAATCGTGTTGGCACAGCGtt < 2:829932/141‑1 (MQ=255) cgcTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCTTTACACTTTCGCGCGTGGTCAGTGATGGCTGCGGGCGAATCGTACCAGACGTTGTGTATTAATCGTGTTGGCACAGCGTTATg < 2:768014/143‑1 (MQ=255) gcTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTGAGGATGGTAAGGCACCTGCTTTACACTTTCGCCCGTGGTCAGTGATGGCTGCGGGCGAATCGTACCAGATGTTGTCAATTAATCGTGTTGGCACAGCGTTATGa < 2:530579/143‑1 (MQ=255) aTGGGAGTAATCCCCGCATCTCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCTTCACACTTTCGCCCGTGGTCAGTGCTGGCTGCGGGCGCATCGTACCAGATGTTGTCAATTAATCGTGTTGGCACAGCGTTATGACTAt < 1:1131845/143‑1 (MQ=255) aTGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCTTTACACTTTCGCCCGTGGTCAGTGATGGCTGCGGGCGAATCGTACCAGATGTTGTCAATTAATCGTGTTGGCACAGCGTTATGACTAt < 1:1135707/143‑1 (MQ=255) gAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCTTTACACTTTCGCCCGTGGTCAGTGATGGCTGCGGGCGAATCGTACCAGATGTTGTCAATTAATCGTGTTGGCACAGCGTTATGACTAtcttt < 1:197363/143‑1 (MQ=255) | GCTTACAGGTGGCCATTCGTGGGACAGTATCCCTGACAGCCTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCTTTACACTTTCGCCCGTGGTCAGTGATGGCTGCGGGCGAATCGTACCAGATGTTGTCAATTAATCGTGTTGGCACAGCGTTATGACTATCTTT > NC_000913/609213‑609492 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |