Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
MC JC | NC_000913 | 3,815,859 | Δ82 bp | [rph]–[rph] | [rph], [rph] |
Missing coverage evidence... | ||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
* | * | ÷ | NC_000913 | 3815859 | 3815940 | 82 | 68 [0] | [0] 69 | [rph]–[rph] | [rph],[rph] |
New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | = 3815858 | 0 (0.000) | 67 (1.130) | 60/264 | 0.0 | 100% | pseudogene (24/48 nt) | rph | ribonuclease PH (defective);enzyme; Degradation of RNA; RNase PH |
? | NC_000913 | 3815941 = | 0 (0.000) | pseudogene (609/669 nt) | rph | ribonuclease PH (defective);enzyme; Degradation of RNA; RNase PH |
CAAAAAAAAGGCGACTCATCAGTCGCCTTAAAAATCAGTTTGCCAGCGCCGCCTTCTGCGTCGCTACAATGGATTCGATTCCCCTCGGGCCAGAGCCAACAAGATGAGTAGCTCTTCATGGGTGAACGGCTCGCCTTCTGCCGTCCCCTGCACTTCAATGATGCGCCCGTCTTCGGTCATCACTACGTTCATGTCGGTCTCTGCGGCAGAGTCTTCAACGTATTCCAGATCGCAAACCGCTTCGCCGTTCACAATTCCGACAGAAACTGCGGCTACCATCCCTT > NC_000913/3815800‑3816083 | cacctgcttgctaagcgcaaattcaataaactggcgctgatatggtttcatgccttcgctcctcatcttacttttctacagacaaaaaaaaggcgactcatccgtcgccttaaaaatcagtttgccctcgccgccgtctgcCg > 1:862928‑M2/142‑143 (MQ=255) cctgcttgctaagcgcaaattcaataaactggcgctgatatggtttcatgccttcgctcctcatcttacttttctacagacaaaaaaaaggcgactcatcagtcgccttaaaaatcagtttgccagcgccgccttctgcCGTc > 1:410766‑M2/140‑143 (MQ=255) tgcttgctaagcgcaaattcaataaactggcgctgatatggtttcatgccttcgctcctcatcttacttttctacagacaaaaaaaaggcgactcatcagtcgccttaaaaatcagtttgccagcgccgccttctgcCGTccc < 1:801222‑M2/6‑1 (MQ=255) tgcttgcgaagcgcaaattcaataacctggcgctgatatggtttcatgccttcgctcctcatcttacttttctacagacaaaagaaaggcgtctcatcagtcgccttaaaaagcagtttgccagcgccgccttctgcCGTccc < 1:701385‑M2/6‑1 (MQ=255) cttgctaagcgcaaattcaataaactggcgctgatatggtttcatgccttcgctcctcatcttacttttctacagacaaaaaaaaggcgactcatcagtcgccgtaaaaatcagtttgccagcgccgccttctgcCGTCCCCt > 1:802667‑M2/136‑143 (MQ=255) gctaagcgcaaattcaataaactggcgctgatatggtttcatgccttcgctcctcatcttacttttctacagacaaaaaaaaggcgactcatcagtcgccttaaaaatcagtttgccagcgccgccttctgcCGTCCCCTGCa < 1:691771‑M2/11‑1 (MQ=255) taagcgcaaattcaataaactggcgctgatatggtttcatgccttcgctcctcatcttacttttctacagacaaaaaaaaggcgactcatcagtcgccttaaaaatcagtttgccagcgccgccttctgcCGTCCCCTGCACt > 1:290588‑M2/131‑143 (MQ=255) tcgcaagtccaataaacgtgcgctgatatggcttcatgccatcgctactgttgtgacttttctacagacaaaaaaaaggcgactcatcagtcgccttaaaaatcagtttgccagcgccgccttctgcCGTCCCCTGCACTTCa < 2:1119434‑M2/16‑1 (MQ=255) cgcaaattcaataaactggcgctgatatggtttcatgccttcgctcctcatcttacttttctacagacaaaaaaaaggcgactcatcagtcgccttaaaaatcagtttgccagcgccgccttctgcCGTCCCCTGCACTTCaa > 2:912809‑M2/127‑143 (MQ=255) cgcaaattcaataaactggcgctgatatggtttcatgccttcgctcctcatcttacttttctaaagacaaaaaaaaggcgactcatcagtcgccttaaaaatcagttggccaccgcagccttctgcCGTCACATGCCCTCCaa > 1:95497‑M2/127‑143 (MQ=255) cacattcaataaacaagcggtgagatggtttcatgccttcgctcctcatcttacttttctacagacaaaaaaaaggcgactcatcagtcgccttaaaaatcagtttgccagcgccgccttctgcCGTCCCCTGCACTTCAatg < 1:474834‑M2/19‑1 (MQ=255) aattcaataaactggcgctgatatggtttcatgccttcgctcctcatcttacttttctacagacaaaaaaaacgcgactcatcagtcgccttaaaaatcagtttgccagcgccgccttctgcCGTCCCCTGCACTTCAatgat < 2:258713‑M2/21‑1 (MQ=255) caatacactggcgctggtatggtttcatgccttcgctcctcatcttacttttctacagacaaaaaaaaggcgactcatcagtcgccttaaaaatcagtttgccagcgccgccttctgcCGTCCCCTGCACTTCAATGATgcgc < 2:1077159‑M2/25‑1 (MQ=255) caataaactggcgctgatatggtttcatgccttcgctcctcatcttacttttctacagacaaaaaaaaggcgactcatcagtcgccttaaaaatcagtttgccagcgccgccttctgcCGTCCCCTGCACTTCAATGATgcgc < 1:949477‑M2/25‑1 (MQ=255) ggcgctgatatggtttcctgccttccctcctcatcttactttgctacaaacaaaaaaaaggcgactcatcagtcgccttaaaaatcagtttgccagcgccgccttctgcCGTCCCCTGCACTTCAATGATGCGCCCGTCTTCg < 1:156900‑M2/34‑1 (MQ=255) ggcgctgatatggtttcatgccttcgctcctcatcttacttttctacagacaaaaaaaaggcgactcatcagtcgccttaaaaatcagtttgccagcgccgccttctgcCGTCCCCTGCACCTCCATGATGCGCCCGTCTTCg > 2:86163‑M2/110‑143 (MQ=255) atatggtttcatgccttcgctcctcatcttacttttctacagacaaaaaaaaggcgactcatcagtcgccttaaaaatcagtttgccagcgccgccttctgcCGTCCCCTGCACTTCAATGATGCGCCCGTCTTCGGtcatca < 2:936358‑M2/41‑1 (MQ=255) atggtttcatgccttcgctcctcatcttacttttctacagacaaaaaaaaggcgcctcatcaggcgccttaaaaatcagtttgccagcgccgccttctgcCGTCCCCTGCACTTCAATGATGCGCACGTCTTCGGTCACCACt > 2:712683‑M2/101‑143 (MQ=255) ggtttcatgccttcgctcctcatcttacttttctacagacaaaaaaaaggcgactcatcagtcgccttaaaaatcagtttgccagcgccgccttctgcCGTCCCCTGCACTTCAATGATGCGCCCGTCTTCGGGCACCACTAc > 1:179538‑M2/99‑143 (MQ=255) tttcatgccttcgctcctcatcttacttttctacagacaaaaaaaaaggcgactcatcagtcgccttaaaaatcagtttgccagcgccgccttctgcCGTCCCCTGCACTTCAATGATGCGCCCGTCTTCGGTCCTCACTACg > 1:751628‑M2/98‑143 (MQ=255) gtgtcatgccttctcccctcatcttagtttcctacagacaaaaacaaggcgactcatcagtcgccttaaaaagcagtttgccagcgccgccttctgcCGTCCCCTGCACTTCAATGATGCGCCCGTCTTCGGTCATCACTACg < 1:861603‑M2/46‑1 (MQ=255) ttcatgccttcgctcctcatcttacttttctacagacaaaaaaaaggcgactcatcagtcgccttaaaaatcagtttgccagcgccgccttctgcCGTACCCTGCACTTCAATGATGCGCCCGTCTTCGGTCATCACTAAGtt > 1:302512‑M2/96‑143 (MQ=255) ttcatgccctcgctcctcatcttacttttctacagacaaaaaaaaggcgactcatcagtcgccttaaaaatcagtgtgccagcgccgccttctgcCGTCCCCTGCACTTCAATGATGCGCCCGTCTTCGGTCATCACTACGtt < 1:1108491‑M2/48‑1 (MQ=255) tcatgccttcgctcctcatctcacttttctacagaaaaaaaaaaggagtctcttgcaccgcctgaaaactcagtttgccagcgccgccttctgcCGTCCCCTGCACTTCAATGATGCGCCCGTCTTCGGTCATCACTACGTTc < 1:530890‑M2/49‑1 (MQ=255) catgccttcgctcctcatcttacttttctacagacaaaaaaaaggcgactcatcagtcgccttaaaaatcagtttgccagcgccgccttctgcCGTCCCCTGCACTTCAATGATGCGCCCGTCTTCGGTCATCACTACGTGCa > 1:63934‑M2/94‑143 (MQ=255) tgccttcgctcctcatcttacttttctacagacaaaaaaaaggcgactcatcagtcgccttaaaaatcagtttgccagcgccgccttctgcCGTCCCCTGCACTTCAATGACGCGCCCGTCTGCGGTCATCACTCCGTCCatc > 1:473645‑M2/92‑142 (MQ=255) ccttcgctcctcatcttccttttctacagccaaaaacaggcgactcatcagtcgccttaaaaatcagtttgccagcgccgccttctgcCGTCCCCTGCACTTCAATGATGTGCCCGTCTTCGGTCATCACTACGTTCATGTCg < 2:605122‑M2/55‑1 (MQ=255) tcgctcctcatcttacttttctacagacaaaaaaaaggcgactcatcagtcgccttaaaaatcagtttgccagcgccgccttctgcCGTCCCCTGCACTTCAATGATGCGCCCGTCTTCGGTCATCACTACGTTCATGTCGGt < 1:559637‑M2/57‑1 (MQ=255) gctcctcatcttacttttctacagacaaaaaaaaggcgactcatcagtcgccttaaaaatcagtttgccagcgccgccttctgcCGTCCCCTGCCCTTCAATGATGCGCCCGTCTTCGGTCATCACTACGTTCATGTCGGtct > 1:925990‑M2/85‑143 (MQ=255) gctcttcgtattttcctacagacaaaaaaaaggcgactcatcagtcgccttaaaaatcagtttgccagcgccgccttctgcCGTCCCCTGCACTTCAATGATGCGCCCGTCTTCGGTCATCACTACGTTCATGTCGGTCTCTg < 2:330434‑M2/62‑1 (MQ=255) ctcatcttacttttctacagacaaaaaaaaggcgactcatcagtcgccttaaaaatcagtttgccagcgccgctttctacCGTCCCCTGCACTTCAATGATGCTCCCGTCTTCGGTCATCACTACGTTAATTTCGGTCTCTGc > 1:442911‑M2/81‑143 (MQ=255) atcttacttttctacagacaaaaaaaaggcgactcatcagtcgccttaaaaatcagtttgccagcgccgccttctgcCGTCCCCTGCACTTCAATGATGCGCCCGCCTTCGGTCATCACTACCTTCCTGTCGGTCTCTgcgtc > 1:759488‑M2/78‑141 (MQ=255) acttatctacagacaaaaaaaaggcgacgcatcagtcgccttaacaatcagtttgccagcgccgccttctgcCGTCCCCTGCACCTCAATGATGCGCCCGTCTTCGGTCATCACTACGTTCATGTCGGTCTCTGCGGCAGAGt < 1:258956‑M2/71‑1 (MQ=255) tttctacagacaaaaaaaaggcgactcatcagtcgccttaaaaatcagtttgccagcgccgccttcggcCGTCCCCTGCACTTCAATGATGCGCCCGGCTTCGGTCATCACTACGTTCATGTCGGTCTCTGCGGCAGAGTCtt < 2:118182‑M2/74‑1 (MQ=255) ctacagacaaaaaaaaggcgactcatcagtcgccttaaaaatccgtttgccagcgccgccttctgcCGTCCCCTGCACTTCAATGATGCGCCCGTCCTCGGTCATCACTACGTTCATGTCGGTCTCTCCGGCAGAgtcttaca > 2:1092727‑M2/67‑140 (MQ=255) ctacagacaaaaaaaaggcgactcatcagtcgccttaaaaatcagtttgccagcgccgccttctgcCGTCCCCTGCACTTCAATGATGCGCCCGTCTTCGGTCATCACTACGTTCATGTCGGTCTCTGCGGCAGAGTCTTCaa < 1:1038588‑M2/77‑1 (MQ=255) tccaggcaaaaaataggcgactcatcagtcgccttaaaaatcagtttgccagcgccgccttctgcCGTCCCCTGCACTTCAATGATGCGCCCGTCTTCGGTCATCACTACGTTCATGTCGGTCTCTGCGGCAGAGTCTTCAAc < 2:478835‑M2/78‑1 (MQ=255) acagacaaaaaaaaggcgactcatcagtcgccttaaaaatcagtttgccagcgccgccttctgcCGTCCCCTGCACTTCAATGATGCGCCCGTCTTCGGTCATCACTACGTTCATGTCGGTCTCTGCGGCAGAGGCTTAAACg > 1:444582‑M2/65‑143 (MQ=255) gacaaaaaaaaggcgactcatcaggcgcctcaaaaatcagtttgccagcgcccccttcctcCGTCCCCTGCACTTCAATGATGCGCCCGTCTTCGGTCATCAATACGTTCATGGCGGGCTCTGCGGCAGAGTCTTCAACGTAt < 2:565812‑M2/82‑1 (MQ=255) caaaaaaaaggcgactcatcagtcgccttaaaaatcagtttgccagcgccgccttctgcCGTCCCCTGCACTTCAATGATGCGCCCGTCTTCGGTCATCACTACGTTCATGTCGGTCTCTGCGGCAGAGTCTTCAACGTATTc < 1:912809‑M2/84‑1 (MQ=255) aaaaaaaaggcgactcatcagtcgccttaaaaatcagtttgccagcgccgccttctgcCGTCCCCTGCACTTCAATGATGCGCCCGTCTTCGGTCATCACTACGTTCATGTCGGTCTCTGCGGCAGAGTCTGCGACGTATTcc > 2:1089151‑M2/59‑143 (MQ=255) aaaaaaaggcgactcatcagtcgccttaaaaatcagtttgccagcgccgccttctgcCGTCCCCTGCACTTCAATGATGCGCCCGTCTTCGGTCATCACTACGTTCATGTCGGTCTCTGCGGCAGAGTCTTCCACGTATTCCa > 1:1011243‑M2/58‑143 (MQ=255) aaaaaggcgactcatcagtcgccttaaaaatcagtttgccagcgccgccttctgcCGTCCCCTGCACTTCAATGATGCGCCCGTCTTCGGTCATCACTACGTTCATGTCGGTCTCTGCGGCAGGGGCTTCAACGTAGTCCAGa > 1:808410‑M2/56‑143 (MQ=255) ggcgactgatgagtcgccttaaaaatcagtttgccagcgccgccttctgcCGTCCCCTGCACTTCAATGATGCGCCCGTCTTCGGTCATCACTACGTTCATGTCGGTCTCTGCGGCAGAGTCTTCAACGTATTCCAGATCGCa > 1:943491‑M2/51‑143 (MQ=255) gcgactcatcagtcgccttaaaaatcagtttgccagcgccgccttctgcCGTCCCCTGCACTTCAATGATGCGCCCGTCTTCGGTCATCACTACGTTCATGTCGGTCTCTGCGGCAGAGTCTTCAACGTATTCCAGATCGCaa > 1:91358‑M2/50‑143 (MQ=255) cgccccatccgtcgccttaaaaatcagttggccagcgccgccttctgcCGTCCCCTGCCCTTCAATGATGCGCCCGTCTTCGGTCATCACTACGTTCATGTCGGTCTCTGCGGCAGAGTCTTCAACGTATTCCAGATCGCaaa < 1:104479‑M2/95‑1 (MQ=255) cgactcatcagtcgccttaaaaatcagtttgccagcgccgccttctgcCGTCCCCTGCACTTCAATGATGCGCCCGTCTTCGGTCATCACTACGTTCATGTCGGTCTCTGCGGCAGAGTCTTCAACGTATTCCAGATCGCaaa < 1:326087‑M2/95‑1 (MQ=255) cgacccatcaggcgccttaaaaatcagtttgccagcgccgccttctgcCGTCCCCTGCACTTCAATGATGCGCCCGTCTTCGGTCATCACTACGTTCATGTCGGTCTCTGCGGCAGAGTCTTCAACGTATTCCAGATCGCaaa < 2:444742‑M2/95‑1 (MQ=255) gactcatcagtcgccttaaaaatcagtttgccagcgccgccttctgcCGTCCCCTGCCCTTCAATGATGCGCCCGTCTTCGGTCATCACTACGTTCATGTCGGTCTCTGCGGCAGAGTCTTCAACGTGTTCCAGATCgcaacc > 2:454765‑M2/48‑141 (MQ=255) catcagtcgccttaaaaatcagtttgccagcgccgccttctgcCGTCCCCTGCACTTCAATGATGCGCCCGTCTTCGGTCATCACTACGTTCATGTCGGTCTCTGCGGCAGAGTCTTCAACGTATTCCAGCTCGCAAACCGCt > 2:53394‑M2/44‑143 (MQ=255) atcagtcgccttaaaaatcagtttgccagcgccgccttctgcCGTCCCCTGCACTTCAATGATGCGCCCGTCTTCGGTCATCACTACGTTCATGTCGGTCTCTTCGGCAGCGTCTTCAACGTATTCCAGATCGCAAACCGCtt > 1:1104893‑M2/43‑143 (MQ=255) gtcgccttaaaaatcagtttgccagcgccgccttctgcCGTCCCCTGCACTTCAATGATGCGCCCGTCTTCGGTCATCACTACGTTCATGTCGGTCTCTGCGGCAGAGTCTTCAACGTATTCCAGATCGCAAACCGCTTCGcc > 2:1027192‑M2/39‑143 (MQ=255) gtcgccttaaaaatcagtttgccagcgccgccttctgcCGTCCCCTGCACTTCAATGATGCGCCCGTCTTCGGTCATCACTACGTTCATGTCGGTCTCTGCGGCAGAGTCTTCAACGTATTCCAGATCGCAAACCGCTTCGcc < 1:118140‑M2/105‑1 (MQ=255) ttacacatcagtttgcccgcgccgccttctgcCGTCCCCTGCACTTCAATGATGCGCCCGTCTTCGGTCATCACTACGTTCATGTCGGTCTCTGCGGCAGAGTCTTCAACGTATTCCAGATCGCAAACCGCTTCGCCGTTcac < 2:728032‑M2/111‑1 (MQ=255) ttaaaaatcagtttgccagcgccgccttctgcCGTCCCCTGCACTTCAATGATGCGCCCGTCTTCGGTCCTCACTACGTCCATGCCGGTCTCTGCGGCAGAGTCCTCGACGCATGACGGCTCGCAAGCCGCGTCGCCGTCcac > 2:169026‑M2/33‑143 (MQ=255) taaaaatcagtttgccagcgccgccttctgcCGTCCCCTGCACTTCAATGATGCGCCCGTCTTCGGTCATCACTACGTTCATGTCGGTCTCTGCGGCAGAGTCTTCAACGTCTTCCAGATCGCAAACCGCTTCGCCGTTccca > 2:1072385‑M2/32‑143 (MQ=255) aaaaatcagtttgccagcgccgccttctgcCGTCCCCTGCACTTCAATGATGCGCCCGTCTTCGGTCATCACTACGTTCATGTCGGTCTCTGCGGCAGAGTCTTCAACGTATTCCAGATCGCAAACCGCTTCGCCGTTCACaa > 1:723256‑M2/31‑143 (MQ=255) aatcagtttgccagcgccgccttctgcCGTCCCCTGCACTTCAATGATGCGCCCGTCTTGGGTCATCACTACGTTCATTTCGGTCTCTGCGGCAGAGTCTTCAACGTATTCCAGATCGCAAACCGCTTCGCCGTTCACAATTc < 1:824853‑M2/116‑1 (MQ=255) aatcagtttgccagcgccgccttctgcCGTCCCCTGCACTTCAATGATGCGCCCGTCTTCGGTCATCACTACGTTCATGTCGGTCTCTGCGGCAGAGTCTTCAACGTATTCCAGATCGCAAACCGCTTCGCCGTTCACAATTc > 1:671758‑M2/28‑143 (MQ=255) tcagtttgccagcgccgccttctgcCGTCCCCTGCACTTCAATGATGCGCCCGTCTTCGGTCATCACTACGTTCATGTCGGTCTCTGCGGCAGAGTCTTCAACGTATTCCAGATCGCAAACCGCTTCCCCGTTCCCAATCCCg > 2:692808‑M2/26‑143 (MQ=255) cagtttgccagcgccgccttctgcCGTCCCCTGCACTTCAATGATGCGCCCGTCTTCGGTCATCACTACGTTCATATCGGTCTCTGCGGCAGAGTCTTCAACGTATTCCAGATCGCAAACCGCTTCGCCGTTCACAATTCCGa < 2:576324‑M2/119‑1 (MQ=255) caggttgccagcgccgccttctgcCGTCCCCTGCACTTCAATGATGCGCCCGTCTTCGGTCATCACTACGTTCATGTCGGTCTCTGCGGCAGAGTCTTCAACGTATTCCAGATCGCAAACCGCTTCGCCGTTCACAATTCCGa < 1:338060‑M2/119‑1 (MQ=255) tttgccagcgccgccttctgcCGTCCCCTGCACTTCAATGATGCGCCCGTCTTCGGTCATCACTACGTTCATGTCGGTCTCTGCGGCAGAGTCTTCAACGTATTCAAGATCGCAAACCGCTTCGCCGTTCGCAATTCCCACAg > 2:83340‑M2/22‑143 (MQ=255) tgccagcgccgccttctgcCGTCCCCTGCACTTCAATGATGCCCCCGTCTTCGGTCATCACTACGTTCATGTCGGTCTCTGCGGCAGAGTCTTCAACGTATTCCAGATCGCAAACCGCTTCGCCGTTCACAATTCCGACAGaa < 1:836788‑M2/124‑1 (MQ=255) ccagcgccgccttctgcCGTCCCCTGCACTTCAATGATGCGCCCGTCTTCGGTCATCACTACGTTCATGTCGGTCTCTGCGGCAGAGTCTTCAACGTATTCCCGCTCCTAAACCGCTTCGCCGTTCACAATTCCCACagaacc > 2:810466‑M2/18‑141 (MQ=255) ccagcgccgccttctgcCGTCCCCTGCACTTCAATGATGCGCCCGTCTTCGGCCATCACTACGTTCATGTCGGTCTCTGCCGCAGAGTCTTCAACGCATTCCAGATCGCACACCGCTCCGCCGTTCACCACTCCGAcagaccc > 2:376024‑M2/18‑140 (MQ=255) gccgccttctgcCGTCCCCTGCACTTCAATGATGCGCCCGTCTTCGGTCATCACTACGTTCATGTCGGTCTCTGCGGCAGAGTCTTCAACGTATTCCAGATCGCAAACCGCTTCGCCGTTCACCCTTCCGACAGCACCTGCgg > 1:475025‑M2/13‑143 (MQ=255) cgccttctgcCGTCCCCTGCACTTCAATGATGCGCCCGTCTTCGGTCATCACTACGTTCATGTCGGTCTCTGCGGCAGAGTCTTCAACGTATTCCAGATCGCAAACCGCTTCGCCGTTCACAGTTCCGACAGAAACTGCGgcc > 1:407343‑M2/11‑142 (MQ=255) cGTCCCCTGCACTTCAATGATGCGCCCGTCTTCGGTCATCACTACGTTCATGTCGGTCTCTGCGGCAGAGTCTTCAACGTATTCCAGATCGCAAACCGCTTCGCCGTTCACAATTCCGACAGAAACTGCGGCTACCATCCCtt < 1:433780/143‑1 (MQ=255) | CAAAAAAAAGGCGACTCATCAGTCGCCTTAAAAATCAGTTTGCCAGCGCCGCCTTCTGCGTCGCTACAATGGATTCGATTCCCCTCGGGCCAGAGCCAACAAGATGAGTAGCTCTTCATGGGTGAACGGCTCGCCTTCTGCCGTCCCCTGCACTTCAATGATGCGCCCGTCTTCGGTCATCACTACGTTCATGTCGGTCTCTGCGGCAGAGTCTTCAACGTATTCCAGATCGCAAACCGCTTCGCCGTTCACAATTCCGACAGAAACTGCGGCTACCATCCCTT > NC_000913/3815800‑3816083 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |