New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | 1417458 = | 49 (0.930) | 3 (0.060) | 3/264 | 6.6 | 6.2% | intergenic (‑72/+30) | recE/racC | Rac prophage; exonuclease VIII, 5' to 3' specific dsDNA exonuclease/Rac prophage; uncharacterized protein |
? | NC_000913 | 1417483 = | 45 (0.920) | intergenic (‑97/+5) | recE/racC | Rac prophage; exonuclease VIII, 5' to 3' specific dsDNA exonuclease/Rac prophage; uncharacterized protein | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
ATTTTTTCGCTTTCCGTAACAGGAAGAGTGGTTTTGTGCTCATTGTTTTTTAACCTCAACTCAGATTAAAATTCGTTTTGTTCAGTGAATGATCTTGCCGGATACACACTGTTCATAGCCTGCGCCATACGCAGGCTATTTCTTTCAGATTTCACCTTTTAATTTCATTGCAATTAGAGTTGCCAGAAATTCGGCTTTTTTTTCTGCGGGCAGATTCTTTCCGATATGCACCAGGCACATTTTTTTGACACCTTCATCAAGTGTTTTTACGTTGCCTGATG > NC_000913/1417344‑1417624 | atTTTTTCGCTTTCCGTAACAGGAAGAGTGGTTTTGTGCTCATTGTTTTTTAACCTCAACTCAGATTAAAATTCGTTTTGTTCAGTGAATGATCTTGCCGGATACACACTGTTCATAGCCTGCGCCATACGCAGGCTAtttct < 1:860614/143‑1 (MQ=255) tttttCGCTTTCCGTAACAGGAAGAGTGGTTTTGGGCTCATTGTTTTTTAACCTCAACTCAGATTAAAATTCGTTTTGTTCAGTGAATGATCTTGCCGGATACACACTGTTCATAGCCTGCGCCATACGCAGGCTAtttcttt < 1:740558/143‑1 (MQ=255) tCGCTTTCCGTAACAGGAAGAGTGGTTTTGTGCTCATTGTTTTTTAACCTCAACTCAGATTAAAATTCGTTTTGTTCAGTGAATGATCTTGCCGGATACACACTGTTCATAGCCTGCGCCATACGCAGGCTATTTCTTTCAGa < 1:416933/143‑1 (MQ=255) cTTTCCGTAACAGGAAGAGTGGTTTTGTGCTCATTGTTTTTTAACCTCAACTCAGATTAAAATTCGTTTTGTTCAGTGAATGATCTTGCCGGATACACACTGTTCATAGCCTGCGCCATACGCAGGCTATTTCTTTCAGAttt > 1:616067/1‑143 (MQ=255) tttCCGTAACAGGAAGAGTGGTTTTGTGCTCATTGTTTTTTAACCTCAACTCAGATTAAAATTCGTTTTGTTCAGTGAATGATCTTTCCGGATACACACTGTTCATAGCCTGCGCCATACGCAGGCTATTTCTTTCAGATTTc > 1:798844/1‑143 (MQ=255) tttCCGTAACAGGAAGAGTGGTTTTGTGCTCATTGTTTTTTAACCTCAACTCAGATTAAAATTCGTTTTGTTCAGTGAATGATCTTGCCGGATACACACTGTTCATAGCCTGCGCCATACGCAGGCTATTTCTTTCAGATTTc > 1:770957/1‑143 (MQ=255) aaCAGGAAGAGTGGTTTTGTGCTCATTGTTTTTTAACCTCAACTCAGATTAAAATTCGTTTTGTTCAGTGAATGATCTTGCCGGATACACACTGTTCATAGCCTGCGTCATACGCAGGCTATTTCTTTCAGATTTCACCtttt < 1:469209/143‑1 (MQ=255) aaCAGGAAGAGTGGTTTTGTGCTCATTGTTTTTTAACCTCAACTCAGATTAAAATTCGTTTTGTTCAGTGAACGATCTTGCCGGATACACACTGTTCATAGCCTGCGCCATACGCAGGCTATTTCTTTCAGATTTCACCtttt < 2:766599/143‑1 (MQ=255) agTGGTTTTGTGCTGATTGTCTTTTAACCTCAACTCATATTAAAATTCGTTTTGTTCAGTGAATGATCTTGCCGGATACACACTGTTCATAGCCTGCGCCATACGCAGGCTATTTCTTTCAGATTTCACCTTTTAATTTCAtt < 2:255263/143‑1 (MQ=255) agTGGTTTTGTGCTCATTGTTTTTTAACCTCACCTCAGATTAAAATTCGTTTTGTTCAGTGAATGATCTTGCCGGATACACACTGTTCATAGCCTGCGCCATACGCAGGCTATTTCTTTCAGATTTCACCTTTTAATTTCAtt < 1:6457/143‑1 (MQ=255) agTGGTTTTGTGCTCATTGTTTTTTAACCTCAACTCAGATTAAAATTCGTTTTGTTCAGTGAATGATCTTGCCGGATACACACTGTTCATAGCCTGCGCCATACGCAGGCTATTTCTTTCAGATTTCACCTTTTAATTTCAtt > 2:810205/1‑143 (MQ=255) agTGGTTTTGTGCTCATTGTTTTTTAACCTCAACTCAGATTAAAATTCGTTTTGTTCAGTGAATGATCTTGCCGGATACACACTGTTCATAGCCTGCGCCATACGCAGGCTATTTCTTTCAGATTTCACCTTTTAATTTCAtt < 2:404830/143‑1 (MQ=255) gTGGTTTTGTGCTCATTGTTTTTTAACCTCAACTCAGATTAAAATTCGTTTTGTTCAGTGAATGATCTTGCCGGATACACACTGTTCATAGCCTGCGCCATACGCAGGCTATTTCTTTCAGATTTCACCTTTTAATTTCATTg < 1:301316/143‑1 (MQ=255) cTCATTGTTTTTTAACCTCAACTCAGATTAAAATTCGTTTTGTTCAGTGAATGATCTTGCCGGATACACACTGTTCATAGCCTGCGCCATACGCAGGCTATTTCTTTCAGATTTCACCTTTTAATTTCATTGCTATTCGAGtt > 1:261269/1‑143 (MQ=255) tCATTGTTTTTTAACCTCAACTCAGATTAAAATTCGTTTTGTTCAGTGAATGATCTTGCCGGATACACACTGTTCATAGCCTGCGCCATACGCAGGCTATTTCTTTAAGATGACACCTTTTAATTTCATTGCCATTAGAGTTg > 2:923534/1‑143 (MQ=255) aTTGTTTTTTAACCTCAACTCAGATTAAAATTCGTTTTGTTCAGTGAATGCTCTTGCCGGATACACCCTGTTCATAGCCTGCGCCATACGCAGGCTATTTCTTTCAGATTTCACCTTTTAATTTCATTGCAATTAGAGTTGcc < 1:524036/143‑1 (MQ=255) ttGTTTTTTAACCTCAACTCAGATTAAAATTCGTTTTGTTCAGTGAATGATCTTGCCGGATACACACTGTTCATAGCCTGCGCCATACGCAGGCTATTTCTCTCAGATTTCACCTTTTACTTTCATTGCAATTAGAGtgccca > 2:804161/1‑138 (MQ=255) tttttAACCTCAACTCAGATTAAAATTCGTTTTGTTCAGTGAATGATCTTGCCGGATACACACTGTTCATAGCCTGCGCCATACGCAGGCTATTTCTTTCAGATTTCACCTTTTAATTTCATTGCAATTAGAGTTGCCAGaaa < 2:493272/143‑1 (MQ=255) gaaCCTCAACTCAGATTAAAATTCGTTTTGTTCAGTGAATGATCTTGCCGGATACACACTGTTCATAGCCTGCGCCATACGCAGGCTATTTCTTTCAGATTTCACCTTTTAATTTCATTGCAATTAGAGTTGCCAGAAATTCg < 2:475925/142‑1 (MQ=255) tcttaGATTAACATTGTTTTTGTTCAGGGAATGATTTTGCCGGATACACACTGTTCATAGCCTGCGCCATACTCAGGCTATTTCTTTCAGATTTCACCTTTTAATTTCATTGCAATTAGAGTTGCCAGAAATTCGGCtttttt < 2:90003/139‑1 (MQ=255) tCAGATTAAAATTCGTTTTGTTCAGTGAATGATCTTGCCGGATACACACTGTTCATAGCCTGCGCCATACGCAGGCTATTTCTTTCAGATTTCACCTTTTAATTTCATTGCAATTAGAGTTGcc < 2:775415/124‑1 (MQ=255) tCAGATTAAAATTCGTTTTGTTCAGTGAATGATCTTGCCGGATACACACTGTTCATAGCCTGCGCCATACGCAGGCTATTTCTTTCAGATTTCACCTTTTAATTTCATTGCAATTAGAGTTGcc > 1:775415/1‑124 (MQ=255) tCAGATTAAAATTCGTTTTGTTCAGTGAATGATCTTGCCGGATACACACTGTTCATAGCCTGCGCCATACGCAGGCTATTTCTTTCAGATTTCACCTTTTAATTTCATTGCAATTAGAGTTGCCAGAAATTCGGCtttttttt < 1:9215/143‑1 (MQ=255) aTTAAAATTCGTTTTGTTCAGTGAATGATCTTGCCGGATACACACTGTTCATAGCCTGCGCCATACGCAGGCTATTTCTTTCAGATTTCACCTTTTAATTTCATTGCAATTAGAGTTGCCAGAAATTCGGCTTTTTTTTCTGc < 1:284863/143‑1 (MQ=255) agttCGTTTTTTCTAGTGAATGATCTTGTCGGATACACACTTTTGATAGTTTGCGCCATACGCTTGCTATTTCTTTCACACTTCACCTTTTAATTTCATTGCAATTAGAGTTGCCAGAAATTCGGCTTTTTTTTCTGCGGGCa < 2:13951/141‑1 (MQ=255) aTTCGTTTTGTTCAGTGAATGATCTTGCCGGATACACACTGTTCATAGCCTGCGCCATACGCAGGCTATTTCTTTCAGATTTCACCTTTTAATTTCATTGCTATTAGAGTTGCCAGCAATTCGGCTTTTTTTTCTGCGGGccg > 1:263538/1‑141 (MQ=255) ttCGTTTTGTTCAGTGAATGATCTTGCCGGATACACACTGTTCATAGCCTGCGCCATACGCAGGCTATTTCTTTCAGATTTCACCTTTTAATTTCATTGCAATTAGAGTTGCCAGAAATTCGGCTTTTTTTTCTGCGGGCAGa < 2:395837/143‑1 (MQ=255) cttCAGTGAATGATCTTGCCGGATACACGCTGTTTATGTCCTGCGCCATACGCAGGCTATTTCTTTCAGATTTCATCGTTTAATTTCATTGCAATTAGAGTTTCCAGAAATTCGGCTTTTTTTTCTGCGGGCAGATTCTTTcc < 2:556408/142‑1 (MQ=255) ttCAGTGAATGATCTTGCCGGATACACACTGTTCATAGCCTGCGCCATACGCAGGCTATTTCTTTCAGATTTCACCTTTTAATTTCATTGCAATTAGAGTTGCCAGAAATTCGGCTTTTTTTTCTGCGGGCAGATTCTTTCCg < 2:361659/143‑1 (MQ=255) aGTGAATGATCTTGCCGGATACACACTGTTCATAGCCTGCGCCATACGCAGGCTATTTCTTTCAGATTTCACCTTTTAATTTCATTGCAATTAGAGTTGCCAGAAATTCGGCTTTTTTTTCTGCGGGCATCTTCTTTCCgtaa > 2:485615/1‑140 (MQ=255) gTGAATGATCTTGCCGGATACACACTGTTCATAGCCTGCGCCCTACGCAGACTATTTCGTTCAGATTTCACCTTTTAATTTCATTGTCCTTTGAGTCGGCGGACCGTCGCCTTTTTTTTCTGCGGTTAGCTTCCTTCCGatat > 2:878149/1‑143 (MQ=255) gTGAATGATCTTGCCGGATACACACTGTTCATAGCCTGCGCCATACGCAGGCTATTTCTTTCAGATTTCACCTTTTAATTTCATTGCAATTAGAGTTGCCAGAAATTCGGCTTTTTTTTCTGCGGGCAGATTCTTTCCGatat < 2:810452/143‑1 (MQ=255) tGAATGATCTTGCCGGATACACACTGTTCATAGCCTGCGCCATACGCAGGCTATTTCTTTCAGATTTCACCTTTTAATTTCATTGCAATTAGAGTTGCCAGAAATTCGGCTTTTTTTTCTGCGGGCAGATTCTTTCCGATATg < 1:826459/143‑1 (MQ=255) aaTGATCTTGCCGGATACACACTGTTCATAGCCTGCGCCATACGCAGGCTATTTCTTTCAGATTTCACCTTTTAATTTCATTGCAATTAGAGTTGCCAGAAATTCGGCTTTTTTTTCTGCGGGCAGGTTCTTTCCGTTATGCa > 1:216031/1‑143 (MQ=255) ttGCCGGATACACACTGTTCATAGCCTGCGCCATACGCAGGCTATTTCTTTCAGATTTCACCTTTTAATTTCATTGCAATTAGAGTTGCCAGAAATTCGGCTTTATTCTATGTTGGCTGATTCTTTCCGATATGCACCAGGca > 1:900053/1‑143 (MQ=255) ttctaccTGTTCATAGCCTTCGCCATTCTGTTGCTATTTCTTTCAGATTTCTCCTTTTAATTTCATTGCAATTAGTGTTTCCAGAAATTCGGCTTTTTTTTCTGCGTGCAGATTCTTTCCGATATGCACCAGGCACAtttttt < 2:539497/137‑1 (MQ=255) tACACACTGTTCATAGCCTGCGCCATACGCAGGTGTTTGCTTTCAGATTTCACCTTTTAATTTCATTGCAATTAGAGTTGCCAGAAATTCGGCTTTTTTTTCTGCGGGCAGATTCTTTCCGATATGCACCAGGCACAtttttt < 2:671747/143‑1 (MQ=255) acacacTGTTCATAGCCTGCGCCATACGCAGGCTATTTCTTTCAGATTTCACCTTTTAATTTCATTGCAATTAGAGTTGCCAGAAATTCGGCTTTTTTTTCTTCGGATAGATTCTTTCCCATATGCACCACTCACAttttttt > 2:390223/1‑143 (MQ=255) cacacTGTTCATAGCCTGCGCCATACGCAGGCTATTTCTTTCAGATTTCACCTTTTAATTTCATTGCAATTAGAGTTGCCAGAAATTCGGC‑TTTTTTTCTGCGGGCAGGTTCTTTCCGATATGCACCAGGCCCATTTTTTTGa > 1:247056/1‑143 (MQ=255) acccTGTTCACAGCCTGCGCCATACGCAGGCTATTTCTTTCAGATTTCACCTTTTAATTTCATTGCAATGAGAGTTGCCAGAAATTCGGCTTTTTTTTCTGCGGGCAGATTCTTTCCGATATGCACCAGGCACATTTTTTTGa < 1:858465/140‑1 (MQ=255) acacTGTTCATAGCCTGCGCCATACGCAGGCTATTTCTTTCAGATTTCACCTTTTACTTTCATTGCAATTAGAGTTGCCAGAAATTCGGCTTTTTTTTCTGCGGGCAGGTTCTTTCCGCTATGCACCAGGCACATTTTTTTgc > 2:390158/1‑142 (MQ=255) cATAGCCTGCGCCATACGCAGGCTATTTCTTTCAGATTTCACCTTTTAATTTCATTGCCATTAGAGTTGCCAGAAATTCGGCTTTTTTTTCTGCTGGCAGATTCTTTCCGATATGCACCAGGCACATTTTTTTGACACCTtca < 1:449085/143‑1 (MQ=255) cATAGCCTGCGCCATACGCAGGCTATTTCTTTCAGATTTCACCTTTTAATTTCATTGCAATTAGAGTTGACAGAAATTCGGCTTTTTTTTTTGCGGCTAGGTCCTTTTCGATAGGCCCCAGCCACCTTGCTTTTTCACTTtca > 2:303996/1‑143 (MQ=255) tacgagggCTATTTCTTTCAGCTTTGACCTTTTAATTTCATTGCAATTAGAGTTGCCAGAAACTCGGCTTTTTCTCCGGCGGGCAGATTCTTTCCGATATGCACCAGGCACATTTTTTTGACACCTTCATCAAGTGTTTTTAc < 1:385718/137‑1 (MQ=255) tACGCAGACTATTTCTTTCAAAATGCACCTGCTAATTTCGTTGCAATAAGAGTTGCCAGAAATTCGGCTTTTTTTTCTGCGGGCAGATTCTTTCCGATAGGCACCAGGCACATTTTTTTGACACCTTCATCAAGTGTTTTTAc < 1:323891/143‑1 (MQ=255) aCGCAGGCTATTTCTTTCAGATTTCACCTTTTAATTTCATTGCAATTAGAGTTGCCAGAAATTCGGCTTTTTTTTCTGCGGGCAGATTCTTTCCGATATGCACCAGGCACATTTTTTTGTCACCTTAATCTAGTGtttttgct > 2:655744/1‑140 (MQ=255) cGCAGGCTATTTCTTTCAGATTTCACCTTTTAATTTCATTGCAATTAGAGTTGCCAGAAATTCGGCTTTTTTTTCTGCGGGCAGATTCTTTCCGATATGCACCAGGCACATTTTTTTGACACCTTCATCAAGTGTTTTTACGt > 1:927501/1‑143 (MQ=255) gCAGGCTATTTCTTTCAGATTTCACCTTTTAATTTCATTGCAATTAGAGTTGCCAGAAATTCGGCTTTTTTTTCTGCGGGCAGATTCTTTCCGCTATGCTCCTGGCACATTTTTTTGTCCCCTTCTTCCATTTTTTTTACttt > 1:61651/1‑143 (MQ=255) gCTATTTCTTTCCGCTTTCACCTTTTGATTTCATTGCAACTAGAGTTGCCAGAAATTCGGCTTTTTTTTCTGCGGGCAGATTCTGTCCGATATGCACCAGGCACATTTTTTTGACACCTTCATCAAGTGTTTTTACGTTGCCt < 2:272244/143‑1 (MQ=255) tATTTCTTTCAGATTTCACCTTTTAATTTCATTGCAATTAGAGTTGCCAGAAATTCGGCTTTTTTTTCTGCGGGCAGATTCTTTCCGATATGCACTCGGCCCATTTTTTTGTCCCCTTCAGCTCGCGTTTTTTCGTTTCCTgc > 1:130330/1‑142 (MQ=255) tATTTCTTTCAGATTTCACCTTTTAATTTCATTGCAATTAGAGTTGCCAGAAATTCGGCTTTTTTTTCTGCGGGCAGATTCTTTCCGATATGCACCAGGCACATTTTTTTGACACCTTCATCAAGTGTTTTTACGTTGCCTGa > 1:842170/1‑143 (MQ=255) aTTTCTTTCAGATTTCACCTTTTAATTTCATTGCACTTAGAGTTGCCAGAAATTCGCGGTGTTTTGCTGCGGGCAGATTCTTTCCGATATGCACCAGGCACATTTTTTTGACACCTTCATCAAGTGTTTTTACGTTGCCTGAt < 1:218865/143‑1 (MQ=255) tttctttcAGATTTCATCTTTTAATTTCATTGCAATTAGAGTTGCCAGAAATTCGGCTTTTTTTTCTGCGGGCAGATTCTTTCCGATATGCACCAGGCACATTTTTTTGACACCTTCATCAAGTGTTTTTACGTTGCCTGATg < 2:107585/143‑1 (MQ=255) tttctttcAGATTTCACCTTTTGATTTCATTGCAATTAGAGTTGCCAGAAATTCGGCTTTTTTTTCTGCGGGCAGATTCTTTCCGATATGCACCAGGCACATTTTTTTGACACCTTCATCAAGTGTTTTTACGTTGCCTGATg < 2:210273/143‑1 (MQ=255) tttctttcAGATTTCACCTTTTAATTTCATTGCAATTAGAGTTGCCAGAAATTCGGCTTTTTTTTCTGCGGGCAGATTCTTTCCGATATGCACCAGGCCCATTTTTTTCACACCTTCATCAAGTGTTTTTTCGTTTCctgctg > 1:579726/1‑143 (MQ=255) | ATTTTTTCGCTTTCCGTAACAGGAAGAGTGGTTTTGTGCTCATTGTTTTTTAACCTCAACTCAGATTAAAATTCGTTTTGTTCAGTGAATGATCTTGCCGGATACACACTGTTCATAGCCTGCGCCATACGCAGGCTATTTCTTTCAGATTTCACCTTTTAATTTCATTGCAATTAGAGTTGCCAGAAATTCGGCTTTTTTTTCTGCGGGCAGATTCTTTCCGATATGCACCAGGCACATTTTTTTGACACCTTCATCAAGTGTTTTTACGTTGCCTGATG > NC_000913/1417344‑1417624 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |