Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
JC JC | NC_000913 | 1,937,136 | IS2 (–) +5 bp | coding (485‑489/870 nt) | yebK → | putative DNA‑binding transcriptional regulator |
New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | = 1651548 | NA (NA) | 51 (0.960) | 42/284 | 0.2 | 98.0% | noncoding (706/706 nt) | IS2 | repeat region |
? | NC_000913 | = 1937140 | 1 (0.020) | coding (489/870 nt) | yebK | putative DNA‑binding transcriptional regulator | |||||
* | ? | NC_000913 | 1937136 = | 1 (0.020) | 59 (1.110) | 44/284 | 0.2 | 98.3% | coding (485/870 nt) | yebK | putative DNA‑binding transcriptional regulator |
? | NC_000913 | = 2070271 | NA (NA) | noncoding (1/1331 nt) | IS2 | repeat region |
GTGTGGTACGCCGTCTGCGTTTCTCCGGCCCTAAGACATCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAGTGGCGAAGCATCCTCCCGTGTTTTAATTCTCATTGATGGTCAGGAGGTAACTTATCAGCGCGCCGGAGATAATTATGGTGTGGGACTGTTGATAGATGAGTCTGCGCTGGAGCGTGTTGAGGTAGTGAAAGGTCCA > NC_000913/2070135‑2070408 | gtgtgGTACGCCGTCTGCGTTTCTCCGGCCCTAAGACATCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAGTGGCg > 2:482059/1‑143 (MQ=32) gtgGTACGCCGCCTGCGTTTCTCCGGCCCTAAGACATCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAGTGGCGaa < 1:688157/143‑1 (MQ=21) ccGTCTGCGTTTCTCCGGCCCTAAGACCTCAATCAGCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAGCTAGTATTAAGACTATCACTTAGTTAAGTGATATTGGTTGGCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAGTGGCGAAGCAtcctc < 1:108763/143‑1 (MQ=14) gCGTTTCTCCGGTCCTAAGTCATCAATCATCTGTTCTTCAATTTTTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAGTGGCGAAGCATCCTCCCgtgt < 1:859291/143‑1 (MQ=14) gCGTTTCTCCGGCCCTAAGACATCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAGTGGCGAAGCATCCTCCCgtgt < 2:357414/143‑1 (MQ=255) cGTTTCTCCGGCCCTAAGACATCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCGGTCTAGTGGCGCAGCATCCTCCCGCGtt > 1:491168/1‑143 (MQ=255) gTTTCTCCGGCCCTAAGACATCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAGTGGCGAAGCATCCTCCCGTGttt < 1:482059/143‑1 (MQ=255) tctcCGGCCCTAAGACATCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAGTGGCGAAGCATCCTCCCGTGTTTTaa > 1:92554/1‑143 (MQ=255) ggCCCTAAGACATCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAGTGGCGAAGCATCCTCCCGTGTTTTAATtctc < 1:706864/143‑1 (MQ=255) gCCGTAAGACATCAATCATCTGGTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAGTGGCGAAGCATCCTCCCGTGTTTTAATTCTCa < 1:889138/143‑1 (MQ=255) cTAAGACAGCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTGGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTGAGGGGGCCAGTCTAGTGGCGAAGCATCCTCCCGTGTTTTAATTCTCATTg < 2:379137/143‑1 (MQ=255) aaGACATCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAGTGGCGAAGCATCCTCCCGTGTTTTAATTCTCATTGAt > 1:438017/1‑143 (MQ=255) aGACATCAATCATCTGTTCTCCAATTACTAGTCTAAAATCTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAGTGGCGAAGCATCCTCCCGTGTTTTAATTCTCATTGATg < 2:5231/143‑1 (MQ=255) attatcTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGATGTCTGGAGATTCAGTAGGCCAGTCTAGTGGCGAAGCATCCTCCCGTGTTTTAAGTCTCATTAATGGTCaggag > 2:195466/4‑143 (MQ=18) atcatcTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAGTGGCGAAGCATCCTCCCGTGTTTGAATTCTCCTTGATGGTCaggag > 2:248751/1‑143 (MQ=255) cttcTGCTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTTAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCATGGGGCCTGTCTAGTGGCGAAGCATCCTCCCGTGTTTTAATTCTCATTGATGGTCAGGAGGt < 2:568650/141‑1 (MQ=255) tcTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAGTGGCGAAGCATCCTCCCGTGTTTTAATTCTCATCGATGGTCAGGAGGTaa > 2:387087/1‑143 (MQ=255) cTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAGTGGCGAAGCATCCTCCCGTGTTTTAATTCTCATTGATGGTCAGGAGGTAAc < 1:665067/143‑1 (MQ=255) cAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAGTGGCGAAGCATCCTCCCGTGTTTTAATTCTCATTGATGGTCAGGAGGTAACTTATCAgc > 1:605183/1‑143 (MQ=255) aaTGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGTCAGTCTAGTGGCGAAGCATCCTCCCGTGTTTTAATTCTCATTGATGGTCAGGGGGTAACTTAGCAgcg > 2:122799/1‑143 (MQ=255) tAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAGTGGCGAAGCATCCTCCCGTGTTTTAATTCTCATTGATGGTCAGGAGGTAACTTATCAGCGCGCCgg > 2:112170/1‑143 (MQ=255) aGTCTAACAACTAGTATTAAGACTATCACTGATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAGTGGCTACGCATCCTCCCGTGTTTTACTTCTCATTGATGGTCAGGAGGTAACTTATCAGCGCGCCGga < 1:533503/143‑1 (MQ=25) gTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAGTGGCGAAGCATCCTCCCGTGTTTTAATTCTCATTGATGGTCCGGAGGTAACTTATCAGCGCGCCCgag > 2:698785/1‑143 (MQ=255) tAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAGTGGCGAAGCATCCTCCCGTGTTTTAATTCTCATTGATGGTCAGGAGGTaa < 2:584730/122‑1 (MQ=255) tAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAGTGGCGAAGCATCCTCCCGTGTTTTAATTCTCATTGATGGTCAGGAGGTaa > 1:584730/1‑122 (MQ=255) tAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAGTGGCGAAGCATCCTCCCGTGTTTTAATTCTCATTGATGGTCAGGAGGTAACTTATCAGCGCGCGGGAGATa > 1:843520/1‑143 (MQ=255) tAAAAACTAGTATTAAGACTACCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAGTGGCGAAGCATCCTCCCGTGTTTTAATTCTCATTGATGGTCAGGAGGTAACTTATCAGCGCGCCGGAGATa > 2:296561/1‑143 (MQ=255) aaCTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAGTGGCGAAGCATCCTCCCGTGTTTTAATTCTCATTGATGGTCAGGAGGTACCTTATCAGCGCTCCGACGATAACTa > 2:126804/1‑143 (MQ=25) aaCTAGTATTAAGACTATCACTTATTGAAGTGATATTGGCTGCCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAGTGGCGAAGCAGCCTCCCGTGTTTTAATTCTCATTGATGGTCAGGAGGTAACTTATCAGCGCGCCGGAGATAATTa < 1:180646/143‑1 (MQ=255) aGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAGTGGCGAAGCATCCTCCCGTGTTTTAATTCTCATTGATGGTCAGGAGGTAACTTATCAGCGCGCCGGAGATAATTATGgt < 1:186069/143‑1 (MQ=255) aTTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAGTGGCGAAGCATCCTCCCGTGTTTTAATTCTCATTGATGGTCAGGAGGTAACTTATCAGCGCGCGGGAGATAGTTATGGtgtg > 1:349913/1‑143 (MQ=255) tccTAGCACTGATTTAGGTGACATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCGCCACGTGAAGCATCCTCCCGTGTTTTAATGCTCATTGATGGTCAGGAGGTAACTTATCAGCGCGCCGGAGATAATTATGGTGTGGGACt < 2:827087/141‑1 (MQ=37) cTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAGTGGCGAAGCATCCTCCCGTGTTTTAATTCTCATTGATGGTCAGGAGGTAACTTATCAGCGCGCCGGAGATAATTATGGTGTGGGACTGt < 1:309496/143‑1 (MQ=255) cACGTATATGAGTGATATTGGGTGTCTGGAGATGCAGGGGGCCAGTCTAGTGGCGAAGCATCCTCCCGTGTTTTAATTCTCATTGATGGTCAGGAGGTAACTTATCAGCGCGCCGGAGATAATTATGGTGTGGGACTGTTGAt < 1:320824/143‑1 (MQ=255) aCTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAGTGGCGAAGCATCCTCCCGTGTTTTAATTCTCATTGATGGTCAGGAGGTAACTTATCAGCGCGCCGGCGATAATTATGGTGTGGGACTGTTGaca > 2:336182/1‑141 (MQ=255) tcaaTTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAGTGGCGAAGCATCCTCCCGTGTTTTGATTCTCATTGATGGTCAGGAGGTAACCTATCAGCGCGCCGCAGGTATGTATGGTGTGGGACTGTTGATAg > 2:809210/4‑143 (MQ=37) ttATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAGTGGCGAAGCATCCTCCCGTGTTTTAATTCTCATTGATGGTCAGGAGGTAACTTATCAGCGCGCCGGAGATAATTATGGTGTGGGACTGTTGATAGa < 1:764135/143‑1 (MQ=255) ttATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAGTGGCGAAGCATCCTCCCGTGTTTTAATTCTCATTGATGGTCAGGAGGTAACTTATCAGCGCGCCGGAGATAATTATGGTGTGGGACTGTTGATAGa > 1:953737/1‑143 (MQ=255) tATGTAGGTGGTATTGGTTGTCTGGTGATTCAGGGTGCCAGTCTAGTGGCGAAGCATCCTCCCGTGTTGTAATTCTCATTGATGGTCAGGAGGTAACTTATCAGCGCGCCGGAGAGAATTATGGTGTGGGACTGTTGATAGAt < 2:856174/143‑1 (MQ=255) gaTTTGAGTGATATTGGTGGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAGTGGCGAAGCATCCTCCCGTGTTTTAATTCTCATTGATGGTCAGGAGGTAACTTATCAGCGCGCCGGAGATAATTATGGTGTGGGACTGTTGATAGAt < 2:655808/142‑1 (MQ=255) aGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAGTGGCGAAGCATCCTCCCGTGTTTTAATTCTCGTTGATGGTCAGGAGGTAACTTATCAGCGCGCCGGCGATAATTATGGTGTGGGACTGTTGATAGATGAGTCt > 2:12921/1‑143 (MQ=255) aGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAGTGGCGAAGCATCCTCCCGTGTTTTAATTCTCATTGATGGTCAGGAGGTAACTTATCAGCGCGCCGGAGATAATTATGGTGTGGGACTGTTGATAGATGAGTCt < 1:863891/143‑1 (MQ=255) tGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCAAGTGGCGCACAATCCATCCGAGTTTTAATTCTCATTGATGGTCAGGAGGTAACTTATCAGCGCGCCGGAGAGAATTATGGTGTGGGACTGCTGATAGATGAGTCTgc > 1:859737/1‑143 (MQ=38) tagtagTTGGCTGGAGATTCAGGACGTGAGTCTAGTGGCGAAGCATCCTCCCGTGTTTTAATTCTCATTGATGGTCAGGAGGTAACTTATCAGCGCGCCGGGGATAATTATGGTGTGGGACTGTTGATAGATGAGTCTGctct < 2:374686/138‑1 (MQ=255) atTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAGTGGCGAAGCATCGTCCCGTGTTTTAATTCTCATTGATGGTCAGGAGGTAACTTATCAGCGCGCCGGAGATAATTATGGTGTGGGACTGTTGATAGATGAGTCGgcgcgg > 2:900052/1‑141 (MQ=255) atTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAGTGGCGAAGCATCCTCCCGTGTTTTAATTCTCATTGATGGTCAGGAGGTAACTTATCAGCGCGCCGGAGATAATTATGGTGTGGGACTGTTGATAGATGAGTCTGCGCTg > 2:150216/1‑143 (MQ=255) gTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAGTGGCGAAGCATCCTCCCGTGTGTTAATTCTCATTGATGGTCAGGAGGTACCTTATCAGCGCGCCGGAGATAATTATGGTGTGGGACTGTTGATAGATGAGTCTGCGCTGGAGc > 2:687922/1‑143 (MQ=255) cgtttGGAGATTCGGGGGTCCAGTCTAGTGGCGAAGCATCCTCCCGTGTTTTAATTCTCATGGAGGGTCAGGAGGTAACTTATCAGCGCGCCGGAGAGAATTATGGTGTGGGACTGTTGATAGATGAGTCTGCGCTGGAGCgt < 2:619138/139‑1 (MQ=255) tCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAGTGGCGAAGCATCCTCCCGTGTTTTAATTCTCATTGATGGTCAGGAGGTAACTTATCAGCGCGCCGGAGATAATTATGGTGTGGGACTGTTGATAGATGAGTCTGCGCTGGAGCgtgt > 2:204286/1‑143 (MQ=255) 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1:8125/143‑1 (MQ=255) ggCCAGTCTAGTGGCGAAGCATCCTCCCGTGTTTTAATTCTCATTGATGGTCAGGAGGTAACTTATCAGCGCGCCGGAGATAATTATGGTGTGGGACTGTTGATAGATGAGTCTGCGCTGGAGCGTGTTGAGGTAGTGAAAgg < 1:341982/143‑1 (MQ=255) gCCAGTCTAGTGGCGAAGCATCCTCCCGTGTTTTAATTCTCATTGATCGTCAGGAGGTAACTTATCAGCGCGCCGGAGATAATTATGGTGTGGGACTGTTGATAGATGAGTCTGCGCTGGAGCGTGTTGAGGTAGTGAAAGGt < 1:58094/143‑1 (MQ=255) cAGTCTAGGGGCGAAGCATCCTCCCGTGTTTTAATTCTCATTGATGGTCAGGAGGTAACTTATCAGCGCGCCGGAGATAATTATGGTGTGGGACTGTTGATAGATGAGTCTGCGCTGGAGCGTGTTGAGGTAGTGAAAGGTcc < 1:763583/143‑1 (MQ=255) aGTCTAGTGGCGAAGCATCCTCCCGTGTTTTAATTCTCATTGATGGTCAGGAGGTAACTTATCAGCGCGCCGGAGATAATTATGGTGTGGGACTGTTGATAGATGAGTCTGCGCTGGAGCGTGTTGAGGTAGTGAAAGGTCCa > 1:198090/1‑143 (MQ=255) | GTGTGGTACGCCGTCTGCGTTTCTCCGGCCCTAAGACATCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAGTGGCGAAGCATCCTCCCGTGTTTTAATTCTCATTGATGGTCAGGAGGTAACTTATCAGCGCGCCGGAGATAATTATGGTGTGGGACTGTTGATAGATGAGTCTGCGCTGGAGCGTGTTGAGGTAGTGAAAGGTCCA > NC_000913/2070135‑2070408 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |