| New junction evidence | |||||||||||
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| ? | NC_000913 | = 3992760 | 65 (1.050) | coding (1608/2547 nt) | cyaA | adenylate cyclase | |||||
Only 100 of 130 total aligned reads displayed.
CATAATATTGTGGTGATCGGTCGCAGTGCCGAAGAGATGGCGCTGGCGGTCAATCAGGTGATTCAGGATGGCGGCGGGCTGTGCGTGGTACGTAACGGCCAGGTACAAAGTCATCTGCCGTTACCCATTGCCGGGCTGATGAGCACCGACACGGCGCAGTC‑‑GCTGGCGGAACAAATTGACGCCTTGAAAGCCGCCGCCCGTGAATGCGGTCCGTTACCCGATGAGCCGTTTATTCAGATGGCGTTTCTTTCTCTGCCAGTGATCCCCGCGCTAAAACTAACCAGT > NC_000913/3845389‑3845673 | taaactggtggcgtgggcatggtttaacggcctgctgacctcgcacacccgtttgtatattaaaggtaacggcattgtcgatttgcctaagttgcaggagatggtcgccgacgtgtcgcaccatttcccgctgcgcttacctg < 1:175397‑M1/1‑1 (MQ=255)cATAATATTGTGGTGATCGGTCGCAGTGCCGAAGAGATGGCGCTGGCGGTCAATCAGGTGATTCAGGATGGCGGCGGGCTGTGCGTGGTACGTAACGGCCAGGTACAAAGTCATCTGCCGTTACCCATTGCCGGGCTGATGAg > 1:370296/1‑143 (MQ=255)cATAATATTGTGGTGATCGGTCGCAGTGCCGAAGAGATGGCGCTGGCGGTCAATCAGGTGATGCAGGATGGCGGCGGGCTGTGCGTGGTACGTAACGGCCAGGTACAAAGCCATCTGCCGGTGCCCCTTGGCGGAGGGATGAg > 2:298947/1‑143 (MQ=255) taataTTGTGGTGATCGGTCGCAGTGCCGAAGAGATGGCGCTGGCGGTCAATCAGGTGATTCAGGATGGCGGCGGGCTGTGCGTGGTACGTAACGGCCAGGTACAAAGTCATCTGCCGTTACCCATTGCCGGGCTGATGAGCa < 1:6122/143‑1 (MQ=255) ctggtagcgtgagcatagttcaacggcctgctgacctcgcgcacgcgtgtgtatattaaaggtaacggcattgtcgatttgcctaagttgcaggagatggtcgccgacgtgtcgcaccatttcccgctgcgcttacctGCAcc > 1:728807‑M1/139‑143 (MQ=255) ctgatggcttgagcatggtttaacggcatccggagcccgcgcgcccggttgtatatcaaaggtaacggcattgtcgctttgcctaagttgcaggagatggtcgccgacgtgtcgcaccatttcccgctgcgcttacctGCAcc > 1:152612‑M1/139‑143 (MQ=255) tggtggcgtgggcatggtttaacggcctgctgacctcgcgcacccgtttgtatattaaaggtaacggcattgtcgatttgcctaagttgcaggagatggtcgccgacgtgtcgcaccatttcccgctgcgcttacctGCACCg < 1:1177222‑M1/6‑1 (MQ=255) tggtggcgtgggcatggtttaacggcctgctgacctcgcgcacccgtttgtatattaaaggtaacggcattgtcgatttgcctaagttgcaggagatggtcgccgacgtgtcgcaccatttccagctgcgcttacctGCGCCg < 1:428592‑M1/6‑1 (MQ=255) tggtgATCGGTCGCAGTGCCGAAGAGATGGCGCTGGCGGTCAATCAGGTGATTCAGGATGGCGGCGGGCTGTGCGTGGTACGTAACGGCCAGGTACAAAGTCATCTGCCGTTACCCATTGCCGGGCTGATGAGCACCGACACg < 1:1183557/143‑1 (MQ=255) 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catttcccgctgcgcttacctGCACCGACACGGCGCAGTC‑‑GCTGGCGGAACAAATTGACGCCTTGAAAGCCGCCGCCCGTGAATGCGGTCCGTTACCCGATGAGCCGTTTATTCAGATGGCGTTTCTTTCTCTGCCAGTGATc < 2:555976‑M1/122‑1 (MQ=255) ccATTGCCGGGCTGATGAGCACCGACACGGCGCAGTC‑‑GCTGGCGGAACAAATTGACGCCTTGAAAGCCGCCGCCCGTGCATGCGGTCCGTTACCCGATGAGCCGTTTATTCAGCTGGCGTTTCTTTCTCTGCCAGTGATcccc > 1:1153149/1‑143 (MQ=255) ccATTGCCGGGCTGATGAGCACCGACACGGCGCAGTC‑‑GCTGGCGGAACAAATTGACGCCTTGAAAGCCGCCGCCCGTGAATGCGGTCCGTTACCCGATGAGCCGTTTATTCAGATGGCGTTTCTTTCTCTGCCAGTGATcccc > 1:512784/1‑143 (MQ=255) ccATTGCCGGGCTGATGAGCACCGACACGGCGCAGTC‑‑GCTGGCGGAACAAATTGACGCCTGGAAAGCCGCCGCCCGTGAATGCGGTCCGCTACCCGATGAGCCGCTGATTCAGATGGCGTCTCTTGCCATGCCAgagaacacc > 2:375778/1‑138 (MQ=255) ccgctgcgcttaccgGCACCGACACGGCGCAGTC‑‑GCTGGCGGAACAAATTGACGCCTTGAAAGCCGCCGCCCGTGCATGCGGTCCGTTACCCGATGAGCCGTTTATTCAGATGGCGTTTCTTTCTCTGCCAGTGATCCCcgcg > 2:430020‑M1/16‑143 (MQ=255) cgctgcgcttacctGCACCGACACGGCGCAGTC‑‑GCTGGCGGAACAAATTGACGCCTTGAAAGCCGCCGCCCGTGAACGCGGTAGCTCCGCCGATGAGCCGTTTATTCAGAAGGCGTTTCTTTCTCTGCCAGTGATACCCgcgc < 1:876260‑M1/129‑1 (MQ=255) ccGGGCTGATGAGCACCGACACGGCGCAGTC‑‑GCTGGCGGAACAAATTGACGCCTTGAAAGCCGCCGCCCGTGAATGCGGTCCGTTACCCGATGCGCCGTTTACTCAGCTGGCGTTTCTTTCTCTGCCAGTGATGCCCGCGCTa > 2:186576/1‑143 (MQ=255) cGGGCTGATGAGCACCGACACGGCGCAGTC‑‑GCTGGCGGAACAAATTGACGCCTTGAAAGCCGCCGCCCGTGAATGCGGTCCGTTACCCGATGAGCCGTTTATTCAGATGGCGTTTCTTTCTCTGCCAGTGATCCCCGCGCTaa > 2:225444/1‑143 (MQ=255) ggCTGATGAGCACCGACACGGCGCAGTC‑‑GCTGGCGGAACAAATTGACGCCTTGAAAGCCGCCGCCCGTGAATGCGGTCCGTTACCCGATGAGCCGTTTATTCAGATGGCGTTTCTTTCTCTGCCAGTGATCCCCGCGCTaaaa < 2:276415/143‑1 (MQ=255) cgcttacctGCACCGAGACGGCGCAGTC‑‑GCTGGCGGAACAAATTGACGCCTTGAAAGCCGCCGCCCGTGAATGCGGTCCGCTACCCGATGAGCCGTTTATTCAGCTGGAGTTTCCTTCTCTGCCAGTGATCCCCGCGCTaaaa > 2:427765‑M1/10‑143 (MQ=255) gCTGATGAGCCCCGACACGGCGCCGTC‑‑GCTGGCGGAACAAATTGACGCCTTGAAAGCCGCCGCCCGTGAATGCGGTCCGTTACCCGATGAGCCGTTTATTCAGATGGCGTTTCTTTCTCTGCCAGTGATCCCCGCGCTaaacc < 2:920020/143‑3 (MQ=255) ttacctGCACCGACACGGCGCAGTC‑‑GCTGGCGGAACAAATTGACGCCTTGAAAGCCGCCGCCCGTGAATGCGGTCCGTTTCCCGCTGTGCCGTTTATTCAGTTGTCGTTTCTTTCTCTGCCAGTGCTCCCCTCGCTAAAACTa < 1:252459‑M1/137‑1 (MQ=255) tgatgaGCACCGACACGGCGCAGTC‑‑GCTGGCGGAACAAATTGACGCCTTGAAAGCCGCCGCCCGTGAATGCGGTCCGTTACCCGATGAGCCGTTTATTCAGATGGCGTTTCTTTCTCTGCCAGTGATCCCCGCGCTAAAACTa > 1:96202/1‑143 (MQ=255) atgaGCACCGACACGGCGCAGTC‑‑GCTGGCGGAACAAATTGACGCCTTGAAAGCCGCCGCCCGTGAATGCGGTCCGTTACCCGATGAGCCGTTTATTCAGATGGCGTTTCTTTCTCTGCCAGTGATCCCCGCGCTAAAACTAAc > 1:1075004/1‑143 (MQ=255) acctGTACCTACACTGCTCAGTC‑‑GCTGGCGGAACAAATTGACGCCTTCAAAGCCGCCGCCCGTTAATGCGGTCCGTTACCCGATGAGCCGTTTATTCAGATGGCGTTTCTTTCTCTGCCAGTGATCCCCGCGCTAAAACTAAc > 1:80258‑M1/5‑143 (MQ=255) ctGCACCGACACGGCGCAGTC‑‑GCTGGCGGAACAAATTGACGCCTTGAAAGCCGCCGCCCGTGAATGCGGTCCGTTACCCGATGAGCCGTTTATTCAGATGGCGTTTCTTTCTCTGCCAGTGATCCCCGCGCTGAACCTACCCa < 1:960276‑M1/141‑1 (MQ=255) | CATAATATTGTGGTGATCGGTCGCAGTGCCGAAGAGATGGCGCTGGCGGTCAATCAGGTGATTCAGGATGGCGGCGGGCTGTGCGTGGTACGTAACGGCCAGGTACAAAGTCATCTGCCGTTACCCATTGCCGGGCTGATGAGCACCGACACGGCGCAGTC‑‑GCTGGCGGAACAAATTGACGCCTTGAAAGCCGCCGCCCGTGAATGCGGTCCGTTACCCGATGAGCCGTTTATTCAGATGGCGTTTCTTTCTCTGCCAGTGATCCCCGCGCTAAAACTAACCAGT > NC_000913/3845389‑3845673 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |