| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC JC | NC_000913 | 2,313,540 | Δ2 bp :: IS186 (+) +6 bp | coding (53‑58/2673 nt) | rcsD → | phosphotransfer intermediate protein in two‑component regulatory system with RcsBC |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 2313540 = | 0 (0.000) | 79 (1.080) | 65/276 | 0.1 | 100% | coding (53/2673 nt) | rcsD | phosphotransfer intermediate protein in two‑component regulatory system with RcsBC |
| ? | NC_000913 | = 2515617 | NA (NA) | noncoding (1345/1345 nt) | IS186 | repeat region | |||||
| * | ? | NC_000913 | = 2313545 | 0 (0.000) | 78 (1.050) | 64/280 | 0.1 | 100% | coding (58/2673 nt) | rcsD | phosphotransfer intermediate protein in two‑component regulatory system with RcsBC |
| ? | NC_000913 | 2514275 = | NA (NA) | noncoding (3/1345 nt) | IS186 | repeat region | |||||
GGCCTGAATGAAGAGCAAGGTAACGTGGTTTCTCGCTTCGGTCTGAAGCTGGTTTACGGCTCTACCCTGGTGAGTGTGCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGAAGAACTGGATACTTCGGCACGTAATG > NC_000913/2514134‑2514412 | ggCCAGAATGAAGAGCAAGGTAACGTGGTTTCTCGCTTCGGTCTGAAGCTGGTTTACGGCTCTACCCTGGTGAGTGTGCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTccc < 1:545334/143‑1 (MQ=255) gCCTGAATGAAGAGCAAGGTAACGTGGTTTCTCGCTTCGGTCTGAAGCTGGTTTACGGCTCTACCCTGGTGAGTGTGCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCa < 1:520586/143‑1 (MQ=255) gCCTGAATGAAGAGCAAGGTAACGTGGTTTCTCGCTTCGGTCTGAAGCTGGTTTACGGCTCTACCCTGGTGAGTGTGCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACAGAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCa > 2:1205157/1‑143 (MQ=255) gCCTGAAGGAAGAGCAAGGTAACGTGGTTTCTCGCTTCGGTCTGAAGCTGGTTTACGGCTCTACCCTGGTGAGTGTGCTGTCGGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCa < 1:947338/143‑1 (MQ=255) ccTGAATGAAGAGCAAGGTAACGTGGTTTCTCGCTTCGGTCTGAAGCTGGTTTACGGCTCTACCCTGGTGAGTGTGCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCAt > 1:793259/1‑143 (MQ=255) aaGAGCAAGGTAACGTGGTTTCTCGCTTCGGTCTGAAGCTGGTTTACGGCTCTACCCTGGTGAGTGTGCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATCATTCCCATAAGCGCTa > 2:1020193/1‑143 (MQ=255) agggTGACGTGGTTTCTCGCTTCGGTCTGAAGCTGGTTTACGGCTCTACCCTGGTGAGTGTGCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTaa < 2:1026021/141‑1 (MQ=255) aaGGTAACGTGGTTTCTCGCTTCGGCCTGAAGCTGGTTTACGGCTCTACCCTGGTGAGTGTGCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACGGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTaa < 1:271107/143‑1 (MQ=255) aGGTAACGTTGTTTCTCGCGTCGGTCTGAAGCTGGTTTACGGCTCTACCCTGGTGAGTGTGCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAg < 2:7905/143‑1 (MQ=255) aGGTAACGTGGTTTCTCGCTTCGGTCTGAAGCTGGTTTACGGCTCTACCCTGGTGAGTGTGCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACCTAAAAAAGCCGGGGATAGTTCCCATAAGCGCTCACTTAAg > 2:932156/1‑143 (MQ=255) ggTAACGTGGTTTCTCGCTTCGGTCTGAAGCTGGTTTACGGCTCTACCCCGGTGAGTGTGCTGTCAGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTCTAAGACCACACATAAAAAAGCAGGGGCTAAGTGCCATAACCGCTAACGCAAgg > 2:441669/1‑143 (MQ=255) gttgtctctgGCTTCTGTCTGAGGCGGGTTTCCGGCTCTACCCTGGTGAGTGTGCTGTCTGCGTCAATCGCCGCACTGGTTCCGTAAGACCATACATAAGATAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTtgtg < 2:757510/137‑1 (MQ=255) tttCTCGCTTCGGTCTGAAGCTGGTTTACGGCTCTACCCTGGTGAGTGTGCTGTCTGCGTCAAGCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCGAAATTAAGGGGGGTggcag > 2:212192/1‑140 (MQ=255) cGCTTCGGTCTGAAGCTGGTTTACGGCTCTACCCTGGTGAGTGTGCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGc < 1:1050699/143‑1 (MQ=255) tCGGTCTGAAGCTGGTTTACGGCTCTACCCTGGTGAAGATGCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGa < 1:433192/143‑1 (MQ=255) tCGCTCTGAAGCTGGTTTACGGCTGTACCCTGGTGAGCGTGCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTACGACCATACATAAACAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGa < 1:1131592/143‑1 (MQ=38) cTGAAGCTGGTTTCCGGCTCTACCCTGGTGAGTGTGCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGa < 2:923418/143‑1 (MQ=255) ggaacccggTTTACGGCTCCGCCGTGGTGAGTGTGCTGTCTGCGTCAATCGCAGGACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGAt < 2:689971/136‑1 (MQ=37) gAAGCTGGTTTACGGCTCTACCCTGGTGAGTGTGCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGAtt < 2:1138848/143‑1 (MQ=255) aaGCTGGTTTACGGCTCTACCCTGGTGAGTGTGCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCCTACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATGACGCCTGATATGGttt > 1:439871/1‑143 (MQ=255) aaGCTGGTTTACGGCTCTACCCTGGTGAGTGTGCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGCTATGAttt > 1:896265/1‑143 (MQ=255) gTTTACGGCTCTACCCTGGTGAGTGTGCTGCACCCAGCTGGGCCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTg < 1:249321/143‑1 (MQ=21) ggCTCTACCCTGGTGAGTGTGCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGaag > 2:290518/1‑141 (MQ=255) ggCTCTACCCTGGTGAGTGTGCTGAAAGCGTGAATCGCAGCACTGGTGCAATAGAAAAGGAGAGAGAAGAGGACATGAAAATTCCCATAGGCGCTAACTTAACGGTCGAGGTATTACGCCCGACATGATTTAACGCGCCGacg > 2:967258/1‑141 (MQ=255) gCTCTACCCTTGTGAGTGGGCTGTCTGCGTGAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGa < 2:346461/143‑1 (MQ=255) tctACCCTGGTGAGTGTGCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACGTAAGGGTGGTGGCAGTACGCCAGAAGTGATCTAACGTGCCGATGCAt > 2:182819/1‑143 (MQ=255) aCCCTGGTGAGTGTGCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTAc < 1:31948/143‑1 (MQ=255) aCCCGGGCGAGTGGTCTGTCGCCGTAAATCGGAGCAGTTGGGCTGTAAGACCAAACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTAc < 2:780566/143‑1 (MQ=18) cccTGGTGAGTGTGCCGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTAct < 1:307253/143‑1 (MQ=255) ccTGGTGAGTGTGCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTATGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTGAACGTGCGGGTGAATTActc > 2:683077/1‑143 (MQ=255) tGGTGAGTGTGCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGAGATGATTTAACGTGCCGATGAATTActcgc > 1:407592/1‑141 (MQ=255) ggTGAGTGTGCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCa > 2:884071/1‑143 (MQ=255) gggtgtgtgtTGACTGGGTCACTCGCAGCGCGTGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCAc < 2:1214014/139‑1 (MQ=18) gTGAGTGTGCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACGGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCAc < 1:1200411/143‑1 (MQ=255) tGAGTGTGCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACg > 1:508853/1‑143 (MQ=255) tgtgCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAACAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGGGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCGCGATaa > 1:1266265/1‑143 (MQ=255) tgtgggCGGCAAGCGCAGCACCGGTGCTGCAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGt < 1:67226/138‑1 (MQ=18) tGTTTGTGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGATCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGt < 2:1273100/143‑1 (MQ=255) gTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATACTTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGGATTACGCCGGCTATGATTTAACCTACCGATGCAGTACTCTCACGATAACTgacc > 2:45338/1‑140 (MQ=25) tCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGCTGGATTACTCCCACGATAACTGGTcg > 2:517281/1‑142 (MQ=255) tGCGTCACTCGCAGCACTGGTGCTGTACGACCATACATAACAAAGCCGGGGATAATCCCCATTAACGCTAGCTTAAGGGTTGTGGTAGTACGCCTGATGTGATTGAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGGTAACTGGTCCGc > 1:194726/1‑143 (MQ=18) gCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCa > 1:438736/1‑143 (MQ=255) cGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCAGACAGAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGATGTGGTATTACGCCTGAGATGATTTAACGTGGCGATGAGTTAGCCTAACGATAACTGGTCACCaa > 2:566199/1‑143 (MQ=21) gTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAAt > 2:669191/1‑143 (MQ=255) aTCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTg > 2:1101693/1‑143 (MQ=255) tCGCAGCACTGGTGATGCACGGCCAGACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTgg < 2:215274/143‑1 (MQ=17) agctcacaCCGGTGCCGCATGAGCATACATACAAAAGCCGGGCATAATTCCCATAAGCGCTGACTTAACTGTTTTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGGGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTgg < 1:1344131/137‑1 (MQ=14) cGCAGCACTTGTGCTTCAAGACCATCCATAAAATAGCCGGCGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTCGGGGTATTACGCCTGATATGATTGAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGc < 2:414855/143‑1 (MQ=17) cGCAGCACTGGTTCTGGAACACCATACATAAAAAAGCCGAGCATAATTCCCATAAGCGCTAACGTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGAGTTAACTTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGc < 2:415092/143‑1 (MQ=17) cGCAGCACAGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGCGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGc < 1:782420/143‑1 (MQ=255) gcagcaCTGGTGCTGTAAGTGCATACATAGAAAAGCCGGGGATGATTCGCATAAGCGCTAACTTGAGGGTTGGGGTATTACGCGTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGcc < 2:1262478/143‑1 (MQ=17) tagtccTGTAAGACCCTACACAAAATAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACCTAAGAGTTGTCGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTCCCGATGAATTACTCTCACGATAACTTGTCAGCAATTCTGGCCCATATTg < 2:87660/138‑1 (MQ=14) tGGTGCTGTAGGTCCATAAATAAAAAAGCCGGTGATATGTCCCATAAGCGCTAACTTATGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTg < 2:1143282/143‑1 (MQ=14) tGGTGCTGTAAGACCACACATCAACAAGCCGGGTATAATGCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTAGTCAGCGATTCTGGCCCATATTg < 1:1288837/143‑1 (MQ=17) gTGCTGTAAGACCATACATAAGAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGt < 1:664531/143‑1 (MQ=255) gTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGt < 1:662974/143‑1 (MQ=255) cTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCAAAATGACGGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAg > 1:1284466/1‑143 (MQ=255) tGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGc > 2:691216/1‑143 (MQ=255) aCCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCgaag < 1:361298/143‑1 (MQ=255) catacataAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCAACAGATCATGAGAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCACgaagaa > 2:282058/1‑143 (MQ=17) cagacataAAAAGGCCGGGGAGAATTCCCGTAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTGAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCgaagaa < 2:978885/140‑1 (MQ=14) cataAAACAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGAAGAACTgg < 1:996736/143‑1 (MQ=255) cataAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGAAGAACTgg < 1:1363536/143‑1 (MQ=255) ataCAAAAGTCGGGGATAATTGCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGGGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCTCATATTGGTAAGCCCGAAGAACTGGa < 1:802163/143‑1 (MQ=11) ataCAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGAAGAACTGGa < 1:1024623/143‑1 (MQ=255) ataAAAACGCCGTGGCTCATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGTGTTGTGGTATTCCGCCGGATATGGTTTGACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTCAGCCCGAAGAACTggc < 2:421282/143‑2 (MQ=11) taAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGAAGAACTGGAt > 1:1250877/1‑143 (MQ=255) actcctaccGGGGAGCATTACCATAACCGCTAACTTAAGGGCTGTGGTATTACACATGCTATGATTTAAAGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTGAGCAATGATGGCCAAAATTGGTAGTCACGGCGAACTGGATa > 2:935359/8‑143 (MQ=2) gaaaaGCCGGGGATAATGCCCATAAGCGCGAACGTAAGGGGTGTGGTATTACGCCGGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGAAGAACTGGATAc < 1:355805/142‑1 (MQ=14) aaaaGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGAAGAACTGGATACt > 2:510496/1‑143 (MQ=40) aGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGAAGAACTGGATACTTCg < 1:1328830/143‑1 (MQ=38) ccGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGAAGAACTGGATACCTCGGc > 2:40389/1‑143 (MQ=37) ccGGGGATAATGCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATACGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGAAGAACTGGATACTTCGGc < 1:637152/143‑1 (MQ=25) ggggATAATTCCCATCAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATAATGGTAAGCCAGAAGCACTGGATACTTCGGCAc > 2:1149809/1‑143 (MQ=255) ggggATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGAAGAACTGGATACTTCGGcca > 1:410846/1‑141 (MQ=25) gggATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGAAGAACTGGATACTTCGGCACg > 1:608110/1‑143 (MQ=35) ggATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGAAGAACTGGATACTTCGGCACGt < 1:1101693/143‑1 (MQ=34) gATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGAAGAACTGGATACTTCGGCACGTa > 1:488640/1‑143 (MQ=34) aaTTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGAAGAACCGGATACTTCGGCACGTAATg > 2:646442/1‑143 (MQ=17) | GGCCTGAATGAAGAGCAAGGTAACGTGGTTTCTCGCTTCGGTCTGAAGCTGGTTTACGGCTCTACCCTGGTGAGTGTGCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGAAGAACTGGATACTTCGGCACGTAATG > NC_000913/2514134‑2514412 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |