New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | = 4178481 | 59 (0.970) | 5 (0.090) | 5/270 | 7.7 | 8.4% | coding (35/429 nt) | rplK | 50S ribosomal subunit protein L11 |
? | NC_000913 | = 4178484 | 53 (0.920) | coding (38/429 nt) | rplK | 50S ribosomal subunit protein L11 | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
GAATACAATTTCGCGCCTTTTGTTTTTATGGGCCTTGCCCGTAAAACGATTTTTTATATCACGGGGAGCCTCTCAGAGGCGTTATTACCCAACTTGAGGAATTTATAATGGCTAAGAAAGTACAAGCCTATGTCAAGCTGCAGGTTGCAGCTGGTATGGCTAACCCGAGTCCGCCAGTAGGTCCGGCTCTGGGTCAGCAGGGCGTAAACATCATGGAATTCTGCAAAGCGTTCAACGCAAAAACTGATTCCATCGAAAAAGGTCTGCCGATTCCGGTAGTA > NC_000913/4178340‑4178620 | gAATACAATTTCGCGCCTTTTGTTTTTATGGGCCTTGCCCGTAAAACGATTTTTTATATCACGGGGAGCCTCTCAGAGGCGTTATTACCCAACTTGAGGAATTTATAATGGCTAAGAAAGTACAAGCCTATGTCAAGCTGCAg < 1:649124/143‑1 (MQ=255) gAACACAATTTCGCGCCTTTTGTTTTTATGGGCCTTGCCCGTAAAACGATTTTTTATATCACGGGGAGCCTCTCAGAGGCGTTATTACCCAACTTGATGAATTTATAATGGCTAAGAAAGTACAAGCCTATGTCAAGCTGCAg < 1:923739/143‑1 (MQ=255) aaTACAATTTCGCGCCTTTTGTTTTTATGGGCCTTGCCCGTAAAACGATTTTTTATATCACGGGGAGCCTCTCAGAGGCGTTATTACCCAACTTGAGGAATTTATAATGGCTAAGAAAGTACAAGCCTATGTCAAGCTGCAgg < 2:1000661/143‑1 (MQ=255) aaTACAAGTTCGCGCCTTTTGTTTTTATGGGCCTTGCCCGTAAAACGATTTTTTATATCACGGGGAGCCTCTCAGAGGCGTTATTACCCAACTTGAGGAATTTATAATGGCTAAGAAAGTACAAGCCTATGTCAAGCTGCAgg < 1:489702/143‑1 (MQ=255) tACAATTTCGCGCCTTTTGTTTTTATGGGCCTTGCCCGTAAAACGATTTTTTATATCACGGGGAGCCTCTCAGAGGCGTTATTCCCCAACTTGAGGAATTTATAATGGCTAAGAAGGGCCCAGCCTGTGTCACGCTGCAGGtt > 1:266367/1‑143 (MQ=255) tACAATTTCGCGCCTTTTGTTTTTATGGGCCTTGCCCGTAAAACGATTTTTTATATCACGGGGAGCCTCTCAGAGGCGTTATTACCCAACTTGAGGAATTTATAATGGCTAAGAAAGTACAAGCCTATGTCAAGCTGCaacct > 2:762978/1‑139 (MQ=255) aCAATTTCGCGCCTTTTGTTTTTATGGGCCTTGCCCGTAAAACGATTTTTTATATCACGGGGAGCCTCTCAGAGGCGTTATTACCCAACTTGAGGAATTTATAATGGCTAAGAAAGTACAAGCCTATGTCAAGCTGCAGGTTg < 1:1078373/143‑1 (MQ=255) tttCGCGCCTTTTGTTTTTATGGGCCTTGCCCGTAAACCGATTTTTTATATCACGGGGAGCCTCTCAGAGGCGTTATTACCCAACTTGAGGAATTTATAATGGCTAAGAAAGTACAAGCCTATGTCAAGCTGCAGGTTGCAGc < 1:489961/143‑1 (MQ=255) gcgcgCCTTTTGTTTTTATGGGCCTTGCCCGTAAAACGATTTTTGAGAGCAGGGGGAGCCTCTCAGAGGCGTTATTACCCAACTTGAGGAATTTATAATGGCTAAGAAAGTACAAGCCTATGTCAAGCTGCAGGTTGCAGCTg < 2:431537/142‑1 (MQ=255) cgcgCCTTTTGTTTTCATGGGCCTTGCCCGTAAAACGATTTTTTATATCACGGGGAGCCTCTCAGAGGCGTTATTACCCAACTTGAGGAATTTATAATGGCTAAGAAAGTACAAGCCTATGTCAAGCTGCAGGTTGCAGCTgg < 1:971548/143‑1 (MQ=255) gcgcCTTTTGTTTTTATGGGCCTTGCCCGTAAAACGATTTTTTATATCACGGGGAGCCTCTCAGAGGCGTTATTACCCAACTTGAGGAATTTATAATGGCTAAGAAAGTACAAGCCTATGTCAAGCTGCTGGTTGCGGCTGGt > 1:131141/1‑143 (MQ=255) gcgcCTTTTGTTTTTATGGGCCTTGCCCGTAAAACGATTTTTTATATCACGGGGAGCCTCTCAGAGGCGTTATTACCCAACTTGAGGAATTTATAATGGCTAAGAAAGTACAAGCCTATGTCAAGCTGCAGGTTGCAGCTGGt > 1:758569/1‑143 (MQ=255) ccTTTTGTTTTTATGTGCCTTGCCCGTAATACGATTTTTTATATCACGGGGAGCCTCTCAGAGGCGTTATTACCCAACTTGAGGAATTTATAATGGCTAAGAAAGTACAAGCCTATGTCAAGCTGCAGGTTGCAGCTGGTATg < 1:677330/143‑1 (MQ=255) tGTTTTTATGGGCCTTGCCCGTAAAACGATTTTTTATATCACGGGGAGCCTCTCAGAGGCGTTATTACCCAACTTGAGGAATTTATAATGGCTAAGAAAGTACAAGCGTATGTCAAGCTGCAGGTTGCAGCTGGTATGGCTag > 1:363708/1‑142 (MQ=255) ttATGGTCCTTGCCCGTAAAACGATTTTTTATATCACGGGGAGCCTCTCAGAGGCGTTATTACCCAACTTGAGGAATTTATAATGGCTAAGAAAGTACAAGCCTATGTCAAGCTGCAGGTTGCAGCTGGTATGGCTAACCCGa < 2:385157/143‑1 (MQ=255) ttATGGGCCTTGCCCGTAAAACGATTTTTTATATCACGGGGAGCCTCTCAGAGGCGTTATTACCCAACTTGAGGAATTTATAATGGCTAAGAAAGTACAAGCCTATGTCAAGCTGCAGGTTGCAGCTGGTATGGCTAACCCGa < 1:437915/143‑1 (MQ=255) ttATGGGCCTTGCCCGTAAAACGATTTTTAATATCACGGGGAGCCTCTCAGAGGCGTTATTACCCAACTTGAGGAATTTATAATGGCTAAGAAAGTACAAGCCTATGTCAAGCTGCAGGTTGCAGCTGGTATGGCTAATCCGa < 2:190065/143‑1 (MQ=255) gggCCGTGCCCGCAAAACGATTTTGTATATCACGGGGAGCCGTTCAGAGGCGTTATTACCCAACTTGAGGAATTTATAATGGCTAAGAAAGTACAAGCCTATGTCAAGCTGCAGGTTGCAGCTGGTATGGCTAACCCGAGTcc < 1:487006/143‑1 (MQ=255) ccTTGCCCGTAAAACGATTTTTTATATCACGGGGAGCCTCTCAGCGGCGTTATTACCCAACTTGAGGAATTTATAATGGCTAAGAAAGTACAAGCCTATGTCCACCTGCGGGTTGCAGCTGGTATGGCTCACCAGAGgccgcc > 2:322050/1‑143 (MQ=255) tGCCCGTAAAACGATTTTTTATATCACGGGGAGCCTCTCAGAGGCGTTATTACCCAACTTGAGGAATTTATAATGGCTAAGAAAGTACAAGCCTATGTCAAGCTGCAGGTTGCAGCTGGTATGGCTAACCCGAGTCCGCCAGt < 1:859298/143‑1 (MQ=255) ccggTAAAACGAGTTTTTATATCACGGGGAGCCTCTCAGAGGCGTTATTACCCAACTTGAGGAATTTATAATGGCTAAGAAAGTACAAGCCTATGTCAAGCTGCAGGTTGCAGCTGGTATGGCTAACCCGAGTCCGCCAGTAg < 2:52991/140‑1 (MQ=255) gTAAAACGATTTTTTATATCACGGGGAGCCTCTCAGAGGCGTTATTACCCAACTTGAGGAATTTATAATGGCTAAGAAAGTACAAGCCTATGTCAAGCTGCAGGTTGCAGCTGGTATGGCTAACCCGAGTCCGCCAGTAGGTc > 1:767750/1‑143 (MQ=255) aaaCGATTTTTGATATCACGGGGAGCCTCTCAGAGGCGTTATTACCCAACCTGAGGAATTTATAATGGCTAAGAAAGTACAAGCCTATGTCAAGCTGCAGGTTGCAGCTGGTATGGCTAACCCGAGTCCGCCAGTAGGTCCgg < 1:317281/143‑1 (MQ=255) aaaCGATCTTTTATATCACGGGGAGCCTCTCAGAGGCGTTATTACCCAACTTGAGGAATTTATAATGGCTAAGAAAGTACAAGCCTATGTCAAGCTGCAGGTTGCAGCTGGTATGGCTAACCCGAGTCCGCCAGTAGGTCCgg < 1:344062/143‑1 (MQ=255) aaCGATTTTTTATATCACGGGGAGCCTCTCAGAGGCGTTATTACCCAACTTGAGGAATTTATAATGGCTAAGAAAGTACACGCCTATGTCAAGCTGCAGGTTGCAGCTGGTATGGCTAACCCGAGTCCGCCAGTAGGTCCGGc > 1:554544/1‑143 (MQ=255) cgagtctttATATCACGGGGAGCCTCTCAGAGGCGTTATTACCCAACTTGAGGAATTTATAATGGCTAAGAAAGTACAAGCCTATGTCAAGCTGCAGGTTGCAGCTGGTATGGCTAACCCGAGTCCGCCAGTAGGTCCGGctc < 1:1019055/137‑1 (MQ=255) ttttttATATCACGGGGAGCCTCTCAGAGGCGTTATTACCCAACTTGAGGAATTTATAATGGCTAAGAACGTACAAGCCTATGTCAAGCTGCAGGTTGCAGCTGGTATGGCTAACCCGAGTCCGCCAGTAGGTCCGGCTCTgg < 1:749717/143‑1 (MQ=255) ttttATATCACGGGGAGCCTCTCAGAGGCGTTATTACCCAACTTGAGGAATTTATAATGGCTAAGAAAGTACAAGCCTATGTCAAGCTGCAGGTTGCAGCTGGTATGGCTAACCCGAGTCCGCCAGTAGGTCCGGCTCTGGGt > 1:529138/1‑143 (MQ=255) aCGGTGAGCCTCTCAGAGGCGTTATTACCCAACTTGAGGAATTTATAATGGCTAAGAAAGTACAAGCCTATGTCAAGCTGCAGGTTGCAGCTGGTATGGCTAACCCGAGTCCGCCAGTAGGTCCGGCTCTGGGTCAGCAGGGc < 2:253783/143‑1 (MQ=255) aCGGGGCGCCTCGGGTAGGCGTTGTTCCGCAACTTGAGGCATTTATACTGGCTAAGAAAGTACAAGCCTATGTCCCGCTGCTGGTGGCAGCTGGTATGGCTAACCCGAGTCCGCCAGTAGGTCCGGCTCTGGGTCAGCAGGGc < 2:259340/143‑1 (MQ=255) aCGGGGAGCCTCTCAGAGGCGTTATTACCCAACTTGAGGAATTTATAAGGGCTGAGAAAGTACAAGCCTATGTCAAGCTACAGGTTGCAGAGCGTATAGCTAGCCCGAGTACGCCAGTAGGTCCGGCTCTGGGTCACCAGGGc > 2:1008513/1‑143 (MQ=255) cGGGGAGCCTCTCAGAGGCGTTATTACCCAACTTGAGGAATTTATAATGGCTAAGAAAGTACAAGCCTATGTCAAGCTGCAGGTTGCAGCTGGTATGGCTACCCCGAGTCCGCCAGTAGGTCCGGCTCTGGGTCAGCCCGGCg > 2:421511/1‑143 (MQ=255) ggAGCCTCTCAGAGGCGTTATTACCCAACTTGAGGAATTTATAATGGCTAAGAAAGTACAAGCCTATGTCAAGCTGCAGGTTGCAGCTGGTATGGCTAACCCGAGTCCGCCAGTAGGTCCGGCTCTGGGTCAGCCGGGCGtcg > 2:739979/1‑141 (MQ=255) cttctgAGAGGCGTTCTTCCCCAACTTGAGGAATTTATAAGGGCTAAGAAAGTACAAGCCTATGTCAAGCTGCAGGTTGCAGCTGGTATGGCTAACCCGAGTCCGCCAGTAGGTCCGGCTCTGGGTCAGCAGGGCGTAAAcat < 2:759157/141‑1 (MQ=255) ccTCTCAGAGGCGTTATTACCCAACTTGAGGAATTTATAATGGCTAAGAAAGTACAAGCCTATGTCAAGCTGCAGGTTGCAGCTGGTATGGCTAACCCGAGTCCGCCAGTAGGTCCGGCTCTGGGTCAGCAGGGCGTAAAcat > 2:1004606/1‑143 (MQ=255) ctctCAGAGGCGTTATTACCCAACTTGAGGAATTTATAATGGCTAAGAAAGTACAAGCCTATGTCAAGCTGCAGGTTGCAGCTGGTATGGCTAACCCGAGTCCGCCAGTAGGTCCGGCTCTGGGTCAGCAGGGCGTAAAcatc < 2:246966/143‑1 (MQ=255) tctcAGAGGCGTTATTACCCAACTTGAGGAATTTATAATGGCTAAGAAAGTACAAGCCTATGTCAGGCTGGTGGGTCCAGGTGGTGTGGTTGACCTGAGGCCGCCAGTAGGTCCGGCCTCGGGTCAGCAGGGCGTACAcatca > 2:1067481/1‑143 (MQ=255) tctcAGAGGCGTTATTACCCAACTTGAGGAATTTATAATGGCTAAGAAAGTACAAGCCTATGTCAAGCTGCAGGTTGCAGCTGGTATGGCTAACCCGAGTCCGCCAGTAGGTCCGGCTCTGGGTCAGCAGGGCGTAAAcatca > 1:945465/1‑143 (MQ=255) tctcAGAGGCGTTATTACCCAACTTGAGGAATTTATAATGGCTAAGAAAGTACAAGCCTATGTCAAGCTGCAGGTTGCAGCTGGTATGGCTAACCCGAGTCCGCCAGTAGGTCCGGCTCTGGGTCAGCAGGGCGTAAAcatca > 1:836545/1‑143 (MQ=255) ctcAGAGGCGTTATTACCCAACTTGAGGAATTTATAATGGCTAAGAAAGTACAAGCCTATGTCAAGCTGCAGGTTGCAGCTGGTATGGCTAACCCGAGTCCGCCAGTAGGTCCGGCTCTGGGTCAGCAGGGCGTAAAcatcat < 1:368001/143‑1 (MQ=255) ctcAGAGGCGTTATTACCCAACTTGAGGAATTTATAATGGCTAAGAAAGTACAAGCCTATGTCAAGCTGCAGGTTGCAGCTGGTATGGCTAACCCGAGTCCGCCAGTAGGTCCGGCTCTGGGTCAGCAGGGCGTAAAcatcat < 1:729255/143‑1 (MQ=255) gcAGAGGGGTTATTACCCAACTTGAGGGATTTATAAGGGCTAAGAAAGTACAAGCCTATGTCAAGCTGCAGGTTGCAGCTGGTATGGCTAACCCGGGTCCGCCAGTAGGTCCGGCTCTGGGTCAGCAGGGCGTAAACATCATg < 2:430060/142‑1 (MQ=255) acAGAGGCGTTATCACCCAACTTGAGGAATCTATAAGGGCTAAGAAAGTACAAGCCTATGTCAAGCTGCAGGTTGCAGCTGGTATGGCTAACCCGAGTCCGCCAGTAGGTCCGGCTCTGGGTCAGCAGGGCGTAAACATCATg < 1:97542/142‑1 (MQ=255) ttGAGGTATTTATAATGGCTAAGAAAGTACAAGCCTATGTCAAGCTGCAGGTTGCAGCTGGTATGGCTAACCCGAGTCCGCCAGTAGGTCCGGCTCTGGGTCAGCAGGGCGTAAACATCATGGAATTCTGCAAAGCGTTCAAc < 2:78777/143‑1 (MQ=255) gAGGAATTTATAATGGCTAAGAAAGTACAAGCCTATGTCAAGCTGCGGGTTGCAGCTGGTATGGCTAACCCGAGTCCGCCAGTAGGTCCGGCTCTGGGTCAGCAGGGCGTAGACATCATGGAATTCTGCAAAGCGTTCAACGc > 1:1079708/1‑143 (MQ=255) gAGGAATTTATAATGGCTAAGAAAGTACAAGCCTATGTCAAGCTGCGGGTTGCAGCTGGTATGGCTAACCCGAGTCCGCCAGTAGGTCCGGCTCTGGGTCAGCAGGGCGTAAACATCATGGAATTCTGCAAAGCGTTCAACGc > 1:844681/1‑143 (MQ=255) gAGGAATTTATAATGGCTAAGAAAGTACAAGCCTATGTCAAGCTGCAGGTTGCAGCTGGTATGGCTAACCCGAGTCCGCCAGTAGGTCCGGCTCTGGGTCAGCAGGGCGTAAACATCATGGAATTCTGCAAAGCGTTCAACGc > 1:51311/1‑143 (MQ=255) gAATTTATAATGGCTAAGAAAGTACAAGCCTATGTCAAGCTGCAGGTTGCAGCTGGTATGGCTAACCCGAGTCCGCCAGTAGGTCCGGCTCTGGGTCAGCAGGGCGTAAACATCATGGAATTCTGCAAAGCGTTCAACGCaaa > 2:352019/1‑143 (MQ=255) gAATTTATAATGGCTAAGAAAGTACAAGCCTATGTCAAGCTGCAGGTTGCAGCTGGTATGGCTAACCCGAGTCCGCCAGTAGGTCCGGCTCTGGGTCAGCAGGGCGCACACCTCATGGAATTCTGCGCAGCGTTCAACGCgaa > 1:488243/1‑143 (MQ=255) tttATAATGGCTAAGAAAGTACAAGCCTATGTCAAGCTGCAGGTTGCAGCTGGTATGGCTAACCCGAGTCCGCCAGTAGGTCCGGCTCTGGGTCAGCAGGGCGTAAACATCATGGAATTCTGCAAAGCGTTCAACGCAAAAAc < 1:577244/143‑1 (MQ=255) ataATGGCTAAGAAAGTACAAGCCTATGTCAAGCTGCATGTTGCAGCTGGTATGGCTAACCCAAGTCCGCCAGTAGGTCCGGCTCTGGGTCAGCAGGGCGTAAACATCATGGAATTCTGCAAAGCGTTCAACGCAAAAACTGa > 2:383177/1‑143 (MQ=255) gCTAAGAAAGTACAAGCCGATGTCAAGCTGCAGGTTGCAGCTGGTATGGGCCCGTCAAAACCTCCAGTAGGTCCGGCTCTGGGTCAGCAGGGCGTAAACATCATGGAATTCTGCAAAGCGTTCAACGCAAAAACTGATTCCAt < 1:504170/143‑1 (MQ=255) aaGAAAGTACAAGCCTATGTCAAGCTGCAGGTTGCAGCTGGTATGGCTAACCCGAGTCCGCCAGTAGGTCCGGCTCTGGGTCAGCAGGGCGTAAACATCATGGAATTCTGCAAAGCGTTCAACGCAAAAACTGATTCCATCGa > 1:483556/1‑143 (MQ=255) aaaGTACAAGCCTATGTCAAGCTGCAGGTTGCAGCTGGTATGGCTAACCCGAGTCCGCCAGTAGGTCCGGCTCTGGGTCAGCAGGGCGTAAACATCATGGAATTCTGCAAAGCGTTCAACGCAAAAACTGATTCCATCGaaaa > 1:815801/1‑143 (MQ=255) aaaGTACAAGCCTATGTCAAGCTGCAGGTTGCAGCTGGTATGGCTAACCCGAGTCCGCCAGTAGGTCCGGCTCTGGGTCAGCAGGGCGTAAACATCATGGAATTCTGCAAAGCGTTCAACGCAAAAACTGATTCCATCGaaaa > 1:755143/1‑143 (MQ=255) ccggCCTATGTAAAGCTGCAGTGTGCAGCTGGTATGGCTAACCCGAGTCCGCCATTAGGTCCGGCTCTGGGTCAGCAGGCCGTAAACATCATGGAATTCTGCAAAGCGTTCAACGCAAAAACTGATTCCATCGAAAAAGGTCt < 2:349319/140‑1 (MQ=255) aaGCCTATGTCAAGCTGCAGGTTGCAGCTGGTATGGCTAACCCGAGTCCGCCAGTAGGTCCGGCTCTGGGTCAGCAGGGCGTAAACATCATGGAATTCTGCAAAGCGTTCAACGCAAAAACTGATTCCATCGACAAAGGTCTg > 2:1019053/1‑143 (MQ=255) gtcTATGTCAAGCTGCAGGATGCAGCGGGTATGGCTAACCCGAGTCCGCCAGTAGGTCCGGCTCTGGGTCAGCAGGGCGTAAACATCATGGAATTCTGCAAAGCGTTCAACGCAAAAACTGATTCCATCGAAAAAGGTCTGcc < 1:972628/141‑1 (MQ=255) gCTGCAGGTTGCAGCTGGTATGGCTAACCCGAGTCCGCCAGTAGGTCCGGCTCTGGGTCAGCAGGGCGTAAACATCATGGAATTCTGCAAAGCGTTCAACGCAAAAACTGATTCCATCGAAAAAGGTCTGCCGATTCCGgtag > 2:238261/1‑143 (MQ=255) tGCAGGTTGCAGCTGGTATGGCTAACCCGAGTCCGCCAGTAGGTCCGGCTCTGGGTCAGCAGGGCGTAGACATCATGGAGTTCTGCAAAGCGTTCAACGCAAAAACTGATTCCATCCAAAAAGGTCTGCCGCTTCCGcaagta > 2:100186/1‑143 (MQ=255) | GAATACAATTTCGCGCCTTTTGTTTTTATGGGCCTTGCCCGTAAAACGATTTTTTATATCACGGGGAGCCTCTCAGAGGCGTTATTACCCAACTTGAGGAATTTATAATGGCTAAGAAAGTACAAGCCTATGTCAAGCTGCAGGTTGCAGCTGGTATGGCTAACCCGAGTCCGCCAGTAGGTCCGGCTCTGGGTCAGCAGGGCGTAAACATCATGGAATTCTGCAAAGCGTTCAACGCAAAAACTGATTCCATCGAAAAAGGTCTGCCGATTCCGGTAGTA > NC_000913/4178340‑4178620 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |