| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | NC_000913 | 3,815,859 | Δ82 bp | [rph]–[rph] | [rph], [rph] | |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | NC_000913 | 3815859 | 3815940 | 82 | 65 [0] | [0] 65 | [rph]–[rph] | [rph],[rph] |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 3815858 | 0 (0.000) | 60 (1.180) | 48/264 | 0.1 | 100% | pseudogene (24/48 nt) | rph | ribonuclease PH (defective);enzyme; Degradation of RNA; RNase PH |
| ? | NC_000913 | 3815941 = | 0 (0.000) | pseudogene (609/669 nt) | rph | ribonuclease PH (defective);enzyme; Degradation of RNA; RNase PH | |||||
AAAAGGCGACTCATCAGTCGCCTTAAAAATCAGTTTGCCAGCGCCGCCTTCTGCGTCGCTACAATGGATTCGATTCCCCTCGGGCCAGAGCCAACAAGATGAGTAGCTCTTCATGGGTGAACGGCTCGCCTTCTGCCGTCCCCTGCACTTCAATGATGCGCCCGTCTTCGGTCATCACTACGTTCATGTCGGTCTCTGCGGCAGAGTCTTCAACGTATTCCAGATCGCAAACCGCTTCGCCGTTCACAATTCCGACAGAAACTGCGGCTACCATCCCT > NC_000913/3815805‑3816082 | gcttgctaagcgcaaattcaataaactggcgctgatatggtttcatgccttcgctcctcatcttacttttctacagacaaaaaaaaggcgactcatcagtcgccttaaaaatcagtttgccagcgccgccttctgcCGTcccc < 1:23949‑M2/7‑1 (MQ=255) attgctaagcgaaaagtcaataaacgggcgctgatatggtgtcatgccttcgctcctcatcttacttttctacagacaaaaaaaaggcgactcatcagtcgccttaaaaatcagtttgccagcgccgccttctgcCGTCCCCt < 1:369022‑M2/8‑1 (MQ=255) ctaagcgcaaattcaagaaactggcgctgatatggtttcatgccttcgctcctcagcttacttttctacagacaaaaaaaaggcgactcatcagtcgccttaaaaatcagtttgccagcgccgccttctgcCGTCCCCTGCAc < 2:343143‑M2/12‑1 (MQ=255) taagcgcaaattcaataaactggcgctgatatggtttcatgccttcgctcctcatcttacttttctacagccaaaaaaaaggcgactcatcagtcgccttaaaaatcagtttgccagcgccgccttctgcCGTCCCCTGCACt > 2:355535‑M2/131‑143 (MQ=255) taagcgcaaattcaataaactggcgctgatatggtttcatgccttcgctcctcatcttacttttctacagacaaaaaaaaggcgactcatcagtcgccttaaaaatcagtttgccagcgccgcctcctgcCGCCCCCTGCACt > 2:264610‑M2/131‑143 (MQ=255) gcaagttcaataaactggcgctgatatggttgcatgccttcgctcctcatcttacttttctacagacaaaaaaaaggcgactcatcagtcgccttaaaaatcagtttgccagcgccgccttctgcCGTCCCCTGCACTTCAat < 1:528640‑M2/18‑1 (MQ=255) gcaaattcaataaactggcgctgatatggtttcatgccttcgctcctcatcttacttttctacagacaaaaaaaaggcgactcatcagtcgccttaaaaatcagtttgccagcgccgccttctgcCGTCCCCTGCACTTCAat > 2:530071‑M2/126‑143 (MQ=255) caattcaataaactgccgctgatagggtttcatgccatcgctcctcatcttacttttctacagacaaaaaaaaggcgactcatcagtcgccttaaaaatcagtttgccagcgccgccttctgcCGTCCCCTGCACTTCAatga < 2:82866‑M2/20‑1 (MQ=255) ttcaataaactggcgctgatatggtttcatgccttcgctcctcatcttacttttctacagacaaaaaaaaggcgcctcatccgtcgccttaaaaatcagtttgccagcgccgccttctgcCGTCCCCTGCACTTCCATGATgc > 2:891028‑M2/121‑143 (MQ=255) caatcaacaggcactgacattgtttcatgccttcgctcctcacctgactgccctccagaccaaaaaaaggcgactcatcagtcgccttaaacatcagtttgccagcgccgccttctgcCGTCCCCTGCACTTCAATGATgcgc < 1:327962‑M2/25‑1 (MQ=255) caataaactggcgctgatatggtttcatgccttcgctcctcatcttacttttctacagacaaaaaaaatgcgattcattagtcgcattaaaaatcagtttgccagcgccgccttctgcCGTCCCCTGCACTTCAATGATgcgc < 1:803225‑M2/25‑1 (MQ=255) ataaactggcgctgatatggtttcatgccttcgctcctcatcttacttttctacagacaaaaaaaaggcgactcatcagtcgccttaaaaatcagtttgccagcgccgccttctgcCGTCCCCTGCACTTCAATGATGCGccc > 2:424431‑M2/117‑143 (MQ=255) aaactggcgctgatatggtttcatgccttcgctcctcatcttacttttctacagacaaaaaaaaggcgacccatcagtcgccttaaaaatcagtttgccagcgccgccttctgcCGTCCCCTGCACTTCAATGATGCGCCcgc > 2:609076‑M2/115‑142 (MQ=255) ctggtgctgttatggtttcatgccttcgcgcctcatcttactgttctacagacaaaaaaaaggcgactcatcagtcgccttaaaaatcagtttgccagcgccgccttctgcCGTCCCCTGCACTTCAATGATGCGCCCGTCtt < 2:823768‑M2/32‑1 (MQ=255) tgtagctgagatggtttcaggccttcgcgcctcattttacttttctacttaccaaaaaaaggcgactcatcagtcgccttaaaaatcagtttgccagcgccgccttctgcCGTCCCCTGCACTTCAATGATGCGCCCGTCTTc < 2:881259‑M2/33‑1 (MQ=255) gcgctgatatggtttcatgccttcgctcctcatcttacttttctacagacaaaaaaaaggcgactcatcagtcgccttaaaaatcagtttgccagcgccgccttctgcCGTCCCCTGCACTTCAATGATGCGCCCGTCTTCgg < 1:407129‑M2/35‑1 (MQ=255) cgctgatatggtttcatgccttcgctcctcatcttacttttctacagacaaaaaaaaggtgactcatcggtcgccttaaaactcagtttgccagcgccgccttctgcCGTCCCCTGCACTTCAATGATGCGCCCGTCTTCGGt < 1:518292‑M2/36‑1 (MQ=255) tgatatggcttcatgccttcgctcctcatcttacttttctacagacaaaaaaaaggcgactcatcagtcgccttaaaaatcagtttgccagcgccgccttctgcCGTCCCCTGCACTTCAATGATGCGCCCGTCTTCGGtcat < 1:527902‑M2/39‑1 (MQ=255) atatggttgcacgccttcgctccccatcttacttttcgacagacaaaaaaaaggcgacgcatcagtcgccttaaaaatcagtttgccagcgccgccttctgcCGTCCCCTGCACTTCAATGATGCGCCCGTCTTCGGtcatca < 1:852757‑M2/41‑1 (MQ=255) atggtttcatgccgtcgctcctcatcttacttttctacagacaaaaaaaaggcgactcatcagtcgccttaaaaatcagtttgccagcgccgccttctgcCGTCCCCTGCACTTCAATGATGCGCCCGTCTTCGGTCATCACt < 2:448399‑M2/43‑1 (MQ=255) gtttcatgccttcgctcctcatcttacttttctacagacaaaaaaaaggcgactcatcagtcgccttaaaaatcagtttgccagcgccgccttctgcCGTCCCCTGCACTTCAGTGATGCCCCCGTCTCCGGTCATcactgag > 2:342352‑M2/98‑140 (MQ=255) gttccatgcctgcgcccctcgtcgtacttttctacagacaaaaaaaaggcgactcatcagtcgccttaaaaatcagtttgccagcgccgccttctgcCGTCCCCTGCACTTCAATGATGCGCCCGTCTTCGGTCATCACTACg < 2:728932‑M2/46‑1 (MQ=255) tttcatgccttcgctcctcatcttacttttctacagacaaaaaaaaggcgactcatcagtcgccttaaaaatcagtttgccagcgccgccttctgcCGTCCCCTGCACTTCAATGATGCGCCCGTCTTCGGGCACCACtacct > 2:891524‑M2/97‑141 (MQ=255) tcatgccttcgctcctcatcttacttttctacagacaaaaaaaaggcgactcatcagtcgccttaaaaatcagtttgccagcgccgccttctgcCGTCCCCTGCACTTCAATGATGCGCCCGTCCTCGCTCATCACTAcgtcc > 2:718317‑M2/95‑141 (MQ=255) 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actcatcagtcgccttaaaaatcagtttgccagcgccgccttctgcCGTCCCCTGCACTTCAATGATGCGCCCGTCTTCGGTCATCACTACGTTCATGTCGGTCTCTGCGGCAGAGTCTTCAACGAAGTCCAGATCGCAAAcc > 1:674819‑M2/47‑143 (MQ=255) atcagtcgccttaaaaatcagtttgccagcgccgccttctgcCGTCCCCTGCACTTCAATGATGCTCCCGTCTTCGGTCGTCACTACGTTCCTGTCGGTCTCTGCGGCAGAGTCCTCCCCGTCTTCCAGGTCCCAAACCGCtt > 1:105519‑M2/43‑143 (MQ=255) cagtcgccttaaaaatcagtttgccagcgccgccttctgcCGTCCCCTGCACTTCAATGATGCGCCCGTCTTCGGTCATCACTACGTTCATGTCGGTCTCTGCGGCAGAGTCTTCAACGTATTCCAGATCGCAAACCGCTTCg < 1:464008‑M2/103‑1 (MQ=255) gcccgaaaaatcagttcggcagcgccgccttcggcCGCCCCCTGCACTTCAATGATGCGCCCGTCTTCGGTCATCACTACGTTCATGTCGGTCTCTGTGGCAGAGTCTTCAACGTATTCCAGATCGCAAACCGCTTCGCCGtt < 1:264610‑M2/108‑1 (MQ=255) atcagtttgccagcgccgccttctgcCGTCCCCTGCACTTCAATGATGCGCCCGTCTTCGGTCATCACTACGTTCATGTCGGTCTCTGCGGCAGCGTCTTCAACGTATTCCAGATCACAAACCGCTTCGCCGTTCAACATTcc > 1:642353‑M2/27‑143 (MQ=255) atcagtttgccagcgccgccttctgcCGTCCCCTGCACTTCAATGATGCGCCCGTCTTCGGTCATCACTACGTTCATGTCGGTCTCTGCGGCAGAGTCTTCAACGTATTCCAGATCGCAAACCGCTTCGCCGTTCACAATTcc > 1:910699‑M2/27‑143 (MQ=255) tcagtttgccagcgccgccttctgcCGTCCCCTGCACTTCAATGATGCGCCCGTCTTCGGTCATCACTACGTTCATGTCGGTCTCTGCGGCAGAGTCTTCAACGTATTCCAGATCGCAAACCGCTTCGCCGTTCACAATTCCg > 2:357144‑M2/26‑143 (MQ=255) agtttgccagcgccgccttctgcCGTCCCCTGCACTTCAATGATGCGCCCGTCTTCGGTCATCACTACGTTCATGTCGGTCTCTGCGGCAGAGTCTTCAACGTATTCCAGATCGCAAACCGCTTCGCCGTTCACAATTCCGAc < 1:424431‑M2/120‑1 (MQ=255) agtttgccagcgccgccttctgcCGTCCCCTGCACTTCAATGATGCGCCCGTCTTCGGTCATCACTACGTTCATGTCGGTCTCTGCGGCAGAGTCTTCAACGTATTCCAGATCGCAAACCGCTTCGCCGTTCACAATTCCGAc < 1:153073‑M2/120‑1 (MQ=255) gtgtgccagcgccgccttctggCTCCCCCTGCACTTCAATGATGCGCCCGTCTTCGGTCATCACTACGTTCATGTCGGTCTCTGCGGCAGAGTCTTCAACGTATTCCAGATCGCAAACCGCTTCGCCGTTCACAATTCCGACa < 2:907863‑M2/121‑1 (MQ=255) tttgccagcgccgccttctgcCGTCCCCTGCACTTCAATGATGCGCCCGTCTTCGGTCATCACTACGTTCATGTCGGTCTCTGCGGCAGAGTCTTCAACGTATTCCAGATCGCAAACCGCTTCGCCGTTCACAAttccgtccg > 1:904591‑M2/22‑139 (MQ=255) agctccgcgttctgcCGTCCCCCGCACCTCAATGATGCGCCCGGCTTCGGTCATCCCTACGTTCATGTCGGCCTCTGCGGCATAGTCTTTAACGTATTCCAGATCGCAAACCGCTTCGCCGTTCACAATTCCGACAGAAACTg < 1:783794‑M2/128‑1 (MQ=255) agcgccgccttctgcCGTCCCCTGCACTTCAATGATGCGCCCGTCTTCGGTCATCACTACGTTCATGTCGGTCTCTGCGGCAGAGTCTTCAACGTATTCCAGATCGCAAACCGCTTCGCCGTTCACAATTCCGACAGAAACTg > 2:68498‑M2/16‑143 (MQ=255) gcgccgccttctgcCGTCCCCTGCACTTCAATGATGCGCCCGTCTTCGGTCATCACTACGTTCATGTCGGTCTCTGCGGCAGAGTCTTCAACGTATTCCAGATCGCAAACCGCTTCGCCGTCCACAATTCCGACAGACACTGc > 2:98569‑M2/15‑143 (MQ=255) gcgccgccttctgcCGTCCCCTACACTTCAATGATGCGCCCGTCTTCGGTCATCACTACGTTCATGTCGGTCTCTGCGGCAGCGTCTTCAACGTATTCCAGATCGCCAACCGCTTCGCCGTTCACAATTGCGACAGATACTGc > 2:202895‑M2/15‑143 (MQ=255) gcccccttctgtCGGCTCTTGCTCTTCAATGCTGCGCCCGTCTTCTGTCATCACGCCGTTCATGTCGGTCTCTGCGGCAGAGTCTTCAACGTATTCCAGATCGCAAACCGCTTCGCCGTTCACAATTCCGACAGAAACTGCgg < 2:857415‑M2/131‑1 (MQ=255) ccttctgtCGTCCCCTGCACTTCAATGATGCGCCCGTCTTCGGTCATCACTACGTTCATGTCGGTCTCTGCGGCAGAGTCTTCAACGTATTCCAGATCGCAAACCGCTTCGCCGTCCCCCAACCCAACAGAAACTGCGACTAc > 2:468883‑M2/9‑143 (MQ=255) tgcCGTGCCCTGCACTTCACTGCGTGGCCCGTCTTCGGTCATCACTACGTTCATGTCGGTCTCTGCGGCAGCGTCTTCAACGTATTCCAGATCGCAAACCGCTTCGCCGTTCACAATTCCGACAGAAACTGCGGCTACCATcc < 2:470927‑M2/140‑1 (MQ=255) tgcCGTCCTCTGCACTTCAATGATGCGCCCGTCTTCGGTCATCACTACGTTCATGTCGGTCTCTGCGGCAGAGTCTTCAACGTATTCCAGATCGCAAACCGCTTCGCCGTTCACAATTCCGACAGAAACTGCGGCTACCATcc < 2:220541‑M2/140‑1 (MQ=255) tgcCGTCCCCTGCACTTCAATGATGCGCCCGTCTTCGGTCATCACTACGTTCATGTCGGTCTCTGCGGCAGAGTCTTCAACGTATTCCAGATCGCAAACCGCTTCGCCGTTCACAATTCCGACAGAAACTGCGGCTACCATcc < 1:355535‑M2/140‑1 (MQ=255) cCGTCCCCTGCACTTCAATGATGCGCCCGTCTTCGGTCATCACTACGTTCATGTCGGTCTCTGCGGCAGAGTCTTCAACGTATTCCAGATCGCAAACCGCTTCGCCGTTCACAATTCCGACAGAAACTGCGGCTACCATCCCt > 1:170025‑M2/2‑143 (MQ=255) | AAAAGGCGACTCATCAGTCGCCTTAAAAATCAGTTTGCCAGCGCCGCCTTCTGCGTCGCTACAATGGATTCGATTCCCCTCGGGCCAGAGCCAACAAGATGAGTAGCTCTTCATGGGTGAACGGCTCGCCTTCTGCCGTCCCCTGCACTTCAATGATGCGCCCGTCTTCGGTCATCACTACGTTCATGTCGGTCTCTGCGGCAGAGTCTTCAACGTATTCCAGATCGCAAACCGCTTCGCCGTTCACAATTCCGACAGAAACTGCGGCTACCATCCCT > NC_000913/3815805‑3816082 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |