| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 1226106 = | 53 (1.110) | 4 (0.090) | 3/266 | 7.2 | 7.8% | intergenic (‑26/‑494) | minC/ycgJ | inhibitor of FtsZ ring polymerization/uncharacterized protein |
| ? | NC_000913 | 1226128 = | 45 (1.000) | intergenic (‑48/‑472) | minC/ycgJ | inhibitor of FtsZ ring polymerization/uncharacterized protein | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
CCTGAGCGATTTTGTCTTCCAGCGCCTGATGGATAACCTTAGGTTCTGCCTCATGCAGATGAACCACAGATAAAGTGAAGCTACTGCCTTTAAGCTCGATTGGCGTGTTTGACATCCTGGCCTTACTCAATTAGCTATTAATCATCGCCAGCGCGCGATGATGTTCCGAAGACTATAAGGCATGTTATAGTCTGGATTATATTGAGGCAAGTCACCCTCCCATTTATTCAGAGTAAAAGTCTATTCTGTGATAAATGGCGCTGATTCATAGCTTAAAAAATA > NC_000913/1225966‑1226247 | ccTGAGCGATTTTGTCTTCCAGCGCCTGATGGATAACCTTAGGTTCTGCCTCATGCAGATGAACCACAGATAAAGTGAAGCTACTGCCTTTAAGCTCGATTGGCGTGTTTGACATCCTGGCCTTACTCAATTAGCTATTAatc < 1:647550/143‑1 (MQ=255) gATTTTGTCTTCCAGCGCCTGATGGATAACCTGAGGTTCTGCCTCATGCAGATGAACCACAGATAAAGTGAAGCTACTGCCTTTAAGCTCGATTGGCGTGTTTGACATCCTGGCCTTACTCAATTAGCTATTAATCATCGCCa < 2:536148/143‑1 (MQ=255) ttttGTCTTCCAGCGCCTGATGGATAACCTTAGGTTCTGCCTCATGCAGATGAACCACAGATAAAGTGAAGCTACTGCCTTTAAGCTCGATTGGCGTGTTTGACATCCTGGCCTTACTCAATTAGCTATTAATCATCGCCAgc > 1:742896/1‑143 (MQ=255) ttttGTCTTCCAGCGCCTGATGGATAACCTTAGGTTCTGCCTCATGCAGATGAACCACAGATAAAGTGAAGCTACTGCCTTTAAGCTCGATTGGCGTGTTTGACATCCTGGCCTTACTCAATTAGCTATTAATCATCGCCAgc > 1:472219/1‑143 (MQ=255) ttttGTCTTCCAGCGCCTGATGGATAACCTTAGGTTCTGCCTCATGCAGATGAACCAAAGATAGCTTGAAGCGACTGCCTTAAAGCTCGATTGGCGTGTTTGACATACTGGCCTTACTCAATTAGCTATTAATTATCGGCAgc > 1:315928/1‑143 (MQ=255) ttCCAGCGCCTGATGGATAACCTTAGGTTCTGCCTCATGCAGATGAACCACAGATAAAGTGAAGCTACTCCCTTTAAGCTCGATTGGCGTGTTTAACATCCTTACCTTACTCAATTAGCTATTAATCATCGCCAGCGCGCgat > 1:626884/1‑143 (MQ=255) ccAGCGCCTCTCAGATAACTTCAGGCGCTGCCTCATGCAGATGAACCACAGATAAAGTGAAGCTACTGCCTTTAAGCTCGATTGGCGTGTTTGACATCCTGGCCTTACTCAATTAGCTATTAATCATCGCCAGCGCGCgatga < 2:453934/143‑1 (MQ=255) cgcCTGATGGATAACCTTAGGTTCTGCCTCATGCAGATGAACCACAGATAAAGTGAAGCTACTGCCTTTAAGCTCGATTGGCGTGTTTGACATCCTGGCCTTACTCAATTAGCTATTAATCATCGCGCGCTGGCgatgattaa < 1:572439/143‑4 (MQ=255) tGGATAACCTTAGGTTCTGCCTCATGCAGATGATCCACTGATAAAGTGACGCTACGGCCTTTAAGCTCGACTGGCGTGTTTGACATCCTGGCCGTACTCAATTAGCTATTAATCATCGCCAGCGCGCGATGATGTTCCGAAGa < 2:592812/143‑1 (MQ=255) gATAACCTTAGGTTCTGCCTCATGCAGATGAACCACAGATAAAGTGAAGCTACTGCCTTTAAGCTCGATTGGCGTGTTTGACATCCTGGCCTTACTCAATTAGCTATTAATCATCGCCAGCGCGCGATGATGTTCCGacggct > 2:26029/1‑138 (MQ=255) ccTTAGGTTCTGCCTCATGCAGATGAACCACAGATAAAGTGACGCTACTGCCTTTAAGCTCGATTGGCGTGTTTGACATCCTGGCCTTACTCAATTAGCTATTAATCATCGCCAGTGCGCGATGATGTTCCGAAGACtctacg > 2:235241/1‑141 (MQ=255) ccTTAGGTTCTGCCTCATGCAGATGAACCACAGATAAAGTGAAGCTACTGCCTTTAAGCTCGATTGGCGTGTTTGACATCCTGGCCTTACTCAATTAGCTATTAATCATCGCCAGCGCGCGATGATGTTCCGAAGACTATCAg > 2:388363/1‑143 (MQ=255) ttAGGTTCTGCCTCATGCAGATGAACCACAGATAAAGTGAAGCTACTGCCTTTAAGCTCGATTGGCGTGTTTGACATCCTGGCCTTACTCAATTAGCTATTAATCATCGCCAGCGCGCGATGATGTTCCGAAGACTATAAAGc > 2:407292/1‑143 (MQ=255) tgaGGTGCTGCCTCATGCAGATGAACCACAGAGAAGGTGAAGCTACTGCCTTTAAGCTCGATTGGCGTGTTTGACATCCTGGCCTTACTCAATTAGCTATTAATCATCGCCAGCGCGCGATGATGTTCCGAAGACTATAAGGc < 2:742819/141‑1 (MQ=255) tAGGTTCTGCCTCATGCAGATGAACCACAGATAAAGTGAAGATACTGCCTTTAAGCTCGATTGGCGTGTTTGACCTCCTGGCCTTACTCAATTAGCTATTAATCATCGCCAGCGCGGGATGATGTTCCGAAGACTCTAAGGCa > 1:430055/1‑143 (MQ=255) tCATGCAGATGAACCACAGATAAAGTGAAGCTACTGCCTTTAAGCTCGATTGGCGTGTTTGACATCCTGGCCTTACTCAATTAGCTATTAATCATCGCCAGCGCGCGATGATGTTCCGAAGACTATAAGGCATGTTATAGTCt < 1:68804/143‑1 (MQ=255) tGCAGATGAACCACAGATAAAGTGAAGCTACTGCCTTTAAGCTCGATTGGCGTGTTTGACATCCTGGCCTTACTCAATTAGCTATTAATCATCGCCAGCGCGCGATGGTGTTCCGAAGACTATAAGGCATGTTATATTCTGGa > 1:211937/1‑143 (MQ=255) cAGCTGAACCACAGATTACGTGGAGCTACTGCCTTTAAGCTCGATTGGCGTGTTTGACATCCTGGCCTTACTCAATTAGCTATTAATCATCGCCAGCGCGCGATGATGTTCCGAAGACTATAAGGCATGTTATAGTCTGGAtt < 2:326471/143‑1 (MQ=255) aGATGAACCACAGATAAAGTGAAGCTACTGCCTTTAAGCTCGATTGGCGTGTTTGACATCCTGGCCTTACTCAATTAGCTATTAATCATCGCCAGCGCGCGATGATGTTCCGAAGACTATAAGGCATGTTATAGTCTGGATta < 1:800091/143‑1 (MQ=255) gATGAACCACAGATAAAGTGAAGCTACTGCCTTTAAGCTCGATTGGCGTGTTTGACATCCTGGCCTTACTCAATTAGCTATTAATCATCGCCAGCGCGCGATGATGTTCCGAAGACTATAAGGCATGTTATAGTCTGGATtat > 1:852864/1‑143 (MQ=255) ccACAGATAAAGTGAAGCTACTGCCTTTATGCTAGATCCAAGGGCGGGTCACCCTGGCGTTACTCAATCAGCTATGAAGGATGGCGAGCGCGCGGGGAGGTGCCGAAGACTAAAAGGCATGAGATAGGCGGCATTATATTGat > 2:105775/1‑142 (MQ=255) ccACAGATAAAGTGAAGCTACTGCCTTTAAGCTCGATTGGCGTGTTTGACATCCTGGCCTTACTCAATTAGCTATTAATCATCGCCAGCGCGCGATGATGTTCCGAAGACTATAAGGCATGTTATAGTCTGGATTATATTGAg > 1:850013/1‑143 (MQ=255) aGATAGAGCGAAGCTACTGGCTTTAAGCTCGATTGGCGTGTTTGACATCCTGGCCTTACTCAATTAGCTATTAATCATCGCCAGCGCGCGATGATGTTCCGAAGACTATAAGGCATGTTATAGTCTGGATTATATTGAGGCaa < 2:597564/143‑1 (MQ=255) aGATAAAGTGAAGCTACTGCCTTTAAGCTCGATTGGCGTGTTTGACATCCTGGCCTTACTCAATTAGCTATTAATCATCGCCAGCGCGCGATGATGTTCCGAAGACTATAAGGCATGTTATAGTCTGGATTATATTGAGGCaa < 2:611348/143‑1 (MQ=255) aaaGTGAAGCTCCTGACTTTAAGCTCGATTGGCGTGTTTGACATCCTGGCCTTACTCAATTAGCTATTAATCATCGCCAGCGCGCGATGATGTTCCGAAGACTATAAGGCATGTTATAGTCTGGATTATATTGAGGCAAGTCa < 1:544516/143‑1 (MQ=255) aaaGTGAAGCTACTGCCTTTAAGCTCGATTGGCGTGTTTGACATCCTGGCCTTACTCAATTAGCTATTAATCATCGCCAGCGCGCGATGATGTTCCGAAGACTATAAGGCATGTTATAGTCTGGATTATATTGAGGCAAGTCa > 1:563299/1‑143 (MQ=255) aaGTGAAGCTACTGCCTTTAAGCTCGATTGGCGTGTTTGACATCCTGGCCTTGATCGATTAGCAATTAATGAAAAATAGCGCGCGATGATGTTCCGAAGACTCTAAGGCATGTTATAGTCTGGGTTCTATTGGGGCCAGTGAc > 1:406869/1‑143 (MQ=255) tgTGAGGGTACTGCGGTTAGGCTCGATTGGCGTGTGTGGCATCCTGGCGTTACTCAATTAGGTATTAATCATCGCCTGCGCGGGATGATGTTCCGAAGACTATAAGGCATGTTATAGTCTGGATTATATTGAGGCAAGTCAcc < 2:877027/142‑1 (MQ=255) aGTGAAGCTACTGCCTTTAAGCTCGATTGGCGTGTTTGACATCCTGGCCTTACTCGATTAGCTATTAATCATCGCCAGCGCGCGATGATGTTCCGCAGACTATAAGGCATGTTATAGTCTGGAGTATATTGAGGCAAGtaaag > 2:816008/1‑139 (MQ=255) tGAAGCTACTGCCTTTAAGCTCGATTGGCGTGTTTGACATCCTGGCCTTACTCAATTAGCTATTAATCATCGCCAGCGCGCGATGATGTTCCGAAGACTATAAGGCATGTTATAGTCTGGATTATATTGAGGCAAGTCACCCt > 1:773741/1‑143 (MQ=255) tgaCTTCCTTTAACCTCGCGTGGCGTTGTTGCTATCCCGGCCTTAGTCAATTAGCGATTAATCATCGCGGGCGTGCGATGATGTTCCGAAGACTATAAGGCATGTTATAGTCTGGATTATATTGAGGCAAGTCACCCTCCCAt < 2:665581/141‑1 (MQ=255) ccTTTATGCTCGATGGGCGTGTTTCACATCCTGGCCTTACTCAATTAGCTATTAATCATCGCCAGCGCGCGATGATGTTCCGAAGACTATAAGGCATGTTATAGTCTGGATTATATTGAGGCAAGTCACCCTCCCATTTATTc < 2:876718/143‑1 (MQ=255) cTTTAAGCTCGAGTGGCGTGTTTGACATCCTGGCCTTACTCAATTAGCTATTAATCATCGCCAGCGCGCGATGATGTTCCGAAGACTATAAGGCATGTTATAGTCTGGATTATATTGAGGCAAGTCACCCTCCCATTTATTCa < 1:713470/143‑1 (MQ=255) tttAAGCTCGATTGGCGTGTTTGACATCCTGGCCTTACTCAATTAGCTATTAATCATCGCCAGCGCGCGATGATGTTCCGAAGACTATAAGGCATGTTATAGTCTGGATTATATTGAGGCAAGTCACCCTCCCATTTATTCag > 2:241813/1‑143 (MQ=255) ttAAGCTCGATTGGCGTGTTTGACATCCTGGCCTTACTCAATTAGCTATTAATCATCGCCAGCGCGTGATGATGTTCCGAAGACTATAAGGCATGTTATAGTCTGGATTATATTGAGGCAAGTCACCCTCCCATTTATTCgga < 2:843570/143‑1 (MQ=255) cTCGATTGGCGTGTTTGACATCCTGGCCTTACTCAATTAGCTATTAATCATCGCCAGCGCGCGATGATGTTCCGAAGACTATAAGGCATGTTATAGTCTGGAATATATGGGGGCAAGTCACCCTCCCATTTATTCAGAGTaaa > 1:365880/1‑143 (MQ=255) ttGGCGTGTTTGACATCCTGGCTGCACTCAATTAGCTATTAATCATCGCCAGCGCGCGATGATGTTCCGAAGACTATAAGGCATGTTATAGTCTGGATTATATTGCGGCAAGTCACCCTCCCATTTATTCAGAGTAAAAGTCt > 2:535368/1‑143 (MQ=255) gtgtTTGACATCCTGGCCTTACTCAATTAGCTATTAATCATCGCCAGCGCGCGATGATGTTCCGAAGACTATAAGGCATGTTATAGTCTGGATTATATTGAGGCCAGTCACCCTCCCATTTATTCAGAGTAAAAGTCTATTCt > 1:445114/1‑143 (MQ=255) tgtTTGACATCCTGGCCTTACTCAATTAGCTATTAATCATCGCCAGCGCGCGATGATGTTCCGAAGACTATAAGGCATGTTATAGTCTGGATTATATTGAGGCAAGTCACCCTCCCATTTATTCAGAGTAAAATTCTATTCtg > 2:408299/1‑143 (MQ=255) gtTTGACATCCTGGCCTTACTCAATTAGCTATTAATCATCGCCAGCGCGCGATGATGTTCCGAAGACTATAAGGCATGTTATAGTCTGGATTATATTGAGGCAAGTCACCCTCCCATTTATTCAGAGTAAAAGTCTATTCtgt < 1:779356/143‑1 (MQ=255) tttGACATCCTGGCCTTACTCAATTAGCTATTAATCATCGCCAGCGCGCGATGAAGTTCCGAAGACTATAAGGCATGTTATAGTCTGGATTATATTGAGGCAAGTCACACTCCCATTTCTTCAGAGTAAAAGTCTATGCtgtg > 2:315465/1‑143 (MQ=255) cATCCTGGCCTTACTCAATTAGCTATTAATCATCGCCAGCGCGCGATGATGTTCCGAAGACTATAAGGCATGTTATAGTCTGGATTATATTGTGGCTTGTCGCCCTCCCATTTATTCAGAGTAAAAGTCTATTCTGTTATaaa > 1:164134/1‑143 (MQ=255) aTCCTGGCCTTACTCAATTAGCTATTAATCATCGCCAGCGCGCGATGATGTTCCGAAGACTATAAGCCATGTTATAGTCTGGATTATATTGAGGCACGACACCCTCCCGTTTAAAGAAATACCAAGTCTCTTCTGTGATAAAt > 1:548541/1‑143 (MQ=255) aTCCTGGCCTTACGCGATTAGCTATTAATCATCGCCAGCGCGCGATGATGTTCCGAAGACTATAAGGCATGTTATAGTCTGGATTATATTGAGGCAAGTCACCCTCCCATTTATTCAGAGTAAAAGTCTAGTCTGTGATAAAt > 2:395261/1‑143 (MQ=255) tCCTGGCCTTACTCAATTAGCTATTAATCATCGCCAGCGCGCGATGATGTTCCGAAGACTATAAGGCATGTTATAGTCTGGATTATATTGAGGCAAGTCACCCTCCCATTTATTCAGAGTAAAAGTCTATTCTGTGATAAATg > 1:696887/1‑143 (MQ=255) tGGCCTTACTCAATTAGCTATTAATCATCGCCAGCGCGCGATGATGTTCCGAAGACTATAAGGCATGTTATAGTCTGGATTATATTGAGGCAAGTCACCCTCCCATTTATTCAGAGTAAAAGTCTATTCTGTGATAAATGgcg < 1:184599/143‑1 (MQ=255) ttACTCAATTAGCTATTAATCATCGCCAGCGCGCGATGATGTTCCGAAGACTATAAGGCATGTTATAGTCTGGATTATATTGAGGCAAGTCACCCTCCCATTTATTCAGAGTAAAAGTCTATTCTGTGATAAATGGCGCTGAt < 2:472219/143‑1 (MQ=255) ttACTCAATTAGCTATTAATCATCGCCAGCGCGCGATGATGTTCCGAAGACTATAAGGCATGTTATAGTCTGGATTATATTGAGGCAAGTCACCCTCCCATTTATTCAGAGTAAAAGTCTATTCTGTGATAAATGGCGCTGAt > 2:161041/1‑143 (MQ=255) cAATTAGCTATGAATCATCGCCAGCGCGCGATGATGTTCCGAAGACTATAAGGCATGTTATAGTCTGGATTATATTGAGGCAAGTCACCCTCCCATTTATTCAGAGTAAAAGTCTATTCTGTGATAAATGGCGCTGATTCATa < 1:412345/143‑1 (MQ=255) cTATTAATCATCGCCAGCGCGCGATGATGTTCCGAAGACTATAAGGCATGTCATAGTCTGGATTATATTGAGGCAAGTCACCCTCCCATTTATTCAGAGTAAAAGTCTATTCTGTGCTCAATGGCACTGATTCATCGCTTaaa > 2:9052/1‑143 (MQ=255) tATTAATCATCGCCATCGCGCGATGATGTTCCGACGACTATAAGGCATGTTATAGTCTGGATTATATTGAGTCAAGTCACCCTCCCATTTATTCAGAGTAAAAGTCTATTCTGTGATAAATGGCGCTGATTCATAGCTTaaaa < 1:121991/143‑1 (MQ=255) tAATCATCGCCAGCGCGCGATGATGTTCCGAAGACTATAAGGCATGTTATAGTCTGGATTATATTGAGGCAAGTCACCCTCCCATTTATTCAGAGTAAAAGTCTATTCTGTGATAAATGGCGCTGATTCATAGCTTAAAAAAt < 1:858451/143‑1 (MQ=255) aaTCATCGCCAGCGCGCGATGATGTTCCGAAGCCTATAAGGCATGTTCTCGTCTGGATTCTCTTGAGGCAAGTCACCCTCCCATTTATTCAGAGTAAAAGTCTATTCTGTGATAAATGGCGCTGATTCATAGCTTAAAAAATa > 1:26702/1‑143 (MQ=255) | CCTGAGCGATTTTGTCTTCCAGCGCCTGATGGATAACCTTAGGTTCTGCCTCATGCAGATGAACCACAGATAAAGTGAAGCTACTGCCTTTAAGCTCGATTGGCGTGTTTGACATCCTGGCCTTACTCAATTAGCTATTAATCATCGCCAGCGCGCGATGATGTTCCGAAGACTATAAGGCATGTTATAGTCTGGATTATATTGAGGCAAGTCACCCTCCCATTTATTCAGAGTAAAAGTCTATTCTGTGATAAATGGCGCTGATTCATAGCTTAAAAAATA > NC_000913/1225966‑1226247 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |