| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 458787 = | 7 (0.130) | 56 (1.080) | 46/278 | 0.1 | 89.1% | intergenic (+87/‑101) | clpX/lon | ATPase and specificity subunit of ClpX‑ClpP ATP‑dependent serine protease/DNA‑binding ATP‑dependent protease La |
| ? | NC_000913 | 608011 = | NA (NA) | intergenic (+23/‑54) | hokE/insL1 | toxic polypeptide, small/IS186 transposase | |||||
Only 100 of 105 total aligned reads displayed.
GCAAACCGTTGCTGATTTATGGCAAGCCGGAAGCGCAACAGGCATCTGGTGAATAATTAACCAT‑TCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTAATAGATGGCGTGAAGCACAGTCGTGTCATCTGATTACCTGGCGGAAATTAAACTAAGAGAGAGCTCTATGAATCCTGAGCGTTCTGAACGCATTGAAATCCCCGTATT > NC_000913/458645‑458928 | gcgaaCCGTTGCTGATTTACGGCAAGCCGGAAGCGCAACAGGCATCTGGTGAATAATTAACCAT‑TCCCATACACTTAGTTACCCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTgg < 2:83885/140‑1 (MQ=255)gCAAACCGTTGCTGATTTATGGCAAGCCGGAAGCGCAACAGGCATCTGGTGAATAATTAACCAT‑TCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTgg < 2:342311/143‑1 (MQ=255)gCAAACCGTTGCTGATTTATGGCAAGCCGGAAGCGCAACAGGCATCTGGTGAATAATTAACCAT‑TCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTgg < 2:561238/143‑1 (MQ=255) ccccggcagtacgttctgaagtatccagttcttggggcttacttgtatgggccagaattgctgaccagttatggtgatagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatg > 1:102308‑M1/143‑143 (MQ=255) 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gcttaccaatatgggccagaattgctgaccagttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatGGGGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTAATa > 2:716337‑M1/107‑143 (MQ=255) cttgccaatatgggccagaattgctgaccagttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatGGGGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTAATAg > 1:913345‑M1/106‑143 (MQ=255) ggCATCTGGTGAATAATTAACCAT‑TCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGACTGTGGGGGAAACATCCCatacgcgctaacttaagggttgaaccat > 2:147890‑M1/1‑115 (MQ=255) tgtctGTTTAATGATTAGCACT‑TCCCATATAATTAATAAAAAAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCataagcgctaacttaagggttgaaccatct < 1:674707‑M1/141‑31 (MQ=255) caatatgggccagaattgctgaccagttatcgtgagggtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatGGGGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTttatagtgggc < 2:442389‑M1/43‑6 (MQ=255) 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ttaagttagcgcttatGGGGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTAATAGATGGCGTGAAGCACAGTCGTGTCATCTGATTACCTGGCGGAAATTAAACTAAGAGAGAGCTCTATGAATCCTGAGCGTTCTGAACGCAt > 2:633883‑M1/17‑143 (MQ=255) ttaagttagcgcttatGGGGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTAATAGATGGCGTGAAGCACAGTCGTGTCATCTGATTACCTGGCGGAAATTAAACTAAGAGAGAGCTCTATGAATCCTGAGCGTTCTGAACGCAt < 2:761068‑M1/127‑1 (MQ=255) taagttagcgcttatGGGGAAACCTCCCCATATACTGACGTACATGTTAATAGATGGCGTGAAGCACAGTCGTGTCATCTGATTACCTGGCGGAAATTAAACTAAGAGAGAGCTCTATGAATCCTGAGCGTTCTGAACGCAtt > 2:756740‑M1/16‑143 (MQ=255) cGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgttaagacgatgcctcgcgttcttcaattgcgttttgtaggctgtcagggatgctgtccca > 1:649828‑M1/1‑27 (MQ=255) gttagcgcttatGGGGAAACATCCCCATATACTGGCGTACATGTTAATAGATGGCGTGAAGCACAGTCGTGTCATCTGATTACCTGGCGGAAATTAAACTAAGAGAGAGCTCTATGAATCCTGAGCGTTCTGAACGCATTGaa > 1:633661‑M1/13‑143 (MQ=255) ttagcgcttatGGGGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTAATAGATGGCGTGAAGCACAGTCGTGTCATCTGATTACCTGGCGGAAATTCAACTAAGAGAGAGCTGTATGAATCCTCAGCGTTCTGAACGAAATGaaa < 1:311061‑M1/132‑1 (MQ=255) gcgcttatGGGGAAACATCCCCACATACTGACGTACATGTTAATAGATGGCGTGAAGCACAGTCGTGTCATCTGATTACCTGGCGGAAATTAAACTAAGAGAGAGCTCTATGAATCCTGAGCGTTCTGAACGCATTGAAATcc > 1:873614‑M1/9‑143 (MQ=255) catGTGGGGGAAACATCCCataagcgctaacttaagggtttatccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgttaagacgatgcctcgcgttcttcaattgcgttttgtaggctgtcagggatactgtcccacgaatggc < 1:132504‑M1/142‑125 (MQ=255) gtgGGGGAAACATCCCagaagcgctaacgtaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgccgcggtgcctcgttaagacgatgcctcgcgttctaaggttgcttgttgtaggctgtcagggatactgtcccacgaatggccac < 1:650867‑M1/143‑128 (MQ=255) tGGGGAAATATCGCAATATACTGGCGTACATGTTAATGGATGGCGTGAAGCACAGTCGTGTCATCTGATTACCTGGCGGAAATTAAACTAAGAGAGAGCTCTATGAATCCTGAGCGTTCTGAACGCATTGAAATCCCCGTAtt > 1:846251‑M1/2‑143 (MQ=255) tGGGGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTAATAGATGGCGTGAAGCACAGTCGTGTCATCTGATTACCTGGCGGAAATTAAACTAAGAGAGAGCTCTATGAATCCTGAGCGTTCTGAACGCATTGAAATCCCCGTAtt < 2:295395‑M1/142‑1 (MQ=255) | GCAAACCGTTGCTGATTTATGGCAAGCCGGAAGCGCAACAGGCATCTGGTGAATAATTAACCAT‑TCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTAATAGATGGCGTGAAGCACAGTCGTGTCATCTGATTACCTGGCGGAAATTAAACTAAGAGAGAGCTCTATGAATCCTGAGCGTTCTGAACGCATTGAAATCCCCGTATT > NC_000913/458645‑458928 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |