New junction evidence | |||||||||||
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attTACCATCTGCCGTCCATGGAAGACTTCGAAAAAGTGGTTATCGACGAGTCGGTAATTGAAGGTCAAAGCAAACCGTTGCTGATTTATGGCAAGCCGGAAGCGCAACAGGCATCTGGTGAATAATTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCATAAGCGCT‑AACTT < 1:366187/236‑1 ATGTACGATCTGCCGTCCATGGAAGACGTCGAAAAAGTGGTTATCGACGAGGCGGTAATTGATGGTCAAAGCAAACCGTTGCTGATTTATGGCAAGCCGGAAGCGCAACAGGCATCTGGTGAATAATTAACCATTCCCATACAATTAGTTAATCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCATAAGCGCT‑AACTT < 2:1142907/239‑1 gtttgGATTTGCCGTCCATGGAAAACGGCGAAAAGGTGGTTATTGGCGAGTCGGTAATTGATGGTCAAAGCAAACCGTTGCTGATTAATGGCAAGCCGGAAGCGCAACAGGCATCTGGTGAATAATTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTGATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCATAAGCGCT‑AACTTA < 1:140450/234‑1 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> 1:197864/1‑232 TGGAAGACGTCGAAAAAGTGGTTATCGACGAGTCGGTAATTGATGGTCAAAGCAAACCGTTGCTGATTTATGGCAAGCCGGAAGCGCAACAGGCATCTGGTGAATAATTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCATAAGCGC < 2:1058670/214‑1 AAGACGTCGAAAAAGTGGTTATCGACGAGTCGGTAATTGATGGTCAAAGCAAACCGTTGCTGATTTATGGCAAGCCGGAAGCGCAACAGGCATCTGGTGAATAATTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTTTCTCCCCTTTAATTTTTCCTCAATTCTCGGAGTTGAATGTGGGGGAAAATTCCCATAA‑CGCTAAATTTAAAGGTTGAACCAattcaaaaa > 1:610260/1‑230 ACGTCGAAAAAGTGGTTATCGACGAGTCGGTAATTGATGGTCAAAGCAAACCGTTGCTGATTTATGGCAAGCCGGAAGCGCAACAGGCATCTGGTGAATAATTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCATAAGCGCT‑AACTT < 1:1092901/214‑1 ACGTCGAAAAAGTGGTTATCGACGAGTCGGTAATTGATGGTCAAAGCAAACCGTTGCTGATTTATGGCAAGCCGGAAGCGCAACAGGCATCTGGTGAATAATTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCATAAGCGCT‑AACTT > 2:1092901/1‑214 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TTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCATAAGCGCT‑AACTTAAGGGTTGAACCATCTGAAGAATGCGACGCCTCGGTGCCTCGTTAAGACGATGCCTCGCGTTCTTCAATTGCGTTTTGTAGGCTGTCAGGGGTACTTTCCCACGAATGGCCACCTGTAAGCTCCAG > 2:968811/1‑239 CATTCCCATTCAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATGTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAAGGTGGGGGAAACATCCCATAAGCGCT‑AACTTAAGGGTTGAACCATCTGAAGAATGCGACGCCTCGGTGCCTCGTTAAGACGATGCCTCGCGTTCTTCAATTGCGTTTTGTAGGCTGTCAGGGATACTGTCCCACGAATGGCCACCTGTAAGCTCCAGATGAC < 2:391283/239‑1 TTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCATAAGCGCT‑AACTTAAGGGTTGAACCATCTGAAGAATGCGACGCCTCGGTGCCTCGTTAAGACGATGCTTCGCGTTCTTCAATTGCGTTTTGTAGGCTGTAAGGGATCCTGTCCCACGAATGTCCACCTGTAAGCTTCAGATGAC > 2:880590/1‑237 TCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCATAAGCGCT‑AACTTAAGGGTTGAACCATCTGAAGAATGCGACGCCTCGGTGCCTCGTTAAGACGATGCCTCGCGTTCTTCAATTGCGTTTTGTAGG > 2:884113/1‑187 TCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCATAAGCGCT‑AACTTAAGGGTTGAACCATCTGAAGAATGCGACGCCTCGGTGCCTCGTTAAGACGATGCCTCGCGTTCTTCAATTGCGTTTTGTAGG < 1:884113/187‑1 TCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCATAAGCGCT‑AACTTAAGGGTTGAACCATCGGAAGAATGCGACGCCTCGGTGCCTCGTTAAGACGATGCCTCGCGTTCTTCAATTGCGTTTTGTAGGCTGTCAGGGATACTGTCCCACGAATGGCCACCTGTAAGCTCCGGATGACCAT < 1:1283474/239‑1 TTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGTGGACACATCCCATAAGCGCT‑AACTTAAGGGTTGAACCATCTGAAGAATGCGACGCCTCGGTGCCTCGTTAAGACGAGGCCTCGCGTTCTTCAATTGGGTTTTGTAGCCGTTCAGGTATACTGTCCCACGAATGGCCACCTGTAAGGTCCAGAGGACCAGTTTTGTTtt > 1:135440/1‑236 TTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCATAAGCGCT‑AACTTAAGGGTTGAACCATCTGAAGAATGCGACGCCTCGGTGCCTCGTTAAGACGATGCCTCGCGTTCTTCAATTGCGTTTTGTAGGCTGTCAGGGCTACTGTCCCACGAATGGCCACCGGTAACACCCAGATGCCCATTTTTGTTAT > 2:429781/1‑238 TTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCATAAGCGCT‑AACTTAAGGGTTGAACCATCTGAAGAATGCGACGCCTCGGTGCCTCGTTAAGACGATGCCTCGCGTTCTTCAATTGCGTTTTGTAGGCTGTCAGGGATACTGTCCCACGAATGGCCACCTGTAAGCTCCAGATGACCATTTTTGTTATT > 2:83539/1‑239 TTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCATAAGCGCT‑AACTTAAGGGTTGAACCATCTGAAGAATGCGACGCCTCGGTGCCTCGTTAAGACGATGCCTCGCGTTCTTCAATTGCGTTTTGTAGGCTGTCAGGGATACTGTCCCACGAATGGCCACCTGTAAGCTCCAGATGACCATTTTTGTTAT > 2:1114262/1‑238 TTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCATAAGCGCT‑AACTTAAGGGTTCAACCATCTGAAGAATGCGACGCCACGCTGCCTCGTTAAGACGATGCCTAGCGTTCTTCAATTGCGTTTTGTAGGCTGTCAGGGATACTGTCCTACGAACGGCCACCTGTAAGCTCCAGATGACCATTTTTGTTA > 2:375588/1‑237 TTAGGTAACCAAAAAGGCGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGATGAATGTGGGGGAAACATCCCATAAGCGCT‑AACTTAAGGGTTGAACCATCTGAAGAATGAGACGCCTCGGTACCTCGTTAAGACGATGCCTCGCGTTCTTCAATTGCGTTTTGTAGGATGTCAGGGAAACTGTCCCCCGAATGGCGACCTGTAAGTACAAGGTGAGCCTTTTTGTTATT > 1:786373/1‑239 TTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGACGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCATAAGCGCT‑AACTTAAGGGTTGAACCATCTGAAGAATGCGACGCCTCGGTGCCTCGTTAAGACGATGCCTCGCGTTCTTCAATTTCGTTTGGTAGGCTGTCAGGGATACTGTCCCCCGAAGGGCCACCGGTAAGCTCAAGATGACCATTTTTGTAATTTTCa > 1:311102/1‑238 AACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGTCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCATAAGCGCT‑AACTTAAGGGTTGAACCATCTGAAGAATGCGACGCCTCGGTGCCTCGTTAAGACGATGCCTCGCGTTCTTCAATTGCGTTTTGTAGGCTGTCATGGATACTGTCCCACGAATGGCCACCTGTAAGCTCCAGATGACCATTTTTGTTATTCTCCcc > 2:885746/1‑237 aCAAAAAGGGGGGATTTTTTCCTCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTGGGCGTTGAAGGGGGGGGAAACATCCCATAAGGGGT‑AACTTAAGGGTTGAACCATCTGAAGAATGAGACGCCTCGGTGCCTCGTTAAGACGATGCCTCGCGTTCTTCAATTGCGTTTTGTAGGCTGTCAGGGATACTGTCCCACGAATGGCCACCTGTAAGCTCCAGATGACCATTTTTGTTATTCTCCACAA < 1:348959/238‑1 CCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCATAAGCGCT‑AACTTAAGGGTTGAACCATCTGAAGAATGCGACGCCTCGGTGCCTCGTTAAGACGATGCCTCGCGTTCTTCAATTGCGTTTTGTAGGCTGTCAGGGATACTGTCCCACGAATGGCCACCTGTAAGCTCCAGATGACCATTTTTGTTATTCTCCACAA < 2:308742/239‑1 ATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCATAAGCGCT‑AACTTAAGGGTTGAACCATCTGAAGAATGCGACGCCTCGGTGCCTCGTTAAGACGATGCCTCGCGTTCTTCAATTGCGTTTTGTAGGCTGTCAGGGATACTGTCCCACGAATGGCCACCTGTAAGCTCCAGGTGACCATTTTTGTTATTTTTCCCAACGCGTTAGTTCTTCTTTT > 2:816861/1‑239 CCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCATAAGCGCT‑AACTTAAGGGTTGAACCATCTGAAGAATGCGACGCCTCGGTGCCTCGTTAAGACGATGCCTCGCGTTCTTCAATTGCGTTTTGTAGGCTGTCAGGGATACTGTCCCACGAATGGCCACCTGTAAGCTCCAGATGACCATTTTTGTTATTATCCATAACGCGTTAGTTCTTCTTTTCGGt > 2:211926/1‑237 CCTTTAATTTTTCCTCTATTCCCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCATAAGCGCT‑AACTTAAGGGTTGAACCATCTGAAGAATGCGACGCCTCGGTGCCTCGTTAAGACGATGCCTCGCGTTCTCCAATTGCGTTTTGTAGGCTGTCAGGGATACTGTCCCACGAATGGCCACCTGTAAGCTCCAGATGACCATTTTTGTTATTCTCCACAACGAGTTAGTTCTTCTTTTCGGATC < 2:1063349/239‑1 TTAATTTTTCCCTTATTCTCGGCGTTGTATGTGGGGGAAACCTCCCATAAGGGCT‑AACTTAAGGGTTGAACCATCTGAAGAATGCGGCGCCTCGGTGCCTCGTTAAGACGATGCCTCGCGTTCTTCAATTGCGTTTTGTAGGCTGTCAGGGATACTGTCCCACGAATGGCCACCTGTAAGCTCCAGATGACCATTTTTGTTATTCTCCACAACGAGTTAGTTCTTCTTTTCGGATCCGG < 1:894137/239‑1 TCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCATAAGCGCT‑AACTTAAGGGTTGAACCATCTGAAGAATGCGACGCCTCGGTGCCTCGTTAAGACGATGCCTCGCGTTCTTCAATTGCGTTTTGTAGGCTGTCAGGGATACTGTCCCACGAATGGCCACCTGTAAGCTCCAGATGACCATTTTTGTTATTCTCCACAACGAGTTAGTTCTTCTTTTCGGATCCGGCCTTTCTG > 2:679048/1‑239 TCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCATAAGCGCT‑AACTTAAGGGTTGAACCATCTGAAGAATGCGACGCCTCGGTGCCTCGTTAAGACGATGCCTCGCGTTCTTCAATTGCGTTTTGTAGGCTGTCAGGGATACTGTCCCACGAATGGCCACCTGTAAGCTCCAGATGACCATTTTTGTTATTCTCCACAACGAGTTAGTTCTTCTTTTCGGATCCGGCCCTTCTG > 2:1064162/1‑239 TCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCATAAGCGCT‑AACTTAAGGGTTGAACCATCTGAAGAATGCGACGCCTCGGTGCCTCGTTAAGACGATGCCTCGCGTTCTTCAATTGCGTTTTGTAGGCTGTCAGGGATACTGTCCCACGAATGCCCACCTGTAAGCTCCAGATGACCATTTTTGTTATTCTCCACAACGAGTTAGTTCTTCTTTTCGGATCCGGCACTTCTG > 1:85649/1‑239 ttttcggggGTTGAATGTTGGGGAAACATCCACTTAGCTGT‑GACCTAAGGGTTGAACCCTCTGAAGGATGCGACGCCTCGGTGCCTCGTTAAGACGATGCCTCGCGTTCTTCAATTGCGTTTTGTAGGCTGTCAGGGATACTGTCCCACGAATGGCCACCTGTAAGCTCCAGATGACCATTTTTGTTATTCTCCACAACGAGTTAGTTCTTCTTTTCGGATCCGGCACTTCTGGGGGGG < 1:526223/230‑1 tTTCTCGGGTTTGAATGTGGGGGAAACATCCCATTAGCGCT‑AACTTAAGGGGTGAACCAGTTGAAGAATGGGACGCCTCGGTGCCTCGTTAAGACGATGCCTCGCGTTCTGCAATTGCGTTTTGTAGGCTGTCAGGGATACTGTCCCACGAATGGCCACCTGTAAGCTCCAGATGACCATTTTTGTTATTCTCCACAACGAGTTAGTTCTTCTTTTCGGATCCGGCACTTCTGGGGGGG < 1:679048/238‑1 ccggtTTGTATGTGGGGAAAACATCCCCTAAGCCCT‑AGTTTAAAGGCTGAACCCTCTGAAGAATGGGACGCCTCGGTGCCTCGGTAAGACGCGGCCTCGCGTTCTTCAAGTGCCTTTTGTAGGCTGTCAGGGATACTGTCCCTCGAATTGCCCCCTGTAAGCACCAGATGACTATTTTTGTTATTCTCCACAACGAGTTAGTTCTTCTTTTCGGATCCGGCACTTCTGGGGGGGAAAgc < 1:917207/234‑3 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ggGGGGGAAACAACCCATAAGCCCT‑AACTTAAGGGTTGAACCATCTGAAGAATGCGACGCCTCGGTGCCTCGTTAAGACGATGCCTCGCGTTCTTCAATTGCGTTTTGTAGGCTGTCAGGGATACTGTCCCACGAATGGCCACCTGTAAGCTCCAGATGACCATTTTTGTTATTCTCCACAACGAGTTAGGTCTTCTTTTCGGATCCGGCACTTCTGGGGGGGAAATCCAGCGATGGCT < 2:786373/237‑1 GGGGGAAACATCCCATAAGCGCT‑AACTTAAGGGTTGAACCATCTGAAGAATGCGACGCCTCGGTGCCTCGTTAAGACGATGCCTCGCGTTCTTCAATTGCGTTTTGTAGGCTGTCAGGGATACTGTCCCACGAATGGCCACCTGTAAGCTCCAGATGACCATTTTTGTTATTTTCCACAACGAGTTAGTTCTTCTTTTCGGATCCGGCACTTCTGGGGGGGAAATCCAGCGATGG > 1:993832/1‑235 GGGGGAAACATCCCATAAGCGCT‑AACTTAAGGGTTGAACCATCTGAAGAATGCGACGCCTCGGTGCCTCGTTAAGACGATGCCTCGCGTTCTTCAATTGCGTTTTGTAGGCTGTCAGGGATACTGTCCCACGAATGGCCACCTGTAAGCTCCAGATGACCATTTTTGTTATTCTCCACAACGAGTTAGTTCTTCTTTTCGGATCCGGCACTTCTGGGGGGGAAATCCAGCGATGG < 2:993832/235‑1 AAACATCCCATAAGCGCT‑AACTTAAGGGTTGAACCATCTGAAGAATGCGACGCCTCGGTGCCTCGTTAAGACGATGCCTCGCGTTCTTCAATTGCGTTTTGTAGGCTGTCAGGGATACTGTCCCACGAATGGCCACCTGTAAGCTCCAGATGACCATTTTTGTTTTTCTCCACAACGAGTTAGTTCTTCTTTTCGGATCCGGACCTTTTTGGGGGGAAATCAAACGAGGGCTGGTTTAT > 1:554101/1‑239 ATCCCATAAGCGCT‑AACTTAAGGGTTGAACCATCTGAAGAATGCGACGCCTCGGTGCCTCGTTAAGACGATGCCTCGCGTTCTTCAATTGCGTTTTGTAGGCTGTCAGGGATACTGTCCCACGAATGGCCACCTGTAAGCTCCAGATGACCATTTTTGTTATTCTCCACAACGAGTTAGTTCTTCTTTTCGGATCCGGCACTTCTGGGGGGGAAATCCAGGAAGGGCTGGTATATGTCG > 1:341172/1‑239 ATCCCATAAGCGCT‑AACTTAAGGGTTGAACCATCTGAAGAATGCGACGCCTCGGTGCCTCGTTAAGACGATGCCTCGCGTTCTTCAATTGCGTTTTGTAGGCTGTCAGGGATACTGTCCCACGAATGGCCACCTGTAAGCTCCAGATGACCATTTTTGTTATTCTCCACAACGAGTTAGTTCTTCTTTTCGGATCCGGCACTTCTGGGGGGGAAATCCAGCGAGGGCTGGATTATGT > 2:104252/1‑237 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|
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |