New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | NC_000913 | 458787 = | 29 (0.280) | 75 (0.730) | 47/426 | NT | 72.4% | intergenic (+87/‑101) | clpX/lon | ATPase and specificity subunit of ClpX‑ClpP ATP‑dependent serine protease/DNA‑binding ATP‑dependent protease La |
? | NC_000913 | 608011 = | NA (NA) | intergenic (+23/‑54) | hokE/insL1 | toxic polypeptide, small/IS186 transposase |
Only 100 of 198 total aligned reads displayed.
TAGAAGCCGCACTGCTCGATACCATGTACGATCTGCCGTCCATGGAAGACGTCGAAAAAGTGGTTATCGACGAGTCGGTAATTGATGGTCAAAGCAAACCGTTGCTGATTTATGGCAAGCCGGAAGCGCAACAGGCATCTGGTGAATAATTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTAATAGATGGCGTGAAGCACAGTCGTGTCATCTGATTACCTGGCGGAAATTAAACTAAGAGAGAGCTCTATGAATCCTGAGCGTTCTGAACGCATTGAAATCCCCGTATTGCCGCTGCGCGATGTGGTGGTTTATCCGCACATGGTCATCCCCTTATTTGTCGGGCGGGAAAAATCTATCCGTTGTCTGGAAGCGGCGATGGACCAT > NC_000913/458552‑459025 | tgacttcacgtaatgacatccccccggggccgtaagccagccccagacgtagcagagttgcagcatcacgaatttcgcggcggcgggttagagccccggcattacgtgccgaagtatccagttcttcgggcttaccaatatgggccagaattgcttaccagttatcgtgagggtaattcatcggcacgttaaatcaaatcaggcgtaaaaccacaacccttaagttagcgcttatgggg < 2:611651‑M1/4‑1 (MQ=255) tgacttcacgtaatgacatccccccggggccgtaagccagccccagacgtagcagagttgcagcatcacgaatttcgcggcggcggggtagagccccggcattacgtgccgaagtatccagttcttcgggcttaccaatatgggccagaattgctgaccagttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccccacaccttaagttaccgcttatgggg < 2:1120050‑M1/4‑1 (MQ=255) tAGAAGCCGCACTGCTCGATACCATGTACGATCTGCCGTCCATGGAAGACGTCGAAAAAGTGGTTATCGACGAGTCGGTAATTGATGGTCAAAGCAAACCGTTGCTGATTTATGGCAAGCCGGAAGCGCAACAGGCATCTGGTGAATAATTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTggggg > 2:1154107/1‑239 (MQ=255) acttcacgtaatgacatccccccggggccgtaagccagccccagacgtagcagagttgcagcatcacgaatttcgcggcggcgggttagagccccggcattacgtgccgaaggatacagttcttcgggcttacccacctcggccagcattgctgaccagttatcgttggagtaattcgtcggcaccttaaatcatatcaactgtaataccccaacacttaagttaaaccttatggggtt < 1:289435‑M1/6‑3 (MQ=255) tccagtatggacctccccccggggccggaacccaggcctcgatggagcagagttggaggtacccaaatttcgcggcggcggtttagacccccggcaattcgtgccgaagtatccagttcttcgggcttaccaatatgggccagaattgctgtccagttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgattatGGGGAAACa > 1:609891‑M1/231‑239 (MQ=255) tcacgtatttacatcccccggggggcgtaagccagccccagacgtagcaggggtgcagcatcccgaatttcccggcggcgggttagagccccgggattacgtgccgaagtatccagttcttcgggcttaccaatatgggccagaattgctgaccagttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcacgcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatGGGGAAACa > 1:551652‑M1/231‑239 (MQ=255) tcacgtaatgacatccccccggggccgtaagccagccccagacgtagcagagttgcagcatcacgaatttcgcggcggcgggttagagccccggcattacgtgccgaagtatccagttcttcgggcttaccaatatgggccagaattgctgaccagttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatGGGGAAACa > 2:870666‑M1/231‑239 (MQ=255) 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |