| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 458787 = | 29 (0.280) | 75 (0.730) | 47/426 | NT | 72.4% | intergenic (+87/‑101) | clpX/lon | ATPase and specificity subunit of ClpX‑ClpP ATP‑dependent serine protease/DNA‑binding ATP‑dependent protease La |
| ? | NC_000913 | 608011 = | NA (NA) | intergenic (+23/‑54) | hokE/insL1 | toxic polypeptide, small/IS186 transposase | |||||
Only 100 of 119 total aligned reads displayed.
TCCAAACCCGAACAATTTGGATGGTAGTCCCTTCTTCGCATGGAGGCAATATAAACATGCTGACGAAATATGCCCTTGCGGCAGTCATAGTGCTGTG‑TTTAACGGTGCT‑GGGATTTACGCTTCTGGTCGGAGACTCGCTGTGTGAGTTTACGGTGAAGGAACGTAATATTGAGTTTAAGGCTGTTCTCGCTTACGAACCGAAGAAGTAGCCGTTGT‑GCGGGGAGTAATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTT‑GTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGAAGAACTGGATACTTCGGCACGTAATGCCGGGGCTCTAACCCGCCGCCGCGAAATTCGTGATGCTGCAACTCTGCTACGTCTGGGGCTGGCTTACGGCCCCGGGGGGATGTCATTACGTGAAGT > NC_000913/607780‑608243 | tCCAACCCCGAACAATTGGGAAGGTAGCCCCTTCTTCGAATGGAGGCAATATAAACATGCTTACGAAATAGGCCCTTGGTGCAGTCATAGTGCGGTG‑TTTACAGGTGCG‑GGGATTTACGCTTGTGGTCGGAGACTCGCTGTGTGAGTTTACGGTGAAGGAACGTAATATTGAGTTTAAGGCTGTTCTCGCTTACGAACCGAAGAAGTAGCCGTTGT‑GCGGGGAGTAATCCCATAAgcgc < 1:237984/239‑1 (MQ=255)tCCAAACCCGAACAATTTGGATGGTAGTCCCTTCTTCGCATGGAGGCAATATAAACATGCTGACGAAATATGCCCTTGCGGCAGTCATAGTGCTGTG‑TTTAACGGTGCT‑GGGATTTACGCTTCTGGTCGGAGACTCGCTGTGTGAGTTTACGGTGAAGGAACGTAATATTGAGTTTAAGGCTGTTCTCGCTTACGAACCGAAGAAGTAGCCGTTGT‑GCGGGGAGTAATCCCATAAgcgc < 2:621548/239‑1 (MQ=255)tCCAAACCCGAACAATTTGGATGGTAGTCCCTTCTTCGCATGGAGGCAATATAAACATGCTGACGAAATATGCCCTTGCGGCAGTCATAGTGCTGTG‑TTTAACGGTGCT‑GGGATTTACGCTTCTGGTCGGAGACTCGCTGTGTGAGTTTACGGTGAAGGAACGTAATATTGAGTTTAAGGCTGTTCTCGCTTACGAACCGAAGAAGTAGCCGTTGT‑GCGGGGAGTAATCCCATAAgcg < 2:534719/238‑1 (MQ=255) ccAAACCCGAACAATTTGGATGGTAGTCCCTTCTTCGCATGGAGGCAATATAAACATGCTGACGAAATATGCCCTTGCGGCAGTCATAGTGCTGTG‑TTTAACGGTGCT‑GGGATTTACGCTTCTGGTCGGAGACTCGCTGTGTGAGTTTACGGTGAAGGAACGTAATATTGAGTTTAAGGCTGTTCTCGCTTACGAACCGAAGAAGTAGCCGTTGT‑GCGGGGAGTACTCCCATAAGCGCt < 2:578118/239‑1 (MQ=255) ccAAACCCGAAAAATTTGGTGGGGTGTCCCTTTTTCGCCTGTAGGCAATATAAACATGCTGACGAAATATGCCCTTGCGGCAGTCATAGTGCTGTG‑TTTAACGGTGCT‑GGGATTTACGCTTCTGGTCGGAGACTCGCTGTGTGAGTTTACGGTGAAGGAACGTAATATTGAGTGTAAGGCTGTTCTCGCTTACGAACCGAAGAAGTAGCCGTTGT‑GCGGGGAGTAATCCCATAAGCGCt < 1:393975/239‑1 (MQ=255) cccGAACAATTTGGATGGTAGTCCCTTCTTCGCATGGAGGCAATATAAACATGCTGACGAAATATGCCCTTGCGGCAGTCATAGTGCTGTG‑TTTAACGGTGCT‑GGGATTTACGCTTCTGGTCGGAGACTCGCTGTGTGAGTTTACGGTGAAGGAACGTAATATTGAGTTTAAGGCTGTTCTCGCTTACGAACCGAAGAAGTAGCCGTTGT‑GCGGGGAGTAATCCCATAAGCGCTAACtt > 2:1156491/1‑239 (MQ=255) cGAACAATTTGGAAGGGAGTCCCTTCTTCGTATGGAGGCAATATAAACATGCTGACGAAATATGCCCTGGCGGCAGTCATAGTGCTGTG‑TTTAACGGTGCT‑GGGATTTACGCTTCTGGTCGGAGACTCGCTGTGTGAGTTTACGGTGAAGGAACGTAATATTGAGTTTAAGGCTGTTCTCGCTTACGAACCGAAGAAGTAGCCGTTGT‑GCGGGGAGTAATCCCATAAGCGCTAACTTaa < 2:1215708/239‑1 (MQ=255) aaCAATTTGGATGGTAGTCCCTTCTTCGCATGGAGGCAATATAAACATGATGACGAAATATGCCCTTGCGGCAGTCCTAGTGCTGTG‑GTTAACGGTGCT‑GGGATTTACGCTTCTGGTCGGAGACCCGCTGTGTGAGGTTACGGGGAGGGAACGTCATTTTGCTTTTAAGACTGTTCTCGCTTATCAACCGTAGAAGGAACCACTGT‑GGCGGGGGAAAACACAAAAGCGCTAATTTaaa > 1:534719/1‑237 (MQ=255) tGGATGGTAGTCCCTTCTTCGCATGGAGGCAATATAAACATGCTGACGAAATATGCCCTTGCGGCAGTCATAGTGCTGTG‑TTTAACGGTGCT‑GGGATTTACGCTTCTGGTCGGAGACTCGCTGTGTGAGTTTACGGTGAAGGAACGTAATATTGGGTTTAAGGCTGTTTTCGCTTACGAACCGGAGAAGTAGCGGTTGT‑GCGGGGGGAAATCCCCTAAGCGCTAACTTAAGGGTT‑gggg > 1:384573/1‑239 (MQ=255) tGGTAGTCCCTTTTTCGCATGGAGGAAATATTAACATGCTGACGAAATATGCCCTTGCGGCAGTCATAGTGCTGTG‑TTTAACGGTGCT‑GGGATTTACGCTTCTGGTCGGAGACTCGCTGTGTGAGTTTACGGTGAAGGAACGTAATATTGAGTTTAAGGCTGTTCTCGCTTACGAACCGAAGAAGTAGCCGTTGT‑GCGGGGAGTAATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTT‑GTGGTAt < 1:398386/238‑1 (MQ=255) ggcccttttgtgCATGGAGGGACTATAAACATGCTGACGAAATATACCTTGGGGGCAGTCTTTGGTCTGTG‑TTTAGCGGTGCT‑GGGATTGACGCTTCTGGTCGGAGACTCGCTGTGTGAGGTTACGGTGCAGGAACGTAATATTGAGTTTAAGGCTGTTCTCGCTTACGAACCGAAGAAGTAGCCGTTGT‑GCGGGGAGTAATCCCATAAGCGTTAACTTAAGGGTT‑GTGGTATTACGcc < 1:445648/228‑1 (MQ=255) cttcttCGCATGGAGGCAATATAAACATGCTGACGAAATATGCCCTTGCGGCAGTCATAGTGCTGTG‑TTTAACGGTGCT‑GGGATTTACGCTTCTGGTCGGAGACTCGCTGTGTGAGTTTACGGTGAAGGAACGTAATATTGAGTTTAAGGCTGTTCTCGCTTACGAACCGAAGAAGTAGCCGTTGT‑GCGGGGAGTAATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTT‑GTGGTATTACGCCTGat < 2:634218/239‑1 (MQ=255) cttaGCATGGAGTCAATATAAACATGCTGACGAAATATGCCCTTGCGGCAGGCATAGTGCTGCA‑TTTAACGGTGCT‑GTGATTTATGCTTCTGGTCGGATACTTGCTGTGACAGTGTACGGTGAGGGAACGTAATATTGAGTTTAAGGCTGTTCTCGCTTACGACCCGAAAAAATAGCCGTTTT‑GAGGGGGGTAGTCCCATAAACGCTAACCTAAAGGGT‑GAGATTTTACGCGTGaatag > 1:1129679/1‑235 (MQ=255) aGGCAATATAAACATGCTGACGAAATATGCCCTTGCGGCAGTCATAGTGCTGTG‑TTTAACGGTGCT‑GGGATTTACGCTTCTGGTCGGAGACTCGCTGTGTGAGTTTACGGTGAAGGAACGTAATCTTGGGTTTAAGGCTGTTCTCGCTTACGAACCGAAGAAGTAGACGTTGT‑GCGGGGAGTAATCCCATAAGCGCTAACTTAAAGGTT‑GTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGt > 2:706484/1‑238 (MQ=255) aaTATAAACATGCTGACGAAATATGCCCTTGCGGCAGTCATAGTGCTGTG‑TTTAACGGTGCT‑GGGATTTACGCTTCTGGTCGGAGACTCGCTGTGTGAGTTTACGGTGAAGGAACGTAATATTGAGTTTAAGGCTGTTCTCGCTTACGAACCGAAGAAGTAGCCGTTGT‑GCGGGGAGTAATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTT‑GTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCg < 2:846786/238‑1 (MQ=255) tataAACATGCTGACGAAATATGCCCTTGCGGCAGTCATAGTGCTGTG‑TTTAACGGTGCT‑GGGATTTACGCTTCTGGTCGGAGACTCGCTGTGTGAGTTTACGGTGAAGGAACGTAATATTGAGTTTAAGGCTGTTCTCGCTTACGAACCGAAGAAGTAGCCGTTGT‑GCCGGGAGTAATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTT‑GGGGTATTCCGCCTGAAATGATTTAACGGGCCGATg > 1:337/1‑239 (MQ=255) aaCATGCTGACGAAATATGCCCTTGCGGCAGTCCTAGTGCTGTG‑TTTAACGGTGCT‑GGGATTTACGCTTCTGGTCGGAGACTCGCTGTGTGAGTTTACGGTGAAGGAACGTAATATTGAGTTTAAGGCTGTTCTCGCTTACGAACCGAAGAAGTAGCCGTTGT‑GCGGGGGTTAGTCCCATAAGCGCACACTAAAGGGTG‑GGGGGATTACGCCGGAATGGATTAAACGTGCCCATGAAta > 1:452376/1‑238 (MQ=255) aTGTTGACGAAATATGCCCTTGCGGCAGTTATAGTGCTGTG‑TTTAACGGTGCG‑GGGATTTACGCTTCTGGTCGGAGACTCGCTGTGTGAGTTTACGGTGAAGGAACGTAATATTGAGTTTAAGGCTGTTCTCGCTTACGAACCGAAGAAGTAGCCGTTGT‑GCGGGGAGTAATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTT‑GTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTAct < 1:799099/239‑1 (MQ=255) gCTGACGAAATATGCCCTTGCGGCAGTCATAGTGCTGTG‑TTTAACGGTGCT‑GGGATTTACGCTTCTGGTCGGAGACTCGCTGTGTGAGTTTACGGTGAAGGAACGTAATATTGAGTTTAAGGCTGTTCTCGCTTACGAACCGAAGAAGTAGCCGTTGT‑GCGGGGAGTAATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTT‑GTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGTTGAATTActc > 2:482691/1‑238 (MQ=255) gCTGACGAAATATGCCCTTGCGGCAGTCATAGGGCTGTG‑TTTAACGGTGCT‑GGGATTTACGCTTCTGGTCGGAGACTCGCTGTGTGAGTTTACGGTGAAGGAACGGAATATTGAGTTTAAGGCTGTTCGCGCTTACGAACCGAAGAAGTAGCCGTTGT‑GCGGGGATGAATCCCCTAATCAATAACTTCAGGGTT‑TGGGAATTATCCCTGATATGATTTaaacgcccggaaaattacta > 1:1252801/1‑220 (MQ=255) cTGACGAAATATGCCCTTGCGGCAGTCATAGTGCTGTG‑TTTAACGGTGCT‑GGGATTTACGCTTCTGGTCGGAGACTCGCTGTGTGAGTTTACGGTGAAGGAACGTACTATTGAGTTTAAGGCTGTTCTCGCTTACGAACCGAAGAGGTAGCCGTTGG‑TCGGGGGGGAATCCCCTAAGCGCTAACTTAAGGGTT‑GGGGGATTACGCCTGGTTTGATTTAACGGGccaagaaataaatctc > 1:694731/1‑225 (MQ=255) cTGACGAAATATGCCCTTGCGGCAGTCATAGTGCTGTG‑TTTAACGGTGCT‑GGGATTTACGCTTCTGGTCGGAGACTCGCTGTGTGAGTTTACGGTGAAGGAACGTAATATTGAGTTTAAGGCTGTTCTCGCTTACGAACCGAAGAAGTAGCCGTTGT‑GCGGGGAGTAATCCCATAAGCGCTACCTTAAGGGTT‑GTGGTATTACGCCCGATATGATTTAACGTACCGATGAATTACtctc > 2:137907/1‑239 (MQ=255) cTGACGAAATATGCCCTTGCGGCAGTCATAGTGCTGTG‑TTTAACGGTGCT‑GGGATTTACGCTTCTGGTCGGAGACTCGCTGTGTGAGTTTACGGTGAAGGAACGTAATATTGAGTTTAAGGCTGTTCTCGCTTACGAACCGAAGAAGTAGCCGTTGT‑GCGGGGAGTAATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTT‑GTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTActct > 2:1155940/1‑238 (MQ=255) cTGACGAAATATGCCCTTGCGGCAGTCATAGTGCTGTG‑TTTAACGGTGCT‑GGGATTTACGCTTCTGGTCGGAGACTCGCTGTGTGAGTTTACGGTGAAGGAACGTAATATTGAGTTTAAGGCTGTTCTCGCTTACGAACCGAAGAAGTAGCCGTTGT‑GCGGGGAGTAATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTT‑GTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACtttc > 2:799099/1‑239 (MQ=255) cTGACGAAATATGCCCTTGCGGCAGTCATAGTGCTGTG‑TTTAACGGTGCT‑GGGATTTACGCTTCTGGTCGGAGACTCGCTGTGTGAGTTTACGGTGAAGGAACGTAATATTGAGTTTAAGGCTGTTCTCGCTTACGAACCGAAGAAGTAGCCGTTGT‑GCGGGGAGTAATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTT‑GTGGTATTAAGCCTGATATGATTTAACCTGCCGATGAATTATtctc > 2:1132995/1‑239 (MQ=255) cTGACGAAATATGCCCTTGCGGCAGTCATAGTGCTGTG‑TTTAACGGTGCT‑GGGATTTACGCTTCTGGTCGGAGACTCGCTGTGTGAGTTTACGGTGAAGGAACGTAATATTGAGTTTAAGGCTGTTCTCGCTTACGAACCGAAGAAGTAGCCGTTGT‑GCGGGGAGTAATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTT‑GTGGAATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTActct > 2:1049452/1‑238 (MQ=255) cTGACGAAATATGCCCTTGCGGCAGTCATAGTGCTGTG‑TTTAACGGTGCT‑GGGATTTACGCTTCTGGTCGGAGACTCGCTGTGTGAGTTTACGGGGAAGGAACGTAATATTGAGTTTAAGGCTGTTCTCGCTTACGAACCGAAGAAGTAGCCGTTGG‑GCGGGGAGTAATCCCCTAAGGCCTAACTTAAGGGTT‑GGGGTATTAGGCCTGATTGGATTTAACGTGccctcaaattacccc > 1:4985/1‑225 (MQ=255) cTGACGAAATATGCCCTTGCGGCAGTCATAGTGCTGTG‑TTTAACGGCGCT‑GGGATTTACGCTTCTGGTCGGAGACTCGCTGTGTGAGTTTACGGTGAAGGAGCGCAATATTGAGTTTAAGGCTGTTCTCGCTTACGAACCGAAGAAGTAGCCGCTGT‑GCAGGGAGTAATCCCATAAGCGGTCACTTAAGGGTT‑GGGGTATTACCCCTGATATGATATAAGTAGCCGAGGAATTAatcca > 1:1015535/1‑237 (MQ=255) aCGAAATATGCCCTTGCGGCAGTCATAGTGCTGTG‑TTTAACGGTGCT‑GGGATTTACGCTTCTGGTCGGAGACTCGCTGTGTGAGTTTACGGTGAAGGAACGTAATATTGAGTTTAAGGCTGTTCTCGCTTACGAACCGAAGAAGTAGCCGTTGT‑GCGGGGAGTAATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTT‑GGGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACg > 2:1184736/1‑239 (MQ=255) aCGAAATATGCCCTTGCGGCAGTCATAGTGCTGTG‑CTTAACGGTGCT‑GGGATTTACGCTTCTGGTCGGAGACTCGCTGTGTGAGGTTACGGGGAGGGAACGTCATATTGAGTTTAAGGCTGTTCTCGCTTACGAACCGCGAACGAAGCCGTTGT‑GCGGGGGTTAATTCCATAAGCGCTCAATTAAGGGTT‑TTGGCATTCAGCCGGATCTGATTTAAAGGGCCCATGAATTTcttcaccg > 1:637130/1‑233 (MQ=255) ttGCCCTTGCGGCAGTCATAGTGCTGTG‑TTTAACGGTGCT‑GGGATTTACGCTTCTGGTCGGAGACTCGCTGTGTGAGTTTACGGTGAAGGAACGTAATATTGAGTTTAAGGCTGTTCTCGCTTACGAACCGAAGAAGTAGCCGTTGT‑GCGGGGAGTAATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTT‑GTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTg < 2:337/238‑1 (MQ=255) ttGCCATTGCGGCTGTTATAG‑GGTGTGTTTTAACGGTGCT‑GGGATTTACGCTTCTGGTCGGAGACTGGCTGTGTGAGTTTACGGTGAAGGAACGTAATATTGAGTTTAAGGCTGTTCTCGCTTACGAACCGAAGAAGTAGCCGTTGT‑GCGGGGAGTAATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTT‑GTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTg < 1:560462/238‑1 (MQ=37) ttgccTTGCGGCATTCATAGTGCTGTT‑TTTAACGGTGCT‑GGGATTTACGCTTCTGGTCGGAGACTCGCTGTGTGAGTTTACGGTGAAGGAACGTAATATTGAGTTTAAGGCTGTTCTCGCTTACGAACCGAAGAAGTAGCCGTTGT‑GCGGGGAGTAATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTT‑GTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTgg < 2:1038016/236‑1 (MQ=255) cttgtgggaggtaTAGTGTTGTG‑TTTTGGGGTGGT‑GGGAGTTACGGTTCTTGTCGGAGTCTCGCTGGGGGAGTTTACGGTGAAGGAACGTAATATTGAGTTTGAGGCTGTTCTCGGTTACGAACCGAAGAAGTAGCCGTTGT‑GCGGGGAGTAATCCCATAAGCGCTAAATTAAGGGTT‑GTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAg < 1:488411/227‑1 (MQ=25) ttggggggggttatggtgcttgttttAAGGGGGCT‑GGGATTTGCGCTTCGTGTCGGAGTCTCGCTGTGTGAGGTTACGGTGAAGGAACGTAAGATTGAGTTGAAGGCTGTTCTCGCTTACGAACCGAAGAAGTAGCCGTTGT‑GCGGGGAGTAATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTT‑GTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAg < 1:180268/216‑1 (MQ=25) gCGGCAGTCATAGTGCTGTG‑TTTAACGGTGCT‑GGGATTTACGCTTCTGGTCGGAGACTCGCTGTGTGAGTTTACGGTGAAGGAACGTAATATTGAGTTTAAGGCTGTTCTCGCTTACGAACCGAAGAAGTAGCCGTTGT‑GCGGGGAGTAATCCCATAAgcgc < 1:927819/162‑1 (MQ=255) gCGGCAGTCATAGTGCTGTG‑TTTAACGGTGCT‑GGGATTTACGCTTCTGGTCGGAGACTCGCTGTGTGAGTTTACGGTGAAGGAACGTAATATTGAGTTTAAGGCTGTTCTCGCTTACGAACCGAAGAAGTAGCCGTTGT‑GCGGGGAGTAATCCCATAAgcgc > 2:927819/1‑162 (MQ=255) ggtaTAGGGGTGTG‑TTTAACGGTGCT‑GGGATTGACGCTTCGGGTCGGAGACTGGGTTTGTGAGTGTACGGGAAAGGAACGTAATATTGAGTTTAAGGCTGTTCCCGCTTACGAACCGAAGAAGTAGCCGTTGT‑GCGGGGAGTAATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTT‑GTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTg < 2:1051082/235‑1 (MQ=25) ttattgtgttgtg‑ttTAAC‑GTGTTGGGGATTTTCGGTTCGTGTCGGAGACTGGTTGTGTGAGTTTACGGTGAAGGAACGTAATTTTGAGTTTAAGGCTGTTCTCGCTTACGAACCGAAGAAGTAGCCGTTGT‑GCGGGGAGTAATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTT‑GTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGc < 1:1155940/234‑1 (MQ=25) tataggtgtggg‑tTTAACGGGGTT‑TGGATTTCAGCTGCTGGTTGGAGACTCGCTGTGTGAGGTTACGGTGAAGGAACGTAATATTGAGTTTAAGGCTGTTCTCGCTTACGAACCGAAGAAGTAGCCGTTGT‑GCGGGGAGTAATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTT‑GTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGc < 2:1129679/227‑1 (MQ=25) cATAGTGCTGTG‑TTTAACGGTGCT‑GGGATTTGCGCTTCTGGTCCGAGTCTCGCTGTGTGAGTTTACGGTGAAGGAACGTAATATTGAGTTTAAGGCTGTTCTCGCTTACGAACCGAAGAAGTAGCCGTTGT‑GCGGGGAGTAATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTT‑GTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATTAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGc < 2:655038/238‑1 (MQ=255) cATAGTGCTGTG‑TTTAACGGTGCT‑GGGATTTACGCTTCTGGTCGGAGACTCGCTGTGTGAGTTTACGGTGAAGGAACGTAATATTGAGTTTAAGGCTGTTCTCGCTTACGAACCGAAGAAGTAGCCGTTGT‑GCGGGGAGTAATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTT‑GTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGc < 2:397515/238‑1 (MQ=255) agggacagg‑tTTTACGGTTTT‑GGGATTTTCGGTTCTGGTCGGAGTCTCGGTGTGTGAGTTTACGGTGAAGGAACGTAATATGGAGTTTAAGGCTGTTCTCGCTTACGAACCGAAGAAGTAGCCGTTGT‑GCGGGGAGTAATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTT‑GTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCat < 1:679241/231‑1 (MQ=25) tGCTGTG‑TTTAACGGTGCT‑GGGATTTACGCTTCTGGTCGGAGACTCGCTGTGTGAGTTTACGGTGAAGGAACGTAATATTGAGTTTAAGGCTGTTCTCGCTTACGAACCGAAGAAGTAGCCGTTGT‑GCGGGGAGTAATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTt‑gtg < 2:1311276/165‑1 (MQ=255) gtg‑tTTAACGGTGCT‑TGGATTTACGCTTCTGGTCGGAGACTCGCTGTGTGAGTTTACGGTGAAGGAACGTAATATTGAGTTTAAGGCTGTTCTCGCTTACGAACCGAAGAAGTAGCCGTTGT‑GCGGGGAGTAATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTT‑GTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGt < 2:4985/239‑1 (MQ=255) gtg‑tTTAACGGTGCT‑GGGATTTACGCTTCTGGTCGGAGACTCGCTGTGTGAGTTTACGGTGAAGGAACGTAATATTGAGTTTAAGGCTGTTCTCGCTTACGAACCGAAGAAGTAGCCGTTGT‑GCGGGGAGTAATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTT‑GTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGt > 2:579762/1‑239 (MQ=255) gtg‑tTTAACGGTGCT‑GGGATTTACGCTTCTGGTCGGAGACTCGCTGTGTGAGTTTACGGTGAAGGAACGTAATATTGAGTTTAAGGCTGTTCTCGCTTACGAACCGAAGAAGTAGCCGTTGT‑GCGGGGAGTAATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTT‑GTGGAATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGt > 2:662779/1‑239 (MQ=255) ggg‑tTTAACGGTGCT‑GGGATTTACGCTTCTGGTCGGAGACTCGCTGTGTGAGTTTACGGTGAAGGAACGTAATATTGAGTTTAAGGCTGTTCTCGCTTACGAACCGAAGAAGTAGCCGTTGT‑GCGGGGAGTAATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTT‑GTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGt < 2:28039/237‑1 (MQ=255) tg‑tTTAACGGTGCT‑GGGATTTACGCTTCTGGTCGGAGACTCGCTGTGTGAGTTTACGGTGAAGGAACGTAATATTGAGTTTAAGGCTGTTCTCGCTTACGAACCGAAGAAGTAGCCGTTGT‑GCGGGGAGTAATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTT‑GTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTg < 1:481080/213‑1 (MQ=255) tg‑tTTAACGGTGCT‑GGGATTTACGCTTCTGGTCGGAGACTCGCTGTGTGAGTTTACGGTGAAGGAACGTAATATTGAGTTTAAGGCTGTTCTCGCTTACGAACCGAAGAAGTAGCCGTTGT‑GCGGGGAGTAATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTT‑GTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGc < 2:721897/228‑1 (MQ=255) tg‑tTTAACGGTGCT‑GGGATTTACGCTTCTGGTCGGAGACTCGCTGTGTGAGTTTACGGTGAAGGAACGTAATATTGAGTTTAAGGCTGTTCTCGCTTACGAACCGAAGAAGTAGCCGTTGT‑GCGGGGAGTAATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTT‑GTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATCCTGGCCCATATTGGTa > 2:461013/1‑239 (MQ=255) tGCT‑GGGATTTACGCTTCTGGTCGGAGACTCGCTGTGTGAGTTTACGGTGAAGGAACGTAATATTGAGTTTAAGGCTGTTCTCGCTTACGAACCGAAGCAGTAGCCGTTGT‑GCGGGGAGTAATCCCCTAAGCGCTAACTTAAAGGTT‑GGGGTATTACCCCTGATATGATTTAACGTGCCGGTGACTTATTCTCACGCTCACTGGTCAACAATTCTAGCCCATAATGGTAAGCCCaaaaa > 1:198598/1‑237 (MQ=255) cT‑GGGATTTACGCTTCTGGTCGGAGACTCGCTGTGTGAGTTTACGGTGAAGGAACGTAATATTGAGTTTAAGGCTGTTCTCGCTTACGAACCGAAGAAGTAGCCGTTGT‑GCGGGGAGTAATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTT‑GTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGc > 2:679241/1‑230 (MQ=255) cT‑GGGATTTACGCTTCTGGTCGGAGACTCGCTGTGTGAGTTTACGGTGAAGGAACGTAATATTGAGTTTAAGGCTGTTCTCGCTTACGAACCGAAGAAGTAGCCGTTGT‑GCGGGGAGTAATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTT‑GTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCgaagaaa > 2:962371/1‑238 (MQ=255) cT‑GGGATTTACGCTTCTGGTCGGAGACTCGCTGTGTGAGTTTACGGTGAAGGAACGTAATATTGAGTTTAAGGCTGTTCTCGCTTACGAACCGAAGAAGTAGCCGTTGT‑GCGGGGAGTAATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTT‑GTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCgaagaa < 2:433564/238‑1 (MQ=255) cT‑GGGATTTACGCTTCTGGTCGGAGACTCGCTGTGTGAGTTTACGGTGAAGGAACGTAATATTGAGTTTAAGGCTGTTCTCGCTTACGAACCGAAGAAGTAGCCGTTGT‑GCGGGGAGTAATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTT‑GTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCgaaga > 2:1307860/1‑237 (MQ=255) tACGCTTCTGGTCGGAGACTCGCTGTGTGAGTTTACGGTGAAGGAGCGTAATATTGAGTTTAAGGCTGTTCTCGCTTACGAACCGAAGAAGTAGCCGTTGT‑GCGGGGAGTAATCCCATAAGAGCTAACTTAAGGGGA‑GTGGTATTACGCCTGCTTGGATTTAACGTCCCGATGAAGTACTCTCACGATACATGGTCTGCAATTCTGGCCCAATTTGTTAAATCCCAAGAAccgaagaaa > 1:697843/1‑231 (MQ=255) tACGCTTCTGGTCGGAGACTCGCTGTGTGAGTTTACGGTGAAGGAACGTAATATTGAGTTTAAGGCTGTTCTCGCTTACGAACCGAAGAAGTAGCCGTTGT‑GCGGGGAGTAATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTT‑GTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGAAGAACTGGATACt > 2:1016327/1‑239 (MQ=255) cGCTTCTGGTCGGAGACTCGCTGTGTGAGTTTACGGTGAAGGAACGTAATATTGAGTTTAAGGCTGTTCTCGCTTACGAACCGAAGAAGTAGCCGTTGT‑GCGGGGAGTAATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTT‑GTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTTTGGCCCATATTGGTAAACCCgaaaaaacggaaaagtc > 1:819657/1‑228 (MQ=255) cTGGTCGGAGACTCGCTGTGTGAGTTTACGGTGAAGGAACGTAATATTGAGTTTAAGGCTGTTCTCGCTTACGAACCGAAGAAGTAGCCGTTGT‑GCGGGGAGTAATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTT‑GTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTCCTCTCACGATAAACGGTCAGCAATTCTGGCCCCTATTGGAAAACCCCAAGAAAAGGATACTTCGGGAc > 1:461711/1‑239 (MQ=25) cTGGGCGGAGACTCTCTGTGTGAGTTTACGGTGACGGAACGTACTATTGAGTTTAAGTCTGTTATCGCTTACGAACCGAAGAAGTAGCCGTGTT‑GGGGGGAGTAATCCTATACGCACTAACTTAAGGATT‑GAGGCATTACGCCTACTATGATTTAACGTGCCGAGGAATTACTCGCACGATAACTGGTCCGAAATTCTTGCCCATCTTGTGAAACCCAAAGAAATGGaaatataggccc > 1:1023633/1‑228 (MQ=255) tGGTCGGAGACTCGCTGTGTGAGTTTACGGTGAAGGAACGTAATATTGAGTTTAAGGCTGTTCTCGCTTACGAACCGAAGAAGTAGCCGTTGT‑GCGGGGAGTAATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTT‑GTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGAAGAACTGGATACTTCGGCACg < 1:579762/239‑1 (MQ=255) gTCGGAGACTCGCTGTGTGAGTTTACGGTGAAGGAACGTAATATTGAGTTTAAGGCTGTTCTCGCTTACGAACCGAAGAAGTAGCCGTTGT‑GCGGGGAGTAATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGGGGGTATTACGCCTGATATGTTTTAACGTGCCGATGCATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGAAGAAATGGATACTTCGGCaaga > 1:215640/1‑236 (MQ=255) agaCTCGCTGTGTGAGTTTACGGTGAAGGAACGTAATATTGAGTTTAAGGCTGTTCTCGCTTACGAACCGAAGAAGTAGCCGTTGT‑GCGGGGAGTAATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTT‑GTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACTTGCCGATGAATTACTCTCACGCTAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGAAGAACTGGATACTTCGGCCCGTAATGcc > 2:515937/1‑239 (MQ=255) gttccctttgttatgtttcgggtaaGGAACGTAATTGTGGGGTTAAGGCTGTTCACGCTTGCGAACCGAAGAAGGAGCCGGTGT‑GCGGGGAGTAATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTT‑GTGGTATTGCGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGAAGAACTGGATACTTCGGCACGTAATGCCg < 1:1286500/215‑1 (MQ=17) gtgcggtggtggtgtgtcagggtaaGGAACTTAAGTGTGAGTTTACGGCTTTTCTCGCTTACTAACCGAAGAAGTAGCCGTTGG‑GCAGGGAGTAATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTT‑GTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCACGAAGAACTGGATACTTCGGCACGTAATGCCg < 1:1049452/215‑1 (MQ=17) aCTCGGTGTGTGAGTTTACGGTGAAGGAACGTAATATTGAGTTTAAGGCTGTTCTCGCTTACGAACCGAAGAAGTAGCCGTTGT‑GCGGGGAGTAATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTT‑GTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGAAGAACTGGATACTTCGGCACGTAATGCCg < 2:819657/238‑1 (MQ=255) aCTCGCTGTGTGATTTTAGTGTGAAAGAACTTAATATTGAGTTTGAGGCTGTGCACGCTTACGAACCGAAGAAGTAGCCGTTGT‑GTGGGGAGTAAGCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTT‑GTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACCCACACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGAAGAACTGGATACTTCGGCACGTAATGCCg < 1:1132995/238‑1 (MQ=18) aCTCGCTGTGTGAGTTTACGGTGAAGGAACGTAATATTGAGTTTAAGGCTGTTCGCGCTTACGAACCGAAGAAGTAGCCGTTGT‑GCGGGGAGTAATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTT‑GTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGAAGAACTGGATACTTCGGCACGTAATGCCg < 2:584883/238‑1 (MQ=255) tACGGTGAAGGAACGTAATATTGAGTTTAAGGCTGTTCTCGCTTACGAACCGAAGAAGTAGCCGTTGT‑GCGGGGAGTAATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTT‑GTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGAAGAACTGGATACTTCGGCACGTAATGCCGGGGCTCTAACccgccg > 2:79452/1‑238 (MQ=255) gtgggAAGGAAAGTAAATTTGAGGTTAAGACTGGTCATCCTTCCGAACCGAAGAAGGAGCGGTTGT‑GCGGGGAGGAATCCCTTAAGCCCTAACTAAAGGTTT‑GTGGTATTCCGCCTGCTAGGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACGGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGAAGAACTGGATACTTCGGCACGTAATGCCGGGGCTCTAACccgccgccg < 1:1147154/235‑1 (MQ=14) cGGTGAAGGAACGTAATATTGAGTTTAAGGCTGTTCTCGCTTACGAACCGAAGAAGTAGCCGTTGT‑GCGGGGAGTAATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTT‑GTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGAAGAACTGGATACTTCGGCACGTAATACCGGGGCCCTAACccgccgcc > 2:289435/1‑238 (MQ=255) aaGGAACGTAATATTGAGTTTAAGGCTGTTCTCGCTTACGAACCGAAGAAGTAGCCGTTGT‑GCGGGGAGTAATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTT‑GTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGCAGAACTGGAAACTTCGGCACGTAAGTCCGGGGCGCTAACCCCCCCCCCGGaaa > 1:859720/1‑239 (MQ=18) cGTAATATTGAGTTTAAGGCTGTTCTCGCTTACGAACCGAAGAAGTAGCCGTTGT‑GCGGGGAGTAATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTT‑GTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTAAGCAATTCTGGCCCAAATTGGTAAGCCCGAAGAACTGGAAACTTCGGCACGTAATGCCGGGGCTCTAACCCGCCGCCGCGCAATTCGTg > 2:645951/1‑239 (MQ=255) tAATATTGAGTTTAAGGCTGTTCTCGCTTACGAACCGAAGAAGTAGCCGTTGT‑GCGGGGAGTAATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTT‑GTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCat > 2:991455/1‑164 (MQ=255) tAATATTGAGTTTAAGGCTGTTCTCGCTTACGAACCGAAGAAGTAGCCGTTGT‑GCGGGGAGTAATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTT‑GTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCat < 1:991455/164‑1 (MQ=255) atTTAGTTTAAGGCTGTTCTCGCTTACGAACCGAAGAAGTAGCCGTTGT‑GCGGGGAGTAATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTT‑GTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGAAGAACTGGATACTTCGGCACGTAATGCCGGGGCTCTAACCCGCCGCCGCGAAATTCGTGAtgctg < 2:697843/239‑1 (MQ=255) ttGAGTTTAAGGCTGTTCTCGCTTACGAACCGAAGAAGTAGCCGTTGT‑GCGGGGAGTAATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGTAT‑GTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATCACTCTCAAGATAACTGGCCAGAAATTCAGCCCCCTATTGGTAACCTCGAAGCACTAGATACTTCGGCCCGTAAAGCCGGGCGGCTAACCCACACCCCCGAAATCCATGAtgccgc > 1:860225/1‑239 (MQ=18) gttgtatggtttgttccgtttACGAACCGAAGAAGTAGCCTTGGT‑GCGGGGGATAATCCCAAAGGCTATAACTTAAGGGTT‑GTGGTTTTACGCCTTATATAATTTAACGTGCCGATTAATTACTGTCACGATAACTGGTCAGCAAGTGTGGCCCATATTGGTAAGCCCGAAGAACTGGATAGTTCGGCGCGTAATGCCGGGCCGCTAACCCGCCGCCGCGAAATTCGTGATGCTGCAAc < 1:1185493/220‑1 (MQ=14) tttAAGGCTGTTCTCGCTTACGAACCGAAGAAGTAGCCGTTGT‑GCGGGGAGTAATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTT‑GTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCCTATTGGTAAGCCCGAAGAACTGGATACTTCGGCACGTACTGCCGGGGCGCTAACCCGCCGCCCCGAAATTTGTGATGCCGCCAccc > 1:332730/1‑237 (MQ=255) tttAAGGCTGTTCTCGCTTACGAACCGAAGAAGTAGCCGTTGT‑GCGGGGAGTAATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTT‑GTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGCAGAACTGGATACTTCGGCACGTAATCCCGGGGCTCTAACCCCCCTCCCCGAAAATccggggtcggcaacac > 1:1289739/1‑224 (MQ=17) tttAAGGCTGTTCTCGCTTACGAACCGAAGAAGTAGCCGTTGT‑GCGGGGAGTAATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTT‑GTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGAAGAACTGGATACTTCGGCCCGTAATGCCGGGGCTCTAACCCGCCGCCGCGAAATTCGTGATGCTGCacc > 2:862678/1‑235 (MQ=255) tttAAGGCTGTTCTCGCTTACGAACCGAAGAAGTAGCCGTTGT‑GCGGGGAGTAATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTT‑GTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGAAGAACTGGATACTTCGGCACGTAATGCCGGGGCTCTAAc > 2:273132/1‑207 (MQ=255) tgggggttgtccGCTTCGGAACCGCGGAGGTAGGCGTGGT‑GCGGTGAGTATTCCCATAAGCGGTAAGTTAAGGGTT‑GTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGGGCCGATGAATTCCTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCGGGCCCATATTGGTAAGCCCGAAGAACTGGATACTTCGGCACGTAATGCCGGGGCTCTAACCCGCCGCCGCGAAATTCGTGATGCTGCAACTCTGc < 1:461013/228‑1 (MQ=11) aaGGCTGTTCTCGCTTACGAACCGAAGAAGTAGCCGTTGT‑GCGGGGAGTAATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTT‑GTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGAAGAACTGGATACTTCGGCACGTAATGCCGGGGCTCTAACCCCCGGCCGCGAAATTGGTGAGCCTGCAAC‑CTGCt > 2:407655/1‑239 (MQ=255) aGGTTGTTCTCGCTTACGAAACGAAGAAGTAGCCGTTGT‑GCGGGGAGTAAACCCATAAGCGCTAACTGAAGGGTT‑GTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGAAGAACTGGATACTTCGGCACGTAATGCCGGGGCTCTAACCCGCCGCCGCGAAATTCGTGATGCTGCAACTCTGCt < 2:204297/239‑1 (MQ=255) ttCTCGCTTACGAACCGAAGAAGTAGCCGTTGT‑GCGGGGAGTCATCCCATAAGCGCTaa > 1:236225/1‑59 (MQ=255) ttCTCGCTTACGAACCGAAGAAGTAGCCGTTGT‑GCGGGGAGTAATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTT‑GTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGAAGAACTGGATACTTCGGCCCGTAATGCCGGGGCTTTAACCCGCCCCCGCGAAATTCGGGATGCTGCAAcacttgcagt > 1:1020061/1‑230 (MQ=255) ttCTCGCTTACGAACCGAAGAAGTAGCCGTTGT‑GCGGGGAGTAATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTT‑GTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGAAGAACTGGATACTTCGGCACGTAATGCCGGGGCTCTAACCCGCCGCCGCGAAATTCTTGATGCGGCAACCCTGCAACg > 1:203582/1‑236 (MQ=255) cGAACCGAAGAAGTAGCCGTTGT‑GCGGGGAGTAATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTT‑GTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGACGAACTGGATACTTCGGCCCGTAATGCCGGGGCTCTAACCCGCCCCCCCGAAATTCGGAGTGCGCCAACTCTGCCACGTCGGGggctggct > 1:7049/1‑239 (MQ=14) aaacGAGGAAGTTG‑CGTTGTGGCGGGGAGTATTCCCAAAAGCGTTAAATAAAGGGTT‑TGTGTATTACGCCTGTTATGATTTAACGTGCCGATGAATTACCCTCACGATAACAGGTCAGCAATTCTGGCCAATTTGGGTAAGCCCGAAGAACTGGATACTCCGGAACGTAATGCCGGGGCTCTAACCCGCCGCCGCGAAATTCGTGATGCTGCAACTCTGCTACGTCTGGGGCTGGCTTa < 1:1184736/236‑1 (MQ=11) cccaaagaagTTGCGGTTTG‑GGGGGGAGTAACCCAATAAGGGTTTACTTAAGGGTT‑TGGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGGGCCTATGAATTACTCTCCAGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGAAGAACTGGATACTTCGGCACGTAATGCCGGGGCTCTAACCCGCCGCCGCGAAATTCGTGATGCTGCAACTCTGCTACGTCTGGGGCTGGCTTAc < 1:1307860/235‑1 (MQ=11) agTAGCCGTTTG‑GGGGGGAGTTATCCCGTAAGCGTGAACTTAAGGTTT‑GTGGTATTTCGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACCCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGAAGAACTGGATGCTTCGGCACGTAATGCCGGGGCTCTAACCCGCCGCCGCGAAATTCGTGATGCTGCAACTCTGCTACGTCTGGGGCTGGCTTACGGcccc < 1:1208573/237‑1 (MQ=11) agTAGCCGTTGT‑GCGGGGAGTAATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTT‑GTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGAAGAACTGGATACTTCGGCACGTAATGCCGGGGCTCTAACCCGCCGCCGCGAAATTCGTGAtgctg < 2:412302/202‑1 (MQ=255) tAGCCGTTGT‑GCGGGGAGTAATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTT‑GTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGAAGAACTGGATACTTCGGCACGTAATGCCCGTGCTCTAACCCGCCGCCCCGAAATTCGTGATGCTGCAACCCTGCTACGTCTGGGGGGGCCTTAAGGCCACtggg > 1:611521/1‑239 (MQ=14) cGTTGT‑GCGGGGAGTAATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTT‑GTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGAAGAACTGGATACTTCGGCACGTAATGCCGGGGCTCTAACCCGCCGCCGCGAAATTCGTGATGCTGCAACTCTGCTACGTCTGGGGCTGGCTTACGGCCCCGGGGGGa < 2:332730/238‑1 (MQ=37) tgt‑gCGGGGAGTAATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTT‑GTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGAAGAACTGGATACTTCGGCACGTAATGCCGGGGCTCTAACCCGCGGCCGCGAAATCCGGGCTCCTGGAACTCTGCTACGTCTGGGGCTGGCTTACGGCCCCGGGGGGATgcg > 2:520078/1‑237 (MQ=255) tgt‑gCGGGGAGTAATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTT‑GTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGAAGAACTGGATACTTCGGCACGTAATGCCGGGGCTCTAACCCGCCCCCGCGAAAATCGGGATGCTGCCACTCTCCGACGTCTGGGCCGGGCTTACGGCCCCGGGGGGATGTc > 1:1106600/1‑239 (MQ=11) gt‑gCGGGGAGTAATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTT‑GTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGAAGAACTGGATACTTCGGCACGTAATGCCGGGGCTCTAACCCGCCGCCGCGAAATTCGTGATGCTGCAACTCTGCTACGTCTGGGGCTGGCTTACGGCCCCGGGGGGATGTCa > 2:623103/1‑239 (MQ=34) aaTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTT‑GTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGAAGAACTGGATACTTCGGCACGTAATGCCGGGGCTCTAACCCGCCGCCGCGAAATTCGTGATGCTGCAACTCTGCTACGTCTGGGGCTGGCTTACGGCCCCGGGGGGATGTCATTACGTTAAGt > 2:1201502/1‑239 (MQ=11) | TCCAAACCCGAACAATTTGGATGGTAGTCCCTTCTTCGCATGGAGGCAATATAAACATGCTGACGAAATATGCCCTTGCGGCAGTCATAGTGCTGTG‑TTTAACGGTGCT‑GGGATTTACGCTTCTGGTCGGAGACTCGCTGTGTGAGTTTACGGTGAAGGAACGTAATATTGAGTTTAAGGCTGTTCTCGCTTACGAACCGAAGAAGTAGCCGTTGT‑GCGGGGAGTAATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTT‑GTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGAAGAACTGGATACTTCGGCACGTAATGCCGGGGCTCTAACCCGCCGCCGCGAAATTCGTGATGCTGCAACTCTGCTACGTCTGGGGCTGGCTTACGGCCCCGGGGGGATGTCATTACGTGAAGT > NC_000913/607780‑608243 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |