| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 458799 | 24 (0.390) | 32 (0.540) | 24/410 | NT | 57.6% | intergenic (+99/‑89) | clpX/lon | ATPase and specificity subunit of ClpX‑ClpP ATP‑dependent serine protease/DNA‑binding ATP‑dependent protease La |
| ? | NC_000913 | = 609347 | NA (NA) | intergenic (+170/+112) | insL1/entD | IS186 transposase/phosphopantetheinyltransferase component of enterobactin synthase multienzyme complex | |||||
TGTACGATCTGCCGTCCATGGAAGACGTCGAAAAAGTGGTTATC‑GACGAGTCGGTAATTGATGGTCAAAGCAAACCGTTGCTGATTTATGGCAAGCCGGAAGCGCAACAGGCATCTGGTGAATAATTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTAATAGATGGCGTGAAGCACAGTCGTGTCATCTGATTACCTGGCGGAAATTAAACTAAGAGAGAGCTCTATGAATCCTGAGCGTTCTGAACGCATTGAAATCCCCGTATTGCCGCTGCGCGATGTGGTGGTTTATCCGCACATGGTCATCCCCTTATTTGTCGGGCGGGAAAAATCTATCCGTTGTCTGGAAGCGGCGATGG > NC_000913/458576‑459020 | tGTACGATCTGCCGTCCATGGAAGACGTCGAAAAAGTGGTTATC‑GACGAGTCGGTAATTGATGGTCAAAGCAAACCGTTGCTGATTTATGGCAAGCCGGAAGCGCAACAGGCATCTGGTGAATAATTAACCATTCCCATACACTTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTTATTTCTCGGCGTTGAATTTGGGGGAAACATCCCataaa > 2:559031‑M1/1‑224 (MQ=255)tGTACGATCTGCCGTCCATGGAAGACGTCGAAAAAGTGGTTATC‑GACGAGTCGGTAATTGATGGTCAAAGCAAACCGTTGCTGATTTATGGCAAGCCGGAAGCGCAACAGGCATCTGGTGAATAATTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTGGAATGTGGGGGAAACATCCCCatat > 1:147478/1‑229 (MQ=255)tGTACGATCTGCCGTCCATGGAAGACGTCGAAAAAGCGGTTATC‑GACGAGTCGGTAATTGATGGTCAAAGCAAACCGTTGCTGATTTATGGCAAGCCGGAAGCGCAAAAGGCATCTGGTGAATAATTAACCATTCCCATACATTTAGTTAACCAACAAGGGGGGATTTTTTCTCCCCTTTAATTTTTACTCTATTTTCGACGTTAAATGTGGGGG‑AACATTCCCaacat > 1:608971/1‑225 (MQ=255) tACGATCTGCCGGCCATGGAAGACGTCGAAAAAGTGGTTATC‑GACGAGTCGGTAATTGATGGTCAAAGCAAACCGTTGCTGATTTATGGCAAGCCGGAAGCGCAACAGGCATCTGGTGAATAATTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCCATATAc < 2:750595/229‑1 (MQ=255) gggccgtaacccagccccagacgtagcagggtttcagcatcccgaatttcgcggcggcgggttagagccccggcattacgtgccgaagtatccagtgcttcgggcttaccaatatgggccagaattgctgaccagttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatGGGGAAACATCCCCAtata > 2:540366‑M1/210‑228 (MQ=255) 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2:454106‑M1/1‑26 (MQ=255) ggCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgttaagacgatgcctcgcgttcttcaattgcgttttgtaggctgtcagggatactgtcccacgaatgcccacctgtaagctccagatgcccatttttgttattctcccccacgggttagttcttcttttcggttccggcacttttggg > 1:247065‑M1/1‑26 (MQ=255) tGAATGTGGGGGAAACATCCCataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgttaagacgatgcctcgcgttcttcaattgcgttttgtaggctgtcagggatactgtcccacgaatggccacctgtaagctccagatgaccatttttgttattctccacaacgagttagttcttcttttcggatccggcacttctggggggga > 1:140452‑M1/1‑21 (MQ=255) gcgcttatGGGGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTAATAGATGGCGTGAAGCACAGTCGTGTCATCTGATTACCTGGCGGAAATTAAACTAAGAGAGAGCTCTATGAATCCTGAGCGTTCTGAACGCATTGAAATCCCCGTATTGCCGCTGCGCGAGTGGGTGGTTTATCCGCACAGGGTCATCCCCTTATTTGTCGGGCGGGAAAACTCTATCCGTTGTCTg < 2:297708‑M1/221‑1 (MQ=255) 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TGTACGATCTGCCGTCCATGGAAGACGTCGAAAAAGTGGTTATC‑GACGAGTCGGTAATTGATGGTCAAAGCAAACCGTTGCTGATTTATGGCAAGCCGGAAGCGCAACAGGCATCTGGTGAATAATTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTAATAGATGGCGTGAAGCACAGTCGTGTCATCTGATTACCTGGCGGAAATTAAACTAAGAGAGAGCTCTATGAATCCTGAGCGTTCTGAACGCATTGAAATCCCCGTATTGCCGCTGCGCGATGTGGTGGTTTATCCGCACATGGTCATCCCCTTATTTGTCGGGCGGGAAAAATCTATCCGTTGTCTGGAAGCGGCGATGG > NC_000913/458576‑459020 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |