New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | NC_000913 | 704375 = | 151 (1.090) | 3 (0.020) | 3/500 | NT | 2.0% | coding (432/1947 nt) | nagE | N‑acetyl glucosamine specific PTS enzyme IIC, IIB, and IIA components |
? | NC_000913 | 704405 = | 141 (1.050) | coding (462/1947 nt) | nagE | N‑acetyl glucosamine specific PTS enzyme IIC, IIB, and IIA components | |||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 166 total aligned reads displayed.
GATAACCTCGCATTAATCTTCGCCATCGGTGTGGCATCCAGCTGGTCGAAAGACAGCGCTGGTGCGGCGGCGCTGGCGGGTGCGGTAGGTTACTTTGTGTTAACCAAAGCGATGGTGACCATCAACCCAGAAATTAACATGGGTGTACTGGCGGGTATCATTACCGGTCTGGTTGGTGGCGCAGCCTATAACCGTTGGTCCGATATTAAACTGCCGGACTTCCTGAGCTTCTTCGGCGGCAAACGCTTTGTGCCGATTGCCACC‑G‑GATTCTTCTGCCTGGTGCTGGC‑GGCCATTTTTGGTTACGT‑CTGGCCGCCGGTACAGCACGCTATCCATGCAGGCGGCGAGTGGATCGTTTCTGCGGGCGCGCTGGGTTCCGGTATCTTTGGTTTCATCAACCGTCTGCTGATCCCAACCGGTCTGCATCAGGTACTGAA‑CACCATCGCCTGGTTCCAGATTGGTGAATTCACCAACGCGGCGGGTACGGTTTTCCACGGTGACATTAACCGCTTCTATGCCGGTGACGGCACCGCGGGGATGTTCATGTCCGGCTTCTTCCCGATCATGATGTT > NC_000913/704091‑704659 | cGCATTAATCTTCGCCATCGGTGTGGCATCCAGCTGGTCGAAAGACAGCGCTGGTGCGGCGGCGCTGGCGGGTGCGGTAGGTTACTTTGTGTTAACCAAAGCGATGGTGACCATCAACCCAGAAATTAACATGGGTGTACTGGCGGGTATCATTACCGGTCTGGTTGGTGGCGCAGCCTATAACCGTTGGTCCGATATTAAACTGCCGGACTTCCTGAGCTTCTTCGGCGGCAAACGCTTTGTGCCGATTGCCACC‑G‑GATTCTTCTGCCTGGTGCTGGC‑GGCCAttttt > 1:671189/1‑289 (MQ=255) aTTAATCTTCGCCATCGGTGTGGCATCCAGCTGGTCGAAAGACAGCGCTGGTGCGGCGGCGCTGGCGGGTGCGGTAGGTTACGTTGTGTTAACCAAAGCGATGGTGACCATCAACCCAGAAATTAACATGGGTGTACTGGCGGGTATCATTACCGGTCTGGTTGGTGGCGCAGCCTATAACCGTTGGTCCGATATTAAACTGCCGGACTTCCTGAGCTTCTTCGGCGGCAAACGCTTTGTGCCGATTGCCACC‑G‑GATTCTTCTGCCTGGTGCTGGC‑GGCCATTTTTGGt < 1:627926/289‑1 (MQ=255) aTCTTCGCCATCGGTGTGGCATCCAGCTGGTCGAAAGACAGCGCTGGTGCGGCGGCGCTGGCGGGTGCGGTAGGTTACTTTGTGTTAACCAAAGCGATGGTGACCATCAACCCAGAAATTAACATGGGTGTACTGGCGGGTATCATTACCGGTCTGGTTGGTGGCGACGCCTATAACCGTTGGTTCGATATTAAACTGGCGGAATTCCTGAGCTTCTTCGGCGGCAAACGGTTTGTGCCGGTTGCCCGC‑G‑GGTTCTTTTGCCTGGGTCTGGG‑GGGACTTTTTGGTTACg > 1:211382/1‑289 (MQ=255) gCCATCGGTGTGGCATCCAGCTGGTCGAAAGACAGCGCTGGTGCGGCGGCGCTGGCGGGTGCGGTAGGTTACTTTGTGTTAACCAAAGCGATGGTGACCATCAACCCAGAAATTAACATGGGTGTACTGGCGGGTATCATTACCGGTCTGGTTGGGGGCGCAGCCCATAACCGTTGGTCCGATATTAAACTGCCTGACTTCCTGAGCTTTTTCCGCGGCACACACTTTTTGCCGGTTGCCCCC‑C‑GATTCTTCTGCCTGGTTCTCGG‑GGCCCTTTTTGGTTTCgctcgg > 2:601006/1‑283 (MQ=255) aTCGGGTTGGCATCCGGCTGGTCGAAAGACAGCGCGGGTGCGGCGGCGCTGGCGGGTGCGGTAGGTTACTTTGTGTTAACCAAAGCGATGGTGACCATCAACCCAGAAATTAACATGGGTGTACTGGCGGGTATCATTACCGGTCTGGTTGGTGGCGCAGCCTATAACCGTTGGTCCGATATTAAACTGCCGGACTTCCTGAGCTTCTTCGGCGGCAAACGCTTTGTGCCGATTGCCACC‑G‑GATTCTTCTGCCTGGTGCTGGC‑GGCCATTTTTGGTTACGT‑CTGgccgc < 2:14815/289‑1 (MQ=255) tCGGTGTGGCATCCAGCTGGTCGAAAGACAGCGCTGGTGCGGCGGCGCTGGCGGGTGCGGTAGGTTACTTTGTGTTAACCAAAGCGATGGTGACCATCAACCCAGAAATTAACATGGGTGTACTGGCGGGTATCATTACCGGTCTGGTTGGTGGCGCAGCCTATAACCGTTGGTCCGATATTAAACTGCCGGACTTCCTGAGCTTCTTCGGCGGCAAACGCTTTGTTGCGATTGCCACC‑G‑GGTTCTTCTGCCTTGTTCTGGC‑CGCCATTTTTGGGTTCGT‑CTGgccgc > 2:1241834/1‑288 (MQ=255) cGGTGTGGCATCCAGCTGGTCGAAAGACAGCGCTGGTGCGGCGGCGCTGGCGGGTGCGTTAGGTTACTTTGTGTTAACCAAAGCGATGGTGACCATCAACCCAGAAATTAACATGGGTGTACTGGCGGGTATCATTACCGGTCTGGTTGGTGGCGCAGCCTATAACCGTTGGTCCGATATTAAACTGCCGGACTTCCTGAGCTTCTTCGGCGGCAAACGCTTTGTGCCGATTGCCACC‑G‑GATTCTTCTGCCTGGTGCTGGC‑GGCCATTTTTGGTTACGT‑CTGGccgccg < 1:412127/289‑1 (MQ=255) 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ttggtgtTAACCAAAGCGATGGTGGCCATCAACCCAGAAATTAACATGGGTGTACTGGCGGGTATCTTTACCGGTCTGGTTGGTGGCGCAGCCTATAACCGTTGGTCCGATATTAAACTGCCGGACTTCCTGAGCTTCTTCGGCGGCAAACGCTTTGTGCCGATTGCCACC‑G‑GATTCTTCTGCCTGGTGCTGGC‑GGCCATTTTTGGTTACGT‑CTGGCCGCCGGTACAGCACGCTATCCATGCAGGCGGCGAGTGGATCGTTTCTGCGGGCGCGCTGGGTTCCGGTATCt < 1:586892/286‑1 (MQ=255) gtgtTAACCAAAGCGATGTGTACCATCAACCCAGAAGTTAACATGGGTGTACTGGCGGGTATCATTACCGGTCTGGTTGGTGGCGCAGCCTATAACCGTTGGTCCGATATTAAACTGCCGGACTTCCTGAGCTTCTTCGGCGGCAAACGCTTTGTGCCGATTGCCACC‑G‑GATTCTTCTGCCTGGTGCTGGC‑GGCCATTTTTGGTTACGT‑CTGGCCGCCGGTACAGCACGCTATCCATGCAGGCGGCGAGTGGATCGTTTCTGCGGGCGCGCTGGGTTCCGGTATCTTTg < 2:211382/289‑1 (MQ=255) tgtTAACCAAAGCGATGGTGACCATCAACCCAGAAATTAACATGGGTGTACTGGCGGGTATCATTACCGGTCTGGTTGGTGGCGCAGCCTATAACCGTTGGTCCGATATTAAACTGCCGGACTTCCTGAGCTTCTTCGGCGGCAAACGCTTTGTGCCGATTGCCACC‑G‑GATTCTTCTGCCTGGTGCTGGC‑GGCCATTTTTGGTTACGT‑CTGGCCGCCGGTACAGCACGCTATCCATGCAGGCGGCGAGTGGATCGTTTCTGCGGGCGCGCTGGGTTCCGGTATCTTTgg > 1:752278/1‑289 (MQ=255) 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tgctGGC‑GGCCATTTTTGGTTACGT‑CTGGCCGCCGGTACAGCACGCTATCCATGCAGGCGGCGAGTGGATCGTTTCTGCGGGCGCGCTGGGTTCCGGTATCTTTGGTTTCATCAACCGTCTGCTGCTCCCAACCGGTCTGCATCAGGTACTGAA‑CCCCATCGCCTGGTTCCAGATTGGTGAATTCCCCAACGCGGCGGGTACGGTTTTCCACGGTGACATTAACCGCTTCTATCCCGGTGCAGGCACTCAGGGcatgttgatgtccggcttctctccgctcgtgctgt < 2:424779‑M1/284‑16 (MQ=255) tGCTGGC‑GGCCATTTTTGGTTACGT‑CTGGCCGCCGGTACAGCACGCTATCCATGCAGGCGGCGAGTGGATCGTTTCTGCGGGCGCGCTGGGTTCCGGTATCTTTGGTTTCATCAACCGTCTGCTGATCCCAACCGGTCTGCATCAGGTACTGAA‑CACCATCGCCTGGTTCCAGATTGGTGAATTCACCAACGCGGCGGGTACGGTTTTCCACGGTGACATTAACCGCTTCTATTCCGGTGACGGCACCGCGGGGATGTTCATGTCCGGCTTCTTCCCGATCATTATGtt > 1:615907/1‑289 (MQ=255) | GATAACCTCGCATTAATCTTCGCCATCGGTGTGGCATCCAGCTGGTCGAAAGACAGCGCTGGTGCGGCGGCGCTGGCGGGTGCGGTAGGTTACTTTGTGTTAACCAAAGCGATGGTGACCATCAACCCAGAAATTAACATGGGTGTACTGGCGGGTATCATTACCGGTCTGGTTGGTGGCGCAGCCTATAACCGTTGGTCCGATATTAAACTGCCGGACTTCCTGAGCTTCTTCGGCGGCAAACGCTTTGTGCCGATTGCCACC‑G‑GATTCTTCTGCCTGGTGCTGGC‑GGCCATTTTTGGTTACGT‑CTGGCCGCCGGTACAGCACGCTATCCATGCAGGCGGCGAGTGGATCGTTTCTGCGGGCGCGCTGGGTTCCGGTATCTTTGGTTTCATCAACCGTCTGCTGATCCCAACCGGTCTGCATCAGGTACTGAA‑CACCATCGCCTGGTTCCAGATTGGTGAATTCACCAACGCGGCGGGTACGGTTTTCCACGGTGACATTAACCGCTTCTATGCCGGTGACGGCACCGCGGGGATGTTCATGTCCGGCTTCTTCCCGATCATGATGTT > NC_000913/704091‑704659 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |