| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 702318 = | 101 (0.790) | 5 (0.040) | 5/510 | NT | 3.7% | coding (434/1149 nt) | nagA | N‑acetylglucosamine‑6‑phosphate deacetylase |
| ? | NC_000913 | 4502091 = | 158 (1.240) | intergenic (+501/+13) | yjgZ/insG | uncharacterized protein/IS4 transposase | |||||
Only 100 of 173 total aligned reads displayed.
CGTCAGAGTGCAATCGTTCATATACACTGTCGGTGATGCGCTAAAAAATGCGTTAATGTTGAGTTCCTCGAACCCTTACCAATTAAGGGACATAGCCAGATACGCAACTGGCTGATGCAAGCAGTCTAATGTCTTTAGATCCGCTGGCCTGCGGGCATGACAATGTCAAACAGTCAAAGATTGTGGCGTTGACGGTCAGTCTTGGGGACAAAAAA‑GCTCAGTATTCTCGTTGGCAACCAGATAATTTAACAGTTGATGCTGAAACGAAATAGGCATCTTGGTTCTGTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTCCAGGGCCTCTCCTTTACCACTCTCGGGAAGGCCCTTTCCCTTCTTGTCGGTAATTTCACAAGTTGTCCCATACTTGCAAGATCGCGCATCAGCTCCGGTATACGTCCCGGTGAAGCGCCCTGCAATGTCATCAGCATTCTCATCACCATTCCGCATGATTCTGAGAAACTCAGTTGATTCGGCCAGTAACCTTTCAGATGTTCCGCCATTTTAATCATCTGATATCTCACCAG > NC_000913/4501805‑4502379 | cGTCAGAGTGCAATCGTTCATATACACTGTCGGTGATGCGCTAAAAAATGCGTTAATGTTGAGTTCCTCGAACCCTTACCAATTAAGGGACATAGCCAGATACGCAACTGGCTGATGCAAGCAGTCTAATGTCTTTAGATCCGCTAGCCTGCGGGCATGACAATGTCAAACAGTCAAAGATTGTGGCGTTGACGGTCAGTCTTGGGGACAAAAAA‑GCTCAGTATTCTCGTTGGCAACCAGATAATTTAACAGTTGATGCTGAAACGAAATAGGCATCTTGGTTCTGTaa > 1:544716/1‑289 (MQ=255) gCAATCGTTCATATACACTGTCGGTGATGCGCTAAAAAATGCGTTAATGTTGCGTTCCTCGAACCCTTACCAATTAAGGGACATAGCCAGATACGCAACTGGCTGATGCAAGCAGTCTAATGTCTTTAGATCCGCTGGCCTGCGGGCATGACAATGTCAAACAGTCAAAGATTGTGGCGTTGACGGTCAGTCTTGGGGACAAAAAA‑GCTCAGTATTCTCGTTGGCAACCAGATAATTTAACAGTTGATGCTGAAACGAAATAGGCATCTTGGTTCTGTAATGCcagtc < 2:720530/288‑1 (MQ=255) cAATCGTTCATATACACTGTCGGTGATGCGCTAAAAAATGCGTTAATGTTGAGTTCCTCGAACCCTTACCAATTAAGGGACATAGCCAGATACGCAACTGGCTGATGCAAGCAGTCTAATGTCTTTAGATCCGCTGGCCTGCGGGCATGACAATGTCAAACAGTCAAAGATTGTGGCGTTGACGGTCAGTCTTGGGGACAAAAAA‑GCTCAGTATTCTCGTTGGCAACCAGATAATTTAACAGTTGATGCTGAAACGAAATAGGCATCTTGGTTCTGTAATGCcagtcag > 1:622152/1‑289 (MQ=255) tcgatgtgcagttaaacggctgcggcggcgtacagtttaacgacaccgctgaagcggtcagcgtggaaacgctggaaatcatgcagaaagccaatgagaaatcaggctgtactaactatctgccgacgcttatcaccaccagcgatgagctgatgaaacagggcgtgcgcgttatgcgcgagtacctggcaaaacatccgaatcaggcgttaggtctgcatctggaaggtccgtggctgaatctggtaaaaaaaggcacccataatccTAATGCCAGTCAGTTAAGCaa < 1:864264‑M2/21‑1 (MQ=255) atatACACTTTCTTTGATGCGCTAAAAAATGCGTTAATGTTGAGTTCCTCGACCCCTTACCAATTAAGGGACATAGCCAGATACGCAACTGGCTGATGCAAGCAGTCTAATGTCTTTATATCCGCTGGCCTGCGGGCATGAAAATGTCAAACAGTCAAAGATTGTGGCGTTGACGGTCAGTCTTGGGGACAAAAAA‑GCTCAGTATTCTCGTTGGCAACCAGATAATTTAACAGTTGATGCTGAAACGAAATAGGCATCTTGGTTCTGTAATGCcagtc < 2:1037065/278‑1 (MQ=255) acTGTCGGTGATGCGCTAAAAAATGCGTTAATGTTGCGTTCCTCGAACCCTTACCAATTAAGGGACATAGCCAGATACGCAACTGGCTGATGCAAGCAGTCTAATGTCTTTAGATCCGCTGGCCTGCGGTCATGACAATGTCAAACAGTCAAAGATTGTGGCGTTGACGGTCAGTCTTGGGGACAAAAAA‑GCTCAGTATTCTCGTTGGCAACCAGATAATTTAACAGTTGAGCATGAAACGACATAGGAATCTTGGTTCTGTACTGCCAGTCAGTTAAGCAactgcctg > 2:475487/1‑289 (MQ=255) acTGTCGGTGATGCGCTAAAAAATGCGTTAATGTTGAGTTCCTCGAACCCTTACCAATTAAGGGACATAGCCAGATACGCAACTGGCTGATGCAAGCAGTCTAATGTCTTTAGATCCGCTGGCCTGCGGGCATGACAATGTCAAACAGTCAAAGATTGTGGCGTTGACGGTCAGTCTTGGGGACAAAAAC‑GCCCAGTATTCTCGTTGGCAACCAGATAATTTAACAGTTGATGCTGAACCGAAATAGGCCTCTTGGTTCTGTACTGCCAGTCAGTTAACTAactgactg > 2:273196/1‑289 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 10 ≤ ATCG/ATCG < 19 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |