| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | NC_000913 | = 4034101 | 165 (1.080) | 10 (0.070) | 8/504 | NT | 5.8% | coding (958/1452 nt) | trkH | potassium transporter |
| ? | NC_000913 | = 4034171 | 163 (1.100) | coding (1028/1452 nt) | trkH | potassium transporter | |||||
Only 100 of 186 total aligned reads displayed.
ATGATGCCAGTATCGGTTATTTCGATAGCCCGACTATTAACACTATCATTGCTATCTTCCTGCTGATCTCCGGCTGTAACTACGGTCTGCACTTTTCACTGTTAAGTGGGCGTAGTCTGAAGGTTTATTGGCGCGATCCGGAATTTCGCATGTTTATCGGCGTACAGTTTACGCTGGTGGTTATTTGTACCCTCGTACTGTGGTTTCATAATGTCTACAGTTCGGCGCTGATGACAATTAACCAGGCGTTTTTCCAGGTGGTGTCGATGGCGACAACCGCCGGGTTTACAACTGACAGCATTGCCCGCTGGCCGCTCTTTTTGCCGGTACTGCTTTTATGTTCAGCCTTTATCGGC‑GGTTGCGCCGGGTCAACGGGCGGTGGCCTGAAGGTGATCCGCATCCTGCTGCTGTTTAAGCAGGGGAACCGTGAGCTGAAACGACTGGTGCATCCGAACGCCGTCTATAGCATTAAGCTGGGGAATCGCGCACTGCCGGAACGTATCCTCGAAGCCGTTTGGGGATTTTTCTCCGCCTATGCATTGGTGTTTATTGTCAGTATGCTGG > NC_000913/4033820‑4034383 | tATCGGTTATTTCGATAGCCCGACTATTAACACTATCATTGCTATCTTCCTGCTGATCTCCGGCTGTAACTACGGTCTGCACTTTTCACTGTTAAGTGGGCGTAGTCTGAAGGTTTATTGGCGCGATCCGGAATTTCGCATGTTTATCGGCGTACAGTTTACGCTGGTGGTTATTTGTACCCTCGTACTGTGGTTTCATAATGTCTACAGTTCGGCGCTGATGACAATTAACCAGGCGTTTTTCCAGGTGGTGTCGATGGCGACAACCGCCGGGTTTACAACTGACAg > 2:1071882/1‑288 (MQ=255) gaggccGACTGTTAACTCTATCATTGCGATCTTCCTGCGGGTCTCTGTGTGTAGCGATGGGCTGCAGTGTTCGCTGTTAAGTGGGCGTAGTCTGAAGTGTTATTGGCGCGATCCGGAATTTCGTATGTGTATGGGCGTACAGTTTGCGCTGGTGGTTATTTGTACCCTGGTACTGTGGTTTCATAATGGATACAGTTCGGCGCTGATGACAATTAACCAGGCGTTTTTCCAGGTGGTGTTGATGGCGACAACCGCCTGGTGTACAACTGACAGCATTGCCCGCTgggc < 2:385149/284‑3 (MQ=255) cacTATCATTGCTATCTTCCTGCTGATCTCCGGCTGTAACTACGGTCTGCACTTTTCACTGTTAAGTGGGCGTAGTCTGAAGGTTTATTGGCGCGATCCGGAATTTCGCATGTTTATCGGCGTACAGTTTACGCTGGTGGTTATTTGTACCCTCGTACTGTGGTTTCATAATGTCTACAGTTCGGCGCTGATGACAATTAACCAGGCGTTTTTCCAGGTGGTGTCGATGGCGACAACCGCCGGGTTTACAACTGACAGCATTGCCCGCTGGCCGCTCTTTTTGCCGGTa < 1:1071882/289‑1 (MQ=255) aTCATTGCTATCTTCCTGCTGATCTCCGGCTGTAACTACGGTCTGCACTTTTCACTGTTAAGTGGGCGTAGTCTGAAGGTTTATTGGCGCGATCCGGAATTTCGCATGTTTATCGGCGTACAGTTTACGCTGGTGGTTATTTGTACCCTCGTACTGTGGTTTCATAATGTCTACAGTTCGGCGCTGATGACAATTAACCAGGCGTTTTTCCAGGTGGTGTCGATGGCGACAACCGCCGGGTTTACAACTGACAGCATTGCCCGCTGGCCGCTCTTTTTGCCGGTAc < 2:111731/286‑1 (MQ=255) aTCATTGCTATCTTCCTGCTGATCTCCGGCTGTAACTACGGTCTGCACTTTTCACTGTTAAGTGGGCGTAGTCTGAAGGTTTATTGGCGCGATCCGGAATTTCGCATGTTTATCGGCGTACAGTTTACGCTGGTGGTTATTTGTACCCTCGTACTGTGGTTTCATAATGTCTACAGTTCGGCGCTGATGACAATTAACCAGGCGTTTTTCCAGGTGGTGTCGATGGCGACAACCGCCGGGTTTACAACTGACAGCATTGCCCGCTGGCCGCTCTTTTTGCCGGTAc > 1:111731/1‑286 (MQ=255) aTCATTGCTATCTTCCTGCTGATCTCCGGCTGTAACTACGGTCTGCACTTTTCACTGTTAAGTGGGCGTAGTCTGAAGGTTTATTGGCGCGATCCGGAATTTCGCATGTTTATCGGCGTACAGTTTACGCTGGTGGTTATTTGTACCCTCGTACTGTGGTTTCATAATGTCTACAGTTCGGCGCTGATGACAATTAACCAGGCGTTTTTCCAGGTGGTGTCGATGGCGACAACCGCCGGGTTTACAACTGACAGCATTGCCCGCTGGCCGCTCTTTTTGCCGGTACt > 1:988753/1‑287 (MQ=255) aTCATTGCTATCTTCCTGCTGATCTCCGGCTGTAACTACGGTCTGCACTTTTCACTGTTAAGTGGGCGTAGTCTGAAGGTTTATTGGCGCGATCCGGAATTTCGCATGTTTATCGGCGTACAGTTTACGCTGGTGGTTATTTGTACCCTCGTACTGTGGTTTCATAATGTCTACAGTTCGGCGCTGATGACAATTAACCAGGCGTTTTTCCAGGTGGTGTCGATGGCGACAACCGCCGGGTTTACAACTGACAGCATTGCCCGCTGGCCGCTCTTTTTGCCGGTACt > 2:1226199/1‑287 (MQ=255) 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> 2:356277‑M1/1‑157 (MQ=255) tATTGGCGCGATCCGGAATTTCGCATGTTTATCGGCGTACAGTTTACGCTGGTGGTTATTTGTACCCTCGTACTGTGGTTTCATAATGTCTACAGTTCGGCGCTGATGACAATTAACCAGGCGTTTTTCCAGGTGGTGTCGATGGCGACAACCGCCGGGTTTACAACTGACAGCATTGCCCGCTGGCCGCTCTTTTTGCCGGTACTGCTTTTATGTTCAGCCTTTATCGGC‑GGTTGCGCCGGGTCAACGGGCgg > 1:1384857/1‑254 (MQ=255) tATTGGCGCGATCCGGAATTTCGCATGTTTATCGGCGTACAGTTTACGCTGGTGGTTATTTGTACCCTCGTACTGTGGTTTCATAATGTCTACAGTTCGGCGCTGATGACAATTAACCAGGCGTTTTTCCAGGTGGTGTCGATGGCGACAACCGCCGGGTTTACAACTGACAGCATTGCCCGCTGGCCGCTCTTTTTGCCGGTACTGCTTTTATGTTCAGCCTTTATCGGC‑GGTTGCGCCGGGTCAACGGGCGGTGGCCTGAAGGTGATCCGCATCCTGCTGCTGTTTa < 2:1224744/289‑1 (MQ=255) tATTGGCGCGATCCGGAATTTCGCATGTTTATCGGCGTACAGTTTACGCTGGTGGTTATTTGTACCCTCGTACTGTGGTTTCATAATGTCTACAGTTCGGCGCTGATGACAATTAACCAGGCGTTTTTCCAGGTGGTGTCGATGGCGACAACCGCCGGGTTTACAACTGACAGCATTGCCCGCTGGCCGCTCTTTTTGCCGGTACTGCTTTTATGTTCAGCCTTTATCGGC‑GGTTGCGCCGGGTCAACGGGCGGTGGCCTGAAGGTGATCCGCATCCTGCTGCTGTTTa > 1:809741/1‑289 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |