| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 4034101 | 165 (1.080) | 10 (0.070) | 8/504 | NT | 5.8% | coding (958/1452 nt) | trkH | potassium transporter |
| ? | NC_000913 | = 4034171 | 163 (1.100) | coding (1028/1452 nt) | trkH | potassium transporter | |||||
Only 100 of 183 total aligned reads displayed.
CGGCTGTAACTACGGTCTGCACTTTTCACTGTTAAGTGGGCGTAGTCTGAAGGTTTATTGGCGCGATCCGGAATTTCGCATGTTTATCGGCGTACAGTTTACGCTGGTGGTTATTTGTACCCTCGTACTGTGGTTTCATAATGTCTACAGTTCGGCGCTGATGACAATTAACCAGGCGTTTTTCCAGGTGGTGTCGATGGCGACAACCGCCGGGTTTACAACTGACAGCATTGCCCGCTGGCCGCTCTTTTTGCCGGTACTGCTTTTATGTTCAGCCTTTATCGGCGGTTGCGCCGGGTCAACGGGCGGTGGCCTGAAGGTGATCCGCATCCTGCTGCTGTTTAAGCAGGGGAACCGTGAGCTGAAACGACTGGTGCATCCGAACGCCGTCTATAGCATTAAGCTGGGGAATCGCGCACTGCCGGAACGTATCCTCGAAGCCGTTTGGGGATTTTTCTCCGCCTATGCATTGGTGTTTATTGTCAGTATGCTGGCGATTATCGCCACGGGCGTGGATGA‑CTTTTCTGCCTTTGCGTCGGTTGTTGCGACATTGAATAACCTGGGGCCA > NC_000913/4033890‑4034457 | tCTGCACTTTTCACTGTTAAGTGGTCGTAGTCTGAAGGTTTATTGGCGCGATCCGGAATTTCGCATGTTTATCGGCGTACAGTTTACGCTGGTGGTTATTTGTTCCCTCGTACTGTGGTTTCATAATGTCTACAGTTCGGCGCTGATGACAATTAACCAGGCGTTTTTCCAGGTGGTGTCGATGGCGACAACCGCCGGGTTTACAACTGACAGCATTGCCCGCTGGCCGCTCTTTTTGCCGGTACTGCTTTTATGTTCAGCCTTTATcggcggttgtcgccatcgaca > 1:492154‑M2/1‑267 (MQ=255) 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tGCACTTTTCACTGTTAAGTGGGCGTAGTCTGAAGGTTTATTGGCGCGATCCGGAATTTCGCATGTTTATCGGCGTACAGTTTACGCTGGTGGTTATTTGTACCCTCGTACTGTGGTTTCATAATGTCTACAGTTCGGCGCTGATGACAATTAACCAGGCGTTTTTCCAGGTGGTGTCGATGGCGACAACCGCCGGGTTTACAACTGACAGCATTGCCCGCTGGCCGCTCTTTTTGCCGGTACTGCTTTTATGTTCAGCCTTTATCGGCGGTTGCGCCGGGTCAACgg > 1:313373/1‑288 (MQ=255) aCTTTTCACGGTTAAGGGGGCGGAGTCTGAAGGTTTATGGGCGCGATCCGGAATTTCGCAGGTTTATCGGCGTACAGTTTACGCTGGTGGTTATTTGTACCCTCGTACTGTGGTTTCATAATGGCTACAGTTCGGCGCGGATGACAATTAACCAGGCGTTTTTCCAGGTGGTGTGGAGGGCGACAGCCGCCGGGTGTACAACTGACAGCATTGCCCGCTGGCCGCTCTTGTTGCCGGTACTGCTTGTATGTTCAGCCTTTATCGGCGGTTGCGCCGGGTCAACGGGCgg < 2:124560/289‑1 (MQ=255) ttCACTGTTAAGTGGGCGTAGTCTGAAGGTTTATTGGCGCGATCCGGAATTTCGCATGTTTATCGGCGTACAGTTTACGCTGGTGGTTATTTGTACCCTCGTACTGTGGTTTCATAATGTCTACAGTTCGGCGCTGATGACAATTAACCAGGCGTTTTTCCAGGTGGTGTCGATGGCGACAACCGCCGGGTTTACAACTGACAGCATTGCCCGCTGGCCGCTCTTTTTGCCGGTACTGCTTTTATGTTCAGCCTTTATCGGCGGTTGCGCCGGGTCAACGGGCGGTgg > 1:926131/1‑288 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 17 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |