| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 1226035 | 96 (1.260) | 3 (0.040) | 3/434 | NT | 2.8% | coding (46/696 nt) | minC | inhibitor of FtsZ ring polymerization |
| ? | NC_000913 | = 1226307 | 114 (1.510) | intergenic (‑227/‑293) | minC/ycgJ | inhibitor of FtsZ ring polymerization/uncharacterized protein | |||||
Only 100 of 106 total aligned reads displayed.
GCCCCATCTTTTCAATTTCGGCTTTAAGTTGCGCATCTTTGCAGCCACTTACGCCAATAACCCGCAAACCGGTTGCCGAAACCGCCTTATGCATCGCTGAC‑CAGTTTACCGGGTCTTCCAGTGCACTGACGT‑TGAGTACAACGGGGGCATGTTTTAAAAATGCGGGGGCCTGAGCGATTTTGTCTTCCAGCGCCTGATGGATAACCTTAGGTTCTGCCTCATGCAGATGAACCACAGATAAAGTGAAGCTACTGCCTTTAA‑GCTCGATTGGCGTGTTTGACATCCTGGCCTTACTCAATTAGCTATTAATCATCGCCAGCGCGCGATGATG‑TTCCGAAGACTATAAGGCATGTTATAGTCTGGATTATATTGAG‑GCAAGTCACCCTCCCATTTATTCAGAGTAAAAGTCTATTCTGTGATAAATGGCGCTGATTCATAGCTTAAAAAATACCCTTGTCAATCAACCCATTGCC > NC_000913/1225798‑1226270 | gCCCCAGTTTTTCAATTTCGGTTTTAAATTGCGCATCTTTGCTGCCACTTACGCCAATAACCCACAAACCGGTTGCCGAACCCGCCTTATGCATCGCTGAC‑CAGTTTACCGGGTCTTCCAGTGCACTGACGT‑TGAGTACAACGGGGGCATGTTTTAAAAATGCGGGGGCCTGAGCGATTTTGTCTTCCAGCGCCTGATGGATAACCTTAGGTTCTGCCTCATGCAGATGAACCACAGAt < 2:859979/239‑1 (MQ=255) cccATCTTTTCAATTTCGGCTTTAAGTTGCGCATCTTTGCAGCCACTTACGCCAATAACCCGCAAACCGGTTGCCGAAACCGCCTTATGCATCGCTGAC‑CAGTTTACCGGGTCTTCCAGTGCACTGACGT‑TGAGTACAACGGGGGCATGTTTTAAAAATGCGGGGGCCTGAGCGATTTTGTCTTCCAGCGCCTGATGGATAACCTTAGGTTCTGCCTCATGCAGATGAACCACAGATaa > 1:487646/1‑239 (MQ=255) tCAATTTCGGCTTTAAGTTGCGCATCTTTGCAGCCACTTACGCCAATAACCCGCAAACCGGTTGCCGAAACCGCCTTATGCATCGCTGAC‑CAGTTTACCGGGTCTTCCAGTGCACTGACGT‑TGAGTACAACGGGGGCATGTTTTAAAAATGCGGGGGCCTGAGCGATTTTGGCTTCCAGCGCCTGATGGCTAACCTTAGGTTCGGCCTCATGCAGCTGAACCACAGATAACGTGAAGCt > 2:318930/1‑239 (MQ=255) cAATTTCTGCCTTAAGTTGCCCCTTTTTGCACCCACTTCCCCCATTACCCCGCAAACCGTTTGCCGAAACCGCCTTATGCATCGCTGAC‑CAGTTTACCGGGTCTTCCAGTGCACTGACGT‑TGAGTACAACGGGGGCATGTTTTAAAAATGCGGGGGCCTGAGCGATTTTGTCTTCCAGCGCCTGATGGATAACCTTAGGTTCTGCCTCATGCAGATGAACCACAGATAAAGTGAAGCTa < 1:829795/239‑1 (MQ=255) aTTTCGGCTTTAAGTTGCGCATCTTTGCAGCCACTTACGCCAATAACCCGCAAACCGGTTGCCGAAACCGCCTTATGCATCGCTGAC‑CAGTTTACCGGGTCTTCCAGTGCGCTGACGT‑TGAGTACAACGGGGGCATGTTTTAAAAATGCGGGGGCCTGAGCGATTTTGTCTTCCAGCGCCTGATGGATAACCTTAGGTTCTGCCTCATGCAGATGAACCACAGATAAAGTGAAGCTACt < 2:125560/239‑1 (MQ=255) ttCGGCTTTAAGTTGCGCATCTTTGCAGCCACTTACGCCAATAACCCGCAAACCGGTTGCCGAAACCGCCTTATGCATCGCTGAC‑CAGTTTACCGGGTCTTCCAGTGCACTGACGT‑TGAGTACAACGGGGGCATGTTTTAAAAATGCGGGGGCCTGAGCGATTTTGTCTTCCAGCGCCTGATGGATAACCTTAGGTTCTGCCTCATGCAGATGAACAACAGATAAAGTGAAGCTACTg > 2:456223/1‑238 (MQ=255) tcgcttttAATTTGCGCATTTTTGCACCCACTTACGCCAATACCCCGCAAACCGGTTGCCGAACCCGCCTTATGCATCGCTGAC‑CAGTTTACCGGGTCTTCCAGTGCACTGGCGT‑TGAGTACAACGGGGGCATGTTTTAAAAATGCGGGGGCCTGAGCGATTTTGTCTTCCAGCGCCTGATGGATAACCTTAGGTTCTGCCTCATGCAGATGAACCACAGATAAAGTGAAGCTACt < 1:796068/231‑1 (MQ=255) cGGCTTTAAGTTGCGCATCTTTGCAGCCACTTACGCCAATAACCCGCAAACCGGTTGCCGAAACCGCCTTATGCATCGCTGAC‑CAGTTTACCGGGTCTTCCAGTGCACTGACGT‑TGAGTACAACGGGGGCATGTTTTAAAAATGCGGGGGCCTGAGCGATTTTGTCTTCCAGCGCCTGATGGAAACCCTTAGGTTCTGCCTCATGCAGATGAACCCCAGATAAAGTGAAGCTACTGCCt > 2:3752/1‑239 (MQ=255) ccATCTTTGCAGCCACTTACGCCAATAACCCGCAAACCGGTTGCCGAAACCGCCTTATGCATCGCTGAC‑CAGTTTACCGGGTCTTCCAGTGCACTGACGT‑TGAGTACAACGGGGGCATGTTTTAAAAATGCGGGGGCCTGAGCGATTTTGTCTTCCAGCGCCTGATGGATAACCTTAGGTTCTGCCTCATGCAGATGAACCACAGATAAAGTGAAGCTACTGCCTTTAA‑GCTCGATTg < 2:814342/237‑1 (MQ=255) gCAGCCACTTACGCCAATACCCCGCAAACCGGTGGCCGAACCCGCCTTATGCATCGCTGAC‑CAGTTTACCGGGTCTTCCAGTGCACTGACGG‑TGAGTACAACGGGGGCATGTTTTAAAAATGCGGGGGCCTGAGCGATTTTGTCTTCCAGCGCCTGATGGATAACCATAGGGTCTGCCTCATGCAGATGAACCACAGATAAAGTGAAGCTACTGCCTTTAA‑GCTCGATTGGCGTGTTTg < 2:109685/239‑1 (MQ=255) ccacccttttccccAATACCCCGAAACCCGGTTGCCACAACCGCCTTAGGCATCGCTGAC‑CAGTTTACCGGGTCTTCCAGTTCACTGACGT‑GGAGTACAACGGGGGCATGTTTTAAAAATGCGGGGGTCTGAGCGATTTTGTCTTCCAGCGCCTGATGGATAACCTTAGGTTCTGCCTCATGCAGATGAACCACAGATAAAGTGAAGCTACTGCCTTTAA‑GCTCGATTGGCGTGTTTGa < 1:696352/227‑1 (MQ=255) cccTTCCGCCAAAAACCCCAAAACCGGTTGCCGAAACCGCCTTATGCATCGCTGAC‑CAGTTTACCGGGTCTTCCAGTGCACTGACGT‑TGAGTACAACGGGGGCATGTTTTAAAAATGCGGGGGCCTGAGCGATTTTGTCTTCCAGCGCCTGATGGATAACCTTAGGTTCTGCCTCATGCAGATGAACCACAGATAAAGTGAAGCTACTGCCTTTAA‑GCTCGATTGGCGTGTTTGACATc < 1:825898/237‑1 (MQ=255) aCTTACGCCAATAACCCGCAAACCGGTTGCCGAAACCGCCTTATGCATCGCTGAC‑CAGTTTACCGGGTCTTCCAGTGCACTGACGT‑TGAGTACAACGGGGGCATGTTTTAAAAATGCGGGGGCCTGAGCGATTTTGTCTTCCAGCGCCTGATGGATAACCTTAGGTTCTGCCTCATGCAGATGAACCACAGATAAAGTGAAGCTACAGCCTTTAA‑GCTCGATTGGCGTGTTTGACATcc < 2:445376/239‑1 (MQ=255) 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ccctaactccgTTGCCAAAACTGTCTTGTGCAACGCTGGC‑CAGTTTACCGGGTTTTCCAGTGCACTGACGT‑TGAGTACAACGGGGTCATGTTTTAAAAATGCGGGGGCCTGAGCGATTTTGTCTTCCAGCGCCTGATGGATAACCTTAGGTTCTGCCTCATGCAGATGAACCACAGATAAAGTGAAGCTACTGCCTTTAA‑GCTCGATTGGCGTGTTTGACATCCTGGCCTTACTCAAtt < 1:617934/229‑1 (MQ=255) ccGCAACCGTGTTCCCCAACCCCCCTTTTGGCTCGCTGGC‑CAGTTTACCGGGTCTTCCAGTGCACTGACGT‑TGAGTACAACCGGGGCATGTTTTAAAAATGCGGGGGCCTGAGCGATTTTGTCTTCCAGCGCCTGATGGATAACCTTAGGTTCTGCCTCATGCAGATGAACCACAGATAAAGTGAAGCTACTGCCTTTAA‑GCTCGATTGGCGTGTTTGACATCCTGGCCTTACTCAAtt < 1:563679/239‑1 (MQ=255) ccGCAAACCGGTTGCCGAAACCGCCTTAGTCATCGCTGAC‑CAGTTTACCGGGTCTTCCAGTGCACTGACGT‑TGAGTACAACGGGGGCATGTTTTAAAAATGCGGGGGCCTGAGCGATTTTGTCTTCCAGCGCCTGATGGATAACCTTAGGTTCTGCCTCATGCAGATGAACCACAGATAAAGTGAAGCTACTGCCTTTAA‑GCTCGATTGGCGTGTTTGACATCCTGGCCTTACTCAAtt < 2:431696/239‑1 (MQ=255) 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NC_000913/1225798‑1226270 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |