| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 1226035 | 96 (1.260) | 3 (0.040) | 3/434 | NT | 2.8% | coding (46/696 nt) | minC | inhibitor of FtsZ ring polymerization |
| ? | NC_000913 | = 1226307 | 114 (1.510) | intergenic (‑227/‑293) | minC/ycgJ | inhibitor of FtsZ ring polymerization/uncharacterized protein | |||||
Only 100 of 126 total aligned reads displayed.
GTTTGACATCCTGGCCTTACTCAATTAGCTATTAATCATCGCCAGCGCGCGATGATGTTCCGAAGACTATAAGGCATGTTATAGTCTGGATTATATTGAGGCAAGTCACCCTCCCATTTATTCAGAGTAAAAGTCTATTCTGTGATAAATGGCGCTGATTCATAGCTTAAAAAATACCCTTGTCAATCAACCCATTGCCGTCGTACTTTTGATTGTTCTTATTTACGCTTCCTTTTTCCGCACCCTAATCGTGACAGCATCTCCAGACCTGTTTAAATATCCAGTATTGAGGCAAGTGTATTTTTTCACCACGCCAGGCTTTCTTAACTTTCCATTTTTTGCGGCATCATTAAAGAACAGATACCCGTTATCTTAATATCCGCCACAGAATTGCTCTATCATAGAAACCGCAGAAGACGTCTGATACTTCTGTCAGGTCATCGTAACTCGTCCAGGTCAGCGGTTTTGATTA > NC_000913/1226072‑1226543 | gttttaccaccgggCCTTGCTAAAATAGGTTATAATCAGCGGCAGGGCGCGATGATGTTCCGAAAGCTATAAGGCATGGTATGTTCTGGATTAAATGGAGGCAAGGCACCCTCCCATTTATTCAGAGTAAAAATCTATTCTTTTATAAATGGCGCTGATTCATATCTTAAAAAATCCCCTTGGCAATCAACCCATTGCCGTCGTACTTTTGATTGTTCTTATTTACGCTTCCTTTTTcc < 1:634632/227‑1 (MQ=255) tttGACATCCTGGCCTTACTCAATTAGCTATTAATCATCGCCAGCGCGCGATGATGTTCCGAAGACTATAAGGCATGTTATAGTCTGGATTATATTGAGGCAAGTCACCCTCCCATTTATTCAGAGTAAAAGTCTATTCTGTGATAAATGGCGCTGATTCATAGCTTAAAAAATACCCTTGTCAATCAACCCCTTGCCGTCGTACTTTTGATTGTTCTTATTTACGCTTCCTTTTTcc > 1:757556/1‑238 (MQ=255) tttGACATCCTGGCCTTACTCAATTAGCTATTAATCATCGCCAGCCCGAGAAGATGTTCCGAAGACTATAAGGCATGTTATAGTCTGGATTATAGTGAGGCAAGGCACCCTCCCATTTATTCAGAGTAAAAGTCTATTCTGTGATAAATGGCGCTTATTCATAGCTTAAAAAATTCCCTTGTCAATCAACCCATTGCCGTCGTACTTTTGATTGTTCTTATTTACGCTTCCTTTTTCCg < 1:381764/239‑1 (MQ=255) tGACATCCTGGCCTTACTCAATTAGCTATTAATCAGCGCCAGCGCGCGATGATGTTCCGAAGACTATAAGGCATGTTATAGTCTGGATTATATTGAGGCAAGTCACCCTCCCATTTATTCAGAGTAAAAGTCTATTCTGTGATAAATGGCGCTGATTCATAGCTTAAAAAATACCCTTGTCAATCAACCCATTGCCGTCGTACTTTTGATTGTTCTTATTTACGCTTCCTTTTTCCGCa < 2:752682/239‑1 (MQ=255) aCTCAATTAGCTATTAATCATCGCCAGCGCGCGATGATGTTCCGAAGACTATAAGGCATGTTATAGTCTGGATTATATTGAGGCAAGTCACCCTCCCATTTATTCAGAGTAAAAGTCTATTCTGTGATAAATGGCGCTGATTCATAGCTTAAAAAATACCATTGTCAATCAACCCATTGCCGTCGTACTTTTGATTGTTCTTATTTAACCTTCCTTTTTCCGCCCCCCAATCTTGaac > 1:536292/1‑236 (MQ=255) cTCAATTAGCTATTAATCATCGCCAGCGCGGGATGATGTTCCGAAGACTATAAGGCATGTTATAGTCTGGATTATATTGAGGCAAGTCACCCTCCCATTTATTCAGAGTAAAAGTCTATTCTGTGATAAATGGCGCTGATTCATAGCTTAAAAAATACCCTTGTCAATCAACCCATTGCCGTCGTACTTTTGATTGTTCTTATTTACGCTTCCTTTTTCCGCACCCTAATCGTGACAGc < 1:128486/239‑1 (MQ=255) atccaTTGGCTATTTATCATCGCCAGCGCGCTATTGTGGTCCGAAGACTATAAGGCATGTTATAGTCTGGATTATATTGAAGCAAGTCATCCTCCCATTTATTCAGAGTAAAAGGCTTTTCTGTGATAAATGGCGCTGATTCTTAGCTTAAAAAATACCCTTGTCAATCACCCCATTGCCGTCGTACTTTTGATTGTTCTTATTTACTCTTCCTTTTTCCGCACCCTAATCGTGACAGc < 1:787458/235‑1 (MQ=255) 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ttttttattttGGTTTATTTTTAGGCAATTCACCCCCCCATTTATTCAGAGTAAAAGTCTATGCTGGGATAAATTGCGCTGATTCATAGCTTAAAAAATACCCTTTGCAATCAACCCATTGCCGTCGTACTTTTGATTGTTCTTATTTACGCTTCCTTTTTCCGCACCCTAATCGTGACATCATCTCCAGGCCTGTTTAAATATCCAGTATTGAGGCAAGTGTATTTTTTCACCACGcc < 1:194309/229‑1 (MQ=255) tGTTATAGTCTGGATTATATTGAGGCAAGTCACCCTCCCATTTATTCAGAGTAAAAGTCTATTCTGTGATAAATGGCGCTGATTCATAGCTTAAAAAATACCCTTGTCAATCAACCCATTGCCGTCGTACTTTTGATTGTTCTTATTTACGCTTCCTTTTTCCGCACCCTAATCGTGACAGCATCTCCAGACCTGTTTAAATATCCAGTATTGAGGCAAGTGAATTTTTTCACCACTcc > 2:124448/1‑239 (MQ=255) gTTATAGTCTGGATTATATTGAGGCAAGTCACCCTCCCATTTTTTCAGAGTAAAAGTCTATTCTGTGATATACGGCGCTGATTCATAGCTTAAAAAATACCATTGTCAATCAATCCATTGCCGCCGTATTCTTGATTGGTTTTATTTACGCTTCCTTTTTCCGCACCCTAATCGTGACAGCATTTCCAGACCTGTTTTAATATCCAGTATCGCGGCAAGGTCACTTTTTcaccaaccaa > 2:59173/1‑234 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |