| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | NC_000913 | 3796957 | 3797778 | 822 | 20 [19] | [18] 20 | waaL | O‑antigen ligase |
CGCGGTACTTTATGTTCTGGCGCTAACACAAACCAGAGCAACCCTACTCCTGTTCCCTATAATTTGTGTTGCTGCATTAATAGCTTATTATAATAAATCACCCAAGAAATTCACTTCCTCTATTGTTCTACTAATTGCTATATTAGCTAGCATTGTTATTATATTTAATAAACCAATACAGAATCGCTATAATGAAGCATTAAATGACTTAAACAGTTATACCAATGCTAATAGTGTTACTTCCCTAGGTGCAAGACTGGCAATGTACGAAATTGGTTTAAATATATTCATAAAGTCACCTTTTTCATTTAGATCAGCAGAGTCACGCGCTGAAAGTATGAATTTGTTAGTTGCAGAACACAATAGGCTAAGAGGGGCATTGGAGTTTTCTAACGTACATCTACATAATGAGATAATTGAAGCAGGGTCACTGAAAGGTCTGATGGGAATTTTT > NC_000913/3797555‑3798008 | cgcgGTACTTTATGTTCTGGCGCTAACACAAACCAGAGCAACCCTACTCCTGTTCCCTATAATTTGTGTTGCTGCATTAATAGCTTATTATAATAAATCACCCAAGAAATTCACTTCCTCTATTGTTCTACTAATTGCTATATTAGCTAGCATTGTTATTATATTTAATAAACCAATACAGAATCGCTATAATGAAGCATTAAATGACTTAAACAGATATACCAATGCTAATAGTGTTa < 2:231898/239‑1 (MQ=255) tGTTCTTGCTCTAACAAAAACCAGAGCAACCCTACTCCTGTTCCCTATAATTTGTGTTGCTGCATTAATAGCTTATTATAATAAATCACCCAAGAAATTCACTTCCTCTATTGTTCTACTAATTGCTATATTAGCTAGCATTGTTATTATATTTAATAAACCAATACAGAATCGCTATAATGAAGCATTAAATGACTTAAACAGTTATACCAATGCTAATAGTGTTACTTCCCTAGGTg < 1:796584/239‑1 (MQ=255) ctATTGTTCTACTAATTGCTATATTAGCTAGCATTGTTATTATATTTAATAAACCAATACAGAATCGCTATAATGAAGCATTAAATGACTTAAACAGTTATACCAATGCTAATAGTGTTACTTCCCTAGGTGCAAGACTGGCAATGTACGAAATTGGTTTAAATATATTCATAAAGTCACCTTTTTCATTTAGATCAGCAGAGTACCGCGCTGAAAGTATGAATTTGTTAGTTGCAGaa > 2:269184/1‑239 (MQ=255) gctagcATTGTTATTATATTTAATAAACCAATACAGAATCGCTATAATGAAGCATTAAATGACTTAAACAGTTATACCAATGCTAATAGTGTTACTTCCCTAGGTGCAAGACTGGCAATGTACGAAATTGGTTTAAATATATTCATAAAGTCACCTTTTTCATTTAGATCAGCAGAGTCACGCGCTGAAAGTATGAATTTGTTAGTTGCAGAACACAATAGGCTAAGAGGGGCATTg < 1:376303/237‑1 (MQ=255) gctagcATTGTTATTATATTTAATAAACCAATACAGAATCGCTATAATGAAGCATTAAATGACTTAAACAGTTATACCAATGCTAATAGTGTTACTTCCCTAGGTGCAAGACTGGCAATGTACGAAATTGGTTTAAATATATTCATAAAGTCACCTTTTTCATTTAGATCAGCAGAGTCACGCGCTGAAAGTATGAATTTGTTAGTTGCAGAACACAATAGGCTAAGAGGGGCATTg > 2:376303/1‑237 (MQ=255) cATTGTTATTATATTTAATAAACCAATACAGAATCGCTATAATGAAGCATTAAATGACTTAAACAGTTATACCAATGCTAATAGTGTTACTTCCCTAGGTGCAAGACTGGCAATGTACGAAATTGGTTTAAATATATTCATAAAGTCACCTTTTTCATTTAGATCAGCAGAGTCACGCGCTGAAAGTATGAATTTGTTAGTTGCAGAACAAAATAGGCTAAAAGGGGAATTGGAGgttt > 1:368002/1‑239 (MQ=255) tACAGAATCGCTATAATGAAGCATTAAATGACTTAAACAGTTATACCAATGCTAATAGTGTTACTTCCCTAGGTGCAAGACTGGCAATGTACGAAATTGGTTTAAATATATTCATAAAGTCACCTTTTTCATTTAGATCAGCAGAGTCACGCGCTGAAAGCATGAATTTGTTAGTTGCAGAACACAATAGGCTACGAGGGGCATTGGAGTTTTCTAACGTACATCTACATAATGAAATa > 2:246472/1‑239 (MQ=255) taaaaaTCGCTTTAATTAAGCATTAAATGACTTAAACAGGTATACCAATGCTAATAGTGTTACTTCCGTAGGTGCAAGACTGGCAATGTACGAAATTGGGTGAAATATAGTCATAAAGTCACCTTTTTCATTTAGATCAGCAGAGTCACGCGCTGAAAGTATGAATTTGTTAGTTGCAGAACACAATAGGCTAAGAGGGGCATTGGAGTTTTCTAACGTACATCTACATAATGAGATaa < 1:269184/235‑1 (MQ=255) tCGCTATAATGAAGCATTAAATGACTTAAACAGTTATACCAATGCTAATAGTGTTACTTCCCTAGGTGCAAGACTGGCAATGTACGAAATTGGTTTAAATATATTCATAAAGTCACCTTTTTCATTTAGATCAGCAGAGTCACGCGCTGAAAGTATGAATTTGTTAGTTGCAGAACACAATAGGCTAAGAGGGGCATTGGAGTTTTCTAACg < 1:208295/212‑1 (MQ=255) tCGCTATAATGAAGCATTAAATGACTTAAACAGTTATACCAATGCTAATAGTGTTACTTCCCTAGGTGCAAGACTGGCAATGTACGAAATTGGTTTAAATATATTCATAAAGTCACCTTTTTCATTTAGATCAGCAGAGTCACGCGCTGAAAGTATGAATTTGTTAGTTGCAGAACACAATAGGCTAAGAGGGGCATTGGAGTTTTCTAACg > 2:208295/1‑212 (MQ=255) cTATAATGAAGCATTAAATGACTTAAACAGTTATACCAATGCTAATAGTGTTACTTCCCTAGGTGc > 1:283097/1‑66 (MQ=255) cTATAATGAAGCATTAAATGACTTAAACAGTTATACCAATGCTAATAGTGTTACTTCCCTAGGTGc < 2:283097/66‑1 (MQ=255) cTATAATGAAGCATTAAATGACTTAAACAGTTATACCAATGCTAATAGTGTTACTTCCCTAGGTGCAAGACTGGCAATGTACGAAATTGGTTTAAATATATTCATAAAGTCACCTTTTTCATTTAGATCAGCAGAGTCACGCGCTGAAAGTATGAATTTGTTAGTTGCAGAACACAATAGGCTAAGAGGGGCATTGGAGTTTTCTAACg < 2:329076/209‑1 (MQ=255) cTATAATGAAGCATTAAATGACTTAAACAGTTATACCAATGCTAATAGTGTTACTTCCCTAGGTGCAAGACTGGCAATGTACGAAATTGGTTTAAATATATTCATAAAGTCACCTTTTTCATTTAGATCAGCAGAGTCACGCGCTGAAAGTATGAATTTGTTAGTTGCAGAACACAATAGGATAAGAGGGGCATTGGAGTTTTCTAACg > 1:329076/1‑209 (MQ=255) cTATAATGAAGCATTAAATGACTTAAACAGTTATACCAATGCTAATAGTGTTACTTCCCTAGGTGCAAGACTGGCAATGTACGAAATTGGTTTAAATATATTCATAAAGTCACCTTTTTAATTTAGATCACGCGATTCCCGCGCTGAAAGTACGAAATTGTTAGTTGCAGAACACAATAGGCTAAGATGGGAATTGGAGTTTTCGAACGTCAATCTAACTAATTAAATAATTAAAgagg > 1:866661/1‑236 (MQ=255) aTGAAGCATTAAATGACTTAAACAGTTATACCAATGCTAATAGTGTTACTTCCCTAGGTGCAAGACTGGCAATGTACGAAATTGGTTTAAATATATTCATAAAGTCACCTTTTTCATTTAGATCAGCAGAGTCACGCGCTGAAAGTATGAATTTGTTAGTTGCAGAACACAATAGGCTAAGAGGGGCATTGGAGTTTTCTAACGTACATCTACATAATAAGAAAATTTAAGCAGGGTc > 1:266668/1‑238 (MQ=255) aGCATTAAATGACTTAAACAGTTATACCAATGCTAATAGTGTTACTTCCCTAGGTGCAAGACTGGCAATGTACGAAATTGGTTTAAATATATTCATAAAGTCACCTTTTTCATTTAGATCAGCAGAGTCACGCGCTGAAAGTATGAATTTGTTAGTTGCAGAACACAATAGGCTAAGAGGGGCATTGGAGTTTTCTAACGTACATCTACATAATGAGTTAATGGAAGCAGGGTCACTGa > 2:486984/1‑239 (MQ=255) ttATACCAATGCTAATAGTGTTACTTCCCTAGGTGCAAGACTGGCAATGTACGAAATTGGTTTAAATATATTCATAAAGTCACCTTTTTCATTTAGATCAGCAGAGTCACGCGCTGAAAGTATGAATTTGTTAGTTGAAGAACACAATAGGCTAAGAGGGGCATTGGAGTTTTCTAACGTACATCTACATAATGAGATAATTGAAGCAGGGTCACTGAAAGGTCTGATGGGAAttttt > 2:835572/1‑238 (MQ=255) aTGCTAATAGTGTTACTTCCCTAGGTGCAAGACTGGCAATGTACGAAATTGGTTTAAATATATTCATAAAGTCACCTTTTTCATTTAGATCAGCAGAGTCACGCGCTGAAAGTATGAATTTGTTAGTTGCAGAACACaa > 1:789268/1‑139 (MQ=255) aTGCTAATAGTGTTACTTCCCTAGGTGCAAGACTGGCAATGTACGAAATTGGTTTAAATATATTCATAAAGTCACCTTTTTCATTTAGATCAGCAGAGTCACGCGCTGAAAGTATGAATTTGTTAGTTGCAGAACACaa < 2:789268/139‑1 (MQ=255) | CGCGGTACTTTATGTTCTGGCGCTAACACAAACCAGAGCAACCCTACTCCTGTTCCCTATAATTTGTGTTGCTGCATTAATAGCTTATTATAATAAATCACCCAAGAAATTCACTTCCTCTATTGTTCTACTAATTGCTATATTAGCTAGCATTGTTATTATATTTAATAAACCAATACAGAATCGCTATAATGAAGCATTAAATGACTTAAACAGTTATACCAATGCTAATAGTGTTACTTCCCTAGGTGCAAGACTGGCAATGTACGAAATTGGTTTAAATATATTCATAAAGTCACCTTTTTCATTTAGATCAGCAGAGTCACGCGCTGAAAGTATGAATTTGTTAGTTGCAGAACACAATAGGCTAAGAGGGGCATTGGAGTTTTCTAACGTACATCTACATAATGAGATAATTGAAGCAGGGTCACTGAAAGGTCTGATGGGAATTTTT > NC_000913/3797555‑3798008 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 17 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |