New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | = 2852111 | 51 (0.670) | 4 (0.050) | 4/410 | NT | 7.3% | coding (250/273 nt) | hypC | hydrogenase maturation protein |
? | NC_000913 | = 2852155 | 53 (0.720) | coding (22/1122 nt) | hypD | hydrogenase maturation protein |
TTCCCGGCCAGATCCGCACCATTGACGGCAACCAGGCGAAAGTCGACGTCTGCGGCATTCAGCGCGATGTCGATTTAACGTTAGTCGGCAGCTGCGATGAAAACGGTCAGCCGCGCGTGGGCCAGTGGGTACTGGTACACGTTGGCTTTGCCATGAGCGTAATTAATGAAGCCGAAGCACGCGACACTCTCGACGCCTTACAAAACATGTTTGACGTTGAGCCGGATGTCGGCGCGCTGTTGTATGGCGAGGAAAAATAATGCGTTTTGTTGATGAATATCGCGCGCCGGAACAGGTGATGCAGTTAATTGAGCATCTGCGCGAACGTGCTTCACATCTCTCTTACACCGCCGAACGCCCTCTGCGGATTATGGAAGTGTGTGGCGGTCATACCCACGCTATCTTTAAATTCGGCCTCGACCAGTTACTGCCGGAAAACGTTGAGTTTATCCACGGTCCGGGGTGCCCGGT > NC_000913/2851875‑2852345 | ttCCCGGCCAGATCCGCACCATTGACGGCAACCAGGCGAAAGTCGACGTCTGCGGCATTCAGCGCGATGTCGATTTAACGTTAGTCGGCAGCGGCGATGAAAACGGCCAGCCGCGCGTGGGCCAGGGGGTACTGGTACACGTTGGCTTTGCCATGAGCGAAATTAATGAGGCCGAGGCACGAGCAACCATCGCACCATTCCACAACATGTTTGGCGTTGAGCCGGAGGTCGGGGCGCgg > 2:732467‑M1/1‑237 (MQ=255) cccGGCCAGATCCGCACCATTGACGGCAACCAGGCGAAAGTCGACGTCTGCGGCATTCAGCGCGATGTCGATTTAACGTTAGTCGGCAGCTGCGATGAAAACGGTCAGCCGCGCGTGGGCCAGTGGGTACTGGTACACGTTGGCTTTGCCATGAGCGTAATTAATGAAGCCGAAGCACGCGACACTCTCGACGCCTTACAAAACATGTTTGACGTTGAGCCGGATGTCGGCGCGCtgtt > 1:887137/1‑239 (MQ=255) aTCCGCACCATTGACGGCAACCAGGCGAAAGTCGACGTCTGCGGCATTCAGCGCGATGTCGATTTAACGTTAGTCGGCAGCTGCGATGAAAACGGTCAGCCGCGCGTGGGCCAGTGGGTACTGGTACACGTTGGCTTTGCCCTGAGCGTAATTAATGAAGCCGAAGCACGCGACACTCTCGACGCCTTACCAAACATGTTTGACGTTGAGCCGGAGGTCGGCGCGCTGTTGTATGGCgc > 1:436135/1‑238 (MQ=255) aTCCGCACCATTGACGGCAACCAGGCGAAAGTCGACGTCTGCGGCATTCAGCGCGATGTCGATTTAACGTTAGTCGGCAGCTGCGATGAAAACGGTCAGCCGCGCGTGGGCCAGTGGGTACTGGTACACGTTGGCTTTGCCATGAGCGTAATTAATGAAGCCGAAGCACGCGACACTCTCGACGCCTTACAAAACATGTTTGACGGTGAGCCGGATGTAGGCGCGCTGTTGAATGGCGa > 1:549274/1‑239 (MQ=255) gcggCACCATGGCCGGCAACCGGGCGAAAGGCGTGGTCGGCGGCATTCAGCGGCATGGCGGTTTAACGTTGGGCGGCAGCTGCGATGAAAACGGTCAGCCGCGCGGGGGCCAGTGGGTACTGGTACACGTTGGCTTTGCCATGAGCGTAATTAATGAAGCCGAAGCACGCGACACTCTCGACGCCTTACAAAACAAGTTTGACGTTGAGCCGGATGTCGGCGCGCTGTTGTATGGCg < 2:200393/234‑1 (MQ=255) ttGACGGCAACCAGGCGAAAGTCGACGTCTGCGGCATTCAGCGCGATGTCGATTTAACGTTAGTCGGCAGCTGCGATGAAAACGGTCAGCCGCGCGTGGGCCAGTGGGTACTGGTACACGTTGGCTTTGCCATGAGCGTAATTAATGAAGCCGAAGCACGCGACACTCTCGACGCCTTACAAAACATGTTTGACGTTGAGCCGGATGTCGGCGCGCTGTTGTATGGCGAg > 1:740574/1‑230 (MQ=255) ttGACGGCAACCAGGCGAAAGTCGACGTCTGCGGCATTCAGCGCGATGTCGATTTAACGTTAGTCGGCAGCTGCGATGAAAACGGTCAGCCGCGCGTGGGCCAGTGGGTACTGGTACACGTTGGCTTTGCCATGAGCGTAATTAATGAAGCCGAAGCACGCGACACTCTCGACGCCTTACAAAACATGTTTGACGTTGAGCCGGATGTCGGCGCGCTGTTGTATGGCGAg < 2:740574/230‑1 (MQ=255) gccaCCGGGGGACAGTTGACGGCTGCGGAATGCAGCGCGATTGCGATTTAAGCTATGTCGGACGCTGCGATTAAAACGGTCAGGCGCGTTTGGGCCAGTGGTTACTGGTACCTGTTGTCTTTGCCAAGTGCGTAATGAATGAAGCCGAAGCACGCGACACTCTCGACGCCTTACAAAACATGTTTGACGGTGAGCCGTATGTCGGAGCGCTGTTGTATGGCGAGGAAAAATAATGCGtt < 2:688390/236‑1 (MQ=255) ccAGGCGAAAGTCGACGTCTGCGGCATTCAGCGCGATGTCGATTTAACGTTAGTCGGCAGCTGCGCTGAAAACGGTCAGCCGCGCGTGGGCCAGTGGGTACTGGTACACGTTGGCTTTGCCATGGGCGTAATTAATGAAGCCGAAGCACGCGACACTCTCGACGCCTTACAAAACATGTTTGACGTTGAGCCGGATGGCGGCGGGCTGTTGTTTTGCGAGGAAAAATAATGCGTTttgt > 1:580467/1‑239 (MQ=255) ccAGGCGAAAGTCGACGTCTGCGGCATTCAGCGCGATGTCGATTTAACGTTAGTCGGCAGCTGCGATGAAAACGGTCAGCCGCGCGTGGGCCAGTGGGTACTGGTACACGTTGGCTTTGCCATGAGCGTAATTAATGAAGCCGAAGCACGCGACACTCTCGACGCCTTACAGACCATGTTTGTCGTTGAGCCGGATGACGGCCCGCGCTTGTATGGCGAGGAAAAATAATGCGTAttgt > 1:412097/1‑239 (MQ=255) cAGGCGAAAGTGGACGTGTGCGGAATTCCGGGCGAGGTCGATTTAACGTTGATCGGCAGCTGCGATGAAAACGGTCAGCCGCGGGTGGGCCAGTGGGTACTGGTACACGTTGGCTTTGCCATGAGCGTAATTAATGAAGCCGAAGCACGCGACACTCTCGACGCCTTACAAAACATGTTTGACGTTGAGCCGGATGTCGGCGCGCgatattcatcaacaaaacgcattatttttcctcg < 2:634375‑M1/239‑35 (MQ=255) gTCTGCGGAATTCAGCTCTTTGTGGATTTAAGGTTAGTCGGCAGGTTAGATGAAAACGGTCAGCCCGGCGTGGGCCAGTGGGTACTGGTACACGTTGGATTTGCCATGAGCGTAATTAATGAAGCCGAAGCACGCGACACTCTCGACGCCTTACAAAACATGTTTGACGTTGAGCCGGATGTCGGCGCGCTGTTGTATGGCGAGGAAAAATAATGCGTTTTGTTGATGAATATCgcgc > 2:10305‑M2/1‑234 (MQ=255) cTGCGGCATTCAGCGCGATGTCGATTTAACGTTAGTCGGCAGCTGCGATGAAAACGGTCAGCCGCGCGTGGGCCAGTGGGTACTGGTACACGTTGGCTTTGCCATGAGCGTAATTAATGAAGCCGAAGCACGCGACACTCTCGACGCCTTACAAAACCTGTTTGACGTTGAGCCGGATGTCGGCGCGCTGTTGTATGGCGCGGAAAAAAAATGCGTTTTTTTGATGAATAACgcgcccc < 2:906786‑M2/239‑8 (MQ=255) gtttgggggttatttCGATTTTATGTTAGTCGCCGGGTGGGATGTAATCGGTCAGCCGGCCGTGGGTCAGTGGGTACTGGTACACGTTGGTGTTTCCATGAGCGTAATTAGTGAAGGCGGAGCACGCGACACTCTCGACGCCTTGCAAATCATGTATGACGTTGAGCCGGATGTCGGCGCGCCGTTATATGGCGAGGAAAAATAATGCGTTTTGTTGATGAATATCGCGCGCCGGAAc < 2:806/224‑1 (MQ=255) ctggctcgttttcgtttAACGTTAGGCGGGAGCTGCGATGAAAACGGTGCGCCGCGTGTGGGCTAGTGGGTACTGGGACACGTTGGCTTTGCCATGAGCGTAATTAATGAAGCCGAAGCACGCGACACTCTCGACGCCTTACAAAACATGTTTGACGTTGAGCCGGATGTCGGCGCGCTGTTGTATGGCGAGGAAAAATAATGCGTTTTGTTGATGAATATCGCGCGCCGGAACAGGTg < 2:121512/225‑1 (MQ=255) tGTCGATTTAACGTTAGTCGGCAGCTGCGATGAAAACGGTCAGCCGCGCGTGGGCCAGTGGGTACTGGTACACGTTGGCTTTGCCATGAGCGTAATTAATGAAGCCGAAGCACGCGACACTCCCGACCCCTTACAAAACATTTTTGACGTTGAGCCGACAGTCGGCGCGCTGTTGGATGGAGAGGTAAAATAATGCGTTTTTTTTCTGAAATAGGCCCGCCGGaaaggggagggcggct > 2:622347/1‑225 (MQ=255) ttAACGTTAGTCGGCAGCTGCGATGAAAACGGTCAGCCGCGCGTGGGCCAGTGGGTACTGGTACACGTTGGCTTTGCCATGAGCGTAATTAATGAAGCCGAAGCACGCGACACTCTCGACGCCTTACAAAACATGTTTGACGTTGAGCCGGATGTCGGCGCGCTGTTGTATGGCGAGGAAAAATAATGCGTTTTGTTGATGAAGATCGCGCGCCGGAACAGGTGATGCAGTTAAtt < 1:732467/236‑1 (MQ=255) acgttggtggggggtgggggtGAAAACGGTCAGCCGGGGGGGGGGCAGTGGGTACTGGTACACGTTGGCTTTGCCATGAGGGTAATTAATGAAGCCGAAGCACGCGACCCTCTCGACGCCTTAAAAAACATGTTTGACGTTGAGCCGGATGTCGGCGCGCTGTTGTATGGCGAGGAAAAATAATGCGTTTTGGTGATGAATATCGCGCGCCGGAACAGGTGATGCAGTTAATTGAGCAt < 2:615093/219‑1 (MQ=255) cGTTAGTCGGCAGCTGCGATGAAAACGGTCAGCCGCGCGTGGGCCAGTGGGTACTGGTACACGTTGGCTTTGCCATGAGCGTAATTAATGAAGCCGAAGCACGCGACACTCTCGACGCCTTACAAAACATGTTTGACGTTGAGCCGGATGTCGGCGCGCTGTTGTATGGCGAGGAAAAATAATGCGTTTTGTTGATGAATATCGCGCGCCGGAACAGGGGATGCAGTTAATTGGACATc > 2:863297/1‑239 (MQ=255) cgttggcagcttgagtgaaaagggtcagccgGGCGTGGGCCGGTGGGTAGGGGTACACGTTGGCTTGGGCATGAGCGTAATTGATGAAGCCGAAGCACGCGACACTCTCGAGGCGTTACAAAACATGTTTGACGTTGAGCCGGATGTCGGCGCGCTGTTGTATGGCGAGGAAAAATAATGCGTTTTGTTGATGAATATCgcgcgccgacatccggctcaacgtcaaacatgttttgtaa > 2:436135‑M2/16‑199 (MQ=255) ggCAGATGCGATGAAAACGGTCAGCCGCGGGTGGGCCAGTGGGTACTGGTACACGTTGGCTTTGCCATGAGCGTAATTAATGAAGCCGAAGCACGCGACACTCTCGACGCCTTACAAAACATGTTTGACGTTGAGCCGGATGTCGGCGCGCTGTTGTATGGCGAGGAAAAATAATGCGTTTTGTTGATGAATATCGCGCGCCGGAACAGGTGATGCAGTTAATTGAGCATCTGCGCGa < 1:367014/238‑1 (MQ=255) cAGCTGCGATGAAAACGGTCAGCCGCGCGTGGGCCAGTGGGTACTGGTACACGTTGGCTTTGCCATGAGCGTAATTAATGAAGCCGAAGCACGCGACACTCTCGACGCCTTACAAAACATGTTTGACGTTGAGCCGGATGTCGGCGCGCTGTTGTATGGCGAGGAAAAATAATGCGTTTTGTTGATGAATATCGCGCGCCGGAACAGGTGATGCAGTTAATTGAGCATCTGCGCGAACg > 1:487770/1‑239 (MQ=255) cgggggcggTGGGCCGGTGGGGTCTGGTCAAGGTTGGGTTTGCCATGGGGTTAATTAAGGCAGGCGAAGCACCCGGCTCTCTCGGCGCTTTAAAAAACATGTTTGACGTTGAGCCGGAGGTCGGCGCGCTGTTGTATGGCGAGGAAAAATAATGCGTTTTGTTGATGAATATCGCGCGCCGGAACAGGTGATGCAGTTAATTGAGCATCTGCGCGAACGTGCTTCACATCTCTCTTaca < 2:644333/231‑1 (MQ=255) aGCCGCGCGTGGGCCAGTGGGTACTGGTACACGTTGGCTTTGCCATGAGCGTAATTAATGAAGCCGAAGCGCGCGACACTCTCGACGCCTTACAAAACATGTTTGACGTTGAGCCGGATGTCGGCGCGCTGTTGTATGGCGCGGCAAAATAATGCGTTTTGTTGATGAATATCGCGCCCCGGAACAGGGGATGAAGTTAATTGGGACTCTGCGCAAACGGGCTTcacaaacacattaa > 2:348370/1‑228 (MQ=255) aCTGGTACACGTTGGCTTTGCCATGAGCGTAATTAATGAAGCCGAAGCACGCGACACTCTCGACGCCTTACAAAACATGTTTGACGTTGAGCCGGATGTCGGCGCGCgatattcatcaacaaaacgcattatttttcctcgccatacaacagcg > 1:895012‑M1/1‑107 (MQ=255) aCTGGTACACGTTGGCTTTGCCATGAGCGTAATTAATGAAGCCGAAGCACGCGACACTCTCGACGCCTTACAAAACATGTTTGACGTTGAGCCGGATGTCGGCGCGCTGTTGTATGGCGAGGAAAAATAATGCGTTTTGTTGATGAATATCGCGCGCCGGTACAGGTGATGCAGTTAATTGAGCATCTCGGCGAACGGGCTTCAAAACCCTTTTAAACCGCCGCACAcccccccgggat > 2:907970/1‑230 (MQ=255) aCTGGTACACGTTGGCTTTGCCATGAGCGTAATTAATGAAGCCGAAGCACGCGACACTCTCGACGCCTTACAAAACATGTTTGACGTTGAGCCGGATGTCGGCGCGCTGTTGTATGGCGAGGAAAAATAATGCGTTTTGTTGATGAATATCCCGCGCCGGAACAGGTGATGCAGTTAATTGAGCATCTCCGCGAACGTGCTTCACTTCTCTCTTCCACCGCCGACCGCCCTCTGCggtt > 1:440599/1‑237 (MQ=255) aCTGGTACACGTTGGCTTTGCCATGAGCGGAATTAATGAAGCCGAAGCACGCGACACTCTCGAAGCCTTACAAAACATGTTTGACGTTGAGCCGGATGTCGGCGCGCgatattcatcaacaaaacgcattatttttcctcgccatacaacagcg < 2:895012‑M1/154‑48 (MQ=255) gtaccggTTGGTTTTGCCATGGGAGTAATTAATGAAGCCGAAGACGGGGACCCTCTTGACGCGTTACAAAACATGTTTGACGTTGGGCCGGATGTCGGCGCGCTGTTGTATGGCGAGGAAAAATAATGCGTTTTGTTGATGAATATCGCGCGCCGGAACAGGTGATGCAGTTAATTGAGCATCTGCGCGAACGTGCTTCACATCTCTCTTACACCGCCGAACGCCCTCTGCGGATTATg < 2:846839/233‑1 (MQ=255) cacGTTGGCTTTGCCATGGGCGTAATTAATGAAGCCGAAGCACGCGACACTCTCGACGCCTTACAAAACATGTTTGACGTTGAGCCGGATGTCGGCGCGCTGTTGTATGGCGAGGAAAAATAATGCGTTTTGTTGATGAATATCGCGCGCCGGAACAGGTGATGCAGTTAATTGAGCATCTGCGCGAACGTGCTTCACATCTCTCTTACACCGCCGAACGCCCTCTGCGGATTATGGaa < 1:906786/239‑1 (MQ=255) cGTTGGCTTTGCCATGAGCGTAATTAATGAAGCCGAAGCACGCGACACTCTCGACGCCTTACAAAACATGTTTGACGTTGAGCCGGATGTCGGCGCGCTGTTGTATGGCGAGGAAAAATAATGCGTTTTGTTGATGAATATCGCGCGCCGGAACAGGTGATGCAGTTAATTGGGCATCTGCGCGAACGTGCTTCACATCTCTCTTACACCGCCGAACGCCctct > 2:585010/1‑224 (MQ=255) cGTTGGCTTTGCCATGAGCGTAATTAATGAAGCCGAAGCACGCGACACTCTCGACGCCTTACAAAACATGTTTGACGTTGAGCCGGATGTCGGCGCGCTGTTGTATGGCGAGGAAAAATAATGCGTTTTGTTGATGAATATCGCGCGCCGGAACAGGTGATGCAGTTAATTGAGCATCTGCGCGAACGTGCTTCACATCTCTCTTACACCGCCGAACGCCctct < 1:585010/224‑1 (MQ=255) cGTTGGCTTTGCCATGAGCGTAATTAATGAAGCCGAAGCACGCGACACTCTCGACGCCTTACAAAACATGTTTGACGTTGAGCCGGATGTCGGCGCGCTGTTGTATGGCGAGGAAAAATAATGCGTTTTGTTGATGAATATCGCGCGCCGGAACAGGTGATGCAGTTAATTGAGCATCTGCGCGAACGTGCTTCACATCACTCTTACACCTCCGAACGCCCTCTGCGGGTATTGGAAgt > 1:278799/1‑239 (MQ=255) tGGCTTTGCCATGAGCGTAATTAATGAAGCCGAAGCACGCGACACTCTCGACGCCTTACAAAACATGTTTGACGTTGAGCCGGATGTCGGCGCGCTGTTGTATGGCGAGGAAAAATAATGCGTTTTGTTGATGAATATCGCGCGCCGGAACAGGTGATGCAGTTAATTGAGCATCTGCGCGAACGGGCTTCACATCTCTCTTACCCCCCCGAACCCCCCCTGCGGTTTAAGGaaagggg > 2:789952/1‑234 (MQ=255) tttGCCAGGAGCGTAATTAATGAAGCCGAAGCACGCGACACTCTCGACGCCTTACAAAACATGTTTGACGTTGAGCCGGATGTCGGCGCGCTGTTGTATGGCGAGGAAAAATAATGCGTTTTGTTGATGAATATCGCGCGCCGGAACAGGTGATGCAGTTAATTGAGCATCTGCGCGAACGTGCTTCACATCTCTCTTACACCGCCGAACGCCCTCTGCGGATTATGGAAGTGTGTgg < 1:736026/238‑1 (MQ=255) tGCCATGAGCGTAATTAATGAAGCCGAAGCACGCGACACTCTCGACGCCTTACAAAACATGTTTGACGTTGAGCCGGATGTCGGCGCGCTGTTGTATGGCGAGGAAAAATAATGCGTTTTGTTGATGAATATCGCGCGCCGGAACAGGGGATGCAGTTAATTGAGCATTTGCCCGAACGGGCTTCCCATCCCTCTTAAACCGCCAGACGCCCCCTCGGGATTTTGGAAGGGGGTGgggg > 2:804054/1‑239 (MQ=255) aGCGTAATTAATGAAGCCGAAGCACGCGACACTCTCGACGCCTTACAAAACATGTTTGACGTTGAGCCGGATGTCGGCGCGCTGTTGTATGGCGAGGAAAAATAATGCGTTTTGTTGATGAATATCGCGCGCCGGAACAGGTGATGCAGTTAATTGAGCATCTGCGCGAACGTGCTTCACATCTCTCTTACACCGCCGAACGCCCTCTGCGGATTAGGGAAGTGTGGGGCGGTccaac > 2:869698/1‑234 (MQ=255) aattaatGAAGCCGAAGCACGCGACACTCTCGACGCCTTACAAAACATGTTTGACGTTGAGCCGGATGTCGGCGCGCTGTTGTATGGCGAGGAAAAATAATGCGTTTTGTTGATGAATATCGCGCGCCGGAACAGGTGAt < 2:98095/140‑1 (MQ=255) aattaatGAAGCCGAAGCACGCGACACTCTCGACGCCTTACAAAACATGTTTGACGTTGAGCCGGATGTCGGCGCGCTGTTGTATGGCGAGGAAAAATAATGCGTTTTGTTGATGAATATCGCGCGCCGGAACAGGTGAt > 1:98095/1‑140 (MQ=255) aattaatGAAGCCGAAGCACGCGACACTCTCGACGCCTTACAAAACATGTTTGACGTTGAGCCGGATGTCGGCGCGCTGTTGTATGGCGAGGAAAAATAATGCGTTTTGTTGATGAATATCGCGCGCCGGAACAGGTGATGCAGTTAATTGAGCATCTGCGCGAACGTGCTTCACATCTCTCTTACACCGCCGAACGCCCTCTGCGGATTATGGAAGTGTGTGGCGGTCATACCCACg < 1:804054/238‑1 (MQ=255) aattaatGAAGCCGAAGCACGCGACACTCTCGACGCCTTACAAAACATGTTTGACGTTGAGCCGGATGTCGGCGCGCTGTTGTATGGCGAGGAAAAATAATGCGTTTTGTTGATGAATATCGCGCGCCGGAACAGGGGATGCAGTTAATTGAGCATCTGCGGGAACGGGCTTCCCATCCCTCTTACACCGCCCACAGCCCTCGGCGGCGTTTGGAAGGGGGGGGCGGTCAATCCCAccg > 2:889996/1‑237 (MQ=255) attaatGAAGCCGAAGCACGCGACACTCTCGACGCCTTACAAAACATGTTTGACGTTGAGCCGGATGTCGGCGCGCTGTTGTATGGCGAGGAAAAATAATGCGTTTTGTTGATGAATATCGCGCGCCGGAACAGGTGATGCAGTTAATTGAGCATCTGCGCGAACGTGCTTCACATCTCTCTTACACCGCCGAACGCCCTCTGCGGATTATGGAAGTGTGTGGCGGTCATACCCACGCt < 1:863297/239‑1 (MQ=255) ttaatGAAGCCGAAGCACGCGACACTCTCGACGCCTTACAAAACATGTTTGACGTTGAGCCGGATGTCGGCGCGCTGTTGTATGGCGAGGAAAAATAATGCGTTTTGTTGATGAATATCGCGCGCCGGAACAGGTGATGCAGTTAATTGAGCATCTGCGCGAACGTGCTTCACATCTCTCTTAAACTGCCGAACGCCCTCTGCGGGTTATGGAAGTGTGTGGCGGTCATACCCCCGCtt > 1:539675/1‑238 (MQ=255) gCCGAAGCACGCGACACTCTCGACGCCTTACAAAACATGTTTGACGTTGAGCCGGATGTCGGCGCGCTGTTGTATGGCGAGGAAAAATAATGCGTTTTGTTGATGAATATCGCGCGCCGGAACAGTGGATGAAGTTAATTGCGCCTCTCCGCGAACGTGCTTCACATCTCTCTTACCCCGCCGAACGCCCTCTGCGGATTATGGAAGAGGTTGGCGGTACCACCAACCCCATCTTTaaa > 2:434442/1‑239 (MQ=255) aCGGGACACTCTCGACGCATTACAAAACCTTTTTGACGTTGAGCCGGATGTCGGCGCGCTGTTGTATGGCGAGTAAAAATAATGCGTTTTGTTGATGAATATCGCGCGCCGGAACAGGTGATGCAGTTAATTGAGCATCTGCGCGAACGTGCTTCACATCGCTCTTACACCGCCGAACGCCCTCTGCGGATTATGGAAGTGTGTGGCGGTCATACCCACGCTATCTTTAAATTCGGCCt < 2:539675/239‑1 (MQ=255) ttACAAAACATGTTTGACGTTGAGCCGGATGTCGGCGCGCgatattcatcaacaaaacgcattatttttcctcgccatacaacagcgcgccgacatccggctcaacgtcaaacatgttttgtaacgcctcgagagtgtcgcgtgcttcggcttcatcaattacgctcatgcccaagccaacgtgtacccctacccaccggcccacgcccggctgacccttttcactcaagctgccaacg > 2:436135‑M1/1‑40 (MQ=255) ttACAAAACATGTTTGACGTTGAGCCGGATGTCGGCGCGCTGTTGTATGGCGAGGAAAAATAATGCGTTTTGTTGATGAATATCGCGCGCCGGAACAGGTGATGCAGTTAATTGAGCATCTGCGCGAACGTGCTTCACATCTCTCTTACACAGCCGAACGCCCTCTGCGGATTATGGAAGTGTGTGGCGGTCACACCCCCCCGCTCTTTAAATTCTGCCCCACCCAGTTCATCCCGGaa > 2:175560/1‑239 (MQ=255) tgtttttGAGTTTGTGCGGGGTGTGGGGGCGCTGTTGGAGGGGGAGGAAAAATAATGGGTGTGGTTGATGAATATCGCGCGCCGGAACAGGTGATGCAGTTAATTGAGCATCTGCGCGAACGTGCTTCACATCTCTCTTACACCGCCGAACGCCCTCTGCGGATTCTGGAAGTGTGTGGCGGTCATACCCACGCTATCTTTAAATTCGGCCTCGACCAGTTACTGCCGGAAAACGt < 2:364754/232‑1 (MQ=255) aTGTTTGACGTTGAGCCGGATGTCGGCGCGCTGTTGGATGGAGAAGAAAAATAAGGCGTTTTGTTGATGAATATCGCGGGCCGGAACAGGTGAGTCAGTTAATGGAGCATCTGCGCTAACGTGCTTCACATCTCTCTTACACCGCCGAACGCCCTCTGCGGATTATGGAAGTGTGTGGCGGTCATACCCACGCTATCTTTAAATTCGGCCTCGACCAGTTACTGCCGGAAAACGTTGAg < 1:181973/239‑1 (MQ=255) gTTTGACGTTGAGCCGGATGTCGGCGCGCTGTTGTATGGCGAGGAAAAATAATGCGTTTTGTTGATGAATATCGCGCGCCGGa > 2:414835/1‑83 (MQ=255) gTTTGACGTTGAGCCGGATGTCGGCGCGCTGTTGTATGGCGAGGAAAAATAATGCGTTTTGTTGATGAATATCGCGCGCCGGa < 1:414835/83‑1 (MQ=255) gTTTGACGTTGAGCCGGATGTCGGCGCGCTGTTGTATGGCGAGGAAAAATAATGCGTTTTGTTGATGAATATCGCGCGCCGGAACAGGTGATGCAGTTAATTGAGCATCTGCGCGAACGTGCTTCACATCTCTCTTACACCCCCGAACGCCCTCTGCGGATTATGGAAGTGTGGGGCGGCCATACCCCCGCCATCTTTAAATTCAGCGCCGACCAGGTAAGTCCGGAAAAAGGTGAGtt > 2:204517/1‑239 (MQ=255) ttGACGTTGAGCCGGATGTCGGCGCGCTGTTGTATGGCGAGGAAAAATAATGCGTTTTGTTGATGAATATCGCGCGCCGGAACAGGTGATGCAGTTAATTGAGCATCTGCGCGAACGTGCTTCACATCTCTCTTACACCGCCGAACGCCCTCTGCGGATTATGGAAGTGTGTGGCGGTCATACCCACGCTATCTTTAAATTCGGCCTCGACCAGTTACTGCCGGAAAACGTTGAGtttt > 1:754215/1‑238 (MQ=255) ccggtggggcggtgggcGGCGCGCTGTTGTCTTGCGAGGAAAAATAATGCGTTTTGTTGATTAATCTGGGGCGCCGGAACAGGTGATTCAGTTAAGTGAGCATCTGGGCGAACGTGCTTACCATCTCGCTTACACCGCCGAACGCCCTCTGCGGATTATGGAAGTGTGTGGCGGTCATACCCACGCTATCTTTAAATTCGGCCTCGACCCGTTACTGCCGGAAAACGTTGAGTTTATcc < 2:781687/223‑1 (MQ=255) agtgtgggcgggttttCGGGGCGCTTTTGTATGGGGAGGAAAAATAATGCTTTTTGGGGATGAATAACGCGCGCCGGAACAAGTGATGCAGTTAATTGAGCATCTGCGCGGACGTGCTTCACATCTCTCTTACACCGCCGAACGCCCTCTGCGGATTATGGAAGTGTGTGGCGGTCATACCCACGCTATCTTTAAATTCGGCCTCGACCAGTTACTGCCGGAAAACGTTGAGTTTATcc < 2:419020/224‑1 (MQ=255) cGTTGAGCCGGATGGCGGCGGGCTGTTGTATGGCGAGGAAAAATAATGCGTTTTGTTGATGAATATCGCGCGCCGGAACAGGTGATGCAGTTAATTGAGCATCTGCGCGAACGTGCTTCACATCTCTCTTACACCGCCGAACGCCCTCTGCGGATTATGGAAGTGTGTGGCGGTCATACCCACGCTATCTTTAAATTCGGCCTCGACCAGTTACTGCCGGAAAACGTTGAGTTTATcc < 1:789952/238‑1 (MQ=255) gtggAGCCGGATGTCGGCGCGCTGTTGGATGGCGAGGAAAAATAATGCGTTTTGTTGATGAATATCGCGCGCCGGAACAGGTGATGCAGTTAATTGAGCATCTGCGCGAACGTGCTTCACATCTCTCTTACACCGCCGAACGCCCTCTGCGGATTATGGAAGTGTGTGGCGGTCATACCCACGCTATCTTTAAATTCGGCCTCGACCAGTTACTGCCGGAAAACGTTGAGTTTATCCa < 1:622347/235‑1 (MQ=255) gTTGAGCCGGATGTCGGCGCGCTGTTGTATGGCGAGGAAAAATAATGCGTTTTGTTGATGAATATCGCGCGCCGGAACAGGTGATGCAGTTAATTGGGCATCTGCGCGAACGTGCTTCACATCTCTCTTACACCGCCGAACGCCCTCTGCGGATTATGGAAGTGTGTGGCGGTCATACCCACGCTATCTTTAAATTCGGCCTCGACCAGTTACTGCCGGAAAACGTTGAGTTTATCCa < 1:907970/238‑1 (MQ=255) gTTGAGCCGGATGTCGGCGCGCTGTTGTATGGCGAGGAAAAATAATGCGTTTTGTTGATGAATATCGCGCGCCGGAACAGGTGATGCAGTTAATTGAGCATCTGCGCGAACGTGCTTCACATCTCTCTTACACCGCCGAACGCCCTCTGCGGATTTTGGAAGGGTGTGGCGGGCTCACCCCCGCTATCTTCTAATTCGGCCCCGCCCAGTTAATGCCGGAAAACGATGAGtttcatcct > 1:364754/1‑233 (MQ=255) gggCGCGCTTTTTTAAGGGGAGGAAAAATAAGGGGTTTTGTTTATGAATTACGCGCGCCGGAACAGGTGATGCAGTTAATTGAGCATCTGCGGGAACGTGCTTCACATCTCTCTTACACCGCCGAACGCCCTCTGCGGATTATGGAAGTGTGTGGCGGTCATACCCACGCTATCTTTAAATTCGGCCTCGACCAGTTACTGCCGGAAAACGTTGAGTTTATCCACGGTCCGGGGTGccc < 2:487770/238‑1 (MQ=255) ggggcgcgttattcatcaaaaaaacgcattttttttccgcgccatacaacagcgcgccgacatccggctcaacgtcaaacaggttttgtaaggcgtcgagagtgtcgcgtgcttcggcttcattaattacgctcatggcaaagccaacgtgtaccagtacccactggcccacgcgcggctgaccgttttcatcgcagctgccgactaacgttaaatcgacatcgcgctgaatgccgcag < 2:906786‑M1/236‑233 (MQ=255) gcgcgatattcatcaacaaaacgcattatttttcctcgccatacaacagcgcgccgacatccggctcaacgtcaaacatgttttgtaaggcgtcgagagtgtcgcgtgcttcggcttcattaattacgctcatggcaaatccaacgtgtaccagtacccactggcccacgccgggctgaccgttttcatctaacctgccgactaaccttaaatccacaaagagctgaattccgcagac > 2:10305‑M1/1‑4 (MQ=255) cgcTGTTGTATGGCGAGGAAAAATAATGCGTTTTGTTGATGAATATCgcgcgccgacatccggctcaacgtcaaacatgttttgtaaggcttcgagagtgtcgcgtgcttcggcttcattaattccgctcatggcaaagccaacgtgtaccagt < 2:895012‑M2/154‑108 (MQ=255) cgcTGTTGTATGGCGAGGAAAAATAATGCGTTTTGTTGATGAATATCgcgcgccgacatccggctcaacgtcaaacatgttttgtaaggcgtcgagagtgtcgcgtgcttcggcttcattaattacgctcatggcaaagccaacgtgtaccagt > 1:895012‑M2/1‑47 (MQ=255) | TTCCCGGCCAGATCCGCACCATTGACGGCAACCAGGCGAAAGTCGACGTCTGCGGCATTCAGCGCGATGTCGATTTAACGTTAGTCGGCAGCTGCGATGAAAACGGTCAGCCGCGCGTGGGCCAGTGGGTACTGGTACACGTTGGCTTTGCCATGAGCGTAATTAATGAAGCCGAAGCACGCGACACTCTCGACGCCTTACAAAACATGTTTGACGTTGAGCCGGATGTCGGCGCGCTGTTGTATGGCGAGGAAAAATAATGCGTTTTGTTGATGAATATCGCGCGCCGGAACAGGTGATGCAGTTAATTGAGCATCTGCGCGAACGTGCTTCACATCTCTCTTACACCGCCGAACGCCCTCTGCGGATTATGGAAGTGTGTGGCGGTCATACCCACGCTATCTTTAAATTCGGCCTCGACCAGTTACTGCCGGAAAACGTTGAGTTTATCCACGGTCCGGGGTGCCCGGT > NC_000913/2851875‑2852345 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |