| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | NC_000913 | = 2852111 | 51 (0.670) | 4 (0.050) | 4/410 | NT | 7.3% | coding (250/273 nt) | hypC | hydrogenase maturation protein |
| ? | NC_000913 | = 2852155 | 53 (0.720) | coding (22/1122 nt) | hypD | hydrogenase maturation protein | |||||
GTCTGCGGCATTCAGCGCGATGTCGATTTAACGTTAGTCGGCAGCTGCGATGAAAACGGTCAGCCGCGCGTGGGCCAGTGGGTACTGGTACACGTTGGCTTTGCCATGAGCGTAATTAATGAAGCCGAAGCACGCGACACTCTCGACGCCTTACAAAACATGTTTGACGTTGAGCCGGATGTCGGCGCGCTGTTGTATGGCGAGGAAAAATAATGCGTTTTGTTGATGAATATCGCGCGCCGGAACAGGTGATGCAGTTAATTGAGCATCTGCGCGAACGTGCTTCACATCTCTCTTACACCGCCGAACGCCCTCTGCGGATTATGGAAGTGTGTGGCGGTCATACCCACGCTATCTTTAAATTCGGCCTCGACCAGTTACTGCCGGAAAACGTTGAGTTTATCCACGGTCCGGGGTGCCCGGTGTGCGTACTGCCGATGGGTAGAATCGACACCTGCGTGGAGATTGCCA > NC_000913/2851922‑2852392 | gTCTGCGGAATTCAGCTCTTTGTGGATTTAAGGTTAGTCGGCAGGTTAGATGAAAACGGTCAGCCCGGCGTGGGCCAGTGGGTACTGGTACACGTTGGATTTGCCATGAGCGTAATTAATGAAGCCGAAGCACGCGACACTCTCGACGCCTTACAAAACATGTTTGACGTTGAGCCGGATGTCGGCGCGCTGTTGTATGGCGAGGAAAAATAATGCGTTTTGTTGATGAATATCgcgc > 2:10305‑M2/1‑234 (MQ=255) 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tGTCGATTTAACGTTAGTCGGCAGCTGCGATGAAAACGGTCAGCCGCGCGTGGGCCAGTGGGTACTGGTACACGTTGGCTTTGCCATGAGCGTAATTAATGAAGCCGAAGCACGCGACACTCCCGACCCCTTACAAAACATTTTTGACGTTGAGCCGACAGTCGGCGCGCTGTTGGATGGAGAGGTAAAATAATGCGTTTTTTTTCTGAAATAGGCCCGCCGGaaaggggagggcggct > 2:622347/1‑225 (MQ=255) ttAACGTTAGTCGGCAGCTGCGATGAAAACGGTCAGCCGCGCGTGGGCCAGTGGGTACTGGTACACGTTGGCTTTGCCATGAGCGTAATTAATGAAGCCGAAGCACGCGACACTCTCGACGCCTTACAAAACATGTTTGACGTTGAGCCGGATGTCGGCGCGCTGTTGTATGGCGAGGAAAAATAATGCGTTTTGTTGATGAAGATCGCGCGCCGGAACAGGTGATGCAGTTAAtt < 1:732467/236‑1 (MQ=255) acgttggtggggggtgggggtGAAAACGGTCAGCCGGGGGGGGGGCAGTGGGTACTGGTACACGTTGGCTTTGCCATGAGGGTAATTAATGAAGCCGAAGCACGCGACCCTCTCGACGCCTTAAAAAACATGTTTGACGTTGAGCCGGATGTCGGCGCGCTGTTGTATGGCGAGGAAAAATAATGCGTTTTGGTGATGAATATCGCGCGCCGGAACAGGTGATGCAGTTAATTGAGCAt < 2:615093/219‑1 (MQ=255) cGTTAGTCGGCAGCTGCGATGAAAACGGTCAGCCGCGCGTGGGCCAGTGGGTACTGGTACACGTTGGCTTTGCCATGAGCGTAATTAATGAAGCCGAAGCACGCGACACTCTCGACGCCTTACAAAACATGTTTGACGTTGAGCCGGATGTCGGCGCGCTGTTGTATGGCGAGGAAAAATAATGCGTTTTGTTGATGAATATCGCGCGCCGGAACAGGGGATGCAGTTAATTGGACATc > 2:863297/1‑239 (MQ=255) cgttggcagcttgagtgaaaagggtcagccgGGCGTGGGCCGGTGGGTAGGGGTACACGTTGGCTTGGGCATGAGCGTAATTGATGAAGCCGAAGCACGCGACACTCTCGAGGCGTTACAAAACATGTTTGACGTTGAGCCGGATGTCGGCGCGCTGTTGTATGGCGAGGAAAAATAATGCGTTTTGTTGATGAATATCgcgcgccgacatccggctcaacgtcaaacatgttttgtaa > 2:436135‑M2/16‑199 (MQ=255) ggCAGATGCGATGAAAACGGTCAGCCGCGGGTGGGCCAGTGGGTACTGGTACACGTTGGCTTTGCCATGAGCGTAATTAATGAAGCCGAAGCACGCGACACTCTCGACGCCTTACAAAACATGTTTGACGTTGAGCCGGATGTCGGCGCGCTGTTGTATGGCGAGGAAAAATAATGCGTTTTGTTGATGAATATCGCGCGCCGGAACAGGTGATGCAGTTAATTGAGCATCTGCGCGa < 1:367014/238‑1 (MQ=255) cAGCTGCGATGAAAACGGTCAGCCGCGCGTGGGCCAGTGGGTACTGGTACACGTTGGCTTTGCCATGAGCGTAATTAATGAAGCCGAAGCACGCGACACTCTCGACGCCTTACAAAACATGTTTGACGTTGAGCCGGATGTCGGCGCGCTGTTGTATGGCGAGGAAAAATAATGCGTTTTGTTGATGAATATCGCGCGCCGGAACAGGTGATGCAGTTAATTGAGCATCTGCGCGAACg > 1:487770/1‑239 (MQ=255) cgggggcggTGGGCCGGTGGGGTCTGGTCAAGGTTGGGTTTGCCATGGGGTTAATTAAGGCAGGCGAAGCACCCGGCTCTCTCGGCGCTTTAAAAAACATGTTTGACGTTGAGCCGGAGGTCGGCGCGCTGTTGTATGGCGAGGAAAAATAATGCGTTTTGTTGATGAATATCGCGCGCCGGAACAGGTGATGCAGTTAATTGAGCATCTGCGCGAACGTGCTTCACATCTCTCTTaca < 2:644333/231‑1 (MQ=255) aGCCGCGCGTGGGCCAGTGGGTACTGGTACACGTTGGCTTTGCCATGAGCGTAATTAATGAAGCCGAAGCGCGCGACACTCTCGACGCCTTACAAAACATGTTTGACGTTGAGCCGGATGTCGGCGCGCTGTTGTATGGCGCGGCAAAATAATGCGTTTTGTTGATGAATATCGCGCCCCGGAACAGGGGATGAAGTTAATTGGGACTCTGCGCAAACGGGCTTcacaaacacattaa > 2:348370/1‑228 (MQ=255) 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cGTTGGCTTTGCCATGAGCGTAATTAATGAAGCCGAAGCACGCGACACTCTCGACGCCTTACAAAACATGTTTGACGTTGAGCCGGATGTCGGCGCGCTGTTGTATGGCGAGGAAAAATAATGCGTTTTGTTGATGAATATCGCGCGCCGGAACAGGTGATGCAGTTAATTGAGCATCTGCGCGAACGTGCTTCACATCACTCTTACACCTCCGAACGCCCTCTGCGGGTATTGGAAgt > 1:278799/1‑239 (MQ=255) tGGCTTTGCCATGAGCGTAATTAATGAAGCCGAAGCACGCGACACTCTCGACGCCTTACAAAACATGTTTGACGTTGAGCCGGATGTCGGCGCGCTGTTGTATGGCGAGGAAAAATAATGCGTTTTGTTGATGAATATCGCGCGCCGGAACAGGTGATGCAGTTAATTGAGCATCTGCGCGAACGGGCTTCACATCTCTCTTACCCCCCCGAACCCCCCCTGCGGTTTAAGGaaagggg > 2:789952/1‑234 (MQ=255) tttGCCAGGAGCGTAATTAATGAAGCCGAAGCACGCGACACTCTCGACGCCTTACAAAACATGTTTGACGTTGAGCCGGATGTCGGCGCGCTGTTGTATGGCGAGGAAAAATAATGCGTTTTGTTGATGAATATCGCGCGCCGGAACAGGTGATGCAGTTAATTGAGCATCTGCGCGAACGTGCTTCACATCTCTCTTACACCGCCGAACGCCCTCTGCGGATTATGGAAGTGTGTgg < 1:736026/238‑1 (MQ=255) 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aattaatGAAGCCGAAGCACGCGACACTCTCGACGCCTTACAAAACATGTTTGACGTTGAGCCGGATGTCGGCGCGCTGTTGTATGGCGAGGAAAAATAATGCGTTTTGTTGATGAATATCGCGCGCCGGAACAGGTGATGCAGTTAATTGAGCATCTGCGCGAACGTGCTTCACATCTCTCTTACACCGCCGAACGCCCTCTGCGGATTATGGAAGTGTGTGGCGGTCATACCCACg < 1:804054/238‑1 (MQ=255) aattaatGAAGCCGAAGCACGCGACACTCTCGACGCCTTACAAAACATGTTTGACGTTGAGCCGGATGTCGGCGCGCTGTTGTATGGCGAGGAAAAATAATGCGTTTTGTTGATGAATATCGCGCGCCGGAACAGGGGATGCAGTTAATTGAGCATCTGCGGGAACGGGCTTCCCATCCCTCTTACACCGCCCACAGCCCTCGGCGGCGTTTGGAAGGGGGGGGCGGTCAATCCCAccg > 2:889996/1‑237 (MQ=255) attaatGAAGCCGAAGCACGCGACACTCTCGACGCCTTACAAAACATGTTTGACGTTGAGCCGGATGTCGGCGCGCTGTTGTATGGCGAGGAAAAATAATGCGTTTTGTTGATGAATATCGCGCGCCGGAACAGGTGATGCAGTTAATTGAGCATCTGCGCGAACGTGCTTCACATCTCTCTTACACCGCCGAACGCCCTCTGCGGATTATGGAAGTGTGTGGCGGTCATACCCACGCt < 1:863297/239‑1 (MQ=255) ttaatGAAGCCGAAGCACGCGACACTCTCGACGCCTTACAAAACATGTTTGACGTTGAGCCGGATGTCGGCGCGCTGTTGTATGGCGAGGAAAAATAATGCGTTTTGTTGATGAATATCGCGCGCCGGAACAGGTGATGCAGTTAATTGAGCATCTGCGCGAACGTGCTTCACATCTCTCTTAAACTGCCGAACGCCCTCTGCGGGTTATGGAAGTGTGTGGCGGTCATACCCCCGCtt > 1:539675/1‑238 (MQ=255) gCCGAAGCACGCGACACTCTCGACGCCTTACAAAACATGTTTGACGTTGAGCCGGATGTCGGCGCGCTGTTGTATGGCGAGGAAAAATAATGCGTTTTGTTGATGAATATCGCGCGCCGGAACAGTGGATGAAGTTAATTGCGCCTCTCCGCGAACGTGCTTCACATCTCTCTTACCCCGCCGAACGCCCTCTGCGGATTATGGAAGAGGTTGGCGGTACCACCAACCCCATCTTTaaa > 2:434442/1‑239 (MQ=255) aCGGGACACTCTCGACGCATTACAAAACCTTTTTGACGTTGAGCCGGATGTCGGCGCGCTGTTGTATGGCGAGTAAAAATAATGCGTTTTGTTGATGAATATCGCGCGCCGGAACAGGTGATGCAGTTAATTGAGCATCTGCGCGAACGTGCTTCACATCGCTCTTACACCGCCGAACGCCCTCTGCGGATTATGGAAGTGTGTGGCGGTCATACCCACGCTATCTTTAAATTCGGCCt < 2:539675/239‑1 (MQ=255) 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ccgcgccccgacctccggctcaacgccaaacatgttgtggaatggtgcgatggttgctcgtgcctcggcctcattaatttcgctcatggcaaagccaacgtgtaccagtaccccctggcccacgcgcggctggccgttttcatcgccgctgccgactaacgttaaatcgacatcgcgctgaatgccgcagacgtcgactttcgcctggttgccgtcaatggtgcggatctggccgggaa > 2:732467‑M2/2‑2 (MQ=255) | GTCTGCGGCATTCAGCGCGATGTCGATTTAACGTTAGTCGGCAGCTGCGATGAAAACGGTCAGCCGCGCGTGGGCCAGTGGGTACTGGTACACGTTGGCTTTGCCATGAGCGTAATTAATGAAGCCGAAGCACGCGACACTCTCGACGCCTTACAAAACATGTTTGACGTTGAGCCGGATGTCGGCGCGCTGTTGTATGGCGAGGAAAAATAATGCGTTTTGTTGATGAATATCGCGCGCCGGAACAGGTGATGCAGTTAATTGAGCATCTGCGCGAACGTGCTTCACATCTCTCTTACACCGCCGAACGCCCTCTGCGGATTATGGAAGTGTGTGGCGGTCATACCCACGCTATCTTTAAATTCGGCCTCGACCAGTTACTGCCGGAAAACGTTGAGTTTATCCACGGTCCGGGGTGCCCGGTGTGCGTACTGCCGATGGGTAGAATCGACACCTGCGTGGAGATTGCCA > NC_000913/2851922‑2852392 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |