| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 458799 | 3 (0.040) | 66 (0.810) | 54/276 | 0.4 | 95.8% | intergenic (+99/‑89) | clpX/lon | ATPase and specificity subunit of ClpX‑ClpP ATP‑dependent serine protease/DNA‑binding ATP‑dependent protease La |
| ? | NC_000913 | = 609347 | NA (NA) | intergenic (+170/+112) | insL1/entD | IS186 transposase/phosphopantetheinyltransferase component of enterobactin synthase multienzyme complex | |||||
Only 100 of 166 total aligned reads displayed.
TGATTTATGGCAAGCCGGAAGCGCAACAGGCATCTGGTGAATAATTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTAATAGATGGCGTGAAGCACAGTCGTGTCATCTGATTACCTGGCGGAAATTAAACTAAGAGAGAGCTCTATGAATCCTGAGCGTTCTGAACGCATTGAAATCCCCGTATTGCCGCTGCGCGAT > NC_000913/458657‑458941 | tgattgatGGAAAGCCGGAAGCGCAACAGGCATCTGGTGAATAATTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCC < 2:117769‑M1/143‑1 (MQ=255) tgccgaagtatgcagttcttcgggcttacaaagatgggccagaattgctgaccagttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatGGGGAAACATcccc > 2:1154609‑M1/130‑143 (MQ=255) tgccgaagtatccagttcttcgggcttaccaatatgggccagaattgctgaccagttctcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttggcgcttatGGGGCAACATcccc < 2:502059‑M1/14‑1 (MQ=255) tttATGGCAAGCCGGAAGCGCAACAGGCATCTGGTGAATAATTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGCTTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCTCata > 2:343881‑M1/1‑140 (MQ=255) tGGCAAGCCGGAAGCGCAACAGGCATCTGGTGAATAATTAACCATTCCCATACAATCAGTTAACCTTATGGTTGTGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCataagcg < 2:54146‑M1/143‑8 (MQ=255) gggcAAGCGGGAAGCGCAACAGGCATCTGGAGAGTAATTAACCATTCCCATACACGTAGTTGTCCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCataagcg < 1:506987‑M1/142‑8 (MQ=255) agtatccagttctgcgggcttaccaataggggccagaattgctgaccagttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatGGGGAAACATCCCCATATAc > 1:1036077‑M1/124‑143 (MQ=255) gtatccagttctgcgggcttaccaatatgggccagaattgctgaccagttatcgtgagagtcattcatcggcccgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatGGGGAAACATCCCCATATACt > 1:1008043‑M1/123‑143 (MQ=255) atccagttcttcgggcttaccaatatgggccagaattgctgaccagttatcgtgagagtaattcatcggcaggttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatGGGGAAACATCCCCATATACTGa < 1:1319574‑M1/23‑1 (MQ=255) tccagttcttcgggcttaccaatatgggccagaattgctgaccagttattgtgggcgcaaatcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatGGGGAAACATCCCCATATACTGAc > 2:330114‑M1/120‑143 (MQ=255) tccagttcttcgggcttaccaatatgggccagaattgctgaccagttatcgtgagagtacttcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaatactacaacccttaagttagcgcttatGGGGAACCATCCCCATATCCTGAc < 1:1381101‑M1/24‑1 (MQ=255) tccagttcttcgggcttaccaatatgggccagaattgctgaccagttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatGGGGAAACATCCCCATATCctgcc < 2:248267‑M1/24‑3 (MQ=255) tccagttcttcgggcttaccaatatgggccagaattgctgaccagttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatGGGGAAACATCCCCATATACTGAc < 1:40008‑M1/24‑1 (MQ=255) aaGCCGGAAGCGCAACAGGCATCTGGTGAATAATTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCataagcgctaa < 1:773385‑M1/143‑12 (MQ=255) cgcAACAGGCATCTGGTGAATAATTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCataagcgctaacttaagggtt < 2:1183071‑M1/143‑22 (MQ=255) gggcttaccaatatgggccagaattgctgaccagttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatGGGGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTaa > 1:962157‑M1/109‑143 (MQ=255) gggcgtaccaatagggggcagaagtgctgaccagttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatGGGGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTaa > 2:713399‑M1/109‑143 (MQ=255) ggccctacctatatgggccagaattgctcaccagttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcttaataccacaacccttatgttagcgcttatGGGGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTaa > 2:572220‑M1/109‑143 (MQ=255) ggcttaccaatatgggccagaattgctgaccagttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatGGGGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTAAt < 1:515519‑M1/36‑1 (MQ=255) cgcttaccaatctgggccagaattgctgaccagttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatGGTGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTAAt > 2:653595‑M1/108‑143 (MQ=255) gcttaccaatatgggccagaattgctgaccagttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatGGGGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTAATa > 2:30298‑M1/107‑143 (MQ=255) aaCAGGCATCTGGTGAATAATTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCataagcgctaacttaagggttgaa < 2:263390‑M1/143‑25 (MQ=255) caatatgggccagaattgctgaccagttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatGGGGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTAATAGATGGc < 1:148218‑M1/43‑1 (MQ=255) caatatgggccagaattgctgaccagttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatGGGGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTAATAGATGGc < 2:1045445‑M1/43‑1 (MQ=255) aatatgggccagaattgctgacaagttatcgggagagtaattcatcggcgcgttaaatcagatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatGGGGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTAATAGATGGCg > 2:909292‑M1/100‑143 (MQ=255) aTCTGGTGAATAATTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATATACCAAATAAGTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCataagcgctaacttaagggttgaaccatctg > 1:578955‑M1/1‑112 (MQ=255) cTGGTGAATAATTAACCATTCCCATACAATTATTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaa < 2:534085‑M1/143‑34 (MQ=255) gTGAATAATTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCataagcgctaactaaagggttgaaccatctgaagaa > 2:902764‑M1/1‑107 (MQ=255) gccagaattgctgaccagttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatGGGGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTAATAGATGGCGTGAAGca < 2:69835‑M1/51‑1 (MQ=255) aataatTTACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAATAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATTCCataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgc < 1:162897‑M1/143‑40 (MQ=255) aataatTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCatcaccgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgc > 1:970637‑M1/1‑104 (MQ=255) cagaattgctgaccagttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatGGGGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTAATAGATGGCGTGAAGcaca < 1:336907‑M1/53‑1 (MQ=255) ataatTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATATCACCTTTAATTTTTCATCTATTGTCGGCGTTGAAGGTGGGGGAAACATCCCataagagctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcg > 2:356884‑M1/1‑103 (MQ=255) aattgctgaccagttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatGGGGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTAATAGATGGCGTGAAGCAAAGTc < 2:219338‑M1/56‑1 (MQ=255) ttgctgaccagttatcgggagagtacttcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatGGGGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTAATAGATGGCGTGAAGCACAGTCgt > 1:12051‑M1/86‑143 (MQ=255) ctgtccagttatcgtgcgagtaattgatccgcacgtgaaatcatatccggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatGTGGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTAATAGATGGCGTGAAGCACAGTCGTGTc > 1:427386‑M1/83‑143 (MQ=255) ctgaccagttatcgtcagagtaattcatcggcgcgttcaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatGGGGAAACCTCCCCATATACTGACGTACATGTTAATAGATGGCGTGAAGCACAGTCGTGTc > 2:101025‑M1/83‑143 (MQ=255) tCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCTTATATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATACAataagagtgaacttaagggttaatacatctgaagaatgagacgcagcggtgc > 1:945219‑M1/1‑91 (MQ=255) cccATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcc < 2:820417‑M1/143‑54 (MQ=255) cagttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatGGGGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTAATAGATGGCGTGAAGCACAGTCGTGTCCTCTg < 2:1218902‑M1/66‑1 (MQ=255) ccatcaagatagttaacgaAATGGGGGGGATTGTGTCTCCGCTTTAATTTGTCCTCTATGCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcct < 1:485759‑M1/134‑55 (MQ=255) cATACAATGAGTTAACGAAAGAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctc < 1:622443‑M1/143‑56 (MQ=255) aTACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcg < 2:1418178‑M1/143‑57 (MQ=255) tACAATTAGTTAACCAAAAACGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGCATGTGGGGGAAACATCCCataagcgctaacctaagggttgaaccatctgcagcctgcgcccccccgctgccccct > 1:248394‑M1/1‑86 (MQ=255) aCAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgtt > 1:224100‑M1/1‑85 (MQ=255) catTAGTTAAGCAAATAGGGGGGATGTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCGCTATTCTCAGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgttaa < 1:445973‑M1/142‑61 (MQ=255) aagttgctctccaaagagggggGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgttaa < 1:492386‑M1/133‑61 (MQ=255) gtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatGGGGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTAATAGATGGCGTGAAGAACAGTCGTGTCATCTGATTACCTg > 2:66525‑M1/70‑143 (MQ=255) gTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgttaagagga > 2:1275164‑M1/1‑78 (MQ=255) taattcatcggcaagttaaatcatatcatgcttaataccacaacccttaagttagcgcttatGGGGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTAATAGATGGCTTGAATCACAGTCGTGTCATCTGATTACCTGGCGGaaa > 2:309158‑M1/63‑143 (MQ=255) aCCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCataagcgctaacttaagggttgaaccatccgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgttaagacgatgcg > 1:1051475‑M1/1‑74 (MQ=255) cAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTAGGGGAAACATCCCctcagcgctaacttaaggattgaaccctctgaagaatgagacgccacagcgcctcagtaacacgatgcacc > 1:721582‑M1/1‑72 (MQ=255) cAAAAAGGGGGGATGTTATCTCCCATCCAATTGTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGCAAACATCCCataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgttaagacgatgcctc < 2:731742‑M1/143‑72 (MQ=255) aaaaaGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCatacgcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcggcgcctcggggcctcgttaagactatgccggc > 2:110009‑M1/1‑71 (MQ=255) cggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatGGGGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTAATAGATGGCGTGAAGCACAGTCGTGTCATCTGATTACCTGGCGGAAattaaagta < 2:1196021‑M1/89‑4 (MQ=255) ggggATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgttaagacgatgcctcgcgttctt < 1:694114‑M1/143‑80 (MQ=255) gttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatGGGGAACCATCCCCATTTACTGACGTACATGTGAATAGATGTCGTGAAGCACAGTCGTGTAATCTGATTAACTGGAGGAAAATAAACTAagagag < 2:741581‑M1/95‑1 (MQ=255) gttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatGGGGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTAATAGATGGCGTGAAGCACAGTCGTGTCATCTGATACCCTGGCGGAAATTCAACTAagagag < 1:989108‑M1/95‑1 (MQ=255) gATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgttaagacgatgcctcgcgttcttcaa < 2:206376‑M1/143‑83 (MQ=255) gATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTAGGGGAAACATCCCataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgttaagacgatgcctcgcgttcttcaa > 2:1382259‑M1/1‑61 (MQ=255) ctaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatGGGGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTAATAGATGGCGTGAAGCACAGTCGTGTCATCTGATTACCTGGCGGAAATTAAACTAagagaga > 2:965985‑M1/48‑143 (MQ=255) ttttATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgttaagacgatgcctcgcgttcttcaatt > 2:153246‑M1/1‑59 (MQ=255) ttcttttccccttt‑ATTTTTGCTGGATTCTCGGCGTTGCATGTGGGGGAATCATCCCataagcgctaagttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcgttgcctcgttaagtcgatgcctcgcgttcttcaattgc < 1:1265112‑M1/137‑87 (MQ=255) tATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgttaagacgatgcctcgcgttcttcaattgcg > 1:120497‑M1/1‑56 (MQ=255) tcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatGGGGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTAATAGATGGCGTGAAGCACAGTCGTGTCATCTGATTCCCTGGCGGAAATTAAACTAAGAGAGAGctct < 2:809633‑M1/101‑1 (MQ=255) tatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatGGGGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTAATAGATGGCGTGAAGCACAGTCGTGTCATCTGATTACCTGGCGGAAATTAAACTAAGAGAGAGCTCTATg < 2:156344‑M1/104‑1 (MQ=255) cccTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcgctgcctcgttaagacgatgcctcgcgttcctcaactgcgttttgt > 1:660162‑M1/1‑50 (MQ=255) ccTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCataagcgctaaggtaagggttgaacgatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgttaagacgatgcctcgcgttcttcacgtgcgtttggtg > 2:511169‑M1/1‑49 (MQ=255) ccTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgttaagacgatgcctcgcgttcttcaattgcgttttgta < 2:1119413‑M1/143‑95 (MQ=255) ccTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgttaagacgatgcctcgcgttcttcaattgcgtttggta > 1:466658‑M1/1‑49 (MQ=255) aggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatGGGGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTAATAGATGGCGTGAAGCACAGTCGTGTCATCTGATTACCTGGCGGAAATTAAACTAAGAGAGAGCTCTATGAATc < 1:1442948‑M1/108‑1 (MQ=255) tttAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCataagcgctaacttaagggctgtgcaatcagaagaatgcgacgcctcggtgcctcgttaagacgatgcctcgcgttcttcaattgcgctttgtgcg > 2:1218419‑M1/1‑47 (MQ=255) gtaataccacaacccttaagttagcgcttatGGGGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTAATAGATGGCGTGAAGCACAGTCGTGTCATCTGATTACCTGGCGGAAATTAAACTAAGAGAGAGCTCTATGAATCCTGa > 2:158975‑M1/32‑143 (MQ=255) cagctcccttaacttagcgcttatGGGGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTAATAGATGGCGTGAAGCACAGTCGTGTCATCTGATTACCTGGCGGAAATTAAACTAAGAGAGAGCTCTATGAATCCTGAGCGTTCt > 2:40008‑M1/25‑143 (MQ=255) cacatcccttaagttagcgcttatGGGGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTAATCGATGGCGTGAAGCACAGTCGTGTCATCTGATTACCTGGCGGAAATTAAACTAAGAGAGAGCTCTATGAATCCTGAGCGTTCt > 1:1086809‑M1/25‑143 (MQ=255) acaacccttaagttagcgcttatGGGGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTAATAGATGGCGTGAAGCACAGTCGTGTCATCTGATTACCTGGCGGAAATTAAACTAAGAGAGAGCTCTATGAATCCTGAGCGTTCTg < 2:242380‑M1/120‑1 (MQ=255) tctATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgttaagacgatgcctcgcgttcttcaattgcgttttgtaggctgtcagggata < 2:274639‑M1/143‑109 (MQ=255) tATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgttaagacgatgcctcgcgctcttcaattgcgttttctaggctgtcagggatcct > 1:247869‑M1/1‑33 (MQ=255) ttaagttagcgcttatGGGGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTAATAGATGGCGTGAAGCACAGTCGTGTCATCTGATTACCTGGCGGAAATTAGACTAACAGAGAGCTCTATGAATCCTGACCGTTCTGAACGCAt < 1:902970‑M1/127‑1 (MQ=255) cGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgttaagacgatgcctcgcgttcttcaattgcgttttgtaggctgtcagggatactgtccca > 1:271607‑M1/1‑27 (MQ=255) gTTGAATGTGGGGGAAACATCCCataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgttcagacgatgcctcgcgttcttcaattgcgttttgtaggctgtcagggctactgtcccacgaa > 1:871871‑M1/1‑23 (MQ=255) ttGAAGGTGGGCGAAACATCCCatactccctaacttaacggttgaaccatctgaagcttgcgacgcctcggtgcctcgttaagacgatgcctcgcgttcttcaattgcgttttgtaggctgtcagggatactgtcccacgaat < 1:608382‑M1/143‑122 (MQ=255) agcgcttatGGGGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTAATAGATGGCGTGAAGCACAGTCGTGTCATCTGATTACCTGGCGGAAATTAAACTAAGAGAGAGCTCTATGAATCCTGAGCGTTCTGAACACATTGAAATc > 1:170732‑M1/10‑143 (MQ=255) gcttatGGGGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTAATAGATGGCGTGAAGCACAGTCGTGTCATCTGATTACCTGGCGGAAATTAAACTAAGAGAGAGCTCTATGAATCCTGAGCGTTCTGAACGCATTGAAATcccc > 2:515519‑M1/7‑143 (MQ=255) gcttagGGGGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTAATAGATGGCGTGAAGCACAGTCGTGTCATCTGATTACCTGGCGGAAATTAAACTAAGAGAGAGCTCTATGAATCCTGAGCGTTCTGAACGCATTGAAATcccc > 2:148218‑M1/7‑143 (MQ=255) gtgGGGGAAGCATCCCataggcgctgacttaagggttggaccatctgaagagtgcgacgcctcggtgcctcgtgaagacgatgcctcgcgttcttcaattgcgttttgtaggctgtcagggatactgtcccacgaatggccac < 1:638613‑M1/143‑128 (MQ=255) gtgGGGGAAACATCCCataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgttaagacgatgcctcgcgttcatcaattgcgttttgtaggctgtcagggatactgtcccacgaatggccac < 1:816276‑M1/143‑128 (MQ=255) atGGGGAAACATACCCATATACTGACGTACATGTTAATAGATGGCGTGAAGCACAGTCGTGTCATCTGATTAACTGGCGGAAATTAAACTAAGAGAGAGCTCTATGAATCCTGGGCGTTCTGGACGCATTGAAATGcccgcat < 1:829695‑M1/141‑4 (MQ=255) ggggAAACATCCCataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgttaagacgatgcctcgcgttcttcaattgcgttttgtaggctgtcagggatactgtcccacgaatggccacctg > 1:1211500‑M1/1‑13 (MQ=255) GGGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTAATAGATGGCGTGAAGCACAGTCGTGTCATCTGATTACCTGGCGGAAATTAAACTAAGAGAGAGCTCTATGAATCCTGAGCGTTCTGAACGCATTGAAATCCCCGTATTGc < 2:317801‑M1/143‑1 (MQ=255) GGGAAACATCCCCACGTACTCAGGTACATGTTAATAGATGGCGTGAAGCACAGTCGTGTCATCTGATTACCTGGCGGAAATTAAACTAAGAGAGAGCTCTATGAATCCTGAGCGTTCTGAACGCATTGAAATCCCCGTATTGc > 1:1078382‑M1/1‑143 (MQ=255) aCATCCCCATATACTGACGTACATGTTAATAGATGGCGTGAAGCACAGTCGTGTCATCTGATTACCTGGCGGAAATTAAACTAAGAGAGAGCTCTATGAATCCTGAGCGTTCTGAACGCATTGAAATCCCCGTATTGCCGCTg > 1:545064/1‑143 (MQ=255) aTCCCCATATACTGACGTACATGTTAATAGATGGCGTGAAGCACAGTCGTGTCATCTGATTACCTGGCGGAAATTAAACTAAGAGAGAGCTCTATGAATCCTGAGCGTTCTGAACGCATTGACATCCCCGTATTGCCGCTgcg > 1:454675/1‑143 (MQ=255) tCCCataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgttaagacgatgcctcgcgttcttcaattgcgttttgtaggctgtcagggatactgtcccacgcatggccacctgtgagatccc > 1:344785‑M1/1‑4 (MQ=255) tCCCataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgttaagacgatgcctcgcgttcttcaattgcgttttgtaggctgtcagggatactgtcccacgaatggccacctgtaagctcca < 1:626223‑M1/143‑140 (MQ=255) tCCCataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgttaagacgatgcctcgcgttccgcaattgcgttttgtaggctgtcagggatactgtcccacgactggccacctgtaagcccca > 2:394925‑M1/1‑4 (MQ=255) ccataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgttaagacgatgcctcgcgttcttcaattgcgttttgtaggctgtcagggatactgtcccacgaatggccacctgtaagctccaga < 1:726799‑M1/143‑142 (MQ=255) cataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgttaagacgatgcctcgcgttcttcaattgcgttttgtaggctgtcagggatactgtcccacgaatggccacctgtaagctccagat < 2:461612‑M1/143‑143 (MQ=255) cataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgttaagacgatgcctcgcgttcttcaattgcgttttgtaggctgtcagggatactgtcccacgaatggccacctgtaagctccagat < 2:925836‑M1/143‑143 (MQ=255) cataagcgctaacttaagacttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgttaagacgatgcctcgcgttcttcaattgcgttttgtaggctgtcagggatactgtcccacgaatggccacctgtaagctccagat > 1:884337‑M1/1‑1 (MQ=255) | TGATTTATGGCAAGCCGGAAGCGCAACAGGCATCTGGTGAATAATTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTAATAGATGGCGTGAAGCACAGTCGTGTCATCTGATTACCTGGCGGAAATTAAACTAAGAGAGAGCTCTATGAATCCTGAGCGTTCTGAACGCATTGAAATCCCCGTATTGCCGCTGCGCGAT > NC_000913/458657‑458941 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |