| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 608011 = | NA (NA) | 56 (0.840) | 50/276 | 0.2 | 87.8% | intergenic (+23/‑54) | hokE/insL1 | toxic polypeptide, small/IS186 transposase |
| ? | NC_000913 | 1259756 = | 8 (0.120) | coding (1048/1680 nt) | dauA | C4‑dicarboxylic acid transporter | |||||
CCCCGGCATTACGTGCCGAAGTATCCAGTTCTTCGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATggga‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/608152‑608011‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGGACGTTGCCCCGGCACGGACGTTAGCGGCAGAACGCGCGATGGCAGCTGTAGCGGTAATACCACCAAAGAACGGAGCGATAATATTCCCCAGTCCCTGTCCAACCAGTTCGCTGTTCGCCTTGTGTTTCGTCCCGGTCATAC > NC_000913/1259756‑1259899 CCCCGGCATTACGTGCCGAAGTATCCAGTTCTTCGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATG < 2:315670/143‑1CCCCGGCATTACGTGCCGAAGTATCCAGTTCTTCGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATG > 1:1136491/1‑143CCCCGGCATTACGTGCCGAAGTATCCAGTTCTTCGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTGATG > 2:887681/1‑143CCCCGGCATTACGTGCCGAAGTATCCAGTTCTTCGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGATAAATCATATCAGGCGTAATCCCACAACCCTTAGATTAAGGCTTATG > 2:67959/1‑143CCCCGGCATTACGTGCCGAAGTATCCAGTTCTTCGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTAGCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTCAAGTTAGCGCTAATG > 2:432218/1‑143 CCCGGCATTACGTGCCGAAGTATCCAGTTCTTCGGGCTTACCAATATGGGCGAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACCACCCTTGAGTTAGCGCTTATGG > 1:312891/1‑143 tgcGCATTACGTGCCGAAGTCTCCAGTTCGTCGGGCTTACCAATATGGTCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCAGCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGG < 2:867382/140‑1 ccgcgcTTACGTGCCGAAGTATCCAGTTCTTCGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTGATCGTGAGAGTAATTCATCCGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGG < 2:1098830/137‑1 CCGGCATTACGTGCCGAAGTATCCAGTTCTTCGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGG > 1:206064/1‑143 CCGGCATTACGTGCCGAAGTATCCAGTTCTTCGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCAAGATACAATAGATCGGGCCTAACGCCGCAACCCGGAAGTTAGCGCTTATGGG > 1:268340/1‑143 cgtcactacggcCCGATGTATCCAGTTCTTCGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCTGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGA < 2:502533/131‑1 CGGCATTCCGTGCCGAAGTATCCAGTTCTTCGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATAGCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGA < 1:130303/143‑1 CGGCATTACGTGCCGAAGTATCCAGTTCTTCGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGg < 2:225611/143‑2 CGGCATTACGTGCCGAAGTATCCAGTTCTTCGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGA < 1:209624/143‑1 CGGCATTACGTGCCGAAGTATCCAGTTCTTCGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTGATGGGA > 1:306752/1‑143 CGGCATTACGTGCCGAAGTATCCAGTTCTTCGGGCTTAAAAATATGGAGCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGg > 1:227272/1‑142 GCATTACGTGCCGAAGTATCCAGTTCTTCGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAGTGAATTCTGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAACGCTTATGGcata > 2:1033128/1‑139 GCATTACGTGCCGAAGTATCCAGTTCTTCGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGGTTATGGGACa > 1:626166/1‑142 CATTACGTGCCGAAGTATCCAGTTCTTCGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTGATTGTGAGAGTAATTCATCGCCACGTTAAATCATATCAGGCGGAATACCACTACCCTTAAGGTAGCGCCTATGGGggaa > 2:749019/1‑139 TACGTGCCGAAGTATCCAGTTCTTCGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGACGTTGC > 1:1061885/1‑143 GTGCCGAAGTATCCAGTTCTTCGGGCTTACGAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGgaaacatccc < 1:828687/143‑11 TGCCGAAGTATCCAGTTCTGCGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGgaaacatcccc < 1:183372/143‑12 GAAGTATCCAGTTCTTCGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTTAGCGTAATTCATCGCCACGCTAAATAATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAATGTAGCGCTTATGGGCCGTGCCCCCGGCAC > 2:973695/1‑143 GAAGTATCCAGTTCTTCGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGACGTTGCCCCGGCAC < 2:802138/143‑1 AAGTATCCAGTTCTTCGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGACGTTGCCCCGGCACG > 1:900429/1‑143 ATCCAGTTCTTCGGGCTTACCGATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTAATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTGGCGCTTATGGGACCTTGCCCCGGCCCGGACG > 2:465581/1‑143 TCCAGTGCTTGGGGCTTACCAACATGATCCAGAATTTCTTACCAGTTTTCGTTATAGTAATTCATCGGCACGATAAATCACATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGACGTTGCCCCGGCACGGACGT < 1:38220/143‑1 CAGGTCTTCGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCGGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGACGTTGCCCCGGCACCGACGGTA > 2:1046675/1‑143 ataCTTCGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGACGTTGCCCCGGCACGGACGTTAGC < 1:456140/140‑1 CTTCGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGGTCGAGGCTATCGGACGTTGCCGCGGCACGCACGTTAGCTGC > 2:820354/1‑143 tgCGGGCTTACCAATATGGGCCAGACTTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCGTAAGTTAGCGCTTATGGGACGTTGCCCCGGCACGGACGTTAGCGGCA < 1:314139/141‑1 TTCGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAACTCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGACGTTGCCCCGGCACGGACGTTAGCGGCA > 2:145982/1‑143 TTCGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGACGTTGCCCCGGCACGGACGTTAGCGGCA > 1:1035781/1‑143 TTCGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGACGTTGCCCCGGCACGGACGTTAGCGGCA < 1:1066441/143‑1 CGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGACGTTGCCCCGGCACGGACGTTAGCGGCAGA < 1:825119/143‑1 GGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCTGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGACGTTGCCCCGGCACGGACGTTAGCGGCAGAA < 1:1070205/143‑1 GGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTAAGGGACGATGCGCCGGCACGGACGTTAGCGGCAGAA > 1:497052/1‑143 GGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTAATAGGACGTCACCCCCGGACGGACGTTAGCGGCAGAAC > 2:5822/1‑143 TTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGCGTTGCCCCGGCACGGACGTTAGCGGCAGAACGCG > 2:455459/1‑143 TACCAATATGGGCCAGTATTGCTGACCAGTTATCGTGGGAGTAATTCATCGGCAATTTCTGTTGTATCAGGCGTAATATCCCGACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGCACGTTGCCCCGGCACGGACGTTAGCGGCAGAACGCGC < 2:1038705/143‑1 CCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGACGTTGCCCCGGCACGGACGTTAGCGGCAGAACGCGCGA > 1:372205/1‑143 ATGGGCCAGAATTGATGACCATTGATCGTGAGAGTAATTCATCGTCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGACGTTGCCCCGGCACGGACGTTAGCGGCAGAACGCGCGATGGCA < 2:212287/143‑1 GCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGACGTTGCCCCGGCACGGACGTTAGCGGCAGCACGCGCGATCGCAGCTG > 1:663975/1‑143 TTGCTGCCCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGACGTTGCCCCGGCACGGACGTTAGCGGCAGAACGCGCGATGGCAGCTGTAGCGGT < 1:970144/143‑1 TTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGACGTTGCCCCGGCACGGACGTTAGCGGCAGAACGCGCGATGGCAGCTGTAGCGGT > 2:292303/1‑143 CTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGACGTTGCCCCGGCACGGACGTTAGCGGCAGAACGCGCGATGGCCGCTGTAGCCGTAct > 2:662973/1‑141 gCCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGACGTTGCCCCGGCACGGACGTTAGCGGCAGAACGCGCGATGGCAGCTGTAGCGGTAATACC < 2:148348/142‑1 GTTACCGTGAGAGTGACTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTTCGCGTCGTTGCCCCGGCACGGACGTTAGCGGCAGAACGCGCGATGGCAGCTGTAGCGGTAATACCACCA < 2:1106079/143‑1 cgctcttccgatctGGCACGTTAAATCATATCAGCCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGACGTTGCCCCGGCACGGACGTTAGCGGCAGAACGCGCGATGGCAGCTGTAGCGGTAATACCACCAAAGAACGG > 1:1175311/15‑143 TAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCAATGAAATATGGTATAGGGGACGTTGCCCCGGCACGGACGTTAGCGGCAGAACGCGCGATGGCAGCTGTAGCGGTAATACCACCAAAGAACGGAGCGA < 1:271942/143‑1 AATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGACGTTGCCCCGGCACGGACGTTAGCGGAAGAACTCGCGATGGCCGCTGTAGCGGAACTACGACCAACGAACGGAGCGAc > 2:838745/1‑142 ATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGACGTTGCCCCGGCACGGACGTTAGCGGCAGAACGCGCGATGGCAGCTGTAGCGGTAATCCCACCAAGGAGCGGAGCGATAATAg > 2:289016/1‑142 gGGCACGTCAAATCCTCGCAGGCGTCATACCACAGCCCTTAAGTTAGCGCTTACGGGACGGGGCTCCGGCACTGACGTTAGCCGCAGAACGCGCGATGGCAGCTGTAGCGGTAATACCACCAAAGAACGGAGCGATAATATTC < 1:1041834/142‑1 GGCACGTTAAACCATATCAGGCGTATGACCACACCCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGACGTTGCCCCGGCACGGACGTTAGCGGCAGAACGCGCGATGGCAGCTGTAGCGGTAATACCACCAAAGAACGGAGCGATAATATTCC < 2:867743/143‑1 GCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGACGTTGCCCCGGCACGGACGTTAGCGGCAGAACGCGCGATGGCAGCTGTAGCGGTAATACCACCAAAGACTGGAGCTGTAATATACCC > 1:69860/1‑143 ACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGACGTTGCCCCGGCACGGACGTTAGCGGCAGAACGCGCGATGGCAGCTGTAGCGGTCATACCACCAAAGAACGGAGCGATAATATTCCCCA > 1:393495/1‑143 GTTAAGTCATATCAGGCGCAATACCACGCCCCTTAAGTTAGCGCGTATGGGACGTTGCCCCGGCACGGACGTTAGCGGCAGAACGCGCGATGGCAGCTGTAGCGGTAATACCACCAAAGAACGGAGCGATAATATTCCCCAGT < 2:796982/143‑1 GTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGACGTTGCCCCGGCACGGACGTTAGCGGCAGAACGCGCGATGGCAGCTGTAGCTGTAATACCACCAAAGAACGGAGCGATAATATTCCCCAGT > 1:328662/1‑143 ATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGACGTTGCCCCGGCACGGACGTTAGCGGCAGAACGCGCGATGGCAGCTGTAGCGGTAATACCACCACAGAACGGAGCGAGAATATGCCCCCGTCCCTG > 2:288401/1‑143 CATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGACGTTGCCCCGGCACGGACGTTAGCGGCAGAACGCGCGATGGCAGCTGTAGCGGTACTACCCCCAAAGAACGGCGCGATACTATTCCCCAGTCCCTGTC > 2:1041207/1‑143 TATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGACGTTGCCCCGGCACGGACGTTAGCGGCAGAACGCGCGATGGCAGCTGTAGCGGTAATACCACCAAAGAACGGAGCGATAATATTCCCCAGTCCCTGTCCA < 1:402642/143‑1 ATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGACGTTGCCCCGGCACGGACGTTAGCGGCAGAACGCGCGATGGCAGCTGTAGCGGTAATACCACCAAAGAACGGAGCGATAATATTCCCCAGTCCCTGTCCAA > 2:398458/1‑143 GCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGACGTTGCCCCGGCACGGACGTTAGCGGCAGAACGCGCGATGGCAGCTGTAGCGGTAATACCACCAAAGAACGGAGCGATAATATCCCCCAGTCCCTGTCCAACCAGT < 1:292303/143‑1 GTAATACCACAACCCGTAAGTTCGCGCTTATGGGTCGTTGCCCCGGCACGGACGTTCGCGGCAGAACGCGCGATGGCAGCTGTAGCGGTAATACCACCAAAGAACGGAGCGATAATATTCCCTAGTCCCTGTCCAACCAGTTC < 2:137329/143‑1 TAATACCACGACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGACGTTGCCCCGGCACGGACGTTAGCGGCAGAACGCGCGATGGCAGCTGTAGCGGTAATACCACCAAAGAACGGAGCGATAATATTCCCCAGTCCCTGTCCAACCAGTTCG < 2:497052/143‑1 CCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGACGTTGCCCCGGCACGGACGTTAGCGGCAGAACGCGCGATGGCAGCTGTAGCGGTAATACCACCAAAGAACGGAGCGATAATATTCCCCAGTCCCTGTCCAACCAGTTCGCTGTT > 1:955410/1‑143 cCAACCCTTAGGTTAGCGCTTAGGGGACGTTGCCCCGGCACGGACGTTAGCGGCAGAACGCGCGATGGCAGCTGTAGCGGTAATACCACCAAAGAACGGAGCGATAATATTCCCCAGTCCCTGTCCAACCAGTTCGCTGTTCG < 2:732924/142‑1 ACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGACGTTGCCCCGGCACGGACGTTAGCGGCAGAACGCGCGATGGCAGCTGTAGCGGTAATACCACCAAAGAACGGAGCGAGAATATTCCCCAGTCCCTGTCCAACCAGTTCGCCGTTCG > 2:145692/1‑143 ACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGACGTTGCCCCGGCACGGACGTTAGCGGCAGAACGCACGATGGCGGCTGTAGCGGTAATACCACCAAAGAACGGAGCGATAATATTCCCCAGTCCCTGGCCAACCAGTTCGCCGGTCG > 2:422676/1‑143 CCTTAAGTTAGCGCTTATGGGACGTTGCCCCGGCACGGACGTTAGCGGCAGAACGCGCGATGGCAGCTGTAGCGGTAATACCACCAAAGAACGGCGCGATAATATTCCCCAGTCCCTGGCCAACCAGTTCGCTGTTCGCCTTG > 2:310147/1‑143 CCTTAAGTTAGCGCTTATGGGACGTTGCCCCGGCACGGACGTTAGCGGCAGAACGCGCGATGGCAGCTGTAGCGGTAATACCACCAAAGAACGGAGCGATAATATTCCCCAGTCCCTGTCCAACCAGTTCGCTGTTCGCCTTG > 1:856201/1‑143 CTTAAGTTGGCGCTTGCGCGACGGTGCGCCGGCACGGACGTTAGCGGCAGAACGCGCGATGGCAGCTGTAGCGGTAATCCCACCAAAGAACGTCGCGATAATATTCCCCAGTCCCTGTCCAACCAGTTCGCTGTTCGCCTTGT < 2:414949/143‑1 TTAAGTTAGCGCTTATGGGACGTTGCCCCGGCACGGACGTTAGCGGCAGAACGCGCGATGGCAGCTGTAGCGGTAATACCACCAAAGAACGGAGCGATAATATTCCCCAGTCCCTGTCCAACCAGTTCGCTGTTCGCCTTGTG > 1:1161511/1‑143 TTAAGTTAGCGCTTATGGGACGTTGCCCCGGCACGGACGTTAGCGGCAGAACGCGCGATGGCAGATGAAGCGTTAATACCACCAAAGAACGGAGCGATAATATTCTCCAGTCCCTGTCCAACCAGTTCGCTGTTCGCCTTGcg > 1:1073448/1‑141 GCGCTTATGGGACGTTGCCCCGGCACGGACGTTAGCGGCAGAACGCGCGATGGCAGCTGTAGCGGTAATACCAACAAAGAACGGAGCGATAATATTCCCCAGACCCTGTCCAAACAGTTCCCTGTGCGCCTCGTGCTTCGTCC > 2:1072975/1‑143 TTATGGGACGTTGCCCCGGCACGGACGTTAGCGGCAGAACGCGCGATGGCAGCTGTAGCGGTAATAGCACCAGAGAACGGAGCGATAATATTCCCCAGTCCCTGTCCAACCCGTTCGCTGTTCGCCTTGTGTTTCGTCCCGGT > 1:449503/1‑143 GGGACGTTGCCCCGGCACGGACGTTAGCGGCAGAACGCGCGATGGCAGCTGTAGCGGTAATACCACCAAAGAACGGAGCGATAATATTCCCCAGTCCCTGTCCAACCAGTTCGCTGTTCGCCTTGTGTTTCGTCCCGGTCATA < 1:138771/143‑1 GGACGTTGCCCCGGCACGGACGTTAGCGGCAGAACGCGCGATGGCAGCTGTAGCGGTAATACCACCAAAGAACGGAGCGATAATATTCCCCAGTCCCTGTCCAACCAGTTCGCTGTTCGCCTTGTGTTTCGTCCCGGTCATAC < 1:50682/143‑1 GGACGTTGCCCCGGCACGGACGTTAGCGGCAGAACGCGCGATGGCAGCTGTAGCGGTAATACCACCAAAGAACGGAGCGATAATATTCCCCAGTCCCTGTCCAACCAGTTCGCTGTTCGCCTTGTGTGTCTCCCCAGTCATAC > 2:1155856/1‑143 CCCCGGCATTACGTGCCGAAGTATCCAGTTCTTCGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATggga‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/608152‑608011‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGGACGTTGCCCCGGCACGGACGTTAGCGGCAGAACGCGCGATGGCAGCTGTAGCGGTAATACCACCAAAGAACGGAGCGATAATATTCCCCAGTCCCTGTCCAACCAGTTCGCTGTTCGCCTTGTGTTTCGTCCCGGTCATAC > NC_000913/1259756‑1259899 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |