| New junction evidence | |||||||||||
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Only 100 of 116 total aligned reads displayed.
ACCACTTTGTGCGCTTCACTCATGTTCCACGCCACCATCAACAGCAGGGCTGCCATGGCGGAAAGCGGCAGCCAGGAGAGCAGCGGTGCCAGTACCAGCAGGGCAAGAATAACCAGAATAGAGTGGATCACCGCCGAGATAGGGGACGTTGCCCCGGCACGGACGTTAGCGGCAGAACGCGCGATGGCAGCTGTAGCGGTAATACCACCAAAGAACGGAGCGATAATATTCCCCAGTCCCTGTCCAACCAGTTCGCTGTTCGCCTTGTGTTTCGTCCCGGTCATA > NC_000913/1259614‑1259898 | ccccggcattacgtgccgaagtatccagttcttcgggcttaccaatatgggccagaattgctgaccagttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatg > 1:1136491‑M2/143‑143 (MQ=255)ccccggcattacgtgccgaagtatccagttcttcgggcttaccaatatgggccagaattgctgaccagttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatg < 2:315670‑M2/1‑1 (MQ=255)ccccggcattacgtgccgaagtatccagttcttcgggcttaccaatatgggccagaattgctgaccagttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgctgatg > 2:887681‑M2/143‑143 (MQ=255)ccccggcattacgtgccgaagtatccagttcttcgggcttaccaatatgggccagaattgctgaccagttatcgtgagagtaattcatcggcacgataaatcatatcaggcgtaatcccacaacccttagattaaggcttatg > 2:67959‑M2/143‑143 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ccgcgcttacgtgccgaagtatccagttcttcgggcttaccaatatgggccagaattgctgaccagtgatcgtgagagtaattcatccgcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatggg < 2:1098830‑M2/3‑1 (MQ=255) cACTTTGTGCGCTTCACTCATGTTCCACGCCACCATCAACAGCAGGGCTGCCATGGCGGAAAGCGGCAGCCAGGAGAGCAGCGGTGCCAGTACCAGCAGGGCAAGAATAACCAGAATAGAGTGGATCACCGCCGAGATAgggg > 1:1180700/1‑143 (MQ=255) cACTTTGTGCGCTTCACTCATGTTCCACGCCACCATCAACAGCAGAGATACCATGGCGGAAAGCGGCAGCCAGGAGAGCAGCGGTGCCAGTACCAGCAGGGCAAGAATAACCAGAATAGAGTGGATCACCGCCGAGATAgggg > 1:687243/1‑143 (MQ=255) cgtcactacggcccgatgtatccagttcttcgggcttaccaatatgggccagaattgctgaccagttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatctggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatGGGa < 2:502533‑M2/4‑1 (MQ=255) cggcattccgtgccgaagtatccagttcttcgggcttaccaatatgggccagaattgctgaccagttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatagcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatGGGa < 1:130303‑M2/4‑1 (MQ=255) cggcattacgtgccgaagtatccagttcttcgggcttaccaatatgggccagaattgctgaccagttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatgggg < 2:225611‑M2/4‑2 (MQ=255) cggcattacgtgccgaagtatccagttcttcgggcttaccaatatgggccagaattgctgaccagttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatGGGa < 1:209624‑M2/4‑1 (MQ=255) cggcattacgtgccgaagtatccagttcttcgggcttaccaatatgggccagaattgctgaccagttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgctgatGGGa > 1:306752‑M2/140‑143 (MQ=255) cggcattacgtgccgaagtatccagttcttcgggcttaaaaatatggagcagaattgctgaccagttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatgggg > 1:227272‑M2/140‑142 (MQ=255) aCTTTGTGCGCTTCACTCATGTTCCACGCCACCATCAACAGCAGGGCTGCCATGGCGGAAAGCGGCAGCCAGGAGAGCAGCGGTGCCAGTACCAGCAGGGCAAGAATAACCAGAATAGAGTGGATCACCGCCGAGATAGGGGa < 1:638116/143‑1 (MQ=255) cTTTGTGCGCTTCACTCATGTTCCACGCCACCATCAACAGCAGGGCTGCCATGGCGGAAAGCGGCAGCCAGGAGAGCAGCGGTGCCAGTACCAGCAGGGCAAGAATAACCAGAATAGAGTGGATCACCGCCGAGATAGGGGAc > 1:4920/1‑143 (MQ=255) 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atccagttcttcgggcttaccgatatgggccagaattgctgaccagttatcgtgagagtaattaatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttggcgcttatGGGACCTTGCCCCGGCCCGGACg > 2:465581‑M2/121‑143 (MQ=255) tccagtgcttggggcttaccaacatgatccagaatttcttaccagttttcgttatagtaattcatcggcacgataaatcacatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatGGGACGTTGCCCCGGCACGGACGt < 1:38220‑M2/24‑1 (MQ=255) caggtcttcgggcttaccaatatgggccagaattgctgaccggttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatGGGACGTTGCCCCGGCACCGACGGTa > 2:1046675‑M2/118‑143 (MQ=255) cACGCCACCATCAACAGCAGGGCTGCCATGGCGGAAAGCGGCAGCCAGGAGAGCAGCGGTGCCAGTACCAGCAGGGCAAGAATAACCAGAATAGAGTGGATCACCGCCGAGATAGGGGACGTTGCCCataagcggtaacttaa < 1:889433‑M2/143‑17 (MQ=255) atacttcgggcttaccaatatgggccagaattgctgaccagttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatGGGACGTTGCCCCGGCACGGACGTTAGc < 1:456140‑M2/28‑1 (MQ=255) 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tatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatGGGACGTTGCCCCGGCACGGACGTTAGCGGCAGAACGCGCGATGGCAGCTGTAGCGGTAATACCACCAAAGAACGGAGCGATAATATTCCCCAGTCCCTGTCCa < 1:402642‑M2/104‑1 (MQ=255) atcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatGGGACGTTGCCCCGGCACGGACGTTAGCGGCAGAACGCGCGATGGCAGCTGTAGCGGTAATACCACCAAAGAACGGAGCGATAATATTCCCCAGTCCCTGTCCaa > 2:398458‑M2/39‑143 (MQ=255) aaTAACCAGAATAGAGTGGATCACCGCCGAGATAGGGGACGTTGCCCataagcgctcacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgttaagacgatgcctcgcgttcttcaattgcgttctgaacg < 1:32578‑M2/143‑97 (MQ=255) gcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatGGGACGTTGCCCCGGCACGGACGTTAGCGGCAGAACGCGCGATGGCAGCTGTAGCGGTAATACCACCAAAGAACGGAGCGATAATATCCCCCAGTCCCTGTCCAACCAGt < 1:292303‑M2/110‑1 (MQ=255) ccacaacccttaagttagcgcttatGGGACGTTGCCCCGGCACGGACGTTAGCGGCAGAACGCGCGATGGCAGCTGTAGCGGTAATACCACCAAAGAACGGAGCGATAATATTCCCCAGTCCCTGTCCAACCAGTTCGCTGtt > 1:955410‑M2/26‑143 (MQ=255) agagagtaGATCACCGCCGAGATAGAGGACGTTGCCCataagcgctcacttgagggttgaaccatctgaataatgcgacgcctcggtgcctcgttaagacgatgcctcgcgttcttcaattgcgttttgtaggctgtcaggga > 2:352299‑M2/3‑37 (MQ=255) ccaacccttaggttagcgcttagGGGACGTTGCCCCGGCACGGACGTTAGCGGCAGAACGCGCGATGGCAGCTGTAGCGGTAATACCACCAAAGAACGGAGCGATAATATTCCCCAGTCCCTGTCCAACCAGTTCGCTGTTCg < 2:732924‑M2/120‑1 (MQ=255) acaacccttaagttagcgcttatGGGACGTTGCCCCGGCACGGACGTTAGCGGCAGAACGCGCGATGGCAGCTGTAGCGGTAATACCACCAAAGAACGGAGCGAGAATATTCCCCAGTCCCTGTCCAACCAGTTCGCCGTTCg > 2:145692‑M2/24‑143 (MQ=255) acaacccttaagttagcgcttatGGGACGTTGCCCCGGCACGGACGTTAGCGGCAGAACGCACGATGGCGGCTGTAGCGGTAATACCACCAAAGAACGGAGCGATAATATTCCCCAGTCCCTGGCCAACCAGTTCGCCGGTCg > 2:422676‑M2/24‑143 (MQ=255) tGGATCACCGCAGAGATAGGGGACGTTGCCCataagcgctgacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgttaagacgatgcctcgcgttcttcaattgcgttttgtaggctgtcagggatactgt > 2:334239‑M2/1‑31 (MQ=255) ccttaagttagcgcttatGGGACGTTGCCCCGGCACGGACGTTAGCGGCAGAACGCGCGATGGCAGCTGTAGCGGTAATACCACCAAAGAACGGCGCGATAATATTCCCCAGTCCCTGGCCAACCAGTTCGCTGTTCGCCTtg > 2:310147‑M2/19‑143 (MQ=255) ccttaagttagcgcttatGGGACGTTGCCCCGGCACGGACGTTAGCGGCAGAACGCGCGATGGCAGCTGTAGCGGTAATACCACCAAAGAACGGAGCGATAATATTCCCCAGTCCCTGTCCAACCAGTTCGCTGTTCGCCTtg > 1:856201‑M2/19‑143 (MQ=255) cttaagttggcgcttgcGCGACGGTGCGCCGGCACGGACGTTAGCGGCAGAACGCGCGATGGCAGCTGTAGCGGTAATCCCACCAAAGAACGTCGCGATAATATTCCCCAGTCCCTGTCCAACCAGTTCGCTGTTCGCCTtgt < 2:414949‑M2/126‑1 (MQ=255) ttaagttagcgcttatGGGACGTTGCCCCGGCACGGACGTTAGCGGCAGAACGCGCGATGGCAGCTGTAGCGGTAATACCACCAAAGAACGGAGCGATAATATTCCCCAGTCCCTGTCCAACCAGTTCGCTGTTCGCCTtgtg > 1:1161511‑M2/17‑143 (MQ=255) ttaagttagcgcttatGGGACGTTGCCCCGGCACGGACGTTAGCGGCAGAACGCGCGATGGCAGATGAAGCGTTAATACCACCAAAGAACGGAGCGATAATATTCTCCAGTCCCTGTCCAACCAGTTCGCTGTTCGCcttgcg > 1:1073448‑M2/17‑141 (MQ=255) cACCGCCGAGATAGGGGACGTTGCCCataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacggctcggtgcctcgttaagacgatgcctcgcgttcttcaattgcgttttgtaggctgtcatggatactgtcccac > 1:556905‑M2/1‑26 (MQ=255) cgccgAGATAGGGGACGTTGCCCataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgttaagacgatgcctcgcgttcttcaattgcgttttgtaggctgtcagggatactgtcccacgaa > 1:767324‑M2/1‑23 (MQ=255) gcgcttatGGGACGTTGCCCCGGCACGGACGTTAGCGGCAGAACGCGCGATGGCAGCTGTAGCGGTAATACCAACAAAGAACGGAGCGATAATATTCCCCAGACCCTGTCCAAACAGTTCCCTGTGCGCCTCGTGCTTCGTcc > 2:1072975‑M2/9‑143 (MQ=255) ttatGGGACGTTGCCCCGGCACGGACGTTAGCGGCAGAACGCGCGATGGCAGCTGTAGCGGTAATAGCACCAGAGAACGGAGCGATAATATTCCCCAGTCCCTGTCCAACCCGTTCGCTGTTCGCCTTGTGTTTCGTCCCGGt > 1:449503‑M2/5‑143 (MQ=255) GGGACGTTGCCCCGGCACGGACGTTAGCGGCAGAACGCGCGATGGCAGCTGTAGCGGTAATACCACCAAAGAACGGAGCGATAATATTCCCCAGTCCCTGTCCAACCAGTTCGCTGTTCGCCTTGTGTTTCGTCCCGGTCATa < 1:138771‑M2/143‑1 (MQ=255) | ACCACTTTGTGCGCTTCACTCATGTTCCACGCCACCATCAACAGCAGGGCTGCCATGGCGGAAAGCGGCAGCCAGGAGAGCAGCGGTGCCAGTACCAGCAGGGCAAGAATAACCAGAATAGAGTGGATCACCGCCGAGATAGGGGACGTTGCCCCGGCACGGACGTTAGCGGCAGAACGCGCGATGGCAGCTGTAGCGGTAATACCACCAAAGAACGGAGCGATAATATTCCCCAGTCCCTGTCCAACCAGTTCGCTGTTCGCCTTGTGTTTCGTCCCGGTCATA > NC_000913/1259614‑1259898 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |