| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 458799 | 6 (0.090) | 78 (1.170) | 61/276 | 0.0 | 93.0% | intergenic (+99/‑89) | clpX/lon | ATPase and specificity subunit of ClpX‑ClpP ATP‑dependent serine protease/DNA‑binding ATP‑dependent protease La |
| ? | NC_000913 | = 609347 | NA (NA) | intergenic (+170/+112) | insL1/entD | IS186 transposase/phosphopantetheinyltransferase component of enterobactin synthase multienzyme complex | |||||
Only 100 of 152 total aligned reads displayed.
ATTTATGGCAAGCCGGAAGCGCAACAGGCATCTGGTGAATAATTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTAATAGATGGCGTGAAGCACAGTCGTGTCATCTGATTACCTGGCGGAAATTAAACTAAGAGAGAGCTCTATGAATCCTGAGCGTTCTGAACGCATTGAAATCCCCGTATTGCCGCTGCGCGAT > NC_000913/458659‑458941 | aTTTATGGCAAGCCGGAAGCGCAACAGGCATCTGGTGAATAATTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCat > 1:1069268‑M1/1‑141 (MQ=255) ttgcggggagggggaagcgcaacaggCATCTGGTGAATCATTAGCCGTTCCCATACAATGAGTTAACCAAACATGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCataa < 2:851183‑M1/131‑5 (MQ=255) ctatttttcatgaagccccacagGCATCTGGTGAATAATTAACCATCCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGCGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCCCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCataagc < 1:598589‑M1/132‑7 (MQ=255) cAAGCCGGAAGCGCAACAGGCATCTGGTGAATAATTAACCATTCCCATACAATTGGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCataagcgcta > 1:559458‑M1/1‑133 (MQ=255) cAAGCCGGAAGCGCAACAGGCATCTGGTGAATAATTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCataagcgcta > 2:477577‑M1/1‑133 (MQ=255) ccGGAAGCGCAACAGGCATCTGGTGAATAATTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTGCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACCTCCCatcagcgctaactt > 1:457462‑M1/1‑129 (MQ=255) ggAAGCGCAACAGGCATCTGGTGAATAATTAACCATTCCCATACAGTTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTGATCTCCCCTTTAATGTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCataagcgctaacttaa < 1:467235‑M1/143‑17 (MQ=255) tctccgggcttaccaatatgggccagaattgctgaccagttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatGGGGAAACATCCCCATATACTGACGTACAt > 1:1026242‑M1/114‑143 (MQ=255) caagCGCAACAGGCATCTGGTGAATAATTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCataagcgctaacttaag < 1:598634‑M1/142‑18 (MQ=255) 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< 2:50142‑M1/143‑1 (MQ=255) gggacgttgcccataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgttaagacgatgcctcacgttcttcaattgcgttttgtaggatgacagggatactgtcccacgaagggccacctat > 2:678363‑M1/10‑12 (MQ=255) GGGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTAATAGATGGCGTGAAGCACAGTCGTGTCATCTGATTACCTGGCGGAAATTAAACTAAGAGAGAGCTCTATGAATCCTGAGCGTTCTGAACGCATTGAAATCCCCGTATTGc < 2:789992‑M1/143‑1 (MQ=255) ggacgttgcccataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgttaagacgatgcctcgcgttcttcaattgcgttttgtaggctgtcagggatactgtccaacgaatggccacctgtc > 1:327723‑M1/9‑11 (MQ=255) ggAAACATCCCataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgttaagacgatgcctcgcgttcttcaattgcgttttgtaggctgtcagggatactgtcccacgaatggccacctgta > 1:305187‑M1/1‑11 (MQ=255) aCATCCCCATATACTGACGTACATGTTAATAGATGGCGTGAAGCACAGTCGTGTCATCTGATTACCTGGCGGAAATTAAACTAAGAGAGAGCTCTATGAATCCTGAGCGTTCTGAACGCATTGAAATCCCCGTATTGCCGCTg > 1:251170/1‑143 (MQ=255) 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cccctaagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgttaagacgatgcctcgcgttcttcaattgcgttttgtaggctgtcagggatactgtcccacgaatggccacctgtaagctccag < 1:48657‑M1/143‑141 (MQ=255) ccccATATACTGACGTACATGTTAATAGATGGCGTGAAGCACAGTCGTGTCATCTGATGACCTGGCGGAAATTAAACTAAGAGAGAGCTCTATGAATCCTGAGCGTTCTGAACGCATTGAAATCCCCGTATTGCCGCTGcgcg > 1:1008098/1‑143 (MQ=255) cccataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgttaagacgatgcctcgcgttcttcaattgcgttttgtaggctgtcagggatactgtcccacgaatggccacctgtaagctccag < 1:979865‑M1/143‑141 (MQ=255) ccataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagatgccgacgcctcggtgcctcgttaagacgatgcctcgcggtctgcaattgcggtttgtaggctggcagggatactgtcccacgaatggccacctgtaagctccaga > 2:143589‑M1/1‑2 (MQ=255) cataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgttcagacgctgcctcgcgttcttcaattgcgttttgtaggctgtcagggatactgtcccacgcctggccacctgtaagctccagct > 1:413048‑M1/1‑1 (MQ=255) | ATTTATGGCAAGCCGGAAGCGCAACAGGCATCTGGTGAATAATTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTAATAGATGGCGTGAAGCACAGTCGTGTCATCTGATTACCTGGCGGAAATTAAACTAAGAGAGAGCTCTATGAATCCTGAGCGTTCTGAACGCATTGAAATCCCCGTATTGCCGCTGCGCGAT > NC_000913/458659‑458941 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |