New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | = 458799 | 5 (0.080) | 67 (1.040) | 51/276 | 0.2 | 93.2% | intergenic (+99/‑89) | clpX/lon | ATPase and specificity subunit of ClpX‑ClpP ATP‑dependent serine protease/DNA‑binding ATP‑dependent protease La |
? | NC_000913 | = 609347 | NA (NA) | intergenic (+170/+112) | insL1/entD | IS186 transposase/phosphopantetheinyltransferase component of enterobactin synthase multienzyme complex |
GCTGATTTATGGCAAGCCGGAAGCGCAACAGGCATCTGGTGAATAATTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/458655‑458799 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑tcccATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGAACCATCTGAAGAATGCGACGCCTCGGTGCCTCGTTAAGACGATGCCTCGCGTTCTTCAATTGCGTTTTGTAGGCTGTCAGGGATACTGTCCCACGAATGGCCACCTGTAAGCTCCAGAT < NC_000913/609347‑609206 GCTGATTTATGGCAAGCCGGAAGCGCAACAGGCATCTGGTGAATAATTAACCATTCCCATACAATTAGTTACCCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTCTTCCTCTATTCTCGGCCTTCAATGCGGGGGAAACCTC > 1:852864/1‑143 TGATTTATGGCAAGCCGGAAGCGCAACAGGCATCTGGTGAATAATTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCC > 2:780461/1‑143 TGATTTATGGCAAGCCGGAAGCGCAACAGGCATCTGGTGAATAATTAACCATTCCCATACAATTAGGTAACCAAAAAGGGGGGACTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCC > 1:263725/1‑143 TGATTGATGGTAAGCCGGAAGCGCAACAGGCATCGGGGGAATAATTAGCCAGTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCC < 1:782740/143‑1 GATTTATGGCAAGCCGGAAGCGCAACAGGCATCTGGTGAATAATTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAGAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCA < 1:609742/143‑1 TGGCAAGCCGGAAGCGCAACAGGCATCTGGTGAATAATTAACCCTTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCATAAGCG < 2:88148/143‑1 GGCAAGCCGGAAGCGCAACAGGCATCTGGTGAATAATTAACACATGGGTCACAAGTAGTTAACCAATCAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCATAAGCGC < 2:789460/143‑1 AAGCCGGAAGCGCAACAGGCATCTGGTGAATAATTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTATATCTCCCATTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCATAAGCGCTAA > 2:875399/1‑143 GCCGGAAGCGCAACAGGCATCTGGTGAATAATTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAACAGGGGGCATTTTATCACCCATTTACTTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACAACCCACAAGCACTAACa > 1:869326/1‑142 CGGAAGCGCAACAGGCATCTGGTGAATAATTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCGTTTAATTTTTCCTCTATTCGCGGCGGTGAATGTGGGGGAAACAGCCCCTAAGCGCTAAGTTg > 2:290691/1‑142 GAAGCGCAACAGGCATCTGGTGAATAATTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGTGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCATAAGCGCGCACTTAAG > 2:267189/1‑143 GAAGCGCAACAGGCATCTGGTGAATAATTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCCGCGTTGAATGTGGCGGACACATCCCATAAGCCCTACCTTAcg > 2:1071506/1‑141 AAGCGCAACAGGCATGTGGTGAATAATTAACCATGCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCATAAGCGCTAACTTAAGG < 2:1060207/143‑1 AAGCGCAACAGGCATCTGGTGAATAATTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCATAAGCGCTAACTTAAGG < 2:380109/143‑1 AGCGCAACAGGCATCTGGTGAATAATTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACGAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGG > 2:267014/1‑143 GCGCAACAGGCATCTGGTGAATAATTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCATAAGCGCTAACCTAAGGGT > 1:428300/1‑143 GCAACAGGCATCTGGTGAATAATTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTG < 1:992758/143‑1 GCAACAGGCATCTGGTGAATAATTAACCATTCCAATACAATTAGGTAACCAAAAAAGGGGGATTTTAACACCCCTTTCATTTTTCCTCTATCCCCGGCGTTGAATGCGGGGGCAACATCCCATACGCGATAACTTCAGGGTTG > 1:999206/1‑143 GCATCTGGTGAATAATTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGAACCATC > 2:795228/1‑143 CATCTGGTGAATAATTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGAACGATCT > 1:962144/1‑143 ATCTGGTGAATAATTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTTCTCTGTTCTCCCCTGTGAATGGGGGGGAAACATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGAACCggccg > 2:1150712/1‑138 CTGGTGAATAATTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGAACCATCTGAA < 2:1069244/143‑1 TGGTGAATAATTAACCATTCCCATCCAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTACTTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGTGGAAACATCCCATAAGCCCTAACTTAAGCGTTGAGCCATCcgcac > 1:1099046/1‑138 TGGTGAATAATTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGAACCATCTGAAG > 1:329143/1‑143 GTGAATAATTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGAACCATCTGAAGAA < 2:820785/143‑1 GTGAATAATTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTCTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGAACCATCTGAAGAA > 1:290510/1‑143 caagacaAACCAGACCCATACAATGAGTCAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGAACCATCTGAAGAATGC < 2:394464/136‑1 TTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACCTCCCATGAGCGCTACCTTCAGGATAGAGCAATCTGAgcattgggacga > 1:675278/1‑131 TTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGAACCCTCTGACGAATGCGCCGC > 2:407227/1‑143 TTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGAACCATCTGAAGAATGCGACGC > 2:470390/1‑143 ACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCATAAGCGCTCACTTAAGGGCTGAACCATCTGAAGAATGCGACGCCTC > 1:967942/1‑143 CATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCACATAAGCGCTGACTTACGGGGTGAACCAGCTGCAGAATGCGACGCCTCGc > 1:635436/1‑142 ATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTTTCGGTGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGAACCATCTGAAGAATGCGACGCTTCGGT > 2:56734/1‑143 TCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTCGAACCATCTGAAGAATGCGACGCCTCGGTGC < 2:85505/143‑1 CCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGAACCATCTGAAGAATGCGACGCCTCGGTGCCT > 2:478294/1‑143 TTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTACTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCATAAGCCCTAACTTAAGGGTTGAACCATCTGAAGAATGCGCCGCCTCGGTGCCCCGctcaca > 1:1107386/1‑137 tcAACCAAGAAGTGGGTATTTTATCTCCCCTTTAATGTTTCCGCTATTCTCGGCGTGGAATGTGGGGGAAACATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGAACCATCTGAAGAATGCGACGCCTCGGTGCCTCGTTAAGACGAT < 1:800581/141‑1 TAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGAACCATCTGAAGAATGCGACGCCTCGGTGCCTCGTTAAGACGATG < 1:342939/143‑1 AACCAAAGAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGAACCATCTGAAGAATGCGACGCCTCGGTGCCTCGTTAAGACGATGC < 1:618227/143‑1 AACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGAACCATCTGAAGAATGCGACGCCTCGGTGCCTCGTTAAGACGATGC < 2:505461/143‑1 AACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGAACCATCTGAAGAATGCGACGCCTCGGTGCCTCGTTAAGACGATGC < 2:806383/143‑1 GGGGGGTTGTAGCTCCCGGTTAATGTGTCCCCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCATAGGCGCTAAGTTAAGGGTTGAACCATCTGAAGAATGCGACGCCTCGGTGCCTCGTTAAGACGATGCCTCGCGTTCT < 1:1138760/143‑1 GGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGCTTGAACCATCTGAAGAATGCGACGCCTCGGTGCCTCGTTAAGACGATGCCTCGCGTTCT < 1:870886/143‑1 GGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCATCTAATCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAAAATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGAACCATCTGAAGAATGCGACGCCTCGGTGCCTCGTTAAGACGATGCCTAGCGTACTTCc > 1:414227/1‑142 GATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGAACCATCTGAAGAATGCGACGCCCCGGTGCCTCGTTAAGACGATGCCTCGCGTTCTTCca > 1:403425/1‑141 GATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGAGTTGAATTTGGTTTGTACATCCCATAAGCGCTCACTTTAGGGTTGATCCATCTGAAGAATGCGACGCGTCGGTGCCTCGTTATGACGATACCTCGCGTTCTTCcg > 1:825077/1‑141 TTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAAAATCCCATAAGCGCTCACTTAAGGGTTGAACCATCTGAAGAATGCGACGCCTCGGTGGCTCGTTAAGACGAAGCCAAGCGTTCTTtcatt > 1:425054/1‑138 TTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGAACCATCTGAAGAATGCGACGCCTCGGTGCCTCGTTAAGACGATGCCTCGCGTTCTTCAATTGC > 1:10104/1‑143 TCCGCTTGAATTTTTCCTCTATTCACGGCGTTGAGTGTGGGGGAAACGTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGAACCATCTGAAGAATGCGACGCCTCGGTGCCTCGTTAAGACGATGCCTCGCGTTCTTCAATTGCGTTTT < 1:475919/143‑1 TCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCATACGCGCTGACTGAAGGGGCGTACCATGTGAAGGATGCGACGCCTCGGTGCCTCGTTAAGACGATGCCTCGGGTTTTTCCATGGCGGTTT > 1:1007791/1‑143 TCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGAACCATCTGAAGAATGCGACGCCTCGGTGCCTCGTTAAGACGATGCCTCGCGTTCTTCCATTGCGTTTT > 2:456120/1‑143 TCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGAACCATCTGAAGAATGCGACGCCTCGGTGCCTCGTTAAGACGATGCCTCGCGTTCTTCAATTGCGTCTT > 1:268986/1‑143 gCCTGTAGTTGTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAATCATGCCATGAGCGCTAACTTAAGGGGTGAACCATCTGAAGAATGCGACGCCTCGGTGCCTCGTTAAGACGAGGCCTCGCGTTCTTCAATTGCGTTTTGT < 1:745620/142‑1 CCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGAACCATCTGAAGAATGCGACGCCTCGGTGCCTCGTTAAGACGATGCCTCGCGTGCTTCAATTGCGTTTTGTA > 2:279250/1‑143 TTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGAACCATCTGAAGAATGCGACGCCTCGGTGCCTCGTT > 2:462152/1‑104 TTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGAACCATCTGAAGAATGCGACGCCTCGGTGCCTCGTT < 1:462152/104‑1 TCTATGCTCGGCGTGGAATGAGGGGGAAACATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGAACCATCTGAAGTATGCGACGCCTCGGTGCCTCGTTAAGACGATGCCTCGCGTTCTTCAATGGCGTTTTGTAGGCTGTCAGGGATA < 2:55570/143‑1 TTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCATAAGCGCTAACTTAGGGGTTGAAGCATCTGAAAAATAAGATCCCTGTCGACCTCGTTAAGACGATGCCTCGCGTTCTTCAATTCCGTTTTGTAGGCTGTCAGGGCTACTGT > 2:537848/1‑143 TCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGAACCATCTGAAGAATGCGACGCCTCGGTGCCTCGTTAAGACGATGCCTCGCGTTCTTCAATTGCGTTTTGTAGGCTGTCAGGGATACTGTCCC < 2:329143/143‑1 TCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGAACCATCTGAAGAATGCGACGCCTCGGTGCCTCGTTAAGACGATGCCTCGCGTTCTTCAATTGCGTTTTGTAGGCTGTCAGGGATACTGTCCC > 1:843430/1‑143 TCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATACCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGAACCATCTGAAGAATGCGACGCCTCGGTGCCTCGTTAAGACGATGCCTCGCGTTCTTCAATTGCGTTTTGTAGGCTGTCAGGGATACTGTCCC < 1:166113/143‑1 CGGCGTTGGATGTGGGGGAAACATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGAACCATCTGAAGAATGCGACGCCTCGGTGCCTCGTTAAGACGATGCCTCGCGTTCTTCAATTGCGTTTTGTAGGCTGTCAGGGATACTGTCCCA < 1:669490/143‑1 CGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGAACCATCTGAAGAATGCGACGCCTCGGTGCCTCGTTAAGACGATGCCTCGCGTTCTTCAATTGCGTTTTGTAGGCTGTCAGGGATACTGTCCCA < 2:1139639/143‑1 ggcgtgggtTGTGGGGGAAAGATCACATAAGCGCTATCTTAAGGGTGGAACCATCTGAAGAATGCGACGCCTCGGTGCCTCGTTAAGCCGATGCCTCGCGTTCTTCAATTGCGTTTTGTAGGCTGTCAGGGATACTGTCCCAC < 1:92758/134‑1 GGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGAACCATCTGAAGAATGCGACGCCTCGGTGCCTCGTTAAGACGATGCCTCGCGTTCTTCAATTGCGTTTTGTAGGCTGTCAGGGATACTGTCCCAC < 2:742792/143‑1 ggTGAATGTGGGGGAAACAGTCCATTAGCGCTAAGTTATGGGTTGAACCATCTGAAGAATGCGACGCCTCGGTGCGTCGTTAAGACGATGCCTCGCGTTCTTCAATTGCGTTTTGTAGGCTGTCAGGGATACTGTCCCACGAA < 1:44963/141‑1 TGAATGTGGGGGAAACATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGAACCATCTGAAGAATGCGACGCCTCGGTGCCTCGTTAAGACGATGCCTCGCGTTCTTCAATTGCGTTTTGTAGGCTGTCAGGGATACTGTCCCACGAATG < 1:59503/143‑1 TGAATGTGGGGGAAACATCCCATAAGAGCTAACTTAATTGTTGAACCATCTGAAGAATGCGACGCCTCGGTGCCTCGTTAAGACGATGCCTCGCGTTCTTCAATTGCGTTTTGTAGGCTGTCAGGGATACTGTCCCACGAATG < 2:1089773/143‑1 GTGGGGGAAACATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGAACCACCACCACAACGTGCTGTTTTGGTGCCTCGTTAAGACGATGCCTCGCGTTCTTCAATTGCGTTTTGTAGGCTGTCAGGGATACTGTCCCACGAATGGCCAC < 2:263725/143‑1 ACATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGAACCATCTGAAGAATGCGACGCCTCGGTGCCTCGTTAAGACGATGCCTCGCGTTCCTCCATTGCGTTTTGTCGGCTGTCAGCGATACTGTCCCCCGCATGGCCACCTTTCAGCT > 1:621604/1‑143 ATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGAACCATCTGAAGAATGCGACGCCTCGGTGCCTCGTTAAGACGATGGCTCGCGTTATTCAATTGTGTTTTGTAGGCTGTCAGGGCTACTGTCTCACGCATGGCCACCTGTAAGCTCC > 1:193062/1‑143 TCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGAACCATCTGAAGAATGCGACGCCTCGGTGCCTCGTTAAGACGATGCCGCGCGCGCTTCAATTGCGTTTTGTAGGCTGTCAGGGATACTGTGCCACGACTGGCCCCCTGTAAGCTCCg > 1:647778/1‑142 TCCCATAAGCGCTAACTTAAGGCTTGAACCATCTGAAGAATGCGACGCCTCGGTGCCTCGTTAAGACGATGCCTCGCGTTCTTCAATTGCGTTTTGTAGGCCGTCACGGATACTGTCCCACGCATGGCCACCTGTAAGCTCCA > 1:1048382/1‑143 CCCATACGCGCTAACTTACGGGTTGAACCATCTGAAGAATGCGACGCCTCGGTGCCTCGTTAAGACGATGCCTCGCGTTCTTCAATTGCGTTTTGTAGGCTGTCAGGGATACTGTCCCACGAATGGCCACCTGTAAGCTCCAG < 2:296830/143‑1 CCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGAACCATCTGAAGAATGCGACGCCTCGGTGCCTCGTTAAGACGATGCCTCGCGTTCTTCAATTGCGTTTTGTAGGCTGTCAGGGATACTGTCCCACGAATGGCCACCTGTAAGCTCCAG > 1:317462/1‑143 CCCATAAGCGCTAACTTAAGCGTTGAACCATCTGAAGAATGCGACGCCTCGGTGCCTCGTTAAGACGATGCCTCACGTTCCTCAACTGCCTTTTGTAGACTGTCAGGGATACCGTCCCACGAATGGCCACCTGTCAGCTCCAG < 2:1115295/143‑1 CCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGAACCATCTGAAGAATGCGACGCCTCGGTGCCTCGTTAAGACGAAGCATCGCGGTCTTCAAGTGCGTCTTGTGGGCTGTCAGGGCTCCTGTCCCACGCATAGCCGCCTGTCAGCTCCAGA > 1:1146847/1‑143 CCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGAACCATCTGAACAATGCGACGCCTCGGTGCCTCGTTAAGACGATGCCCCGCGTTCTTCAATTGCGTCTTGTAGGCCGTCAGGGACACTGTCCCACGAATGGCCACCTGTCGGCCCCAGA > 1:757855/1‑143 CATGAGCGCTAACTTAAGGGTTGAACCATCTGAAGAATTCGACGCCTCGGTGCCTGGTTAAGACGATGCCTCGCGTTCTGCAATGGCGTTTTGTAGGCTGTCAGGGATACTGTCCCACGAATGGCCACCTGTAAGCTCCAGAT < 2:284702/143‑1 CATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGAACCATCTGAAGAATGCGACGCCTCGGTGCCTCGTTAAGACGATGCCTCGCGTTCTTCAATTGCGTTTTGTAGGCTGTCAGGGATACTGTCCCACGAATGGCCAGCTGTAAGCTCCAGct > 2:361203/1‑141 GCTGATTTATGGCAAGCCGGAAGCGCAACAGGCATCTGGTGAATAATTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/458655‑458799 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑tcccATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGAACCATCTGAAGAATGCGACGCCTCGGTGCCTCGTTAAGACGATGCCTCGCGTTCTTCAATTGCGTTTTGTAGGCTGTCAGGGATACTGTCCCACGAATGGCCACCTGTAAGCTCCAGAT < NC_000913/609347‑609206 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |